Information report for BVRB_5g112670
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- Encodes a Dicer homolog. Dicer is a RNA helicase involved in microRNA processing. Mutations in this locus can result in embryo lethality. Embryo shape at seed maturity is globular-elongate. Other mutants convert the floral meristems to an indeterminate state, others yet show defects in ovule development. mRNA is expressed in all shoot tissues. DCL1 is able to produce miRNAs and siRNAs.
Homologous
- Actinidia chinensis: CEY00_Acc15976
- Citrullus lanatus: Cla97C05G079940
- Cucumis melo: MELO3C005929
- Glycine max: Glyma.19G261200
- Gossypium hirsutum: Gohir.A07G133700, Gohir.D07G138400
- Juglans regia: Jr07_10040
- Lactuca sativa: gene-LSAT_3X140760
- Manihot esculenta: MANES_05G015200
- Populus trichocarpa: POPTR_002G181400v3
- Prunus avium: Pav_sc0001046.1_g510.1.mk
- Prunus persica: PRUPE_2G200900
- Sesamum indicum: SIN_1002242
- Vitis vinifera: VIT_15s0048g02380
Sequences
gDNA Sequence
- >BVRB_5g112670
CCGTCACCACTAACGACTCCTCTCCTTCACTGCCGTAGTGCCGCCCACCTCGCCAGCAATGTCTTTATATGGTTAGTTTTTGATAAATTCATCTGTAAATTTAGTTATTTAAAATAAACTTGGTTTTTGGTGGATTTTGCGTGAATTACAGAGTGGATTTGATAAATTCATTTGTGTGATTATCTGGTGATTTTAGATGTTTGTATTGTGTTGATATGGTAAATGAGTCCATCACTGAATCATATTTGCTATTGACATCCTTGAGAATAAGTCTATTTCGTGTATAACGTTCGCTATTATGCTGGTCTTATGAAAAACAAAGATGTTTTGATTTTGTTGAGCAGTTTAGCCCCTAGGGAGCTTCTCGCCTTTTCGTTATCAATGATATGATTCCACAACTACTGGTGATGAGCTATCTGTTGGTCGATTGTTTTTATGAGCTTCTTCCCTGTGGGTTTACCTTATCTATGTGTTATCAAGATTAACAGAAAACTGAAATTATTGGCCTACTTTTCATACCTAATTATGTCTGGTTTAGTGTGGTGAATTTAAGATCATATCTTAAGTTGTTATGGAATATTGGCGATCCTCAATTATTCAACTAAAATTGTCGAACAAAACTCTAGTTTTGCAATTGGGCTCAATTGGTTGGGTTTTTTGCAATAAAATAAGGGACGTCGCCTTAGGCGATCTGATTCGCGAACGAAGGCGACCTCATCACGATTTGTTCCGCGATTGGGGACAAGTGATTCAAATCGCACATCGGGAAAGCATCCTACATTCCTTGTATCACTGGACTAAAAGCTAGTTGTGGCTGAATTCTGTGCACCACTCTTCTCTCTTTGAGACATAACTCACCTAAAAAGTTTTCATTTTTAGGGAGTAATTTTCTATGAATCATAGAATTAACGAGTATTATGAAAGATCTTTCTTGAATTTGATGAGCTTTTTTTGTGTCAGCTAATAGTCTCATGTAGTTCACAGGCTTTTGGCCTGAGAAGTAGCATGTAAGCAGAAGTTCTCAAATTGGTATAATAGAAAACCCTTGTCCCCGAAAAAATTATAAGGGTGTCTGAGTGTCTCTCCTCCTAGAATTACTACATCATTTGTTTATTACGGTACTATTATGAAGATATGAAGACAGATAACATTATTAAATGGAAAGTCTTGTTTGTTTTACTTTCATTATTTAAAGTTTTAAACTGCTACTTCTGGAAAGTGGGAGGGGAGTGTGAAAAGTTCATTTGATATGGCACAAGTCAATTGTAGTTTTCTAGAGGGAGATCTAGTCTTCTCTGTGAGGTTGCAGGTCCTCAAAGTTTTGAACTCATTTGTGAGTTATGGTTGATATGGCACAAGTCAACTATGTGTTTCTACCTGCTGAATTGTGTTTTGTACACCCGCTTCCTGGAGAGCTGGTTCGAGGTGCCCAAAGACTGCCGTCAATAATGAGACGGGTTGAAAGCATGTTACTTGCAATTGAACTTAAGAATATAATCAACTATCATATCCCTGCTTCTAAGGTCATCCCTTTCTCAGGCTTCTTTCACTCTTTTCCTTTATGATTCACCCAAAATTGATTATTATGTGTATCCATTTAACCAGTTTGCAAATTTACAGATTCTGGAAGCTTTGACTGCAGCCTCTTGTCAAGAGACATTTTGCTATGAAAGAGCCAAGCTCCTGGGAGATGCTTATTTGAAATGATTTGGTTTTCGTGATTTTCATTCCCGTCATTGCAATTTCTCTTTGGTATTAGGTAATTTTGATGAGCTTCTTACTCTTGTCATTGTACTGGATAAATTGCTTTGGGGTTTAGTAGGATTGTGGTTTAGAAATTTTGTGGCTTTCCATATTAGCTTATTTAGCTTGCTTTTTTGTTCTCTCTTTTTGTTCACTAACTTAGCATTGATGTAGGTGATATACGTATCACATTGCTACAAGCTTACACATTGTAATTCCAAACGGACGCTAATTATTTTGTTGATTATTGTGTAAGGTGGAATTAATAAATTAATACCTTTGGCTCTTTGAATTTTAATAATTAGGTTAATTTCTATTAGGTTTTCTTAAGAGATAGCTGGTCAGGTTTAGAGATTCCAGTATAAACCTTCTATTTCACAAGAACTATATAGTCTGTGAATCTGAACTACAACAGCTGAAAGGCATCAGATTATCTGTTGGTCAGATGAGGAGCTTTTGAAGACTCATTGTCTTTTATCCTCTTTCTTCGATTAAGCCTTAGAAGGTGTTATTTTCTTAGATCCATTCTGATTTGAACATTTTCATAGTAAAGATCATGCTGGACTTAAAGATCCATGAGACGGAGCATCAAAGAATAGGTTTTGCCCTGTGTTATTGAATCAAAATAAGGTTGTATCTATTATTAATGCTCTCTAGTGTATAGATGGAACTGTTATTGAATCAAGAAAGGCTGATTTTCCTGCAATTATTAAAGCGTAATTATAAATTAAACTATGATTTTCCCATGATATATATGTTTTCACACAATATATTCAGCTTCCCATTTAACCTTGAGCATCTTTGCTGTAAATTTAGAATTTCCCTTTTTTCTTCACTGGTTCTTTGAATCATGTGTAAATATTATAAATTATTTCTTTCCTTTTCACAATATATTACATCTTATTTCTTCATTATTCTACAGCAATATTACATTCCCTCAGCACGAGAACTCCAGTGATACAGCATTTTGCCGAGACTATATCTGGAGCAACAACTATTAGGAGCTTCGATCAAGAATCGTGATTCGTTAAAACAAGCGTGAAGCTAGTAAATGGATATTCAAGGCCAAAGTTTTACAATGTTGCTGCAATGGAATGGCTTTGCATTCGCTTGGACTTGTTGTCTTCAATTACATTTGCTGCCTCATTGATATTTCTCATATCCATTCCTGTAGGATTAATCGATCCTGGTATGTGATCCTCATTTAGTAGTCTACTTGCTATCTAAATAGGTTTTGCTTAAATTGGAAACCCTCTTAACAGAAAAAAAAATCTACTTTTTTTTCAAGGGATTGCTGGTTTCTGTTTCATATGGGCTAAATCTGAACATGCTATAAGGCTGGGTGATATGGAATTTATGTAATATGGAGAATAAAATCATCTCAGTTGAGAGGATTCTTAAGTATACATCTATCCCAAGTGAACCTCCCCTTATTATTGAAGAAACTAGGCCAGACCCGTCTTGGCCTTCTCATGGAGAAGTCAATGTTCAAGACCTGCGGGTGATTTTGGTTTCATTTTACTTGCTTTCGTTGCATAACATGTAAGGCCACGACAGAAAAATTGAAACGCGCGCTTTCCTTAAACATTGTGATGGATATATGCAGTTTCGTTATGCGTCCATTTTTTTTAATAATAATATTTCTGAATGTGT
CDS Sequence
- >BVRB_5g112670
ATGGTTGATATGGCACAAGTCAACTATGTGTTTCTACCTGCTGAATTGTGTTTTGTACACCCGCTTCCTGGAGAGCTGGTTCGAGGTGCCCAAAGACTGCCGTCAATAATGAGACGGGTTGAAAGCATGTTACTTGCAATTGAACTTAAGAATATAATCAACTATCATATCCCTGCTTCTAAGATTCTGGAAGCTTTGACTGCAGCCTCTTGTCAAGAGACATTTTGCTATGAAAGAGCCAAGCTCCTGGGAGATGCTTATTTGAAATGA
Protein Sequence
- >BVRB_5g112670
MVDMAQVNYVFLPAELCFVHPLPGELVRGAQRLPSIMRRVESMLLAIELKNIINYHIPASKILEALTAASCQETFCYERAKLLGDAYLK