Information report for BRADI_3g41680v3
Gene Details
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Functional Annotation
- RING/U-box superfamily protein;(source:Araport11)
Homologous
- Brassica napus: BnaC04G0002800ZS, BnaA05G0002700ZS
- Brassica oleracea: Bo4g002370
- Brassica rapa: Bra004436
- Oryza sativa: OsRFPH2-10, IPI1
- Prunus avium: Pav_sc0000174.1_g230.1.mk, Pav_sc0000174.1_g210.1.mk
- Prunus persica: PRUPE_1G134800
- Saccharum spontaneum: Sspon.07G0012650-1A
- Setaria viridis: SEVIR_2G281100v2
- Solanum tuberosum: PGSC0003DMG400029067
Gene Resources
- Pfam: PF13639
- UniProt: A0A2K2D2J6
- RefSeq: XP_014756165.2
- EMBL: CM000882
- InterPro: IPR001841 , IPR013083 , IPR044274
- PANTHER: PTHR46798 , PTHR46798:SF19
- SUPFAM: SSF57850
- PROSITE: PS50089
- Gene3D: 3.30.40.10
- OrthoDB: A0A2K2D2J6
Sequences
gDNA Sequence
- >BRADI_3g41680v3
AGAGACTGAGAGAAAACACAAGGCAACAAACACGCACAGCGCAAGCAAGCTCCTCGTTTTCGAGCTCACGCGCTCTCCGCGAGGGGAGCTAGCTTTTTGGGGGGGATGGAGCCGCTTTCGGGGAAGACGGTGGTGGATCTCGAGAGGTCGCCGCCGCCGTCGCCGACGCAGTGGACGGTGGGGATGGCCGGTTCGGGGGGCGGCGGGGCGTCGTCGTCGTCGTCTGCCGAGGTGGCGGCGGCGATCGCTGCTGCGGAGGCGGCGGCCGAGCCCTGCTCGATCTGCCTGGACCCCGTGCAGGGCGCCGTCGGCCGGGCCACCGCCAAACTGCACTGCGGCCACGAGTTCCACCTTGGTATAACCATGATTCTTCCCTCGCTCGCTGTTGTTAATATGTTGTTATATGTTTATCTCTAGCTAGGCCCTGTGTAGTGTGAATTTTACTTTGATTCCGTATCAGATCTGTTGTTTATGGGCGTGATCTGGTCTGGGGAACCAGGTTTGTGTGTCCCCTGTTTGCTGGATCCCTGTGTGGGCGTCTGTATGGTGATGATGGAGTAGAATTTCCTGTGTAGGTTTGTTGGATCCCTGTGTAGGTTTCTGTATGGCGTGACATGGAGTAGAACTTCCTGTATGCTTGTATGGTGGTGATGGAGTAGAATTTCCTGTGTGACTGTATATATATGGTGGCGATGGAGTAGAATTGCATGTCGTTAGGGTTTTTGTGGCCCCTGTCGGAGCCGTGCTGTACGTGCGGCCTGCAAGGGTGGATGGGGGTGATTTGAAGCATATGGACTTAACGGTCGTCTAGGATTGGCGCGATCTGGCTTAGTTGGATTTATAGCGCCATTTCCTTCTAAAAATGGTGAAAAAAAAATTAGTGGCTATATGAGATGCTAGTTAGGGTTTTGACGGTAATTTTGGAATGGATCTGTGTTGCCTCAAGGATCTCCGTGGTGTGGTTGCACCACGGGGATATCGCAGGTGGTGTGATGGATGTCCAGATGGTGACCCATGAATTTCTTGTATAGGGATGGAGTAGAATTGAATGTAGTTAGGGTTTATGCACCCCCTGTCGGAGTTGTACGTGCAGTCTGTAACGGTCATCCAGGATTGGGGCGATCCAGTTTAGTTGCATTTATAGCCCCATTTCCTTCTTAAAAAAGGTGATCTTTTTAGCAGCTATATGCGATGACGTGACGTTGTTTAACTTAGGGTTTTAATGGTAAATTGGACTGGAGTTGTGTTGCCCAGAGTATCTCGGTTCGGCTTGGTTAGGTCATAGGGGCATTTTCTTTTAAAAGATGCCATTTTGTGATGAGTCGTAATGTTGGCTTGATCTTTTAGCTATAAAGTCACTGCTTTTTTTTCGAAAAGGAAGGAATACCCCCGGCATGCCTTCTATTTAGGTGCATGTTGCTCCAATTTGATCCGTGCATGCCTTCTATGTGTTATGTGTGTAACCATAAAAAATATTTGGACCTTTAATTCCTGAATGGTGTTTGTGGGCGGGATGTGGTACTTTTAGTATGATCATTTCAGGGTGTTCTACCTTGTTCCCTGTAAAAGTCATAACTGTGGCTGTGGTGTTTTTTGAAGCATGGACTCAAGGGTCGTCTAGGATTGGCGCGATCCGGCTTAGTTGGATTTATAGCGCCATTTCCTTCTTAAAATGGTGAAAAAAAATAGTGGCTATATGAGATGCTAGCTAGGGTTTCAACGGCAATTTTGGATTGGATCTGTGTTGCTTCAAGGATCCGCGTGGTGTGGTTGCACCACGGGGATATCACAGGTGGTGTGGATGGATGTCCAGATGGTGATCCATGAATTTCTTGTATGGGGATGGAGTAGAATTGAATGTACTCCAGTTAGAATTTCTTGTATGGGGGATGGTCTCTTAGCATTTACTCTGGGCAAGTATTTGTCTATATCATGTTCCTTTGTGTTCATCATAGTCCATGCATGAAAGTATACTTTGCCGTGGTACCCAATTGTTGAACCACATTTTTCTTTTGCTAGACTGCATTGGATCAGCGTTCAACGTGAAAGGGGCAATGCAATGCCCTAACTGCCGGAAGATAGAGAATGGCCGCTGGATTTTTAAAGACGGGCATGGTCCAGCTCTTTATTATGATACAAACTGGATTGAGGGTACAAATAACTGGGCAATGAATGACCTGGTTCCAGATCCTGTAAGTGTTCATTTTGCTGTTACAGAAGGCAGTTTTAGCTTTGTATGCTGTCATCGGCTAACAACATTTTTGACTTCTCCATATTTATAATCATTTCGTTGTATGCTGTGCAGCCTGGATTTGATTCGTTTGATCCCAGTGATATTGAGGGTTTCACAAATGCATTTATGGCATCCATGTTTGAGTAAGATGTCTCCTTTTATCTTCATACTAGCTAATTTCCCTTGCGTACGTTGCTATGGAATAACAATTTTGATTACCCCTTGCATGTCTAGCCATTGTTCCTGTAGTGCTTAGTGGCAGCATTGCTTTCCTTGGTTTCTGGGTAGTATGCAGTTATTAATGCTGAACTTGCCGTGTTACGAAATATATCTTGCTTACCCCGTGGTGATAGTGTGCAATTTCCTCAGGTTCTTGAAAGACTTTTATATTTCAATTTTTGAAGTTCTGAATTTAGTTGGTATTTTCTTGCAGGGGTTTGCCCGAAGCTGAGCCAAGTCAGCCACTATCCAGTAAGCCTGTCGACCTAAACTTTTAGCTTCCTAATTTCAGTCTTCTTGTTTATTGATTTTTTTTCTCCTTTCATGAAGATCATATGTCTGGAAATCATTCAGGCGCTGGAAGCAGTTCAAATGCTTACCCACAACTTTCAGCGCGTGATTTGCGCCTTCCTGCGCATGTGCCTTCTAGTGCGAGTTCTGGCGCTGAAGTTGCTTCATTACAACACAATCCAACTGGATTGGAAGGCCGTGCAGCTCCTGCTCCGGGCAATGCCCAAGCTGTCCAGGCATCCGAGCCGAGAAATCCTGATGGCGAGCACCAATATTCTGCACTTTCTGCATCAGGCTTCCTGAATCGTGCTATGGCTTCATTTGCTGCTGCTAGAGCACCACAAGGATCAATTCCAACTATTAGCAGCCAACAGAGATCAAGACCATATGTTGTACACCATTATCCTGTAATCTACAACTACAGGTATGCCCGATCGATTAACGAATACTATTGGGGAATACAATCATCTGTCTCTGCAGTTCATGTCTATTTTTTCTTATGCTTAATTAGCTCTTTGATGTTTTAATACTGCAGGTTCACACCTCAGCTCAATGGAAGCAATCTGGGGGCAGCAGCATTAGGGTCGGTGCCAACTGCTATGGCTGATACTATAGGCCATATTCATGGTGCAAGCGCACAACTGTACCAGCAGGCGCTGCACTACCATATGCAAAGCAACCCGTCCCCTCCTACTAGTACAACCAGAAGGGTCAGGCCGAGGGCTACTGCACTTGAATCTTTCATGGCAGCAGCAACAGCAACAGCAGCAGCACAAACCTCATCCAACACTGGATATGCTACCCTTGCCACCATGAACCCTGCAGCTCTCAACATGAACCTTTCCAGCTCTAATGGTGAAGGTCCCTCTTTTAGGCCGCCTGTTGCCCCATCCATGGGGTGGGGCCGAGAGGCCGGTTATCCCGTGGCGCCGGCGGCCGGTGAGACTACTCCTCCTCAATGGTGGAGTACTTCCGTGAGCTCATTCCTGAACCTGAACCCAAATGTGAGCCAGCAAAACCTGAACCTGAACCATGCTCCTGGACGTCTCACTACTCGAAGATCTGCTGCTGGTGCTGAGCAGATGCCGCCGCAGGGTAACCCGGAGAACGGTTGCCCGCCGCCCTCTTCTTCTTCCCAGAGGAGGTCTCCCTCCCAGTGAATGGCTCAGGTACTCTCCTCAGTGAAAATAAGGGGAACGCACATTCTGCGTGCCCTGCCGCACATTTTGCGGCCGCTGGAACTTGGTTGCCGTCGTACCGCACGTCCTGCGGGTTAATTGGAACTTTGAACTCCTTGGTTGGTTGTGGTCGTCCTGCCATATATTCTGTGGTGGACCGTGAACTGTTTTACCTGTTTTATCCGGTGGTCTTGGAACTTGTGTAAGAACCTGTGCGCATGATTGGCGCTCTGTTATTGGTTGACATTATTATTGGACATGGC
