Information report for BRADI_3g17950v3
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a protein with similarity to VRN5 and VIN3.Contains both a fibronectin III and PHD finger domain. VEL1 is a part of a polycomb repressive complex (PRC2) that is involved in epigenetic silencing of the FLC flowering locus.
Homologous
- Citrullus lanatus: Cla97C08G154630
- Juglans regia: Jr08_07470, Jr08_07460
- Musa acuminata: Ma08_g33930
- Oryza sativa: LOC_Os08g12430, OsVIL1
- Setaria italica: SETIT_013411mg
- Setaria viridis: SEVIR_6G024000v2
- Zea mays: GRMZM2G106766, GRMZM2G046861
Gene Resources
- Pfam: PF07227
- UniProt: I1I1Y2
- EMBL: CM000882
- KEGG: bdi:100837188
- OMA: GDAYCKR
- InterPro: IPR032881 , IPR044514
- PANTHER: PTHR46286 , PTHR46286:SF6
- OrthoDB: I1I1Y2
- CDD: cd15521
- eggNOG: ENOG502QR8D
- STRING: 15368.I1I1Y2
- HOGENOM: CLU_016873_0_0_1
Sequences
gDNA Sequence
- >BRADI_3g17950v3
AAAAACTTGTTTAAAATTTGATTTTAGAAGGTAGCCTACAAGCAGGACATATGCGAGATCACGCTTGCATCCCTAGGCAGCAACAATCCAACAAAAAGTAAATACAAGCAGGACATCTGCGAGTAGGAAACTTTTTAGAATGTACTCCCTCCGTTTCATAATTCTTATTGAAATATTACATATATCTAAACACTTTTTAGAAATAGATACATCCATTTTTAGTCAAATTTGAGACAAGAATTGTGAAACGGAGGGAGTATATATGGAACAGAATCTCAAGCAAATTAACTAGCAGTCGCAACTTAATCTGACGAAACACACCCTAGTTTTGACCATCTAAATACAACCAAACCAACCCACGAGATGAATACACGATCACACACATGGACAGAGACAAATCTGTCACATGAGGCCCGGGCGAGAATGGAAGGGGAAGTGCGGCGTCGTAAGGGCAGCCCGATCAAGGTTGCTGCTCCTCTTCTTCTTCTTCACCTCCTCCGTCGTTACACCTTGCTGCTGCTTCTTCTTCCTGCCATGGCCACCAGCACCATTCACAGACGGCGATGAGGAGGAGTTGCTCTTGGGGACTGACGGCACGCAACAACAGAACAACCCCATTTATATATATATCTATAGCCTTCTTCCTTTTCCCCTTCGTTTACAAGCTCTCTCTTTCCTTCTGCAGCTTTATAAACTCGATCTGCTGTTCTTTCTACTCTCTGTCTGTGTGTTGGTAAAGCGGAGAGGTTCCTGGGCACCCTTTTATACTGAACTCGATCTCCAAACTTCCACCTGAAGGTTGCTCCTATAGTTGCTCCTCTCCTGCTCCCGATTTTCTTTTTATTATCCAACACAATGTTGACTTGTGCACCTCGTATTCCTTAGGCACCGTGAGCACGCAACTTTGTAGTAGCTGAAAGGGCTGACATGTGGGCGAGAAGAACTTAGGGCCATCTTGTCAGTGAGAGAAGTGGATGGTGTGGCTGGTAACTATCGTTTGCTCTGGGCCTCTTGGATTTTTCTTAGGCCTTGGTCATGTAGTAAACCGAAGCACCTGGATGAGGTTAGGAGGCGAGCTTCCTTGGCAGGCAAGCCTCTCAGATAAAACAGACTTCTTTCTTTTATTTTTTCTATATTTTCCGGGAAAACGATTTTGTGCATGTGGATTGAAAATGAAAGCTCTGCCAATCATCGATCTCTTGGGATAGAAACTGGGTGGAAGCCCTTTTGTTTTGACCATGCATTTTGCTTCTCTCTTTTAAGAATTGTTTGCTTGGATCTAAGCTTAATGGACCAAACAATCTCACTCTACATTTCTTTTTCTTGAATTGATCACGCAAGTAATATAAGCGTACCGATCATGTCTTACTCTCGGTTACACATATGTAGATAACGCGCGTGTTTAGTGTAAAACAGGAAATCATACGAGTTTGGCCCATACGGTAATTTTCGGAACTCTGAGAGGCCGATTAAATCAAGTGATAAGAGTTCAAATTTCAGGTCCATCTTGCTAAGGTTAGAAGAGTTGCACCACCTGCACTCTATCCCCTTGGCACCACGCAATATGCTTGTGTCATGTTTCGTGAATCAAGTTGATATCATTAGCTTACGTGGTTTTGACTTTTGCTAGCCAGAACCGTATCACGTAAATCGACTTGCATTATGACCGAGTTGCTATACAAAGAGGCGCTCTACCGAGAAGAATCTTGACGCAAACCCATCTCCGGGCTTTGGTCAAAAAAAAAAACCATCTCCGGGCCTCCAGGCCTCCATAGCCCTCAAAGCTCGTCCACCGGGCCTCCTCCAGGCCCGCCACGATCCAGCCCACCCACACAAACACTCCTCTAGATCTATTTATCCTGTCCTGCCCTATCTCTGCATAGTTCCCCTTTCTCTTTTTTCCATGCCACTTCGGGACTCCCCAGTCCCCACCCCACTGGCCCTGGCCTGCACTGCACTCTCACGCGCTGACACCCCGCATCAGCTTTTGCATCTGACACCCCTCTCTCTCCAGCCCCCACACCACCAATGCATCAGCCGCAGCAGAGCAGAGGGCGCCGCTGAACCCATAGAGCTTCGCCCTCCCTCCCTACTGCGCCCCTCCCTCTCACAATTTATCCGCCCCCAATTTGCTTCCTTTCTTTCTCCCAGTCCCAGGTTTCTGCTCCCTGGGCGTCCGTTTCGTTTCTTGGGGAGTTGTTTCCAAAGGTAGGGTTCTCGCCCCTCGTCTTGTGTCCGTTCTCGATCCTTCGGTCCGGTTGTACAGGCAGCGCGTGGAAAAGCTGGTGAACGTCTGATATGTCTGGGCGTGTAGTGTAGTGTTCACATCTAGGGTTGTTCTTGGCTTTGGGGAGCAATGCTGTCCAACTTTTGCGATTCCTTTGGTTCTTGTGGATGAATCTCCAGGCAATGCTGCTCTTTTACGGCAATTTCGTGTTTTTATAGTCGTTGTTGGTCAAATTTGTTTGATTTATACGCCTTGATCTGTTTTTGGGGTTCATAGCATCCACAGGGGTCTGATATTGGAAGTAGACGCTGTTGGTGCTGCTGCGTATTGTCGGTGTTAATTTGTTTCGCCTCTATGTTTGTGTGCTCTTTTGGGGGCAACTGATGCTGGTTTGCCCTAATTTATCGTATAGTCAACGATACCGCCTTGAAGAGCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTTATCTGAATATTCCTGCATGGTCAGAGGGCATAATCTGTGCTTTTTGTTCCTGTAGAAACTTGGGGGCAACAATTGACTGGATTTCTTGAAGAAGAGCACCGTCGAATCTGTTTCACATGGTAGGGTCATGTCTATTTGGCTATGTTAATGATTTTTAATTGCCACTATCTGTGATAAAATGATAATACGAAATGTTTTGCATTTTGTCCCAACACTTATATGGATGAGTTTCCTGTTCATGTAGATGCCCAATTTCAGCAAACAGTGACACCATTGATTGGTTTGGCTTTGGTAGCCTCTGCTTTCCTGGTAAATTTCTTTCTCCCGATGGAAATGCTGTTAACTTCTCACCTATTGCTAGATCTTGTCATCTGTTTGTATTACTGACACTGCGTAACCATGCCTATTAGTTGAAGTGACTAGGTAAGGTATTACCAAGTTTGTCATACAACATAAATGTTCTCAATTCTGATAGTTTGGATTTCCTCGACATAAATGAGTTGATATAAACATGGAGCCTACTTTCTTAGGTATCGTTTGGTAATATTGTGTGGATATGTGCTATATTTCCGATGTGTCTCGTAGTTTTGGTTTATTCTACACATTCCTTTCAGTCCAGTAGATTTCCATGTTGTAGTGTTCAGATTGTAGAACTCCTTGGTGGTACGGAAATATAGAATTATAAATATCGTTAAATAGGAGAACTGGCACTAAAGGTGTTGACCACTGGGCCAGATTTGGATAGCTAAGCTCATATGTTAAAAGCATTTTCTTTCAGAAGATCGCTTGAATTATTCTACAATTAATCTCTGATCATTCCATCTTCTAGTGCTAGTAGCATGAGCAATTCAGTGTAATCTTCACCATCAAGATCTGACATGACAGCTAAGGTTGAAGTTCGCATGATGCTACACAGGGAGGTTTCTGAATTAGCTCTCCTACCATAATGGTAGCATGATAATTATTGGATAAGGATGCGTGCACTGATATGTATCTGTGCCTATCAGAATAGTTTCTTTTTTATAAAATTCCGATAGACCAATTGGATGACCAGTCTTGTTTTTACAACTACGGGAAAGAAAAACAATCAATCTGCATTCTCGCACACAAACAGCAAATTGAAGCCATCTGCCCACACCAGCGACAATCCAATGCTCAGTTTAGGACTAGATGGATGGAACAGGCTGGCACGTCCTCTTTTTGCATTTTTTTCCTTCAAATTTGTATGGATGTATCCTTATTCTTTGGATAACATCATATCTCTATCCATATGGTGTATAGAGGCAACCATGCCAAACTTGTCCAGAGCCGCTGAGAATTGCTCCCTCTGATCCGTATTAGTTGTCGAAATATTACATGTATATAGACGCTTTTTAGGCATAGATACATCCATATTTGGGCAAATTTGAGACAATTAATATGGATCGGAGGGAGTAGTATTTTATTGGTTGGGCATATGGAATCTTGTCATTGTAGAACGGTTATGGAAAGTTTCTCAACTGGAAGTGAGCGAAATTCAATTTTAGTTATAAGCATGTCTGCAGTATAAATTAAACTAAATTATGGAAGCACGGATTTGCAACAATCTCTTCAGTGGTAAGATTTGCAAAACTTGGTCAAAACGTGCAAATCAAATGTCTTACAATGTCATGATCGTCTCGCTTCTTCCTTGCACTCAAGTTGCATGTTCTGAACCACAAAAAAAGTTGCATGTTCTCATTGAATCGAAGATATTTCCGTCTGGAATTATTAGTATCAAGTATATGTACGTACTTTAGTACCTAGGTGCCGTGTACTGAGTACAGGTACGTTGTATCGTATGGTACTGTACCGGGAGTCAACGTACGGTACCTGTAATATATGGAAGTCAGTGCATGGCCAGATTGAACCTTTTCAAAGATCAGCGACATTCCTCTAAACATAGAGAAGGAAAACCAGAAAACATAATCAAAAAAATTTGGGCTGTTGCATATCTTGTCAAAAGATTACGTCATTATGGCGCTGAAGCAATAAGTGTTGCTTTCTATGTAGAACTTCTCATGTTCTCCAAGAAGTAGCTTTCAGCACTAGTGCATTGCTGAATCCACCCCATGGCATTCTAGGCGATGAAAATACCTAACCCCAAAAAGGTGACGAAGGTGATAAGAATCTCTAATTCGTTACCTTTCCCCTCTTTGTTTTTGTTTTGTTTCCATCTGTGTTCTGCCACGAACATTCGATATATGATGTTTGAGATCTTGGATATGTTGGAAAATTGGATCCTTGAAATCCAGAGATGTTGCAGCTTCGGTTTGGACTTGTAAGCTG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- >BRADI_3g17950v3
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Protein Sequence
- >BRADI_3g17950v3
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