Information report for BVRB_5g100300
Gene Details
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Functional Annotation
- Evening-expressed key component of Sin3-HDAC complex, which bind directly to the CIRCADIAN CLOCK ASSOCIATED 1 (CCA1) and PSEUDO-RESPONSE REGULATOR 9 (PRR9) promoters and catalyze histone 3 (H3) deacetylation at the cognate regions to repress expression, allowing the declining phase of their expression at dusk.;Encodes a rice homologue of yeast SAP30, a component of histone deacetylation
Homologous
- Actinidia chinensis: CEY00_Acc20032, CEY00_Acc15664
- Citrullus lanatus: Cla97C07G135360
- Cucumis melo: MELO3C016365
- Gossypium hirsutum: Gohir.D03G149800, Gohir.D12G231900, Gohir.A03G019200, Gohir.A12G230800
- Juglans regia: Jr09_10800, Jr02_17530
- Lactuca sativa: gene-LSAT_3X6221, gene-LSAT_6X86341
- Manihot esculenta: MANES_01G060300
- Oryza sativa: LOC_Os04g08450
- Populus trichocarpa: POPTR_001G101600v3
- Sesamum indicum: SIN_1017905, SIN_1017906, SIN_1015517
- Vitis vinifera: VIT_02s0025g00080
Gene Resources
- Pfam: PF13867
Sequences
gDNA Sequence
- >BVRB_5g100300
AGCAGGTCGTTTCCCCATGGCAGTTGGTAAGCATTTAGTGCGTGCTTCTCTCTTCTCTTTCTCTCTCCTCTCTCACTTACTCACTTACTTACTCACTCACTCATTATCATTTCTTCTACTACTTCATTTTCAGTAACTTCTCTCCTTCCTTAAACTTCTCATTAAAATATAGATCCGTTACATTTTTATTTTCATTTTATCATTCCACATTTTACTTCCTTCGTTTTTCAAGGTATTATAATAATATAATCTTTGAGTTTTGAATATTTCAAGAATTCTGAATTCTGAATTCTGGGTTTAGTTTTGTTTTATCATTTGAATTTGTAGCAACTTGGGTTAGTTGCTTTTTGAAAATCACGATATGGGTGTTTCTCAAAATCATTTCTTTTTAAAGCTTTTTAAAGTAATCTTATTGGAATTTGGTGTGTGTAAATTGTAATTATCTCCTTGTTTTTTGTGCTTTTGATTAATTACTCTTGTTAATCTTGATTAATGGCTTGAATTTCAAGTTTTTTTTTTATGGTGTGTGCTTAATATTGGCGATTTTGGGTGCATGCAGTTGTTTTTAAGGAAGATGATGAAGCTCATTTATTTTCATGTGAATGTAAATGTGATTCTCTCTCATTGGAAATGAATAGTTCCTTGTAATAATTCACTGTCAGAAGTTGAGCTTCAGTATTTTATGAATCCAGGTCAGACTATAATTATGCTTATTTTTAATTTTATTTTCAATAATGTAGTATATCTGATTGATGAAATTAATCTAATAATTCTGTTTTCCCCTTCTTTTTTATTTTCAGGGATTATTATTGGGTTTCAGAAAATTTCAGAATCTGGGTTCTCTACATGCTAATTGTGTTGAATTACAAAAAGTTTGATCTGGGATTAACTTTGAAGATTTAGAGGTTAAAAAAGGTTATGGATTGTGATTAGGGTAATCTCAATTTGGAAGTAAATTTGATGATTTTGAGTGATTTTGAGGAAAATAGGATCTAACTCTGTATTGGGTTTGAAAGATCAATTGGTAAATATTTAGGCTAAAAGTAGAAGGATATTTGATTTAGATTCTTGGTTGATTTGGGTTTTAGTTAAATTCGTTGACAAGAAAATAAGTATATTGGGTAAATTTCTATTAGAAAAACAAGAAAAAAAAAGTGGAAATGATTGAATCAGAGTTATGTGCATCTCGGGTGATGTCACCATTTAGAGAAGAAAGTGGTGATGAAGAACTTTCAGTTTTACCAAGGCATACAAAAGTTATTGTGACTGGAAATAATAGAACTAAATCCGTTTTAGTGGGATTGCAAGGTGTTGTTAAGAAGGCTGTTGGTCTTGGTGGTTGGCATTGGCTGGTATTTTCCTCTACTCACTCTTCCACTTTCCTTTCTACATTGTCATTGTATGTGTTCATCATGCATTAGTGTGTGCGAATTCGGATTCATTGCTTACTTAGCTCCGTTTCTTTTTAATCTACGCACTTTGTATTTTGACACTATTCATATATTTCACCGTTTTACTATTATTGTGTGATTTACGCTTAAAGAAGAATATAGTTACTATTGGATCTTGTTAGATTTATGTCAATATATATTTTGATGATATCAACTTATAATTTTTACTTATTGATAGGTAAAGATATCTATCAATGGATGTATTTGTGTGTTGTCAAGTGTTATTGTCAAACACTGTAGGTTAAAAGGAAACTGAGATAGTATATAGTTTATTTATTCATCTTTTTTGTTGGTTAAGATTCACATTGTCAGAAGACACAAATTTATTATCTTCCTTGTTGCTATGATTTTATTATTGTTTTTGAACTAAAGTATATTTTCTTTTTTACTCTGGTTAGTTAATATCAGTAGGTTATTCCCATTGTCTTATCCAACTTTGTGGTAATGTTGACATTAGTGTAAATAATTATTGCTACAAGTATATTGTAGTAGTATATCATCTTTTGTCTTGGTTAAGATTCAGATTAGTTGTAATTGTTTGTCTTCTTGTGTAGCTTTATCTCTTATTGTTTATGAATTCAATTATATATGTAATCTTCAGAGGGATGTTGGATAGTTGAAACTTAATCTCTGTATGATTTTGTACGGGGTAATGTAAAGAACTGGCTTCATGTTTTATTTTCTATGATGAAATTTTGTGAGCTTAATCGGATCGAATGTCTTAAGTTTCTCGGAGGAAATGGTGAAAAGCTGTTAAGCAATCATCATTCTACTAGTGAAGCATGAATACTATTGCTAATGTTTGTTTAATTAGAGTACTTTTTCTTTTGGCATTTACCTATCAATTTTCTGGCATGACATGATTTTAGTAGTGGGAAGACTTTAGGGTCATTAGGCGTACTAATTTTTCGCAAAAAGAAAAGCAAATATAACGCAATGAAAAGACACAAAAAGTGCTGTTGTCAACTGTATGTAATATTCTTCTAATATAGTAAGTATTTGAGTATTGAATGTGCCTCCATTTTATATAATTATTTGGTGTATGAAGGAATTATATGGCTTCTTTTCACTTTCTGCCTTCTTGTCCTGGGTACTCAACCTCAAGTGATATGGTTGGTTTTGTTGTTTTATATATTGAAAACCATGTCCTAATATAGTGATATGTTGAAGGTTTTGAAGAATGGGATTGAGGTTAAGCTACAACGGAATGCACTGAGTGTGCTAGAACCACCTACGGGACACGAGGAAGATGATGAGCTTGATCACTCTAGCTGCAGCTCTGATCTTGGTGAGAAGGACCATGAATTTGGTAAGCTTCACCAATAGCTCAGATTCATTCTTAATATTGTGACACATGACATAAACACTAAAGTGAGTTTGTCTCATATCTGTATTGCTGTACAAATGTTGCAGGGAATAGCATGGAGTTTCACAAAGTGAGCAAGCCAAGAGTGCGCCATACTAGACCATGGGCTCCTCCATCTGCTTCAGCAAAGTCAAATCATCGGAATTGCTTGAAGGAACTGCACTCCAACATTCATACCTCTCACTGTGTAAGCATTTTAGCCCTTGCGGGTCTTGTATTATAGAAGAAATGGCATATACATTATCTTCAAGGGAGAAAATAAGGGTTGATAATTGATTTGAGATGCATCTTGGTCCTCTCTTAATTTATTTAATCTGATGGTTAGATCCATTTAAAAGGATATGGGAATTTTTGGCCAAAATATGCAAAATTTACCTAAATATAATAAAAAATATCTTTGGGCAATACTCATAACCGAGCTTGACTAAATACGATACTGTTTTGGGTATGATTAAGATATTACCCATTATGATATCTTTATCCTGTTGACTGTTGTCTATTTACATGCTTATAATTCTGTCAATTGGATTTCAATTTTTAATTCCAACTTTAGTGGCTGGAAGCAGGATATGGAGATGAAAATGTTTGCCTTTAGGCAAGTAGGTATATGATTGCTTTTGTTAGTGGTTGAAACTTATCTTACTGTAGGAATGATATATACATCAGATGGGGATTCAGATCTTATTATATATGCCTCATCCTAAACCATGTTCTTTTAAAAGCACAGTCGTCTTTGCTCGGGTTATAACAATGTTAATCACTGGATAGCCATTTTTGCTTCTTGTTAAGGAAACATAACGTTCCCGGCCCTACATAGAAACTACTAATATGTATCTTTTCCTATTTTGTTTTGAACATCTCAAAAATATTGTTGTTATGTGGTCCTAATTTTTGGTCACAAGTTTTCAGGACATAATATTATTGTATATTTGTATCTTTACTCATGAAGTATCTGATCAGTTGTGGTCCTAAAGTTTTCCTATGCTTGACTATGTCAGAGGCTGAACTTTGCTAAGCTTGGCAGTGACTCACTATGGAGGTATTTGAGCCGATTTCATCTGGTCAGTATAATATACTCCCTTGTCGATCTCTTTAATTCCACAGTATATTGTTGCCTAAATCTTCTTGTACTAAGTTATGTTAACCAAAAAAGTATACTATACAGGGGAGCATGAATTCTAGCTCAAGAGAGCAGATGGTTAACATTGTGCAGCGCCACTTTGCTTCACATGTACAGTTTCTCTTTGCGAATCTCTCTTTATATGACACTCAAAAGCGGGCAGAGATCATTACAATTACTAATATTTTGATTCATCTTGACATTTCAGCAAGTTGACGAAGTACAAGTGATTGCGGAATTCATTCGTGCTGCCAAGACACTGAGGAGTGGCAACAGAAGTAGGGAGTGAAAAAAAAATGAAGATAATTCAGGTGTTGTTGATCAGAGAAGAAGCTCTATGTAATTATATTATATATATATACATAAATCGTAGCCTAACTTTTTAGATGGGAACTCTAACTAAGACATGGTTTTGGAAGAGGGTTCATTTTACCTCAGCTGGCTAGAACTCGCCTCGCCCTCCACTCGGATTCTAACCTTGTAATCTCAAATCTGGTGTGTAGATTAGAAGGCCCGGTAATATTTATAACCTAAGTTCTCTCTGTTATATATATATTCCAGTTCTTGTGAATATATTTGCAGGTTTGGG
CDS Sequence
- >BVRB_5g100300
ATGATTGAATCAGAGTTATGTGCATCTCGGGTGATGTCACCATTTAGAGAAGAAAGTGGTGATGAAGAACTTTCAGTTTTACCAAGGCATACAAAAGTTATTGTGACTGGAAATAATAGAACTAAATCCGTTTTAGTGGGATTGCAAGGTGTTGTTAAGAAGGCTGTTGGTCTTGGTGGTTGGCATTGGCTGGTTTTGAAGAATGGGATTGAGGTTAAGCTACAACGGAATGCACTGAGTGTGCTAGAACCACCTACGGGACACGAGGAAGATGATGAGCTTGATCACTCTAGCTGCAGCTCTGATCTTGGTGAGAAGGACCATGAATTTGGGAATAGCATGGAGTTTCACAAAGTGAGCAAGCCAAGAGTGCGCCATACTAGACCATGGGCTCCTCCATCTGCTTCAGCAAAGTCAAATCATCGGAATTGCTTGAAGGAACTGCACTCCAACATTCATACCTCTCACTGTAGGCTGAACTTTGCTAAGCTTGGCAGTGACTCACTATGGAGGTATTTGAGCCGATTTCATCTGGGGAGCATGAATTCTAGCTCAAGAGAGCAGATGGTTAACATTGTGCAGCGCCACTTTGCTTCACATCAAGTTGACGAAGTACAAGTGATTGCGGAATTCATTCGTGCTGCCAAGACACTGAGGAGTGGCAACAGAAGTAGGGAGTGA
Protein Sequence
- >BVRB_5g100300
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