Information report for BRADI_2g05430v3
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- encodes a component of the FAcilitates Chromatin Transcription (FACT) complex, SSRP1. Along with STP16 binds to the promoter of FLC.
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT3G28730
Gene Resources
- Pfam: PF00505 PF17292 PF08512 PF03531
- UniProt: A0A0Q3FUJ2
- EMBL: CM000881
- InterPro: IPR000969 , IPR009071 , IPR011993 , IPR013719 , IPR024954 , IPR035417 , IPR036910 , IPR038167 , IPR048993 , IPR050454
- PANTHER: PTHR45849 , PTHR45849:SF1
- SUPFAM: SSF47095 , SSF50729
- PROSITE: PS50118
- Gene3D: 1.10.30.10 , 2.30.29.150 , 2.30.29.220 , 2.30.29.30
- OrthoDB: A0A0Q3FUJ2
- CDD: cd13230 , cd13231
- STRING: 15368.A0A0Q3FUJ2
Sequences
gDNA Sequence
- >BRADI_2g05430v3
GGGCTGCCGCTGCGCCGCGGCCGCGCCCTCCGATCGCCAAGCAGAAGCGAAACCGCTGGCGTTCGTCTCGCCGAGAAGAAGCGGAAGCGGAGAAGCTCGAGGTGAAGGCACGTCCTGGCCGGGTAGCGGGCGGCGGCGGATATGTCGGACGGCCACCTCTTCAACAACATTCTACTCGGAGGCCGCGGCGGCACGGTGGGCTCGCCGTCTTCCTCGCTTGCCCTTCCCCGATTTCTAGGGATGTCGCCTCCTCTGATTCTCCCAATGTCGCCATTGTAGTGCTGCTATACCCGATTTTTGGTTGAGTGGTTTTTTTTGGCGAAATTTTATACCTCTGTTGTGGGGTTTTCCCAAACCATAAATATTTCTGTTGTGGGGGTGGGTGTTTGCGGTTAGGGTTCTTCGAGTTCGAGGGGCGACAGCTTCAGCGAAATGGGACTTTTACGGCAACTGGAAAGGATGCAGGCTTCTCTGGAGATACCTGCATAAGCATGTTAACGATTAGGAGTAGCCCAGGAACAGGGGACCTTGTTGTTGTGAAGTCATTACTCGAATTAGATTAGATACAAGGGCTTATAATCTGCAAATGTTTTGGCATGCGGTTATAGTTACTCAAAATTAGTAGATATGATCGTGCGTATTTTTTTCCCCATTGTTCAGATTTTAGAAGAGATGTTTGCCGTGGCTGCAAATAGTTTCTCAACTGCTGTGCGGTTATCTGAATTGCCTATGCTTTCCCTAACCCTTGATCCGGTAAAAATCTCGCATCTGTCATCACTAATGAACGCATGATTTTGATCGTCCTCTCACACCATGCCATCCTTTGTTGTACTTAATTAATGACTTTGAGACTGCAAGTTAAGACATGATATATTGTATGTGTGTGGTGAGAATCTTGTCATAGGTTTCATGATTCTTACTCCTTGCAGAATCCTGGTCAGTTTAAAGTGCATCCTGGAGGGCTTTCATGGAAGAAACAAGGAGGAAACGTGATCCACATTGATAAAGTTGATGTAACTTCTGTGACATGGATGAAAATCCCCAGATGTTATCAGCTTAAAATCAGGACCACAGATGGCCTGGTTTACATGTTTAGTGGTTTTCGCGAACAGGTTGTTATTTCCTTATCACTCTTTTCCTTTTAATGTAATTGAGTACTGATATTGTATATCTGACAGAAAACAGGAGAGATATTTGCCTTAGAAGTTACAACCATCTGTGCACAATATTTTTTTTTAAAAATTCTTGATTGTGATGCTTGCTAGTTTGCAGAATCTATCTACAAGACTAAAAAGTAACAGTATCAATTCTGTTTGTAGAACTATCAACGCTATCTAGATTGTCCCATATTAATTTGCTGTGCTGTAGCCATGTTTTTGTAAATATTTTTGTTTTGCCAAGCCAGTTATATTTAACCTGAGTAATTTATGTTTTGCTATTTGATATGTTTTCTTGTATGAACTCGTCATGTATGACTTATCAAACCTGCGGCTGAGGCATTCTACCTTTATCTTTTATGTCTATTTCAATCATGGTGAATTGGTAAACTGATTGATTCTGTGTCATATGTTTTACGTGGGTTATTTAAGTCGTGCAGTATTTATTATATTTTGTTGGAAGACCATACTTTGTATATGTATGTGAACCTTATGGAAATATTGAAGGAAGATTACACATAGTGCTTCTGTAATCGATACAGCATGCTGTATTTATCATACTATCAGCACGAAAAGTCTGGATGCCCTATTGTTGTATCTCACTCAAGATGGGATCCTTTGAATTTTCAAACACTCTTGCTATAGAGTGGGATCAGGTCATTGTTATTCACCAGTGGAGACTAAAACCATCAGATTGTAAAATCGACAAGCATGATTTGTTTTTCAAAATATTGCTAGTTAGTTCTATGAGTATTAACTTGTTAGCGGTAGTGAGTGGTGAGGTTAATGTATTCTACAAATGCAATATTCACCATGAACTTTCTTTCATAGGATACAAGCAACCTGACCAACTTCATGCAAAAGAATATGGGCATCTTACCAGATGAAAAACAGCTCTCTGTTACCGGTCATAACTGGGGAGGGATTGATATAGATGGTAAGCTGCATAGCTTTTTTATTTCTGTAAATACTATTACTTAGTTTTGAATTCTATTTTTAAGTTTTATTTCATTGTAGGAAGCACGCTCACCTTTATGGTTGGTTCAAAGCAAGCATTTGAAGTTTCTCTACCAGATGTCGCACAAACCCAGATGCAAGGCAAAACAGATGTTCTCTTGGAGTTTCATGTTGATGATACTACTGGGGCTAATGAGGTTTTATAGCTCATCTATTCATGTTTTCTATGTTTCCATCCCAGACTATTTAATGTTATAGTGCTACGTTAGCACTTGTTGTGCATATGTTGAGTATTGAGCTCAGTTTAGAATCTCCTGTCATTGTAGAAAGATTCGCTCATGGAGTTGAGTTTTCATGTACCTATGTCAAATACTCAATTTGTTGGAGACGAGAACCGCTCGTCAGCCCAGGTAACACGCCAACACGAAGCAGATTGACATTGTAAATACTAGCGACATCTTCTCATTTTTCTTTTCCTTTGTAGATTCTGTGGGAAACAATACTGGGAGAAGTTGATGCTGGTTCTTCTGAAGCGGCAGTTTCCACCTTTGAAGGGATAGCTATTCTTACACCCAGGTGGGAAATATGACCATCGACTCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACACCTTTGTAGATTCTGTGGGAAACACACAGAGTCCGTACACGCACAAATTAACAACAGATCTTTGCCAATGCAGAGGACGATACAATGTTGAGCTTCATCTTTCATATCTGCGACTCCAAGCACAAGCTAATGATTTTAAAATCCAATACACCAGCATTGTTCGCCTCTTTATTTTGCCAAAGGTTATGTTCTTTTTGTATTTTACTGTGATTTTGTGTTGGTTCATGCTAGATATGAAAATAATTGTATTCCATGGTTGTGCTCTGCAGTCAAACAATCCTCATACAATGGTGGTTGTCACTCTTGATCCGCCAATCCGTAAAGGCCAAACGCTGTACCCTCACATTGTTATTCAGGTTATGTGCTGCAAAATTTGATCATAATGTTTAGATGTTATTTTATGTTTGGTTTGGCTACTTTGTCGCAGTGTTTGTTTTGCTGGACAGTTTTGTGTTGTCTGACAGTTTTCCCTTGTTCTCTTGACAGTTTGAGACAGAGACAGTAGTTGAAATAAATGTGAAATTAAGCACAGAGCTTCTGGCTGAAAAATACAAAGATAGGTTGGAGGAATCTTATCAGGTGAAAGTTTTGTTACTTTGAAATGATACTATTTTGCTTACATTTGATTCGATAATAGTGGAATCAGAAATCTTGTGAAATCATAAAATATATACTCCGTGTTAATTTGCCACGACAAGTTTGTTAGTATTAAAAAGTCCTCCGAGAACTTTATGTATGCTTGAGATAGAAAGAACTCCTTCAAATCACCTGACTTCATTAGAAAACTGAATCTTCCCTGTGCTTTGTTAATAATCGCATTTATGAAACGTGAATTGGATTTGAACCTGAGACAAGTTAAGGCCAAGCAGGAAATTTCCTTCATTTCCAATGAATGCCTTTTTCAAAACTACTCATTTATATAAGAAATAACACCACATTATTTTGGGTGGATCATGCTCATTTCTTTCTAATTGTGCCTCCACAAGGGATAAATTTGGTTTCCTTTATGGAACACAGCACAATATGATTATATGAGGCATCAAAGAAAGGCTTATTACCACATAATTTCATTACTCTCAAGTCTCAGCATGTCCACTGTACATCAGGTTCTGTTATAAGTCAGTGTTTTCTTGTTTGAACTTGCAGTTCTTAGTTCTTACTTATCTTATTCTTTTCTGTTAACAGTTCTTTTGGTCTGCTAGCACCTGTCGTGATAAATCTATTCACTTACATGAGTGTTCAATTTATCCATAGGGTCTAATACATGAGGTATTCATCAAAGTTCTGCGTGGTCTATCTGCTGCTAAAGTCACAAGGCCGGGTTCTTTCAGAAGTTCCCAAGATGGATATGCAGTTCAATCATCACTGAAAGCTGAAGATGGACTGTTGTACCCACTTGAAAAGGGTTTCTTCTTTCTTCCGAAGCCCCCTACGCTCATTCTAGATGAAGAGGTATTACTTTTTTCTTATGCTAGAAATTGCTTACATCTTTTTTTTACTGGGAATTGATTACAACCTTTTATGCATTGCTACAACGAAATGATTCATTGCCGAACCATGGAAATTGTTAACCATGCCCGTTGACTACATTTAATGTAGATTGAGTTTGTTGAATTCCAACGCCTTGGTGCTCGGGGTGCCGGTATGTCATCTCACAATTTTGACCTCCTGGTAAAGTTAAAAAATGATCAAGAGCATCTCTTCAGAAATATTCGAAGGAGTGAATGCCAGAACCTCTCGAACTTTATCAAGTATGTTCCTTTCTATTGGCTTCAACATCCTTTTTCCTATATACATCGTACTCAAAGGTATCTTCCTTTTTCCTTGAAAATTTTAAGTGGGAAGCACTTGAAAATGATGAACCTTGGAGATGGTCAAGGTACAAGTGGTGGGGTTACAGATGTTATACATGACTCCGGTGATGATACTGTTGATCCACATCTAGAGCGAATAAAAAATCAGGCCGGGGATGAGGAAAGTGATGAAGAGGTAGATCGCCTTTTATTGGCTTGTTGTTGCTTGATGTTGACTTGTTAATATTGTTACTAAGTCCCTCCATATACTTGTGTTCATTATCACTTCATGATAGGATGAAGATTTTGTTCTGGATAAAGATGATGGCGGATCTCCTACTGATGATTCTGGTGGAGATGAATCAGATGCTAGTGAAAGTGGGGATGAAAAGGAGGTAATTTTTATTTGCTGATGTGGCAAGCCTGAATTGTGAAACCACTATTATCATTATCTCTTACTCTTTGTCTTCTTCCTTTTCTAGAAATCATCCGGAAAGAAAGCCAGCAGTTCAAAGCCACCTGCGAAGAGGAAGCCTAAGGGTGGGGAAGGCGAAGATTCAGAGAAAAGGAAACGGAAGAGCAAGAAAGATCCTAATGCCCCTAAAAGAGCAATGACACCATTCTTGTGTTTCTCAATTTCTGAGCGAGCAGTAAGTTACTCTGACAAAACGAATGAGTATTATGTACATGAAGAGTTGAATTGACATCTATTGATTTTTCTCGCCGATGTGGGGCTCTTTTCGGTTAAATTCATTCTAAATGCATAAAATTTAGATTGCTAGAGCTTACATCTTGAACTAAAGCCTACGTGATGTTTTCTTGGCGCAGGCTGTGAAGGGTAGCAATCCCGATTTACATTCAAACGAGATCACAAAGAAGCTCGGACTGATGTGGCAGAAGATGTCAAGTAATATTCCCGATCACTCTCCATCGCATTACACATGCCCTAAACCATCTTTCTCCCATCCCTGTCACCTATTTGTTGCATCCACATTTTCCACAATATATAAATACAGTAATACAACCCGTGTGCTCACTATTTCCCTTCTCCATCTTGTCAACGAGCTGCAGCCCAAGAGAAACAACCTTACATCCAGCAGTCCCTGGTCGACAAGAAACGCTACGAGGAGGAGTCCGCGGCCTACCTTGGCGCCAATCTGGCGGACGAGGACCCCATATCCGCCGACGACTAGACTCAAGACACACGACCGATGAATTTGTTGCTTTCTGGTGCGGTTTGGGCTCTGAAATCGTGCGTTCCAATCCCAGCTCGCGCTGGATCAGTCGTGTTGCTGTGTACAGTATAGTATGGGCTGCCAGTCCTCCCGAAAGAATTCGAGTTGTCGGCGGATAATTGCATGCAGGCATTTTAGCAGCTGGAGCTGATTATCGTTTTCGAAGTTGGTTATTGAAAATTAGATCAAAGGAAGGAAATGAGTATTATGTAGTCAGCTTCAATTTATATATCTGCCCCGCGCGCATATATAGAAAGCAAAAATATTTACGTGATCAAATGGACGCGCATAATGCTGGTCTATCTAGTAAAAACAAAATATGATTTAAAATGGTTAGAAATCCTTAAGAATTTTCCC
CDS Sequence
- >BRADI_2g05430v3
ATGTTTGCCGTGGCTGCAAATAGTTTCTCAACTGCTGTGCGGTTATCTGAATTGCCTATGCTTTCCCTAACCCTTGATCCGAATCCTGGTCAGTTTAAAGTGCATCCTGGAGGGCTTTCATGGAAGAAACAAGGAGGAAACGTGATCCACATTGATAAAGTTGATGTAACTTCTGTGACATGGATGAAAATCCCCAGATGTTATCAGCTTAAAATCAGGACCACAGATGGCCTGGTTTACATGTTTAGTGGTTTTCGCGAACAGGATACAAGCAACCTGACCAACTTCATGCAAAAGAATATGGGCATCTTACCAGATGAAAAACAGCTCTCTGTTACCGGTCATAACTGGGGAGGGATTGATATAGATGGAAGCACGCTCACCTTTATGGTTGGTTCAAAGCAAGCATTTGAAGTTTCTCTACCAGATGTCGCACAAACCCAGATGCAAGGCAAAACAGATGTTCTCTTGGAGTTTCATGTTGATGATACTACTGGGGCTAATGAGAAAGATTCGCTCATGGAGTTGAGTTTTCATGTACCTATGTCAAATACTCAATTTGTTGGAGACGAGAACCGCTCGTCAGCCCAGATTCTGTGGGAAACAATACTGGGAGAAGTTGATGCTGGTTCTTCTGAAGCGGCAGTTTCCACCTTTGAAGGGATAGCTATTCTTACACCCAGAGGACGATACAATGTTGAGCTTCATCTTTCATATCTGCGACTCCAAGCACAAGCTAATGATTTTAAAATCCAATACACCAGCATTGTTCGCCTCTTTATTTTGCCAAAGTCAAACAATCCTCATACAATGGTGGTTGTCACTCTTGATCCGCCAATCCGTAAAGGCCAAACGCTGTACCCTCACATTGTTATTCAGTTTGAGACAGAGACAGTAGTTGAAATAAATGTGAAATTAAGCACAGAGCTTCTGGCTGAAAAATACAAAGATAGGTTGGAGGAATCTTATCAGGGTCTAATACATGAGGTATTCATCAAAGTTCTGCGTGGTCTATCTGCTGCTAAAGTCACAAGGCCGGGTTCTTTCAGAAGTTCCCAAGATGGATATGCAGTTCAATCATCACTGAAAGCTGAAGATGGACTGTTGTACCCACTTGAAAAGGGTTTCTTCTTTCTTCCGAAGCCCCCTACGCTCATTCTAGATGAAGAGATTGAGTTTGTTGAATTCCAACGCCTTGGTGCTCGGGGTGCCGGTATGTCATCTCACAATTTTGACCTCCTGGTAAAGTTAAAAAATGATCAAGAGCATCTCTTCAGAAATATTCGAAGGAGTGAATGCCAGAACCTCTCGAACTTTATCAATGGGAAGCACTTGAAAATGATGAACCTTGGAGATGGTCAAGGTACAAGTGGTGGGGTTACAGATGTTATACATGACTCCGGTGATGATACTGTTGATCCACATCTAGAGCGAATAAAAAATCAGGCCGGGGATGAGGAAAGTGATGAAGAGGATGAAGATTTTGTTCTGGATAAAGATGATGGCGGATCTCCTACTGATGATTCTGGTGGAGATGAATCAGATGCTAGTGAAAGTGGGGATGAAAAGGAGAAATCATCCGGAAAGAAAGCCAGCAGTTCAAAGCCACCTGCGAAGAGGAAGCCTAAGGGTGGGGAAGGCGAAGATTCAGAGAAAAGGAAACGGAAGAGCAAGAAAGATCCTAATGCCCCTAAAAGAGCAATGACACCATTCTTGTGTTTCTCAATTTCTGAGCGAGCAGCTGTGAAGGGTAGCAATCCCGATTTACATTCAAACGAGATCACAAAGAAGCTCGGACTGATGTGGCAGAAGATGTCAACCCAAGAGAAACAACCTTACATCCAGCAGTCCCTGGTCGACAAGAAACGCTACGAGGAGGAGTCCGCGGCCTACCTTGGCGCCAATCTGGCGGACGAGGACCCCATATCCGCCGACGACTAG
Protein Sequence
- >BRADI_2g05430v3
MFAVAANSFSTAVRLSELPMLSLTLDPNPGQFKVHPGGLSWKKQGGNVIHIDKVDVTSVTWMKIPRCYQLKIRTTDGLVYMFSGFREQDTSNLTNFMQKNMGILPDEKQLSVTGHNWGGIDIDGSTLTFMVGSKQAFEVSLPDVAQTQMQGKTDVLLEFHVDDTTGANEKDSLMELSFHVPMSNTQFVGDENRSSAQILWETILGEVDAGSSEAAVSTFEGIAILTPRGRYNVELHLSYLRLQAQANDFKIQYTSIVRLFILPKSNNPHTMVVVTLDPPIRKGQTLYPHIVIQFETETVVEINVKLSTELLAEKYKDRLEESYQGLIHEVFIKVLRGLSAAKVTRPGSFRSSQDGYAVQSSLKAEDGLLYPLEKGFFFLPKPPTLILDEEIEFVEFQRLGARGAGMSSHNFDLLVKLKNDQEHLFRNIRRSECQNLSNFINGKHLKMMNLGDGQGTSGGVTDVIHDSGDDTVDPHLERIKNQAGDEESDEEDEDFVLDKDDGGSPTDDSGGDESDASESGDEKEKSSGKKASSSKPPAKRKPKGGEGEDSEKRKRKSKKDPNAPKRAMTPFLCFSISERAAVKGSNPDLHSNEITKKLGLMWQKMSTQEKQPYIQQSLVDKKRYEEESAAYLGANLADEDPISADD