Information report for BRADI_5g24470v3
Gene Details
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Functional Annotation
- AJH1 encodes a protein similar to JAB1, a specific mammalian coactivator of AP-1 transcription. Encodes a subunit of the COP9 complex that is involved in protein deneddylation. Plants with mutations in CSN5A and CSN5B have a de-etiolated phenotype.
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT1G22920
Gene Resources
- Pfam: PF18323 PF01398
- UniProt: I1J2S2
- RefSeq: XP_010240543.1
- EMBL: CM000884
- KEGG: bdi:100841802
- OMA: VKMKLFQ
- InterPro: IPR000555 , IPR037518 , IPR040961 , IPR050242
- PANTHER: PTHR10410
- SUPFAM: SSF102712
- PROSITE: PS50249
- Gene3D: 3.40.140.10
- OrthoDB: I1J2S2
- CDD: cd08069
- eggNOG: KOG1554
- STRING: 15368.I1J2S2
- HOGENOM: CLU_053034_0_2_1
Sequences
gDNA Sequence
- >BRADI_5g24470v3
AACCCAAATCCAAACCCCTCCCCTCTTCTTCCTCCTGCTCTTCCGCTCCTAGGGTTTTGCCTGCCGTCAGCGACGCCGCGATGGATCCCACCTCGTCGTCGGCGATGGCGAAGCAGACGTGGGAGCTGGAGAACAACATCCCGGCGAAGGTCATCGACCCGGAGGCGATGGACGAGGTCTACCGCTTCGACGAGGTGGCGAACGCCCGGGCGCTGCAGCAGAAGCCTTGGGCGAACGACCCCCACCACTACCGCCGCGTCAGGATCTCCGCCCTCGCGCTCCTCAAGATGGTCGTCCACGCCCGCTCCGGGGGCACCATCGAGATCATGGGCCTCATGCAGGGCAAGGTCGACGGCGACACCATGGTCGTCATGGACGCCTTCGCGCTCCCCGTCGAGGGCACCGAGACCAGGGTTAACGCCCAGGCTGACGCCTACGAGTACATGGTCGATTACTCCACCATCAACAAGCAGGTCAGGTTCACACCCCTAACCGTCATCACTGCTTATTTTGGGGCTTCCGATCGTACCAGATTGCAATGTTGCTCCCAACAGACCGAATCTGTGCTTACCCGCGTGAAAACTGCTATATTTTTCGTATGAATTGTTATTGTCACGTAATCCTAGTGCGGTGTTCATGTGAAAAGTTTTGGGATGGATTACTGGCAGCGCTGCTACTTCGGGGTCTATCTGTTTTATGTTTCGTGCATTAAATCTCTGCAGTTATATGGGGCCAATCAATTGTTGTTTGTGTGGTCTTTGTAGTTCTTATGTTTTCTTATTAATAACTTCTGTGTTTGTGTTATGTTCCCTCGGATAGTCAGGTTTGTCCTGTCCACACAGATAGTACTGATAACTTGACTTCGCTTTGGGTTCTCAACTATTGCTAAAGAATCATTAAGTTTTTTTGTTGCATGTGTGCAAGTTGGTAATTTGCTACAAGGTATGATATCGAAACATGACTAGTTTAGTTGTGAGTAGTTGTACTGGTGTGCTTGATAGTTTACTTGTTGCTGGTGTCCCTAGCACTGGTGTAGCTTGAGCGGTTCCCCATTGTTCCAAATTTTGCTGTCACCAATGAATTTATGAGCGCAGTATTATCTGAACTCAACTCTCTGAATTCTGCCATTGTTGTTGGAAGTTATGATACAATATGCATACTTGATTGTGCATTTCTTTACCCTTATTATTGGAAGTTATCATACAATGTTTGATCTGTTTTGGCCAAATGTATTTACGTAAAAGTTACGGTGAAAATGCTGCACCTGAGATGTGTTAGGAAATATGCACATGTGGGTGTGTGTTAGAGCTAACTGAAACTAACCGGCATATGCACTTCCATTGGATAGGCTGGAAGGTTGGAAAATGTGATTGGCTGGTATCACTCACACCCTGGTTATGGATGCTGGCTGTCAGGCATTGATGTTTCAACTCAGATGCTTAATCAGACGTATCAAGAGCCATTCTTGGCTGTTGTGATAGACCCTACAAGGACTGTTTCTGCTGGTAAAGTGGAGATTGGAGCTTTTAGGACATATCCGAAAGATTACAAGCCACCGGATGATCCTATTTCTGAGTACCAGACCATACCACTCAACAAGATTGAAGATTTTGGTGTCCACTGCAAACAGGTTACTAGATTAATTGTTCATCTATCTTTTTTTTTTCCTTCCAGATATGTATGGTTTAGTTCTGTTCTAACTTGATTTCATGCAGTACTATCCTTTGGATATAACATACTTCAAGTCATCCCTGGACTCTCACCTCCTTGATCTACTCTGGAACAAGTACTGGGTCAACACATTATCTTCATCACCACTTCTGGGCAACAGGGATTATGTTGCCGGACAGATCTTTGATTTAGGTAGGCATTCACTTCCAGGGAGATTTCCAGGAACTAGTTTTTTCTATTATATGCAGTTTTGTCTTGTGATATAAATTGAGGGATACTGATAAGTAATTTTTTGTTCAACAGCTGATAAACTAGAGCAAGCTGAAGGGCAACTGGCACACAGTAGATTCGGCATGCTTATGTCATCACAACGAAAGAAAGAGGTCAGTTTCTACATTCATGTCCTTTACACTTGCTTACCATGAAGGGACACCACTGTTCCATTTGCCCTTGTGAAGTTTGCTAGTGTGTTGCTATTTTTATTACTCCCTCCGGCCGGAATTACTTGTCACTGATTTAGTACAAATTTGTACTAAATCTGGGACAAGTAATATGGGTCGGAGGGAGTAGTTTATTTTGCAAACTTGTTGATTGCGCAATTGTTCTTGTTATATTTGTCTGCATGAGAACTGGTAGAAGGAAGAATAAGTTACAAATCTGATTACTGTTTTTTATCACAGTGCTTAACCATGGCTGAAGTTATTGAAGATGTGATGTAATTTTTTGTAGCAAGTAGAATTCCTGAAGTAATGAGAAGTTGCCCTTGAGAAAAAACTTGTCTGAATAAGTTGTTACAAGTTATTGGATGGTCGTGCCTGTAGGAACGATGCTGTCATGTCTTGTAGTTGTGAAATTGAGTTTAGTGAAACTGAGAGGAATCTTGAGCTCGAGTGCATGAGGTGCTACTAAACCTAAGACACGAGGCGGGAGGTGGAATTACACATCTATGCAACAGCTCGTTGAATCAAAACAGTTTATGGGCCGTTGCTGTAGATGTTTAATGAGAGTATGGTTAAGATCTGTACTGAACTGAAACAGTATTGAGGGCCAAGTTTGATGTACCTCTATGTTCACACCCTTCCAGCATACAGTTTGCTGTAGATGTTTAATGAGAGTATGGTTAAGATCTGTACTGAACTGTAGATTGTTAATTTCTTACCCATCATGATTATAATTTTTTTAACAATTCCTAGCAATTCTATGTTTGATCTGTTACTTGATTAATTTATCCCAAGTGTTATGGCTATGTCATTTTCTATAGTTAGGTTTGTAAGTTCATTTTTGTATTTGTTGATTTCTTCTGTTTTGAATCCTTTTTACCTTGTGAACTAATTGTAGTTTCATTTGTTTTCTTTCGGCTTGCTTAGCCAGAGGACTCTCCGCTGGCTAAGGTTACCCGGGATAGCTCCAAAATTACTGCCGAACAGGTTCATGGTCTCATGTCACAAGTAAGTCTTAATTCATGTACTGACTCAATGTGTTCTAATTCTCTGGTTACTATTTTCTTATCTTGCCTTAACTTTTGCAATATGATGGTTAAAGGTCATAAAGGACATTCTCTTCAACTCAGTGCACCCGTCAAGTAAGGCAAGCACAAGTGCTCCAGAATCACCTGTGCCCGAGCCTATGGTTGAAACTTGACTCTGGTGAAATGCTTTACATGCTAGGCTGTTTGGATGCTGGATTAACTGACACTCGGCTTGTGAGCTGTTTTATCACTTTAAAATTGTTGCCAGCATACCCATCTCAAACCGCGTAAGCTGAGTTTCTTATGCCAAAACTGAAACGATATGTAATTAGGAGTCACCTTTTGTGTCTTTGGCTGACATTGAGAGGGCTTGTAATTTACTTTAGGGTCTGCATGGAGTAAAAACTTCTTGGATGTACTGCTTATCTTTGTCAATGTTGACGGCCTTTCTCTGGTACCCTCTGCCTGTATTAACGTTTCGATCAAGCAGTAGGTTCGGTTTTAGTCTTATATTATCGTAAGACTGCATTAATCAATCTATCCAGTTCATTCCCGCCTCGCTGGAAGTTGCGGTCATGACCATTTCAAAATTC
CDS Sequence
- >BRADI_5g24470v3
ATGGATCCCACCTCGTCGTCGGCGATGGCGAAGCAGACGTGGGAGCTGGAGAACAACATCCCGGCGAAGGTCATCGACCCGGAGGCGATGGACGAGGTCTACCGCTTCGACGAGGTGGCGAACGCCCGGGCGCTGCAGCAGAAGCCTTGGGCGAACGACCCCCACCACTACCGCCGCGTCAGGATCTCCGCCCTCGCGCTCCTCAAGATGGTCGTCCACGCCCGCTCCGGGGGCACCATCGAGATCATGGGCCTCATGCAGGGCAAGGTCGACGGCGACACCATGGTCGTCATGGACGCCTTCGCGCTCCCCGTCGAGGGCACCGAGACCAGGGTTAACGCCCAGGCTGACGCCTACGAGTACATGGTCGATTACTCCACCATCAACAAGCAGGCTGGAAGGTTGGAAAATGTGATTGGCTGGTATCACTCACACCCTGGTTATGGATGCTGGCTGTCAGGCATTGATGTTTCAACTCAGATGCTTAATCAGACGTATCAAGAGCCATTCTTGGCTGTTGTGATAGACCCTACAAGGACTGTTTCTGCTGGTAAAGTGGAGATTGGAGCTTTTAGGACATATCCGAAAGATTACAAGCCACCGGATGATCCTATTTCTGAGTACCAGACCATACCACTCAACAAGATTGAAGATTTTGGTGTCCACTGCAAACAGTACTATCCTTTGGATATAACATACTTCAAGTCATCCCTGGACTCTCACCTCCTTGATCTACTCTGGAACAAGTACTGGGTCAACACATTATCTTCATCACCACTTCTGGGCAACAGGGATTATGTTGCCGGACAGATCTTTGATTTAGCTGATAAACTAGAGCAAGCTGAAGGGCAACTGGCACACAGTAGATTCGGCATGCTTATGTCATCACAACGAAAGAAAGAGCCAGAGGACTCTCCGCTGGCTAAGGTTACCCGGGATAGCTCCAAAATTACTGCCGAACAGGTTCATGGTCTCATGTCACAAGTCATAAAGGACATTCTCTTCAACTCAGTGCACCCGTCAAGTAAGGCAAGCACAAGTGCTCCAGAATCACCTGTGCCCGAGCCTATGGTTGAAACTTGA
Protein Sequence
- >BRADI_5g24470v3
MDPTSSSAMAKQTWELENNIPAKVIDPEAMDEVYRFDEVANARALQQKPWANDPHHYRRVRISALALLKMVVHARSGGTIEIMGLMQGKVDGDTMVVMDAFALPVEGTETRVNAQADAYEYMVDYSTINKQAGRLENVIGWYHSHPGYGCWLSGIDVSTQMLNQTYQEPFLAVVIDPTRTVSAGKVEIGAFRTYPKDYKPPDDPISEYQTIPLNKIEDFGVHCKQYYPLDITYFKSSLDSHLLDLLWNKYWVNTLSSSPLLGNRDYVAGQIFDLADKLEQAEGQLAHSRFGMLMSSQRKKEPEDSPLAKVTRDSSKITAEQVHGLMSQVIKDILFNSVHPSSKASTSAPESPVPEPMVET