Information report for BVRB_4g079020
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes gibberellin 20-oxidase that is involved in the later steps of the gibberellin biosynthetic pathway. Regulated by a circadian clock. Weak expression response to far red light.
Homologous
- Actinidia chinensis: CEY00_Acc08030
- Gossypium hirsutum: Gohir.A09G004600, Gohir.D09G004100
- Juglans regia: Jr01_14050, Jr10_09270, Jr06_03150
- Manihot esculenta: MANES_13G085900, MANES_12G157700
- Medicago truncatula: Medtr3g096500
- Populus trichocarpa: POPTR_005G065400v3, POPTR_007G103800v3
- Vitis vinifera: VIT_18s0001g01390, VIT_04s0044g01650
Gene Resources
- Pfam: PF14226
Sequences
gDNA Sequence
- >BVRB_4g079020
TTGAACATTGTAATGAAGTCTAGAGTTTTAAGTACTTAGCACTTCCTATCACAAAAAATAAAGACTTACATATATAGTTTGATCATATATATTATGTCTTCACCATGCATTATGAACACAAATGAGAGCATAGTTTTTGATCCATCAATAATGCAAAACCAACCTAAATTACCAAAAGAGTTCATTTGGTCCAAAGATCCCGGGTTCAACTCAATAAAAGCCAACCTACAAGAAAACCATGATGTGCTCGATGAGCCACTAATTGACCTAGAGGGCTTCTTTAGGGGTGATGAAGAGGCCACTAAACATGCTGCTGAGTTGATCAATGAGGCATGTTTAGCTCATGGGTTCTTCCAAGTCACGAACCATCGGATCGACTCGAGCCTCCTCAGAGCCGCCCATGACCAAATGGATGGGCTATTTAAGTTGCCAATGGAAAAGAAGTTAAGGGTTCAGAGGAGCAATGGAGATATGTGGGGTTACTCTGGTGCCCATGCTCATAGATTCTCTAAACAACTTCCTTGGAAAGAGACCTTCTCTTTTGGGTATAATTACCTTGATGGTGAAGGGAGCATGAGCTCTCATAAGCCTCTTGTGTTAGACTATATCAAATCTTCCTTTGGAGAGGAATTTGAATTAACTGGGTAAGTTTATTAAATTATCATGTTGACTTAAAAACCTACGAACAATTTCTCTTAAAGTAAAACTGTTTAGTTCCTCTTATAAACATTCTGACTGATTAAAGGTAAAACTGCATACAAAAGATCATCGTAATCATTTTAAATAACTTTAAAGTATATTATTTTACTGACTTTTGGCTCTTTCATATAGTCAAACGACCAAAATTATTTGACAAATGATTGTCAAAAGTTAAAAAAAAGTAAGTTTTACTAGGTTTATGGTGAATTTTACAAGTAAATCAGCTAAGTAAAAGGGTAACAATCAATTGTCAAATACCTCTAAAACATGACTAATATAACTTTGCACTATATGTATGTACTTATTAGGTGGGTGTATGAAAGATATTGTGAAGCAATGAAGGATCTCTCTCTAGTGATCTTTGAGCTCTTGGGTATAGGCTTGGGAGTAGAGAGACAATACTTCAGGCAATTCTACAAAGATGGAAACGCACTTTTGAGATGCAATTCTTACCCACCATGCAAAGAACCAAGCCTAACCTTTGGCACAGGCCCTCATTGTGATCCAACCTCTTTGACCATTCTACATCAAGATCAAGTTGGTGGGCTTGAAGTCTTTACAAACAACAAATGGCAAGCTGTACGTCCCAGACAAGATGCTTTGGTCATTAACATAGGAGACACTTTCATGGTAATTTATATAAATTAATGCACATGCATCTTAATAATTTTCTTATAGTAGTACTACTTTAGAGAATTATGATCTTCAACTATTTTTGTTGCAAAAAAGTATTGATATCTTAAAGCAATTTGGACCACGATATAGTATTTTGGACTCACATCAAAAAGATTTTTTAAGAGATAAATAGGTAGGCCATATATATCAAGATTTGGATCAATAATAATAATAATCAATGTCAGATTCAAGTTCTTATCCAAAAAATAAATAAAATCGTAGTACTCCAAATTTATTTTATGGGTGATTTTTGTTTTATGGTTTTGAGATGATGAAAACTAGCTTATGATAGGCTAATACGCTTAATTAATATATTCTCTCTTAGTTTATATTACCTCTCTCTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTCCTCTCCCTTTTTTCACTTTTTACTTAGTCGAAGTGAAAAAGTAAATGTTTCTATTTTGAAAATGGATGGAGTGTAATGTATTACAAAAAAGTGAATAACAAATTATTTCATACTATTTTCACCTCTTTATTAGTTTTCTTTTAGAAAAAAATACTAGATTAATTAGGTTATACTACCTCTTTTTCTGTAGAAGAAAAACAAAGAAAGTATATAATTAGTAATAGTATTTAGACCTCGGCTAAGAAACACACAAATTGACTACTGGCCAAATCGAAGTAAACAATTAAATAAAAACACCGTTTTATTGCTTTTATTGAGAATACTTACAAATCTATAAAAACTGTTACAAATAAAATTCAAATTTTATATAGTTCTTCTTCCACATCAAGATATAATCATCTTCTTATTATATGTGCTTCCAAGTCTTTTCTTTGTCTTTTTATTGATGGGAATAGTACTTCTAAGTTCTAATTTAGAATAAAACAAAGACAAGAAAAACATACAGTTGTATTATTAATTATAAAGTTTATGCATGCACCAAACAAATAATCAAATTCTTGGATGGGAACGTTACGTTGATGCTATCTTTGATTGATTATTTTGTCCTTTGTTATCTTTATTTTACTTATTAGTTTTTCAACTTTTTGGTGATAGAATCTAATTAAATCATTTTTAAAAAAGTTTCAATTTTTTCACATAACATAATGATTGTCGTTTTCCAATTACAAGAGTTGCATAATTCATACGGTTATAAGCATTTTAAGTTTATTATAACAATAAATAAATATGACCGATATCGAATAATCAAGGAAATAGTATACTAGAAATCTAATATACTACATTATTTTAATAGTCTATTATTACTCGTTTCTTTTTGTTGCCATGATCAACAAAATATGAAATGCGCATTTATACCTCAATTACTAATATTGTACTCTGACCATGGGCGGATCTAGAGGGGGTACAAGAGGTACAGCTGTACCCCCATTATTTCTGGAAAATAATGAAAACAAATCAATAAGTTGAGGTTTGTCTTGTTGGTAGCAGAAGGGAAAAGAAAGATTAATGAATTTATGAGGAGGTCTCAAGTTCAAAACCCCACAAAGTTCTTGTTATGCTTTAGCAATTATATCTAAGTTCTTACTTAAACTTAAGGAGAAAAAAAAATTCTCATTTATATACTTAAACAACTGTTTTTGAATTGAACAACTTATTTTTAGAGATCTGGTTATTTAAATTGAAACATTGAACACTTAAATAGTTAGCAATTATATCTAAGTTCTTACTTAAACTTAGGGAGAAAAAAATGTTAATAAAGCTTTATTTTGAAAAAAAAAAATTAACGAGTCTAACTACTTACGTTTTCGTACCCCCATGAGTAAATTCCTAGATACGCCACTGACTCTGACCCATGCATCATATATTCATATTCATGCATGTGTGATGATGTGTGTAGGCATTGTCAAATGGGAGATATAAGAGTTGCTTGCATAGGGCAGTGGTAAACAAGAAGAAAGAGAGAAGATCATTGGCTTTCTTTGTGAGTCCAAAAGAAGACAAAGTGGTGAGAGCCCCACAGGATCTTATTGACAGAGAAGAAGGGACAAAGAGTAGGAGATACCCTGATTTTAAATGGCCACATTTCTTGGAATTTACACAAAAACATTACAGAGCTGATGTTACTACCCTCCAAAACTTTGTCCAGTGGCTTCCCTCTTCCAATATGACCTAACCATCACCTTTCTATTCTTGCTCTTCCTTTTTTTTTAGCTCTTCCTACCTAGTTCACAAAATAAGAATACTAGTAAGAAATAAGAAATAAAGTAATAACTATTTTCTCTAGCTACTTAATTCCTTCTCTTTTGTTCATGTTCTTTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTCTTGAGGGGTGTTTGTGTTCCTTTGTTTGTCCTCTTTTTCATAATAAATTTTGGTTTATATT
CDS Sequence
- >BVRB_4g079020
ATGCAAAACCAACCTAAATTACCAAAAGAGTTCATTTGGTCCAAAGATCCCGGGTTCAACTCAATAAAAGCCAACCTACAAGAAAACCATGATGTGCTCGATGAGCCACTAATTGACCTAGAGGGCTTCTTTAGGGGTGATGAAGAGGCCACTAAACATGCTGCTGAGTTGATCAATGAGGCATGTTTAGCTCATGGGTTCTTCCAAGTCACGAACCATCGGATCGACTCGAGCCTCCTCAGAGCCGCCCATGACCAAATGGATGGGCTATTTAAGTTGCCAATGGAAAAGAAGTTAAGGGTTCAGAGGAGCAATGGAGATATGTGGGGTTACTCTGGTGCCCATGCTCATAGATTCTCTAAACAACTTCCTTGGAAAGAGACCTTCTCTTTTGGGTATAATTACCTTGATGGTGAAGGGAGCATGAGCTCTCATAAGCCTCTTGTGTTAGACTATATCAAATCTTCCTTTGGAGAGGAATTTGAATTAACTGGGTGGGTGTATGAAAGATATTGTGAAGCAATGAAGGATCTCTCTCTAGTGATCTTTGAGCTCTTGGGTATAGGCTTGGGAGTAGAGAGACAATACTTCAGGCAATTCTACAAAGATGGAAACGCACTTTTGAGATGCAATTCTTACCCACCATGCAAAGAACCAAGCCTAACCTTTGGCACAGGCCCTCATTGTGATCCAACCTCTTTGACCATTCTACATCAAGATCAAGTTGGTGGGCTTGAAGTCTTTACAAACAACAAATGGCAAGCTGTACGTCCCAGACAAGATGCTTTGGTCATTAACATAGGAGACACTTTCATGGCATTGTCAAATGGGAGATATAAGAGTTGCTTGCATAGGGCAGTGGTAAACAAGAAGAAAGAGAGAAGATCATTGGCTTTCTTTGTGAGTCCAAAAGAAGACAAAGTGGTGAGAGCCCCACAGGATCTTATTGACAGAGAAGAAGGGACAAAGAGTAGGAGATACCCTGATTTTAAATGGCCACATTTCTTGGAATTTACACAAAAACATTACAGAGCTGATGTTACTACCCTCCAAAACTTTGTCCAGTGGCTTCCCTCTTCCAATATGACCTAA
Protein Sequence
- >BVRB_4g079020
MQNQPKLPKEFIWSKDPGFNSIKANLQENHDVLDEPLIDLEGFFRGDEEATKHAAELINEACLAHGFFQVTNHRIDSSLLRAAHDQMDGLFKLPMEKKLRVQRSNGDMWGYSGAHAHRFSKQLPWKETFSFGYNYLDGEGSMSSHKPLVLDYIKSSFGEEFELTGWVYERYCEAMKDLSLVIFELLGIGLGVERQYFRQFYKDGNALLRCNSYPPCKEPSLTFGTGPHCDPTSLTILHQDQVGGLEVFTNNKWQAVRPRQDALVINIGDTFMALSNGRYKSCLHRAVVNKKKERRSLAFFVSPKEDKVVRAPQDLIDREEGTKSRRYPDFKWPHFLEFTQKHYRADVTTLQNFVQWLPSSNMT