Information report for BVRB_1g003940
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- Encodes PCFS4 (Pcf11p-similar protein 4), a homolog of yeast polyadenylation factor Protein 1 of Cleavage Factor (Pcf11p). Regulates FCA (AT4G16280) mRNA polyadenylation. Promotes flowering time.
Homologous
- Actinidia chinensis: CEY00_Acc17446, CEY00_Acc09621
- Capsicum annuum: T459_31114
- Citrullus lanatus: Cla97C03G053860
- Cucumis melo: MELO3C004944
- Cucumis sativus: CsGy1G013510
- Daucus carota: DCAR_008129
- Glycine max: Glyma.20G142500
- Juglans regia: Jr04_14430, Jr04_14450, Jr04_14500, Jr04_14440, Jr04_14490
- Populus trichocarpa: POPTR_004G020300v3, POPTR_011G024800v3
- Prunus persica: PRUPE_4G024700
- Rosa chinensis: RchiOBHm_Chr5g0003821
- Solanum tuberosum: PGSC0003DMG400029413
Gene Resources
- Pfam: PF04818
Sequences
gDNA Sequence
- >BVRB_1g003940
AGATCTCTTCCGCTCTACAATTTCATCAATACCAGCTTTCCAATTAAAAAGCTAACGAATTATCATAAACATACACAATTTCGGAATTCCATCATCAAACAAAAACCTTTCGATCACTCCCAATTTGAGGAACATATAAGAAGAAAGAATTGCGCTCATATTAAACATATTCCACAAAATCACAAATATTGAAGGTATGTTTAGGATTTATCTTCATATAATCATTGCGATTACAAATTCAGATCTTCCACTTATTTGAGCGAGATTTAAGATTTTTTGTTTTTTTTTTTAACTTTTGATTATTATTTTCCATTGCAAAGCTTAAAAAGAAAAAAAAGAAAAAAAATCAGATTTTGCAATTTTGTTGAAACTACTGAACTTGAGTGTCTTTGCATAATCTTCGAATTTAGTCAATATGAGGGCTTGTGAATCCCCTTCACCTTCTCATGGCATACATATGAATCCCAAATATTTGGAAGCAAGAAGACAATTTGATAATTCATCAATTAATAATGTAAGTTTTTCATGATATTACACTATATGTCGGTCCATTATGCAATCCGCTTATTATGATTCGTTTCATTGTTTACGCTAACGAGATGGTTATATGGGTTAAAAGTTCAGCTTTTAATGAATTTTGTTCAACAGTTGCAAATTTAGGTATATAATGAATGAGATTAGTTTGTTATTGTTGATTACTCTCTCCGTCCCATACTATAGTGCCGGTATCATTCTAGGTGGATAAAACTTTAAAATCTCTGATCAAATATTCGCATTAATATATACAAGAAAAACATAATCGTGCAATCTTTTTAGATCCGCGCTTCAATATGTAGTTTCATAATATTAACTTTTTATAATTTTTTATTAATAAGGAATTGAAGATATCAAAGATCAAATGTTTGTATGGGAGATCGTATAAAAAAGAAACAAGCGGTATATTATGGGATGGAGGGAAAGATCAAATGTTTGTATTGGAGATCGTGTAAGAAAGAAACAAGCGGTATATTATGGGATGGAAGGAGTATAAGTATGTGAGTATTTCATGCTAAAACTTGACGGGGATGGTGGCATGTTTTTGTTATGGATTCATGAGAATTCTCCTATTGTTAACTTTGAAATAAAGCTCAAATGTACTTACGGTTTGTTTCGTGAGTGGTCATAAAGATGGTAATATCTATGGTAATGCTACTGCTGCCTCTGAAAACCTGTTAATTGTTCCTAAAAGTTCGTTACCATATATTACCTTGAGAACGTGGTAGTCAGTGTTAATAGAAATTTATGAAGAAATTAGAAAAACACATGTTTGGAGATGAAGATTCATTACCATGGTTTATAACTTGAGATTTTCTTACAAAATTACCACCCTTTGTTGTTGCATACTGAAATGGCCATTATTGCTATACTGCTATGTGTAAGCTTCTTTTCCTTGTCCCTACCTCCACCTCGTCTTCATGTTATTTCGTCGCCTTTTCTTCCTTCTTATTTGAACTTATCACTCGATAGTCCACAAACATGATTTGTGTAGTATGCCTATGTAAACATAAACATCTCACTAGGTTAGTGGTCAAATTCATTTGCCTTTATGATGTACCCTTTTTACAGTTTTTTCCCCCTCTCTATAGTCTTTTTACAGTTTTTTCTGTCTCTCACTGCACTTCTTTGTGGAGGCATCGATTTGATAGGAACTTGCTTACATTAAAAAGCTTTGAGCATGCTTTTGGAGTGACGCTGACAGTTGATTGCATTTCTTTTTTTTCCTTCGTTGTGTAGAACATCTCACTTGTGAGGGGGGCATTTGACTCAGAGACTCTGAGGCAGAAGCATTCTATTAGGTATGAAGATTATAATTATAATCAAGGAGAAGGCACAACATCCAGTATTGATGCCCAAAGATTCAATGAGTATGGTGGCCGTACATCGCTTCCTCTATCAACAGACAAGTTGCTTCCATCTGGAAGTGTTTTCATCAGGCCCTTGTCACCTTCAATTGATGAGTTCGATGTGTCCAATTCACGAGCAGTTGTAGGGGGATCTCCATTTTGTTCAGGATATAAATATGGACGTAGGAGAGGAAGAGATGAGAAAACTGAAGACTGGCTGAAAAGACATTGCTCTGGTGACTCCTATCGTGATTTTGAAAATATTGCCAACTGTGGTTCAAGCAAAGGTTTTGAACATGACAGACCAAGGGCTTTAATTGATGCTTATGGCCATGATGACGGGCAAAGGTCTGTGAATGAGGAACCTCCTGTTAGGGATCGCCTGAGTGATAGTGGTGCAGTAAGTAAAAAAACTGATAGTTCATGGCAAAGTACTGAAGAAGAAGAATTCGTTTGGGAAGATATGAGCCCGACATTATCTGATGGGAAGACCAACAATGTCACCGCTTCTACTCTGTCTTCCAGAGGTTTTAGAGCTATACCTGGTGTTGGCTCTCTTGACTCCGGACATTTTGATCCCAGTCTCAGGAGGAGCTGGGGAGTGTCTAGTCAGATATCTAGGCTAGAGGATTCACAAAAGACTTTTGAAGATGTACGTACCCGTAACCTGATTATCATTACTTTCTCTAGTGTCCCAATGTTGTTATATCTTTTTGAGAGTGCCTTGATTTCACTTGATAGGAGATTGCTATTGCCTTTTAGTGCTAGGAAAGATGTAAAGCATCAATATTATGGGTTGGTCTTTATTTTCCCTTCGAGACTCTCCATGTCTAATTTATTTATTTTCAATATTTCACTCATCAATAGTGCTATTATGTTTTGTCAATATGTTGCCTATCTCTACTTCATGATTTTGGCCAATGTCATTCCTTGTTACATTTGGGATTGCCTACTGCAGTGGTGGTGATCCTTAATCAACAAAGGGGATCAAGAGCTTCATTGTTTTCTACTTTTTTTTTAATATGAACACTTTGACTTTTGACTATTTACATACTAATGCTGAGTCTATTTTTTCAGTCAATATATATAATGACAAATGATAGTTTGTACGACGATTAGATGTTGGCTTTATCTCAATTATCATCTTTATATGATTTTTAACTTATAGATATTTATAGATATGAATGGTTAAAGTTGTGCGTTTGAGAGTGTGAAAGTCAAAATGGCAATCTAAAAATTAATGGAGGAAGTATTTTTCTTCTTCATTTTCTTTTGAGAGGTAGGATGAAGTTTCTTTACAAGGGTGAGGAGGGGGGGGGGGGGATTTTTGAGGTACCACTTTGCAAGGGGCCATAATCAAACCTCTCTAACAAGGATGGACGGAGGGCCTTCAACCAACTAGACCAATCTTGATTCTTTTTTTTTTTAATTTTCTTCTCATTCTCAGTTAATTATACTAGAAACAGAAAATTCGGATTTACATTTCTACTAAATTGCAGGGCGGTCAATTATCATGCAACAAGCCTCCTTCAAGTAATGAGATGAATCGTTCTCAGGGAGCTTGGAAGTTGCCTAACAGTCATTCTGCGCCTATGTCTGTTGCTGGAAGACAAAATATTTCATCATCATCAGATGGAAAGCCTTCTTCAGCACCAGTGTCAACCTCCTCACTACCCTCTGCGAGTATGCATAATTTGGTGCCTCTGTCACCTGCATATCTGCAACGAAACCAGCCTAGAGTGTCCTTTGACTTTACAAGTAGAAATTACAGTATCCTTGACCAAGGCCTTCAACAATTTGTCACTAATGACCTAAGAAATTTGATTCCTGAAAAGCCAGCTCGCCGGCCACAGTTTAGCTTTGACCGATCACATCATAAGAAGCAGCAACTAGTACCATTACCACAGCAGTTGCGTCTGCCTCAAGAACCTCAGCAGAATGCTGTATCAGCTATTTCTTCACATCCACAACAGACAATATTGCCATCTAGTCTTGGATATACTCTACTAGGTCACAGGGTTGCAGATAGGAATGTTGTGCGCAATCCTGCACTTGGTTCTCATCCTCATGTACCCTTCCGAAACGCACCCAATTGTTCTGTGCAATTCCAAGCACCTATGACACCATATTCCTTAGTCCCTCGTCCCCATCTTCAATATCTACCCCTTCCGCAGAGTTCTGGTCCTCTTGCTAATCAACCATCAACTGCTGCTATTTCTGGCTTACTAGATTCTGGTTTACTTAACTCTCTTATTGCACAAGGTTTATACCCATTGAAGCAGACCCCTGTGCAGGTAAGTGAGCACTGAGCAGTAATTCTATTTTACGCCAAAATTCTCTGTATTTTAGGATTTGTTGTTTATGATTGTATAGCAGCAATAGATTTCTTGTTATTTTCTGCTCCTATTGAATTTTCTTTATATGATACTATTTGAAATTAGGATTTTCTCGGAGTGGATTTTAACCCTGACCACCTTAAAGCGCGTAATGAGTCAACCATAAGGATGTTGTTTGGGGATCTACCCAGACAGTGCACCACATGTGGCCTTCGGTTCAAAACCCAAGAAGAACACGCTAAGCACATGGACTGGCATGTGACTAAGAATCGAATATCAAAGAACCGTAAGCACAACCCTTCTCGTAAGTGGTTCGTCAGTGTGAGTATGTGGCTCAGTGGGGCAGAAACTTTGGGTATTGATGCAGCTCCTGGATTTTTGTCAACTGAGAGAGCTATTGAAAAGAAGGATGATGACGAGATGGCAGTTCCTGCAGATGAGGATCAGAATGTCTGTGCTTTATGCCGGGAACCTTTTGAAGATTTTTATAGTGATGAAACTGAAGAATGGATGTATAGAGGAGCTGTGTACTTGAAAGCGCCTTCTATGTCAACTTTAGGTATGGACAGTTCACAGTTGGGTCCTATTGTGCATGCAAAATGTAGGTCTGATTCTACTGCTACTCCGACCTGAAGAAGAAAAAAGCATTGTGCTTCATGGTAAGTTTCTTGTTTCATTGTTTTCATTTGATATTAGTGTTGTGTCTCATATGGAGGGTGTTTGCTTGAGAATTGGGATGTAAATATTTTCTTGAAAAGGTGATATTCTCATTTTCGTTTGTTTGGTTTATAACGGGTGAAAAATATTTTTTTAAAGGGTAGAAAACAGCTCTTAAGGATGGAAAATATTCTCCTTTGTAAAGGAAGGAATGCACATCTTGTTTCCTATACCTTCCTCTTTGTCTTTCCTCGTCCTCTCTCCCCTCCAATTTTCAGTTTTCCTTTATCTCTCTATATTCTCTGGTGAGGACCAAACAAAGAAAATTTAAGTTACAACTGTGCTTTTTCTAGGAAAATGAATCATTTTCCTTTGAAATGGTTTCCGCCAAACCAAACAGAGTCTAAATCTATGTGCCATCAATTCTATTGAATCTTCAGGATGCAATTGCATGAGATCTCAAGTCCTTTGACATTTATCTCTAGTAAGGGTGGATTTACCTATAGGATATTTGTTATTTTTATAGATTACATCGGGGCTAGAATCAAACTATTAACGTTGTCCTTAGTTAGTAATTGTTTCATGTTCTTTGTTGGGAACAAGTCATCATTGTTATCTTGTATGGAGCATGTATGGTTAGATGTTAGAATTATCTTATTAAACTCATTTGAGTTAGAGTAGGCTGATTGCCTTTAGTGCACTTACTTGACAAGTTGCCTTAATCACAATTTGCTAATTAAGTTTATTAAGGTGATTTGCTTCCTCTTAATTGTCAAACTTTCAAGGGGTTAAATATCATAATACTAACCTCCTGTCTTTAACGACAGATTTGCCTAGTTCACTTACATCAGTGCTTTGCATCAACTTGTTCATATTCCTTGTACATTTCAGTTGTGGCGTATCGAATTTTAATACATTTCTTTGCATTATCAACCTATGTATGTTAATTGTATATTCATTTCCTTGTATACTCTCCAGGTACAAGGACATTCAAGAGGCTAGACAAAGGAAACAAACGAGTTAATTTTCGACCCAGATGTCTGTTTTTCCCTGTAACTTAATCCGAGTTCATCTTGTTATACTTTTCCTCTTCTCCCGCCCCCAGATTTTGTTACCTTGGTGCTCTAGTGTTGACATCACGGCAGAACTGTAAATACAGTGGAGGTCTACAATCCTTACCTTGCCGAGTTGCTGTTGCGCTTTTGGCTCTTTGGCTCAACAATTTTCATCTTTGGGGTAGTCCTATAGGTTATAGCATTGATGAATATGTAGAGGAGATTTCCCCAAATTAACTCATTATTTTCTCTCTATCTCACAATTGTATGCATAGTGTTTTATAAACCTTTTGATGTAGAATAATGTCATGAATTCTAT
CDS Sequence
- >BVRB_1g003940
ATGAGGGCTTGTGAATCCCCTTCACCTTCTCATGGCATACATATGAATCCCAAATATTTGGAAGCAAGAAGACAATTTGATAATTCATCAATTAATAATAACATCTCACTTGTGAGGGGGGCATTTGACTCAGAGACTCTGAGGCAGAAGCATTCTATTAGGTATGAAGATTATAATTATAATCAAGGAGAAGGCACAACATCCAGTATTGATGCCCAAAGATTCAATGAGTATGGTGGCCGTACATCGCTTCCTCTATCAACAGACAAGTTGCTTCCATCTGGAAGTGTTTTCATCAGGCCCTTGTCACCTTCAATTGATGAGTTCGATGTGTCCAATTCACGAGCAGTTGTAGGGGGATCTCCATTTTGTTCAGGATATAAATATGGACGTAGGAGAGGAAGAGATGAGAAAACTGAAGACTGGCTGAAAAGACATTGCTCTGGTGACTCCTATCGTGATTTTGAAAATATTGCCAACTGTGGTTCAAGCAAAGGTTTTGAACATGACAGACCAAGGGCTTTAATTGATGCTTATGGCCATGATGACGGGCAAAGGTCTGTGAATGAGGAACCTCCTGTTAGGGATCGCCTGAGTGATAGTGGTGCAGTAAGTAAAAAAACTGATAGTTCATGGCAAAGTACTGAAGAAGAAGAATTCGTTTGGGAAGATATGAGCCCGACATTATCTGATGGGAAGACCAACAATGTCACCGCTTCTACTCTGTCTTCCAGAGGTTTTAGAGCTATACCTGGTGTTGGCTCTCTTGACTCCGGACATTTTGATCCCAGTCTCAGGAGGAGCTGGGGAGTGTCTAGTCAGATATCTAGGCTAGAGGATTCACAAAAGACTTTTGAAGATGTACGTACCCGTAACCTGATTATCATTACTTTCTCTAGTGTCCCAATGTTGTTATATCTTTTTGAGAGTGCCTTGATTTCACTTGATAGGAGATTGCTATTGCCTTTTAGTGCTAGGAAAGATGTAAAGCATCAATATTATGGGTTGGGCGGTCAATTATCATGCAACAAGCCTCCTTCAAGTAATGAGATGAATCGTTCTCAGGGAGCTTGGAAGTTGCCTAACAGTCATTCTGCGCCTATGTCTGTTGCTGGAAGACAAAATATTTCATCATCATCAGATGGAAAGCCTTCTTCAGCACCAGTGTCAACCTCCTCACTACCCTCTGCGAGTATGCATAATTTGGTGCCTCTGTCACCTGCATATCTGCAACGAAACCAGCCTAGAGTGTCCTTTGACTTTACAAGTAGAAATTACAGTATCCTTGACCAAGGCCTTCAACAATTTGTCACTAATGACCTAAGAAATTTGATTCCTGAAAAGCCAGCTCGCCGGCCACAGTTTAGCTTTGACCGATCACATCATAAGAAGCAGCAACTAGTACCATTACCACAGCAGTTGCGTCTGCCTCAAGAACCTCAGCAGAATGCTGTATCAGCTATTTCTTCACATCCACAACAGACAATATTGCCATCTAGTCTTGGATATACTCTACTAGGTCACAGGGTTGCAGATAGGAATGTTGTGCGCAATCCTGCACTTGGTTCTCATCCTCATGTACCCTTCCGAAACGCACCCAATTGTTCTGTGCAATTCCAAGCACCTATGACACCATATTCCTTAGTCCCTCGTCCCCATCTTCAATATCTACCCCTTCCGCAGAGTTCTGGTCCTCTTGCTAATCAACCATCAACTGCTGCTATTTCTGGCTTACTAGATTCTGGTTTACTTAACTCTCTTATTGCACAAGGTTTATACCCATTGAAGCAGACCCCTGTGCAGGATTTTCTCGGAGTGGATTTTAACCCTGACCACCTTAAAGCGCGTAATGAGTCAACCATAAGGATGTTGTTTGGGGATCTACCCAGACAGTGCACCACATGTGGCCTTCGGTTCAAAACCCAAGAAGAACACGCTAAGCACATGGACTGGCATGTGACTAAGAATCGAATATCAAAGAACCGTAAGCACAACCCTTCTCGTAAGTGGTTCGTCAGTGTGAGTATGTGGCTCAGTGGGGCAGAAACTTTGGGTATTGATGCAGCTCCTGGATTTTTGTCAACTGAGAGAGCTATTGAAAAGAAGGATGATGACGAGATGGCAGTTCCTGCAGATGAGGATCAGAATGTCTGTGCTTTATGCCGGGAACCTTTTGAAGATTTTTATAGTGATGAAACTGAAGAATGGATGTATAGAGGAGCTGTGTACTTGAAAGCGCCTTCTATGTCAACTTTAGGTATGGACAGTTCACAGTTGGGTCCTATTGTGCATGCAAAATGTAGGTCTGATTCTACTGCTACTCCGACCTGA
Protein Sequence
- >BVRB_1g003940
MRACESPSPSHGIHMNPKYLEARRQFDNSSINNNISLVRGAFDSETLRQKHSIRYEDYNYNQGEGTTSSIDAQRFNEYGGRTSLPLSTDKLLPSGSVFIRPLSPSIDEFDVSNSRAVVGGSPFCSGYKYGRRRGRDEKTEDWLKRHCSGDSYRDFENIANCGSSKGFEHDRPRALIDAYGHDDGQRSVNEEPPVRDRLSDSGAVSKKTDSSWQSTEEEEFVWEDMSPTLSDGKTNNVTASTLSSRGFRAIPGVGSLDSGHFDPSLRRSWGVSSQISRLEDSQKTFEDVRTRNLIIITFSSVPMLLYLFESALISLDRRLLLPFSARKDVKHQYYGLGGQLSCNKPPSSNEMNRSQGAWKLPNSHSAPMSVAGRQNISSSSDGKPSSAPVSTSSLPSASMHNLVPLSPAYLQRNQPRVSFDFTSRNYSILDQGLQQFVTNDLRNLIPEKPARRPQFSFDRSHHKKQQLVPLPQQLRLPQEPQQNAVSAISSHPQQTILPSSLGYTLLGHRVADRNVVRNPALGSHPHVPFRNAPNCSVQFQAPMTPYSLVPRPHLQYLPLPQSSGPLANQPSTAAISGLLDSGLLNSLIAQGLYPLKQTPVQDFLGVDFNPDHLKARNESTIRMLFGDLPRQCTTCGLRFKTQEEHAKHMDWHVTKNRISKNRKHNPSRKWFVSVSMWLSGAETLGIDAAPGFLSTERAIEKKDDDEMAVPADEDQNVCALCREPFEDFYSDETEEWMYRGAVYLKAPSMSTLGMDSSQLGPIVHAKCRSDSTATPT