Information report for BRADI_3g51800v3
Gene Details
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Functional Annotation
- Sequence suggests this encodes a MADS-box transcription factor. Negatively regulates the FLC/MAF clade genes and positively regulates FT in Arabidopsis.
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT2G45650
Gene Resources
- Pfam: PF01486 PF00319
- UniProt: I1ICM9
- RefSeq: NP_001289810.2
- EMBL: CM000882
- KEGG: bdi:100822235
- InterPro: IPR002100 , IPR002487 , IPR033896 , IPR036879 , IPR050142
- PANTHER: PTHR48019
- SUPFAM: SSF55455
- PROSITE: PS00350 , PS50066 , PS51297
- Gene3D: 3.40.1810.10
- OrthoDB: I1ICM9
- CDD: cd00265
- STRING: 15368.I1ICM9
- HOGENOM: CLU_053053_0_2_1
Sequences
gDNA Sequence
- >BRADI_3g51800v3
ACCAGCACCGAGCTACAGTTCCCCTTGCCCTTTCCCTCTCTTGCCTGCCCACTGATATCCCGCCCCTCTCGGCTCATTATATGCGCATCATCATTGCACAAGCCAAGCCTTGTGGGTTAGTAGGTGGCATTACAGCCGGAGCAAGCTAGCTCAAGCAAGAGGCCGGAGCTGATCGGTGAGTTGTGTGCTGCTGGGAGGAGGAGATCATGGGGAGGGGAAGGGTTGAGCTGAAGCGCATCGAGAACAAGATCAACAGGCAGGTCACCTTCTCCAAGCGCCGCAACGGCCTCCTCAAGAAGGCCTACGAGCTCTCCGTGCTCTGCGACGCCGAGGTTGCGCTCATCATCTTCTCCAGCCGCGGCAAGCTCTACGAGTTCGGCAGCGCCGGGTATACATACAGTTAGCTCGCTCACGCATCGACCATCAGCTCCTTATTAACCTTTCTGCATGCAGATCTGCTGCTTAATCTGCACAATTGATTCTTGATTTTTACTCTGCTAATGCTTCTGTTTTATTTTGCTGCGGTTGGTTTACTGGTGTATTTAATCTGCTGCCGTTTGCTTACTGGTGTTGCTTTTTTTTATTTGAGGGAGAGAATTAAGCTTTACTGGTGTGTTGCTGATGCTTCCTTTTCTCTGGTGTTTCCTGGTTTTCAGCAGCACGCGCGTAGCCGAGCTACACTTGTACGTAGTTCCTGCACTTGGCTACACAAAGTTATTTTATTCCTGCTACGCATACTACTATAGGGGCATGGCGGTGTTCGTATAAACCGGAGGAAAAATTTGGTGGATCCCTAACCAGCATGCATGAGACATCTTTTCCTCAGATCTACAAGCCCTACACCATTACGTACTGCTCCTTTCTTCCAGCTTCTCCGGAGCTCCGTCTTCCGCCTTTCGGTCTATGTGTTTCTGTATCTTTGTGAGCGTGACGCCAGAGACACCTTAATTAATTGCAGAACAAGTAGAGCTGGGATATATCGTGTGGAGGAATAGAGAAGTCGCGGGCTGTGAGAGGAAAAGGGTAGGAATGTTCTTTCCATTTTGACCCTTCTGGTATTAAAATACGGTCTAAACGTTCGATTTGGTATTGTTTTCGCCCTGGACTTTGGGTAGCACCAGTCGATCCGGCCTGATCTGAATATGTGCCATGAATTAAATTTAAGTCTTTGTTCTTCACCCTTCTGCTCCACCTTTCCGTTCGATTTCTTGCCGTATTGCTCAATAAGGGAAAGTTTTTTTTTTTGGTTTCATTGTATGATTTTCTTCTTCACAAATCTAGATCCACCTTCTTTGGGAGGCTTTTAATTTCACAATCTCAGTACCGAAGCCAAGATCTCCCCACACTTTCCCTTTTTCTTCTTCAATCTTATGTCCCTGTCTCTTTTTCTTGTCTTGGTTCGTTTTTTCTAAGGTTCTCATGTATTCCTGGTATGTCTGCACGGAGTTTAAGCAAAAGTAACTTCACTCGCTTTCCTGCCCAAAATTGATCTTATTCTCAAGCACGTATCAGTTTCCTCTTATGGTAGTGTGGTCAAAAGATGTCGGATAACAATGCATTTTGCTTTTGTTGTTTTTTCTTTCCTCATTTTATGCTGATGAGTGCTACTACAATTAGTCGTTCCTTAGTATTTATGATCTTAGATGTTGCTTGCCCTTCCAATTTACTTTTATATTAGCTCATTTGTGTTTTTGCATTTGTTCAGCTATCTCTGATCTCCTGTGGTGACTAGGTTACTAATCATGTGTGGCAGATCTAATTTTTGTTTTCTACAAAAAGAAGCATTAACGAAACCTAAGATCCACCCCCCCCCCCCTTCCCACAGTGTACTCTCTTACTTTCTTCGAAAGATTTTATTTTGTTTCACACTTCGGTGAGTAGATATATATATAGCTTGATATATGGAACTTCAAAACTGGTGTCCCCTTTATTGGGGATTAGCACTGGACAGTGTTTCGGTATTTGCATGCCTAGGTATATAGTATGCATGTGTGGGTTTCTTGTTTTTAATTTTAGTAAATCCTATATGTGTGCTTCATATCCTATGCCGCCAATTAATCTTTGCTGAGGTTGCTATGATGATGGAAATCGTCTAAATAAAATACGAAGCCTAGCTAAGTTTTAAAACCTGTGCATAACTACTATTTCCATAAGATTATTTGAAATTTTCCAAAATCACGCGTTCTGAAAATCTGACACAGATCTAATTAGTACTATATGGATTGCATCATAAGACCAAGCTACTTTAATTAACCAAGTTTCTATGATCTTGCATGTAACTGTGCATATGTAGACCATGAAACGGGCTGTCTACTTGACCAATTTTTGCTTTATATCTCTACTATTCTTATTTATTCTGCTTCGATCTTTACCTGTTAGTAAAGCCTCTTCCTTGTAAAACGACATGAAACTGATTACAAAGGCATTTTATAAGGTTAATTCCAGAATTATATCTGATCAGCATATTTTGAGCTATACATTAAATAATTTTCCACATAAGGTTCAAACTCCTAACAAAAATCTTATGTATATAATATTGATATTCTAGGAAATGAAGTAGAGCTTCTGTAAATTAATAGGCAATCGATCACTGCAACAAGAAATTTTAGTTTAGTCATGTCACAAAAGGAGATTTGACATGTTTATTAAAAAAATAAACGTTAGTATTTTGATCAAAATCATAATCAGTAGGATTTTCCTCCATGTTAGAATTAAAACACCTTAATTTGTACAGCCCATGTGTAGAAAAAAGTTTTCCTAGTAAGAGAATAAGTCAACATTTGGCAAATTGACCAGGCCCAACCCAGTCTTTCATAAATTAATCTGAGAAAAATATCGTGGCTGATTGGTTTATCAACGATTTGAATGTTCTCAAGGTTGACTCCTATTCCTACAGAAATGTTTTTCTTTTCAGAATAGTGGCGCAACCTAGCTGGGAGGAATTTTGGCTATACCTATATGCATGTGTGTAGTGTATATGCATATCCTGAGAAGGAAGGGGTGCACATGAATTTGGATCGATGAATTGTAGTCAGTATACTCTTGAATAACATGATCAAATTATCAACGGTATTAAGAATTAAAATAATTGTGATGTGACAGACATGGTTAAGTCGTCGTAAAACTAGATAAACATATAAGACCCCTTTAAGTATTTGTTTGATGTTAATCACATGATTAACACTTTAACTTCAAGCATTTTTTTTGTTCTCGCAAAAAAACTTCAAGCATTAATTTTATTTCATATCATATACTTACTCGATATGTCCATTTTGTATTCTCACTTACAGTTAGTAAAATGATGTTACGTTTTCCATTTTGTATTCTCACTTAAGCATTCCTCTAGCAGCCCACGAATTAACTAATTAAAGTGGTTGTATGGTTGAAATCAACAGGCTCTATACTTTGGCTATTTAACAAAACTTATCTCTTCAGCATATTTTATGAGACTACTAGCTCATTAATTCAGTGTATGATGTTTTGGAATTCCATAGAATATATATATTTACGCATAAAATTCTCGTGCAGCACAACTAAAACATTAGAAAGATACCAGCACTGCTGCTACAATGCTCAAGATTCAAATAGTGCACTCTCTGAAACTCAGGTATGTGTATCCTTCAATTGATTGTGGTACCCTCAAGCTTTCAGGTTAACTTTCATATTTGTATTGCCTCACAATTAGCGGTATTTTTCTTTTCATATACTATCCTTTATTTAAAAACTCATAATGCAATGGTACTAGGACATTGAGTATCGATCTTGCATAGTACATATATATTCAGACTCAACCATGTTGGCTATCGCTGCTAATATCAAAGTGAAACAAGAACATCTCCTTATTATTAGGACACTCAATATTAGGAGAATTTTGCAAGACAGGCTGTAAACTATACCTATTTGGTCATACGATCTTAACTACTTTATAAACCTAAATTTTTTATCACATGTGGGCAAAAAGATGTATTTTTTGCATCATCAATTCTTGCATTGCTAGTAAAGGCGTCACCTACAAAAAAGTTTAAATCTGCAAAAGTCTGTCCTATTGAAGCCAAGAGATCGTTCAACATTTTGAAAAATTGATAAACTATATTTCATGTGAAAACTGAAGTTGCTTGTTGAGTTTACTTCACAAGAAAAAAATGTTATGATTATTTGTCATAGCTAGTCATCCTTGCAGACTTCCCAAATCGATTCACAGAAACGAGCTTATGCTATGCAACTGTTTGTCCCAGTCATCCTGTTTTGACTATTAAACTAATCGTGCTATATATTGTTTTTATCTAAAGAGCTGGTACCAGGAAATGTCAAAGCTGAAGGCAAAATTGGAAGCTTTACAGCGCACTCAGAGGTTTCATTTCAGTTCTACCTACATGTCTCATTTGCTATACACATATTTGATTCAATAAAACATTTGCAAAATGTAGGTTACTCGAAATAACTACATATTATCATTCTATACATATATACCCTGCATGATGAATAATTTGAACAGACATTTGCTTGGGGAGGACCTTGGACCGCTCAGCGTGAAGGAATTGCAGCAGCTGGAGAAACAGCTAGAATGTTCTCTGTCCCAGGCGAGACAGCGAAAGGTTGAAATTTATTCAACTCATAACGTATCCCTTTGTTTAAACTAACTGGCGAGGGAAGCAATATGGCGCGCCACTGTTGGATTTACTGATTAATAGTATAACACCATGCTTTATCATACGTGATGGAAGTTAAAACCTACCAACAGAGAAATGGTTTACATTCTTCCCAAGAGAACCACACGGTCCACATGACCGATAACTGGAAAACACCCGTGGTTTCAAATAGTACTGTTAAGATATTATTGTTTGCTTGATTCTGTGCTCTAAACAGGGTATGGAGTCAGCAGAATCCTGTCCTAGCTACTGTTTTCTTGAAAATATAACAGAAACGTACTCATTACCCGTAGGTTTGCACTCCAGAGTCTAGATACATAACTCCTGAAATTTAAAACCGGGTATTTTACG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CDS Sequence
- >BRADI_3g51800v3
ATGGGGAGGGGAAGGGTTGAGCTGAAGCGCATCGAGAACAAGATCAACAGGCAGGTCACCTTCTCCAAGCGCCGCAACGGCCTCCTCAAGAAGGCCTACGAGCTCTCCGTGCTCTGCGACGCCGAGGTTGCGCTCATCATCTTCTCCAGCCGCGGCAAGCTCTACGAGTTCGGCAGCGCCGGCACAACTAAAACATTAGAAAGATACCAGCACTGCTGCTACAATGCTCAAGATTCAAATAGTGCACTCTCTGAAACTCAGAGCTGGTACCAGGAAATGTCAAAGCTGAAGGCAAAATTGGAAGCTTTACAGCGCACTCAGAGACATTTGCTTGGGGAGGACCTTGGACCGCTCAGCGTGAAGGAATTGCAGCAGCTGGAGAAACAGCTAGAATGTTCTCTGTCCCAGGCGAGACAGCGAAAGACACAACTTATGATGGAGCAAGTGGAGGAACTTCGCAGGAAGGAGCGTCATTTGGGAGAAATCAACAGGCAACTCAAGCACAAGCTTGACTCTGAAGGCAGCAGCAGCAACAACAACTACAGGGCCATGCAGCAGGTCTCCTGGGCTGCTGGCGCCGTCGTCGATGAAGCAGGCGCCGCCGCATATCACGTGCAGCAGCAGCAGCCGCCTCATCACTCCGCTGCTATGGACTGCGAACCCACTCTGCAAATTGGATATCCTCATCAGTTTGTGACCGCTCCTGAAGCAGCAGCCAATAATATTCCAAGGAGCAGCGCCCCGGCAGGAGGGGAGAACAACTTCATGCTGGGGTGGGTTCTTTGA
Protein Sequence
- >BRADI_3g51800v3
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