Information report for BVRB_2g046860
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- Dof-type zinc finger domain-containing protein, identical to H-protein promoter binding factor-2a GI:3386546 from (Arabidopsis thaliana). Interacts with LKP2 and FKF1, but its overexpression does not change flowering time under short or long day conditions.
Homologous
- Citrus sinensis: orange1.1g011016m
- Populus trichocarpa: Potri.017G084600.1, POPTR_017G084600v3, Potri.004G121800.1, POPTR_004G121800v3
- Prunus avium: Pav_sc0000484.1_g730.1.mk
- Prunus mume: XP_008230778.1
- Prunus persica: Prupe.3G266200.1.p, PRUPE_3G266200
- Pyrus bretschneideri: Pbr019278.1
- Ricinus communis: 28838.m000250
- Vitis vinifera: VIT_14s0108g00980
Gene Resources
- Pfam: PF02701
Sequences
gDNA Sequence
- >BVRB_2g046860
ATCCTTTGGCAAGACTTGACATGAAAAAATGTTACCATATCCAAACATTAAATCATAATCCAGCAGACTATCTTTCATTTTTGGGCATTCACAAATCAGACTCTTACAGTTTACTAAACTAAACTACAAGTAGTAGTTTCAAAATTCGTATTCCTCTTTCTCTCTTTCTCCCTGTCGGACACACACAACACAAACACACCTTCACCTCCCTCACCAAAGCGGAGGGTGTCAGATCTCTCCAAACCGAAATTTCAGCAACTTTCAGATTCTTTTTTTTTGCACACACACTTTTTCTTTTCTTTTCTCTTCCTTTTCACAAATCCCGGAATTTCAGATAAATATCATTAATAACAACAACAACAACAACAATAATAAAAATGGCGGACCCTGCAATAAAACTCTTTGGCAAAACCATTCCATTGCAAGATAATGATAATGATAATGATGATCATTCCATTCCCTCGGATTCCACGAATACAGAGGATCATATTTCTAAAGATACAGTTTTTGAGGAGAGAGAAAATCATAAGGTAATCATTGTGTTTGCAATTGAATTACATTTGCTTCACTTTTTTCTTTTTTGTGTTCGTCATGATTTTTGAATGTTGTTGAGAAAGTTTCATGGTTATTAAATTTCAAATTTTTTAATTAGGGTTTTAATTATTTATTGGATTATTAGCTGGGTTTTTTTTTTTTTTTGATGAATGTGTTTATTTTATTATTGGAGGTAGAGGGTGGGTGAGGTTTTGGTATGAACTTTGGGTTATAATTAGTGGATTATTTTTATATTTCTTTTGGGTATTAGAATTTTACAACAATATGGGAAGATTTATTTTATGTGATGTCAATAAAAGTTCCTTGTGATTTCTGCAATTTTTCTGATGAATTTTGAAGGTGGGTTTATTCATGATTCTTCTGTAGTTGTTTCCTTTGTTGGTTCTACAGTCTAGAGTTTGTCTCAACTAATGTGTACCTTTTTTGTATTAGAGATTGTTAAAGTGAACTGCTTGATTGAGTCACTATACCTGAGAACAACGTCTAGCATTGAAGATTTTACCATGGAAACAGTTCATTGATTTCCTTGTGATTAGGGATTTCCGCGTTGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGGGGAGTTGATAACGAATTTCGACTATTAAGGTTTGGGCTCTTGGAAAACTTATTGATCAATGGTGGAGGCAAAGACTTTTAAGAAGTGCTAAAACTCAAAAAGTGGTGATATGTTACATAAAGAGGGAGGGCTGCATCCTGCCTTACTATGATTCTTAAAATCAACCGTTCTTGAGGAATTTAGTGTTTATTGTCAGTTGTAAGTTTTAATGTTGATTAAAACATGGGTGGTGACTGGGTGCCTCTTAGTTTCCAAATTGTTGTGTTACCCCCATCTAGCCCTATGTCTTAGAGGGGAATACATTGTAGGTGTTGACGCAGATATGAGAGCGGGTTTTGGGATTGGCTGTAGACAAGGATTTTTCATAGATTCTAGTGGTTGAAGACGATACTATCTTTCCAGGTTGAAGTATTGTTTTATCGTTGTCAGAGCTGTGTGGTGACTTGGTGAGTGCTTGTTCAGTAAGGGGTACAAGTGTCTTAGACACATTATGTATGGATGTTATGGTTGTCTTGGTGGTAAATGATAAGCAGTGTATGTGCTGCTGATACATTTGGTGGAATCTGGTGTTAAATAGTTTGCACGAAAAATTGACTGCAGACATAGTAGTTATATTCACCGTCAGAGAAGCCTAGATGTAATAGGGTGGTGGACGTAGAGTAGTGTATCTATGTATAGTATGCAAAATGGTGAAATCCATGAACGTAGATTTAAAGCTGGAAGGGGAATGACTGGGTACTAAAATCATTGCAAGATTTAATTAACGTCTATTTCGATTCCACCTCAGTTACCATTATAGAGAAGATTTGTGTAACACAACTTTGTAGAACACATATTTTGTGAGTATCTACCTTAAAAATAATTGTTACCTTTTATGATTTTTGTTAGAAACGGAACCCCTCAACGGATTTCGGTGGTTGGACCAACTTTTCCTGTGCTGACTTTTTATCTTCCCTTGTTCTGGTCCTTTTCCTCGCAGTTTCCTGCACAGTTTCCCCCTGCTCACTTCTCTTCCTTCCACTCTAGCTTATCAGCAGTATTTCAAGCAGGCTGCCTTATTCTGGCTGAGTTTTCTGTATTGTTTATTTCTCAGTTAGATATTGCGGAACTGATTCGAGCTAGGCCACTGCAGCAATATAGCATTATTCTTCTCTTCACAGGAGAATCCACAATATGTTAGGGTGTGTCAATCCTGTTCATGTGAAGTAAACGAGAACTGAATCCCGATAAACCTTGAAACTGAATATAGTGAGTAAAAGAGTTCTTTTTTTTATAATTATAGTGAGTTGAGTTAAATCACCTTTTCTTTTGATTTGTATTCATTTCCTGTTTGTTTTAGTCTGGTTGGAGTTTTTTTTTAGCTAGTAGAGGTTTCTCTTTAAGGTATGTGCAACTGTATTGTATAGAAACTACCTGATTATTTTATGGAAAGACAGAAGAAATCTTTGGTCTCAACTGCTTATTAGAAAGATGAGAGATTATATACTAGGTATTCTGTTATGATGAAGTAGGATGATTAAAGAGAGAAGGAAGGTGTCATGGAGCAGTCCTGCGAAAAGGAGGTTGCTACGAATGAATACTGTAGAATTTACTAAGAAATCAAAGGGTTCATTTGTTAATTATTGGAAGTCTGAGCATATGGTGATATAATGTTTTTTCCCCTGATGTTCGTATTGTTTGTTGGTCATTTAGACTGATTACTGAAGAGAAACAGTTGGTATTGGTGCTTCACTAACATGGGGTCTTTTTTCGCCCAAATGAAACTCTGTTGGGCTTGTTTACCATGAGCATCTTTGATCAATTGGAACAAAAGAAACAACTAGATTATGCCATCATGATGGATTCTCTAAAAGTGAAATGTTCCCTAGCTATGGTAATGCATCACTTCTAAATTTCACCCTACTAGCATTTATTCTTTTTTTTCTTTATGTACCGTGTGTCCATATCCAAGCAATTACACTTTATGAATCTTTCTGAATGATTGACCTACTACAACATATCTAAAGAAATATTTTCACACCCAATGACTTAGAATTGAAGCAGTTATGTTAGATCAATTGTGTGATGAGATATTAAATTTAAGGTCTTCTACTAGTTTATTTAGGCTGAACAATTCCTGTGTAGATCCGGGGTGTTTCTGACGTTGCAAAATATCATCCGAGTTCGTTTTCTTATCTCAAAATGAGTTCACGTTCCATTGTATGTTTGATTTTTTTTGGTGAACATTTTGATACTCCCTTTATTAAAAAATTATAGTCCATTTAAGGTTTAGGCACACAGGTTCAATACCTACTACAAGGAGTTTAAATGCTATTACTTGACTGAATTACCCTTGAAAAGGCTGGAGGACAATAAGGAGTAAATGGTAATAACAGAGAAAGAAAAAAGCTGTATATCTGTAGTTGGAGAAGCTGCATTAAGCACTCCATTGTTTTCCTAAAATGTCTTGGTGGCTTATAAGTAACTCCCCCAAGGAGGAAAAAGGACCGCTAAAATTGACATGCATCATGTTATGAAGCTAATATTTGTTGATGGGTCCTAATATTTGTTCTTAAATTTTCATCAAATCAGGTTGACGAAGATGGGAATACATTGCAGACAAAACAAAATGGAGTGTCACCTGAGGTTTCAGATAAGAGTATTTGTCAAGATGCGTCATTAGTAACCCCCGATATTCCAGAGGCATTATCTAATGTTGATGAAAAGGAAGCAGGGGAATCATCAAAGTCAGAAGAAGAAAAGGCTGAGACAAGTCCTTCCCAAGAGAAAACTCCAAAGAAACCTGATAAGATACTTCCATGCCCACGGTGTAATAGTATGGACACCAAGTTCTGTTACTACAACAATTACAATGTCAACCAGCCTCGACACTTTTGCAAAAATTGCCAAAGATATTGGACCGCTGGTGGTACAATGAGGAATGTGCCTGTTGGTGCTGGCCGCCGCAAGAACAAGAACTCAGCCTCTCATTACCGGAACATCACCATCCCAGAAGCACTCCAGAATGCTCGGACTGAAATTCCTAATGGGTTGCACCCTGCACTGCCAAATAATGGCATGGTCCTCACATTCAGCTCAGATTCACCCCTTTGTGAATCTATGGCCTCAATATTGAACCTTGCAGAGAAACCAGTGAGGAACTGCCCACCTAATGCATTCCAAAAACCAGAGGATTTGAAAGTTTCCATTCCCTTTGCAGGCTTGGAAAGTGGAGTTAACCATGATGATGGATCAAATTCAAAGGATGATGCTAGCAAATCAGCAGCACCAAATGAGCCAGCAGCTCAAAATTGCCTTCCCTTCCCAGCTCAAATTCCATGCTACCCCGGGGCACCCTGGCCTTATCCTTGGAACTCCACTCAATGGAGCCCACCAGTAGCAGCTCCACCCTTCTGCCCCAATGGCTTTGCCATGCCTTTTTATCCCGCACCTGCTTACTGGGGCTGTGCTGTACCAGGAGCATGGAATATTCCCTGGATTGCCCAACCATCTCCTCCGAGTAATTCAAATCCAAGCTCTGCCCCAACCTCTCCTTTGGGAAAGCATTCACGAGATGGCAATATGCTCACTTCGACCAACTCCGAGGATAAAGAGGTGGAGGAGAACAGTTCCGAGAGATCTCTTTGGATACCGAAAACCTTGAGAATTGATGATCCAGGAGAAGCTGCAAAGAGCTCTATTTGGAGTACCTTGGGGATCAAGAATAACGAGAAACCGGAATCTATAGGTCGGGGTTTTGGACTTTTTAAGGCATTCCAGTCAAAGCGTGAAGGGAATACTCGCATGGAGACCTCTCCAGTTCTGGAAGCAAATCCAGCAGCCTTATCTAGGTCACAAAATTTTCAAGAGAACACATGACGACCCAATTTGTGTTGGGTCATTTTCTCTCTTCTTATGGAACAAGAAGGTTTGCCTTAACATCTAATCATTTGACTAGAACTAATGATCGAGGATTTCTTGATGGCTTTACTATGAGGGTAGTTTCGCAACTCACTTGGAAAAGAGGCAAGCCATGTTCTTCTTTTGCCTTGGCTGGCTCCTTAAGATTACTGAGACGAAAACTAAAAGCAATTTCACTATGAGATCGAAGATGATTTAATCAGTTCTTTCATTACGATCTCTTCACTTTGCTGTTGTCTGTAATTCTATAAATTGGTGTTTTGTTTTTGCTTTGGATGGTTTCCGGAGTTTTTATTTTATGTACATATAGATGCATAAGCGAGAGTGTAGTTTTCTCGGCATGAGACCTGATGTACGTAAATAAGCAGCTGGAATGCATGTCTGAATGGCGTCTGTGACTCTGTGGCAATATAATATTGTACTCGAT
