Information report for BVRB_4g095150
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a low molecular weight nuclear WDR protein which displays functional homology to the Swd2 protein, an essential subunit of the yeast histone methylation COMPASS complex. APRF1 acts upstream of FLC and promotes flowering under long day conditions.
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT5G14530
Gene Resources
- Pfam: PF00400
- UniProt: A0A0J8BA38
- RefSeq: XP_010694709.1
- EMBL: KQ090265
- AlphaFoldDB: A0A0J8BA38
- KEGG: bvg:104907473
- OMA: HNEGYIR
- InterPro: IPR001680 , IPR015943 , IPR019775 , IPR020472 , IPR036322 , IPR037867
- PANTHER: PTHR19861 , PTHR19861:SF9
- SUPFAM: SSF50978
- PROSITE: PS00678 , PS50082 , PS50294
- Gene3D: 2.130.10.10
- OrthoDB: A0A0J8BA38
- eggNOG: KOG1446
Sequences
gDNA Sequence
- >BVRB_4g095150
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CDS Sequence
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ATGGGGATGATGTCATTAACGGAGCTTGATGACGACACAGTGCGTAGCATGTCAATTGGCGCCGTCTTCTCCGATTTTCAGGGTGAGAAGATAAATTCAATTGATTTCCACCGGACAAGTGATCTGTTGGTCACAGCAAGTGCTGATGATTCAGTTCGGCTTTATGACATTGTCAATGCCAAACTTCTGAAGACCACATACCATAAGAAACATGGTGCTGATCGTATATGCTTCACCCACCACACTAGCTCGGTGGTTTGTTCTTCAAAGTATAACATTGATTCAACCGGAGAATCCCTAAGATATCTTTCCATGTATGATAATCGCTGTCTTCGCTACTTCAAAGGCCATACAGAAAGAGTTGTTTCCTTGTGCATGTCACCAATCAATGATAGTTTTATGTCTGGTTCCCTTGACCACAGTGTAAGAATATGGGATCTTCGAGTAAATGCCTGCCAGGGGATTTTACGTTTGCGTGGAAGACCAGCAGTTGCATATGACCAGCAAGGTCTTGTTTTTGCAGTTGCTATGGAAGGAGGTGCTATTAAATTGTTTGATTCACGCTCTTATGACAAGGGTCCTTTCGATACCTTTTTAGTTGGTGGAGATAATGCGGAAGTCTGTGATATAAAATTCAGTAATGACGGAAAATCAATGCTCTTGACAACCACGAATAACAACGTTTATGTTCTTGATGCATATGCTGGAGAGAAGCGTTGTGGATTTAGCTTAGAGCCTTCAAGTAACACTACAATAGAAGCGACATTCACTCCTGATGGGCAGTATGTTGTTGCAGGTTCAGCTGATGGAAGCATGCATGCTTGGAACATTAACATGCGAAGTGAGGTAGCACGGTGGAGTAGTCAGATTGGTGTTCCATCCTGCCTGAAATGGGCACCACGACGAGTAATGTTTGTGGCAGCTTCTAGTGTTCTCACCTTCTGGATACCTAACCATGAGAAGATCACTGGGGAATCCAATACCAAGGATGCTGATGCTGCAACTACTTTCCCACTGACTGCTAATAGCATGGGCGTATAG
Protein Sequence
- >BVRB_4g095150
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