Information report for BRADI_3g08080v3
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- Encodes a nuclear protein that functions in mRNA processing. Mutations in this gene cause embryo lethality and reduced transmission through the female gametophyte. Over-expression of a CLPS3:TAP protein changes the relative levels of two alternatively processed FCA transcripts. It also causes abnormal phyllotaxy and flower development, early flowering under long and short days, and increased levels of CUC1 and WUS expression.
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT3G04680
Gene Resources
- Pfam: PF06807 PF16573 PF16575
- UniProt: A0A2K2CVW8
- EMBL: CM000882
- AlphaFoldDB: A0A2K2CVW8
- InterPro: IPR010655 , IPR027417 , IPR028606 , IPR032319 , IPR032324 , IPR038238 , IPR038239 , IPR045116
- PANTHER: PTHR12755 , PTHR12755:SF6
- SUPFAM: SSF52540
- Gene3D: 2.40.30.330 , 2.60.120.1030 , 3.40.50.300
- OrthoDB: A0A2K2CVW8
- STRING: 15368.A0A2K2CVW8
Sequences
gDNA Sequence
- >BRADI_3g08080v3
TTTTGTTTTTCTAAAAAATATACTTATTTTAAGAAGACGATCTCGACCGTTGAATCTTTATCTATAGAAATTCATTTTCTTTTCATCCAGTTTCCGTAGAGATGCACGGCATATGCTACCGTGTACGTGCAGGTTCTTTTTTTGCCCCAAAATGAAATACATGAAAATTTTCAAAGCATGGCAGTTTTCGGGTGAAATTCCCATAAAATTCGTTCAAATTCTTGGTTCCCAACTTCCGGTAGGGATCCAATCGTTTGCATTGCTCCTCCGTCCTTTGCGCTCTCCGGCAGTCCAGCTGCCAGCACGCCAGCCTCGGCGGACGCTCAAACCCTCGCCCGCCGCTCCCCAAAACCCCACGATGGCCGCCGCCGGCGCTACCGGGGCCGCGGCCGCGGCCCCGCAGCCGCCGCGGATGTTCAAGCTGGATCCGCAGAGCGAGCTCCGCGTGGAGGTGCCCCCCGACGCGCCCCTCCGCGTGCGCCTCGTCGCCGGCACGGCGGAGATCTTCGGCACCGAGCTTCCCCCCGAGGGTTGGGTCCCCGTCCCGCCCCGCTCCAAGATCGCCGTACGCACGCCTCTCCCATCCCCCACGGATGCCCGCCTTGCTCTGCTTACTAACACCAGCACAAGGAATTGGGTACTGACTTGCCATGCCTGTTTCTTCTCACGATTAGATTTTCACGTGGCACGGCGCGACGGTGGAGCTCGACGGGGTCAGCGAGAGCGAGTACACGTCCGACGAGGTGAGGCAGGGTTTCATTTTCTTCTTCTGTCAAAACATCTTCCGAATCCTGTTGTGTGAATGTGGGGTTTGAGGTTTTTGAATGTGATGCGGTGACGAGATGGTTCTGTTGTGGGTTGTAGACGCCGATGGTGATTTACGTGAACACGCATGCGATCCTTGATGCAAGGAGGGCTAGGGCGAGGGCTGCCGCGGCGCAGGGAGGCGATTTGGAGGCCTCACAGGTGACTCCTCTCATTTCATTCTGTTTAGCAATTATTCTTCCTATTGTTCGATAGGTAAGATAAGGCTCTGTAGAAATGCCATGTTCTTTTTAATCCACAAGTTTGTTTTCTCGTCTCATTATTAATCTACTTGTCAACCTGTTTGTTTTGCAATTTTTGTTGCGTGTGGTAGGTTTATATCATAGAAATGGAGAAGCTATGTGTAAATAACATGATACTTGACTTTAAAACCTGTCTGCAATGCTTTATTGCTATCTGAACAAATAGATTGCTATATAATCCAGGTGAACAGTACCCTGCAGCAATGTTATTTTGATTCAATATGTGTTGGAATTCAGGAATCATTGTGAAAAAGGCTGCTACCAGTTGTTAAGCTTCATATTGAGTCAGTGAATTTTGCTACTCTTGGTGATTTAGGGACCCAGAGTGATTGTTGTGGGGCCGACCGATTCTGGAAAGAGCACTTTGTGCAAAATGCTCCTCAGCTGGGCTGCTAAACAGGGATGGAAGCCAACATATGTGGATTTAGATATTGGCCAGGGATCAATAACCATACCTGGATGTATTTCTGCTACACCGATTGAGAAGCCTATAGATATAGTTGATGGGATTCCCTTGGAGATGCCGATTGCATATTTTTATGGCCATCCAAATCCAAGGTAACTTGCCAATTTACTTCATTGGTGGCTAGTCACTGCTCCGTGTATTAAGGCTGGTACTTTTCTGTTATATTGTTTTGGCGTCTCAGTATTGCTTTGTGTTGCAAACAGTATTAATCCAGATGTTTACAAAGCTCTTATGAAGGAGCTAGCTCAAACATTGGAGACACAGTTCTCTGGAAATGCTGAATCTAGGGCAGCGGGCATGGTTATAAACACTATGGGGTGGGTTGAAGGCCTTGGCTATGAGGTAATTATTTGGTTCGGAAATGTAAATAGCAATTCGATAAGCATGTTGATGGTTAGTTTTACATGCTAACACAACTTAAATCCCCATATGTGCTGTGCAGTTACTTCTCAATGCAATTGAAACCTTCAAGGCTAATGTAGTGCTGGTGTTGGGACAGGCAAGTGCCTCATTGCTATTTTCAGTTTTAATGTCATTAGTTTACTTCATAGTGTTGTTTCACAAGGGATGTGCATGTGCTTTAGTCTTGTAGATAATCAATATTCATTTTGTATTCCCTGACTCTTGCTTTCTAGTATTAGTCTATAATTTTATCCCAGTTTAACAATAGTGTTGACTGCTGAATTTATAGCTTAGCATAGTCAAACCTATCATTTTTTTCCGTAGTACTGTATGTTCTGCTATCCATGTGTTAACTAAAACCTTTTCTTGAAGAGGGAGGTCAAAGATATGTTGGTTCATCCCAGGCCAATTTTCAGCCCTTGGGTAGCCAAGCTTTGTCAAGGATTCCTTGGCCCTTGGGTTGCCAAAATTTTGGCAAGATTTGTCAAGGGATGTGAGTTAGGTGGGAAAGATTCCGTAGGCAGCCAAAATTTTTGCACAAACCAAACATACCCTAACATCCAAGTATCAAACTAATTTACCCAGGGGCCAGGCATGTAAGGATAAGGCATTTATTTTACAACAAAAATATTTTCTTGGGGAAGCTATATCGGACCATCTACTATTAGACGCATGGGTCGAGGTAAGAGAAGTTAATCCAACGCAGCAACATACTCTGCAGGCAGCCCCCTCTGGTTAGAATTATCATCAACATCAGTATATACTATATTCACGCATGAAATCTTACTCGTTGAAGTTTTTTTTTTCATATTATTCAAAAACAAATCTGGGTCGATAAAAAGCCTCTACAGCGAGAAATAAGGAAGTTTGCATTGCAGTTCTAATTCTGGCAAAGATAACCCAAAGAGGTGCTTGTTGAGTCTATGCCAAGTTGCCAGCAGATAAGTTTGCAAAAAAATTGTGTATATAATTAGAACACAAAAACCCCATGGATGCAGAAAAGCAGATACCGTAAAAGAAGAATCAGCTACCAAGATTAGCTTGTATACCTTCTCATGTTGTCATCCATTATTGGTGAAACTTAATGATCTGATTAAACATGAGATCAAATGATCCTGAGGCTTATTGTTAGTTTTGCCTTCAAAATGTGGAATCATGGATAAACATGAGATCAAATGATCCTGAAGCTTGGAGTGATATGATTTGTCTGCTGCAGGAGAAACTCTGGAAGATGTTAAAAGATGCAGTACAAAGTAAGCCCAACATTGATGTTGTAAAGCTTCATAAATCAGAGGGTGTTGTCCTAAGGAATTCAAAATATCGTCAAAAAACTAGAAGCTTCAGAATCAAGGTAAATTCTTTTTTCAATTCGGGCCCTGGGTGTTCCTGATTTTGAGATTCATAAGTAGCCCTGTTGCTATGAATTGCCTTTTAGGATTTTTTAGGTATTTCATTTTATTTATGCTGCAAGGCATGACATAAAATTTAATTTATGGAACCTTGAGTATATGCATTGTTGTACTATGTCACTCGTTATTGCCATTTTTCTATGTTATTTGTATGTTGGCATTTTTCCATTTTAATGCCTCTTTCTTATATTCTTGATACACTAAAGGTAAATCCTAATTTCCTTTTCGCAGGAGTACTTTTATGGGATTGCAAATGATCTTGCACCACATTCAAATGTTGTCAACTTCAGTGATGTTTCTGTTTACAAAATTGGTAGTGGACATCAAGCTCCTCGGTCAGCATTACCAATTGGTGCAGAGCCTGTGGCAGACCCTACTCGGCTTGTTGCTGTTAACATCAGCACAGATATGGTCCACACAGTGCTCGCTGTTTCTTATGCGAAGGAACCTGATGAAATAAGTTCAAGGTAATGTCAGCTGTTATTCTCCAAGATAGAGTATTGATTAGGTGTTACATCCACCACGTGCTTACAGGCTAGGGCTACAAAGCTTGATGCAAAAGTGGCCCCAACTAGAAGTAGAGAAGATCACAAAGGCCTTAACAACAAATTACTCATGTTACAAGTATCAAAGTGCTATAGTATTTTCAGTTTCATATGATTGTTAATTAAACCTAGATATAGAAGATATGGTCGTTTATTTGACTTCCATGCAAACTTTGCAATTTTTACTGCTGTAGGAATAGGAATCATTTGTGTAGTTATTCTTTGGAAAAGGTGGCATAGTTTTGTTGTTTGGCATTGGATTGTTTATGGATTAGAGGTACTTTGTGTAGTCATTTGTGTTTTAACTTTAATTCCACTGGTATATTGTCTCAGCGGACAGATTTGTGTAGTCGTTTGTGCGTGCGTGCGTCTTGGAGCTTGCATTTTTTCTTAATAGAAGTGTATTTACCTTTCTGGAGATAAATTTGCTAACACCTACAATAAAATTTCTGTCCAGCAACGTCGCCGGTTTCATTCATGTCACAGATGTTGACATTCAAAGGTACACCAACACCGTGGAAGCAACTTCTAACCCTGCATGGAATTCCTTGAAGTATTAACCTTGGGACTAACACTAGCGCGTTTCAGGAAGAAGCTGACGTACATTGCACCTTGCCCAGGAGACTTGCCAAGCAGGCTGTTAATCGCGAGCTCCTTAACATGGTACGAGGCATTGTAGTTACGTGTGATCACTTTAACCAGAAGAACTTGTTGTAACGCTGAAATGTATTACGTGCATTTTAACTGTCACAGTGTACTAATGGCAATGGGTTTGATATCTTGGTGTGTAGTTAGTCTTGTATGGGTACGATATCAATATCCTGGCATCTTGCGTAATGAATGTGTCTGATATCAATGTACTACCTCTTACCGTCTTTTACGAGGCTTGTGTGTATATCTAGATCATCAATTTGATCAACAAAATATGTATTATATTCACTCTATTTCACAAAGATCGACGTATTTTGTTTTGTTAAGACAATGCTTTGATCAATGAAAATTCTATTGATGTGTTCTTTCAT
CDS Sequence
- >BRADI_3g08080v3
