Information report for BVRB_4g095150
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a low molecular weight nuclear WDR protein which displays functional homology to the Swd2 protein, an essential subunit of the yeast histone methylation COMPASS complex. APRF1 acts upstream of FLC and promotes flowering under long day conditions.
Homologous
- Actinidia chinensis: CEY00_Acc30606
- Citrullus lanatus: Cla97C10G196710
- Cucumis melo: MELO3C009987
- Cucumis sativus: CsGy3G037710
- Glycine max: Glyma.19G063300
- Gossypium hirsutum: Gohir.D10G086800, Gohir.A10G102600
- Juglans regia: Jr01_04920
- Manihot esculenta: MANES_17G112900
- Medicago truncatula: Medtr6g007797
- Musa acuminata: Ma04_g11280
- Populus trichocarpa: POPTR_001G345900v3, POPTR_017G071900v3
- Prunus persica: PRUPE_3G290600
- Rosa chinensis: RchiOBHm_Chr2g0172941
- Vitis vinifera: VIT_14s0066g00720
Gene Resources
- Pfam: PF00400
- UniProt: A0A0J8BA38
- RefSeq: XP_010694709.1
- EMBL: KQ090265
- AlphaFoldDB: A0A0J8BA38
- KEGG: bvg:104907473
- OMA: HNEGYIR
- InterPro: IPR001680 , IPR015943 , IPR019775 , IPR020472 , IPR036322 , IPR037867
- PANTHER: PTHR19861 , PTHR19861:SF9
- SUPFAM: SSF50978
- PROSITE: PS00678 , PS50082 , PS50294
- Gene3D: 2.130.10.10
- OrthoDB: A0A0J8BA38
- eggNOG: KOG1446
Sequences
gDNA Sequence
- >BVRB_4g095150
TAAAAACAAAAAGTATATTAGTGCAGCGGTTGGACTACTCTAAACAGTGATTAGGTTTCTCATACTCACTGTTTGTCGATCTTAGTTCACATGCTACAATACTAGGTATACTGTATACAATCATATTGGCATGTAATGTACATGTGTCCACTTCCGGCAATTTCTATAGTTACCTCTAACCAGGTTCTTGACCATACTATTAGATTTTTTTGTAATGCTCTGGACTGTCTAAGGCATAACTTGACCTATACGCCCATGCTATTAGCAGTCAGTGGGAAAGTAGTTGCAGCATCAGCATCCTTGGTATTGGATTCCCCAGTGATCTTCTCATGGTTAGGTATCCAGAAGGTGAGAACACTAGAAGCTGCCACAAACATTACTCGTCGTGGTGCCCATTTCAGGCAGGATGGAACACCAATCTGACTACTCCACCGTGCTACCTGGCAGAGAAAGAAAGTATGCCCTTAATTTGATGAGTCTTGAGCAATCCATATGTGGGTTAAAACACAGCAGATAGTAATTTTAGCAAAGAAGAATTAAGATAAGTTGATAACTACAGACTACAGGCACAGAATTGCACCGAGAAATTGGTCGTGAGACCTGACTTATTTTTTCCCACTGTCGCGACCTCAACATGATATGATTTCAGAACTCAAACCGCTCAACAGTAAAAAGCCCTGCAGGATGATCATGTACATAATTGCTGCTACAACAGGCTTCAGTTCCTTTACCAGCTTAAATTGGGATACTACTAGAGTAGTAGTAATAGGGTAGAAGAAACGTATATATTGGATAACAAAGTGTACGGGTTTCTTCTGCTTTTTTTTCGTTAGAAAGGTATCCAATAGTGAGCACTGGACAGCAATAAGATCTTTCTGAGTTCTGCATCGTCAACGTGCTCAGGAAGGGAATGGACAGTATAAAGATGGATGTTAATTTGGTATGATCAGTGTCGAAATGAAGAACTATTCCCAACAGAAGTTTGGTACTTTTTTCGAACAAAACCAAGCAAAAGTCAAACTATTACAGCAAGATACATCAACTAGAATCAAAAGTCAAAATGCTCAGCTATTTTGTCATCAAAATTAGAACCGGACAATGTCATTACTGGCGAACCTACGGTATAGCATCAGAGATGAATAAGATAATTTACATATTTGATGATCAGTCTTCTAAATACCACGGATTCCAGATAGTGAGGATCGTCAAGAAGAATAATCTTCTGGAGGAATTCATTATATTTCAACAACAAATTAACTGAACACGTAAAGGGTTTTACTAATTTACTACATTAAAGTGAGGTGGTCTCATCTGACAAAAAAAAAGAGATTGAATTGAAAGTTCAGAACTGCAGCTACACAGCAATTGGAACTGCAGATATTTAGTTTTCAAGAAACTTTAAGCGGTTGGCTTCCCAAGAATTATCTGGAGCCTACCAAAGAGGAGGCTCAAATGTATCGAAATTAGTGGGATCCCTATTCTTACGGAAACATCAAATTCTTGAGAAAATGGCAAACTAATTGGAAGATAGTCAAACTGAAGGTCACTTGAACACGATATTGCTACTAGATCCTGTACTGTTACATCTACCAAAGTTTACACTTCCATTAATTTCAAAGTGGTGCTCCAAAGCCTGCTTTTAAACCCCATTTTTTAACAGCTCACTCCGTTAAGTTCGCCACCAAATACAAGCGCAGGCAGGAGCTCATTTACAAGCAAAATCCAAACAATGGAGCCGTTGCACATTCAAGTATGCAAATCAAGGTTCCAAAAGTTACATCATCATAAATGAAGATGATGCATTTAAACAAGAAACTAAGAGTATCCATACACCATGATCGGAAAATAAGATTGTGATGTCAATCTTTAATTTGGGGCCCTTAACCATGAGTAGAACAAAGATTATGAGATGATTGAGGAAGTTTCGAGGTATGATTCGAGTGGAATAAAGATCAGGCGTGAGTGCCCCCGCATCGTCTAATTTGGCGAGCTTTAATTTTTTCGGAAAGAAAAAATTAAAGTACGTGTGTCAGCGCCAAGTGCAGGATGCACTTGTTTTATAGGGGAGATAATTAATTATTGTTAATTTTGCAAAGGTTCAACTTTAAAAAATACAAAGTAAAAAAAAAAACCAATAACTCTATTTTTTCGAGCTCTACAAATAGAGATCCATTTTGCAATATTATACACTACTTTTCTCTATCTTCACTAATTTTTCCAATTGTTTTATTTCAATACTCTTCCATTGCTCTTTTTTAAAATCACCATAATTATGGATTCTAGTAATCCTAATTATGGAATAAATCAAAACCAAAACTGCTAAAAAGCCAAATGCCTAGACAACGAAATCATCGAAACACCTCTCAAAATCACTCAAATTATCACCCGCCATCTCAGATAATCACGAATCAAAGGAGTGAAAATTCTCAAAATTATTCTCCTCGATATGATAATTTTAACATGAAGTTTCATATCGAAATGTCAACCTTTCATATCAATATGATTATGATTACGGATTTTCTCAATACCTAAAAGAATCATCTCCAAACCATGTGGCGATGGTGATGATGAAGATGGTCCATACCAAGAAGATGATGATGATGAATATGAAAAGTTATGTTCGGCCAACTCAATCCTTTTCACAATTACTATCAACTTTCTCTTTGTGAGCCACCACTTTCCTTGCAGCCGCCACCCACTCAATCACAAATCCACCTCCTCCAAAAACAAATTGTAGTGTTGAAGGGTTTGGGATCTAGTTGAAGTTGATGGTGATGATAAAGATGGCCAATGCCAAGAAGATGAGGATTATACAAAGTTTATTCACCCAACTCAATCCTTTTTACAATTACTATCACCTTCTCTATGTCAGCCACCACCTCCCTCAAAACCACCACTCACTCAATCACAAATACCACGACCTCTAGAAACAGATTGTAGCAACAAAAGGGTTTGGGGTTGAGTTGAAGATGAAAATCTTATCACAGCAATTATGTAAACTTCACTTAATAAGGTGGTTGGAACGAGTCAAAAGAAATGCGTCTTTTGGGGAAATGTTTGGGATGCGTTCGAGGCTGCAAGAAGAGCCAACCTAACATATATAGCTCCAAGAAATGCAGATATGGTGAAAGGTAGTTAGAGTAGAGTTGCTCCACTGGTTTTTTAAGGTGGGTTGCAATTTATGATGAAGCTCTTGGAAGGAAGAGAGTGGTCAAAACGATTATGACATTCTTCGAGAAGCTTATTTATTGCATAATAGGAAACATGGTAGGTTCCTCTCGAGCATGCTTGGAAAATGTTGAAAAAATTTCCTAAATAAAGAGAGTCATAATTAAGAAGTCATTGGAAAATCCACATGGTTGTCCCATGCTCCAGAAGAAAATGTACATTCACCTGGAATCAAGACTAGCGATAAAAGGTCGAAAGTTGATGGAAGTGACTCAATATCTGACAAACCTACAAGTAGTGAAGGACGTGAAGTGGAATGGTGTGAAGAAGGCAAAGGCAGGGGTGACTGGTGAAACAATTGAGTCTTTAAACTTATTTAATGAGAGACTTCGGTTCCATTCATAGTCTAAGAGTGGAGATTCTAGAAGAAAATGTGGATTCACTTGGAAGTAGGAGTAGCGGTGAAAGGCCGAATGTTGATGGAAATGACTGAATGTCAGCATACCTACCAGGACATGAAGTGGAAAAACGACCCGATAATGTGAAGAAGGCAAAGGGGGGTGGCTGATGAAACAATTGAGTGTTTCAACTTTTAGCTCATATAATGAGAGACTTCGGCTCCATTGGAGATTGAAGGAGTGGAGATGTTGAAAGAGAAAAGGAGAGGTTGGAGGTCCAAAAACAATAGGTGACTCTAAAGAAACAACAAATAGAGTTACCAAAACAATTGGGACTTAAATAAACATTAGGAGTTCCCCTCAAAAAAAATAAAAAATAAACATTAGGAGTGTAAATGAGACGAGACAAATCGCGAGCTAATCGAGACCAATTCAATCAAAACTCGGTCAAAACTCGACTCGAGTGAGCTCGAATCGAACTCGAGATGCTGGCGAGTCTGGTTAAGCAACTCGATAATCGACTCGAAAACTCGTGAGAAGCTCGAATTTGATAGTGTTAAAATACGATCGTTCCGTTCGGTTTGGCTGCATTGTAACGCTTCCCCAAGTTGTCGAACTGATATTCACCGGTTCATACTGCCTCATTATTTTAGTCCGCGATATAGGACGATACGACTGTGTATCTTCTGTTATCCATCGCATCGACCTTGATTCGCCCATATTCCACCGCATCGAGCATCACCCTTGAGTTACCACACCAGGGAACAAAAACTCGGTCGTTCCGTTCTGGAACGGCCGCTTTGTAACGGATTTCAGAGAGGTCGTTCCGTTAAATACCGTTCTAGAACGGTGATTTGGAATTCACACCAAACTCGGCGCGATGGCGTTACGTAACGGTGTAACGGCGTTCCAGAACCATTACAATCACGTAACGTCCGTTATTTGAAGAAGTCCAGTTCTTTTGGTGGAGGAAGAAGAAGAGCCAATGCAAGATCTATAGATCTGAGTTAAAATTTGAAAATAAAGCATTTTTTTTATTTAAATTAAAGCTTACCGAGGATGTAGAACTCAAATCCGAGTAAAACCCCTCCTTTAATTTCATTAGATTACTGCGAATCGAACCCTAAATTGCAAACCCTAATTTCGAAAAAACCCTAATATGCATTGGAATGCAACGCTGCTTCTCCGGTCATGGCAGAGTAGGTCGACGAGTCATCTTCGGCTGCTTCTAGCACTGTAGCTGCCGGTGGTTGGCTTGTTTGCAGGTTAGTGCTTGTTGGTTTTCTTTCTCTTATATCGATCGTCTTCTTTTCTCTCTCTTCTTTTCTCTCCTCTTTTTCTTTTTTATTTTGTGACTGCCAGTCACGTGATAATTGCAACTCATAAAGTATCTCTTTCTCTCTCTTCTTTTCATCATTTTTATTTTTTCTTTCC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CDS Sequence
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ATGGGGATGATGTCATTAACGGAGCTTGATGACGACACAGTGCGTAGCATGTCAATTGGCGCCGTCTTCTCCGATTTTCAGGGTGAGAAGATAAATTCAATTGATTTCCACCGGACAAGTGATCTGTTGGTCACAGCAAGTGCTGATGATTCAGTTCGGCTTTATGACATTGTCAATGCCAAACTTCTGAAGACCACATACCATAAGAAACATGGTGCTGATCGTATATGCTTCACCCACCACACTAGCTCGGTGGTTTGTTCTTCAAAGTATAACATTGATTCAACCGGAGAATCCCTAAGATATCTTTCCATGTATGATAATCGCTGTCTTCGCTACTTCAAAGGCCATACAGAAAGAGTTGTTTCCTTGTGCATGTCACCAATCAATGATAGTTTTATGTCTGGTTCCCTTGACCACAGTGTAAGAATATGGGATCTTCGAGTAAATGCCTGCCAGGGGATTTTACGTTTGCGTGGAAGACCAGCAGTTGCATATGACCAGCAAGGTCTTGTTTTTGCAGTTGCTATGGAAGGAGGTGCTATTAAATTGTTTGATTCACGCTCTTATGACAAGGGTCCTTTCGATACCTTTTTAGTTGGTGGAGATAATGCGGAAGTCTGTGATATAAAATTCAGTAATGACGGAAAATCAATGCTCTTGACAACCACGAATAACAACGTTTATGTTCTTGATGCATATGCTGGAGAGAAGCGTTGTGGATTTAGCTTAGAGCCTTCAAGTAACACTACAATAGAAGCGACATTCACTCCTGATGGGCAGTATGTTGTTGCAGGTTCAGCTGATGGAAGCATGCATGCTTGGAACATTAACATGCGAAGTGAGGTAGCACGGTGGAGTAGTCAGATTGGTGTTCCATCCTGCCTGAAATGGGCACCACGACGAGTAATGTTTGTGGCAGCTTCTAGTGTTCTCACCTTCTGGATACCTAACCATGAGAAGATCACTGGGGAATCCAATACCAAGGATGCTGATGCTGCAACTACTTTCCCACTGACTGCTAATAGCATGGGCGTATAG
Protein Sequence
- >BVRB_4g095150
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