CDS Sequence
- >BRADI_3g41680v3
ATGGAGCCGCTTTCGGGGAAGACGGTGGTGGATCTCGAGAGGTCGCCGCCGCCGTCGCCGACGCAGTGGACGGTGGGGATGGCCGGTTCGGGGGGCGGCGGGGCGTCGTCGTCGTCGTCTGCCGAGGTGGCGGCGGCGATCGCTGCTGCGGAGGCGGCGGCCGAGCCCTGCTCGATCTGCCTGGACCCCGTGCAGGGCGCCGTCGGCCGGGCCACCGCCAAACTGCACTGCGGCCACGAGTTCCACCTTGACTGCATTGGATCAGCGTTCAACGTGAAAGGGGCAATGCAATGCCCTAACTGCCGGAAGATAGAGAATGGCCGCTGGATTTTTAAAGACGGGCATGGTCCAGCTCTTTATTATGATACAAACTGGATTGAGGGTACAAATAACTGGGCAATGAATGACCTGGTTCCAGATCCTCCTGGATTTGATTCGTTTGATCCCAGTGATATTGAGGGTTTCACAAATGCATTTATGGCATCCATGTTTGAGGGTTTGCCCGAAGCTGAGCCAAGTCAGCCACTATCCAATCATATGTCTGGAAATCATTCAGGCGCTGGAAGCAGTTCAAATGCTTACCCACAACTTTCAGCGCGTGATTTGCGCCTTCCTGCGCATGTGCCTTCTAGTGCGAGTTCTGGCGCTGAAGTTGCTTCATTACAACACAATCCAACTGGATTGGAAGGCCGTGCAGCTCCTGCTCCGGGCAATGCCCAAGCTGTCCAGGCATCCGAGCCGAGAAATCCTGATGGCGAGCACCAATATTCTGCACTTTCTGCATCAGGCTTCCTGAATCGTGCTATGGCTTCATTTGCTGCTGCTAGAGCACCACAAGGATCAATTCCAACTATTAGCAGCCAACAGAGATCAAGACCATATGTTGTACACCATTATCCTGTAATCTACAACTACAGGTTCACACCTCAGCTCAATGGAAGCAATCTGGGGGCAGCAGCATTAGGGTCGGTGCCAACTGCTATGGCTGATACTATAGGCCATATTCATGGTGCAAGCGCACAACTGTACCAGCAGGCGCTGCACTACCATATGCAAAGCAACCCGTCCCCTCCTACTAGTACAACCAGAAGGGTCAGGCCGAGGGCTACTGCACTTGAATCTTTCATGGCAGCAGCAACAGCAACAGCAGCAGCACAAACCTCATCCAACACTGGATATGCTACCCTTGCCACCATGAACCCTGCAGCTCTCAACATGAACCTTTCCAGCTCTAATGGTGAAGGTCCCTCTTTTAGGCCGCCTGTTGCCCCATCCATGGGGTGGGGCCGAGAGGCCGGTTATCCCGTGGCGCCGGCGGCCGGTGAGACTACTCCTCCTCAATGGTGGAGTACTTCCGTGAGCTCATTCCTGAACCTGAACCCAAATGTGAGCCAGCAAAACCTGAACCTGAACCATGCTCCTGGACGTCTCACTACTCGAAGATCTGCTGCTGGTGCTGAGCAGATGCCGCCGCAGGGTAACCCGGAGAACGGTTGCCCGCCGCCCTCTTCTTCTTCCCAGAGGAGGTCTCCCTCCCAGTGA
Protein Sequence
- >BRADI_3g41680v3
MEPLSGKTVVDLERSPPPSPTQWTVGMAGSGGGGASSSSSAEVAAAIAAAEAAAEPCSICLDPVQGAVGRATAKLHCGHEFHLDCIGSAFNVKGAMQCPNCRKIENGRWIFKDGHGPALYYDTNWIEGTNNWAMNDLVPDPPGFDSFDPSDIEGFTNAFMASMFEGLPEAEPSQPLSNHMSGNHSGAGSSSNAYPQLSARDLRLPAHVPSSASSGAEVASLQHNPTGLEGRAAPAPGNAQAVQASEPRNPDGEHQYSALSASGFLNRAMASFAAARAPQGSIPTISSQQRSRPYVVHHYPVIYNYRFTPQLNGSNLGAAALGSVPTAMADTIGHIHGASAQLYQQALHYHMQSNPSPPTSTTRRVRPRATALESFMAAATATAAAQTSSNTGYATLATMNPAALNMNLSSSNGEGPSFRPPVAPSMGWGREAGYPVAPAAGETTPPQWWSTSVSSFLNLNPNVSQQNLNLNHAPGRLTTRRSAAGAEQMPPQGNPENGCPPPSSSSQRRSPSQ