ATGCTACCGTGTACGTGCAGGTTCTTTTTTTGCCCCAAAATGAAATACATGAAAATTTTCAAAGCATGGCAGTTTTCGGGTGAAATTCCCATAAAATTCGTTCAAATTCTTGGTTCCCAACTTCCGGTAGGGATCCAATCGTTTGCATTGCTCCTCCGTCCTTTGCGCTCTCCGGCAGTCCAGCTGCCAGCACGCCAGCCTCGGCGGACGCTCAAACCCTCGCCCGCCGCTCCCCAAAACCCCACGATGGCCGCCGCCGGCGCTACCGGGGCCGCGGCCGCGGCCCCGCAGCCGCCGCGGATGTTCAAGCTGGATCCGCAGAGCGAGCTCCGCGTGGAGGTGCCCCCCGACGCGCCCCTCCGCGTGCGCCTCGTCGCCGGCACGGCGGAGATCTTCGGCACCGAGCTTCCCCCCGAGGGTTGGGTCCCCGTCCCGCCCCGCTCCAAGATCGCCATTTTCACGTGGCACGGCGCGACGGTGGAGCTCGACGGGGTCAGCGAGAGCGAGTACACGTCCGACGAGACGCCGATGGTGATTTACGTGAACACGCATGCGATCCTTGATGCAAGGAGGGCTAGGGCGAGGGCTGCCGCGGCGCAGGGAGGCGATTTGGAGGCCTCACAGGGACCCAGAGTGATTGTTGTGGGGCCGACCGATTCTGGAAAGAGCACTTTGTGCAAAATGCTCCTCAGCTGGGCTGCTAAACAGGGATGGAAGCCAACATATGTGGATTTAGATATTGGCCAGGGATCAATAACCATACCTGGATGTATTTCTGCTACACCGATTGAGAAGCCTATAGATATAGTTGATGGGATTCCCTTGGAGATGCCGATTGCATATTTTTATGGCCATCCAAATCCAAGTATTAATCCAGATGTTTACAAAGCTCTTATGAAGGAGCTAGCTCAAACATTGGAGACACAGTTCTCTGGAAATGCTGAATCTAGGGCAGCGGGCATGGTTATAAACACTATGGGGTGGGTTGAAGGCCTTGGCTATGAGTTACTTCTCAATGCAATTGAAACCTTCAAGGCTAATGTAGTGCTGGTGTTGGGACAGGAGAAACTCTGGAAGATGTTAAAAGATGCAGTACAAAGTAAGCCCAACATTGATGTTGTAAAGCTTCATAAATCAGAGGGTGTTGTCCTAAGGAATTCAAAATATCGTCAAAAAACTAGAAGCTTCAGAATCAAGGAGTACTTTTATGGGATTGCAAATGATCTTGCACCACATTCAAATGTTGTCAACTTCAGTGATGTTTCTGTTTACAAAATTGGTAGTGGACATCAAGCTCCTCGGTCAGCATTACCAATTGGTGCAGAGCCTGTGGCAGACCCTACTCGGCTTGTTGCTGTTAACATCAGCACAGATATGGTCCACACAGTGCTCGCTGTTTCTTATGCGAAGGAACCTGATGAAATAAGTTCAAGCAACGTCGCCGGTTTCATTCATGTCACAGATGTTGACATTCAAAGGAAGAAGCTGACGTACATTGCACCTTGCCCAGGAGACTTGCCAAGCAGGCTGTTAATCGCGAGCTCCTTAACATGGTACGAGGCATTGTAG
Protein Sequence
- >BRADI_3g08080v3
MLPCTCRFFFCPKMKYMKIFKAWQFSGEIPIKFVQILGSQLPVGIQSFALLLRPLRSPAVQLPARQPRRTLKPSPAAPQNPTMAAAGATGAAAAAPQPPRMFKLDPQSELRVEVPPDAPLRVRLVAGTAEIFGTELPPEGWVPVPPRSKIAIFTWHGATVELDGVSESEYTSDETPMVIYVNTHAILDARRARARAAAAQGGDLEASQGPRVIVVGPTDSGKSTLCKMLLSWAAKQGWKPTYVDLDIGQGSITIPGCISATPIEKPIDIVDGIPLEMPIAYFYGHPNPSINPDVYKALMKELAQTLETQFSGNAESRAAGMVINTMGWVEGLGYELLLNAIETFKANVVLVLGQEKLWKMLKDAVQSKPNIDVVKLHKSEGVVLRNSKYRQKTRSFRIKEYFYGIANDLAPHSNVVNFSDVSVYKIGSGHQAPRSALPIGAEPVADPTRLVAVNISTDMVHTVLAVSYAKEPDEISSSNVAGFIHVTDVDIQRKKLTYIAPCPGDLPSRLLIASSLTWYEAL