CDS Sequence
- >BVRB_2g046860
ATGGCGGACCCTGCAATAAAACTCTTTGGCAAAACCATTCCATTGCAAGATAATGATAATGATAATGATGATCATTCCATTCCCTCGGATTCCACGAATACAGAGGATCATATTTCTAAAGATACAGTTTTTGAGGAGAGAGAAAATCATAAGGTTGACGAAGATGGGAATACATTGCAGACAAAACAAAATGGAGTGTCACCTGAGGTTTCAGATAAGAGTATTTGTCAAGATGCGTCATTAGTAACCCCCGATATTCCAGAGGCATTATCTAATGTTGATGAAAAGGAAGCAGGGGAATCATCAAAGTCAGAAGAAGAAAAGGCTGAGACAAGTCCTTCCCAAGAGAAAACTCCAAAGAAACCTGATAAGATACTTCCATGCCCACGGTGTAATAGTATGGACACCAAGTTCTGTTACTACAACAATTACAATGTCAACCAGCCTCGACACTTTTGCAAAAATTGCCAAAGATATTGGACCGCTGGTGGTACAATGAGGAATGTGCCTGTTGGTGCTGGCCGCCGCAAGAACAAGAACTCAGCCTCTCATTACCGGAACATCACCATCCCAGAAGCACTCCAGAATGCTCGGACTGAAATTCCTAATGGGTTGCACCCTGCACTGCCAAATAATGGCATGGTCCTCACATTCAGCTCAGATTCACCCCTTTGTGAATCTATGGCCTCAATATTGAACCTTGCAGAGAAACCAGTGAGGAACTGCCCACCTAATGCATTCCAAAAACCAGAGGATTTGAAAGTTTCCATTCCCTTTGCAGGCTTGGAAAGTGGAGTTAACCATGATGATGGATCAAATTCAAAGGATGATGCTAGCAAATCAGCAGCACCAAATGAGCCAGCAGCTCAAAATTGCCTTCCCTTCCCAGCTCAAATTCCATGCTACCCCGGGGCACCCTGGCCTTATCCTTGGAACTCCACTCAATGGAGCCCACCAGTAGCAGCTCCACCCTTCTGCCCCAATGGCTTTGCCATGCCTTTTTATCCCGCACCTGCTTACTGGGGCTGTGCTGTACCAGGAGCATGGAATATTCCCTGGATTGCCCAACCATCTCCTCCGAGTAATTCAAATCCAAGCTCTGCCCCAACCTCTCCTTTGGGAAAGCATTCACGAGATGGCAATATGCTCACTTCGACCAACTCCGAGGATAAAGAGGTGGAGGAGAACAGTTCCGAGAGATCTCTTTGGATACCGAAAACCTTGAGAATTGATGATCCAGGAGAAGCTGCAAAGAGCTCTATTTGGAGTACCTTGGGGATCAAGAATAACGAGAAACCGGAATCTATAGGTCGGGGTTTTGGACTTTTTAAGGCATTCCAGTCAAAGCGTGAAGGGAATACTCGCATGGAGACCTCTCCAGTTCTGGAAGCAAATCCAGCAGCCTTATCTAGGTCACAAAATTTTCAAGAGAACACATGA
Protein Sequence
- >BVRB_2g046860
MADPAIKLFGKTIPLQDNDNDNDDHSIPSDSTNTEDHISKDTVFEERENHKVDEDGNTLQTKQNGVSPEVSDKSICQDASLVTPDIPEALSNVDEKEAGESSKSEEEKAETSPSQEKTPKKPDKILPCPRCNSMDTKFCYYNNYNVNQPRHFCKNCQRYWTAGGTMRNVPVGAGRRKNKNSASHYRNITIPEALQNARTEIPNGLHPALPNNGMVLTFSSDSPLCESMASILNLAEKPVRNCPPNAFQKPEDLKVSIPFAGLESGVNHDDGSNSKDDASKSAAPNEPAAQNCLPFPAQIPCYPGAPWPYPWNSTQWSPPVAAPPFCPNGFAMPFYPAPAYWGCAVPGAWNIPWIAQPSPPSNSNPSSAPTSPLGKHSRDGNMLTSTNSEDKEVEENSSERSLWIPKTLRIDDPGEAAKSSIWSTLGIKNNEKPESIGRGFGLFKAFQSKREGNTRMETSPVLEANPAALSRSQNFQENT