Information report for BRADI_1g43220v3
Gene Details
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Functional Annotation
- This gene belongs to the CO (CONSTANS) gene family. This gene family is divided in three subgroups: groups III, to which COL9 belongs, is characterised by one B-box (supposed to regulate protein-protein interactions) and a second diverged zinc finger. COL9 downregulates expression of CO (CONSTANS) as well as FT and SOC1 which are known regulatory targets of CO.
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT3G07650
- Oryza sativa — LOC_Os06g19444
Gene Resources
- Pfam: PF06203 PF00643
- UniProt: I1GYX7
- EMBL: CM000880
- KEGG: bdi:100823662
- OMA: ESACEQG
- InterPro: IPR000315 , IPR010402 , IPR049808
- PANTHER: PTHR31717 , PTHR31717:SF134
- PROSITE: PS50119 , PS51017
- OrthoDB: I1GYX7
- CDD: cd19821
- eggNOG: ENOG502QUBA
- STRING: 15368.I1GYX7
- HOGENOM: CLU_028225_0_1_1
Sequences
gDNA Sequence
- >BRADI_1g43220v3
TTCTTTCGCTGTGCTCCGCTGCCGCTGCATCTCTCTTATCTCTCTCCCCAGCTCTTGTTGTTCTAGCTGCTGCCTGCCTGCCTATCTTTTCTCTCTGCCTCTTCCTCTTTTCTCTCTCTCAGAAAAAAAGAATTTTTTATTCGGCCTTGGGCTGCTGGCTCCTGTCCTTCCTAGGGGGATTTTGGAGTGATCTCTGGCTGCTCCCTGCCCCCCTGCCTGTGCTGGGGTCTCGGCCGCCGCTCGGCGCCGGCTGGATCTGACTCAGGTTGCTTGCTTCAGGTTCAGGTGCGTGGTTTCTCATAGCTTATCATCTTTTCAGCTACTATTTCTGCTTTCGGCTCCCGATAGCGCGAATCTGTTGGTTTCGGTTGCTCGTGAGGATCATGGGTTGGGTTTCTACTGTTTTTAGATTTGGGGTCCTACTACTTCGTCTTTGGATGGGGAATTGGGGTTATTTTTGTTGATGGGTTTGGTTTTTGTCTTTTGCTGTTTCTTTTGTTGATTGTGTGACCTGCTTTGATTCGTGATTCTGTTTTTTTTCCTCTTGGTTCCGGTGGTGTTTTGAGGTCTGATTTGGCTGAGCTCCTCACTTTAGGTGATTTAATTTCGATTATGTCACTGGAGGTCATGACTGTTCTACCGTAGCTTTATCCTCTTCTTTAATTTTGATTCCCCCACGTCAAAAAATCATCTTCTGAATTTGTTCTTTCTTTTCCAGATTGACAACTAAAAATATCAGAAGAGGGCAAATTTCCTTCATTAGTTTTCAGGGAATACCACCTTCATTAATTTGACGTCACATTTTGGATTATTGCTTTTTATCACAATCTGTTTATAAAATTGGGGAAAAAATAGAACGCTCCGACTACGACTACTTTTCAGTGTTTATACTTCTCACTTGTAAAATATAAATTATTTTTAAAACTTCTATAAAAACGGTCCACATTTAAAAAAATATTTCTGGGTAATGAGTTCATGTGTGCACACTTCGTGAAAATATCTGTTTTATTTTTCTCTTTAATGAACATCTTTCATGTAAAACGATCTTGCTTTTTTGGAGGAATATACACCAATCTTTTTTTTTACCGCTCTGTTTTCCTTTCCCAAGTCATCTTTTGCAACGTCCAGAAAATATCTCCATGACTATTGACTGGTATTTGTAAATTTTCCCATGTCATCTTTTATTTGCCCATGTCATTCATCTAGTCACTCCTGTTTGATATTATTTCATTCCTAATTTATAACGTTGCGCACAGCGCACAGCGCACTGCATGTTGTCTTTAGTTGCTTGGAAAAGCTGAGAAAGAACAGATTTTTTCACATGAAAACAATATTAGGTACCTATTGACCAGTGGGGAATATATACTTGCAACCGACCATTGGGATTATAAATTTTGTACCTGGAGCAGAGGATCCCAAGACCAGTGGCTTGTACTTTTGTAGTGGGATTTCAAGTTCTTTAAGCCTTGGTCGGCAAATTGAGGCGGAGTCTACGGATAGATGAGTCCATCAAAACCTAAAACCTTCTTAATGTTGATGGTGGCAGGCAACATGCCCCAGTTAGGAAGTCGTAGATCTATATTATCCATTATATTATTATTAGCTGATGTATGAGGTGTTGAGGTTGATGGGGTGTGGAGCATGATTGTAGCTGCATGTTTCGAACTCTTGTATTATCAAGTCCTTTCTTATAGGTTTTATATTGTTCTTAACTCATGCAAGACGTCAATGGGATTTTAACATATATGCCATCAGCTCCAATATTTTTATGCATTTGCTAGTATGAAGTCGTTTATTACAAACAGTAGACACATAAACAGTACTCCCTCCGATCCATAAAAAGTGTCGTCCACTTAATACAAAATCTGTACTAAGTTAGTACAAAATGGGCGACACTTTTTATGGATCGGAGGGAGTAATAAACAACTATGCTATGACAAATGCATACTAAATTTTGGAGGTGATGACATTGCTAAAAATTTCCCTTAAATCTATTTCAGCTGGTTTCTAAAAAATAAATCAATTCAGCGTGAATAGTGATTCTTTACTGTTTGGTACCCATTCATTTGTATATATTTTTTTTAATTCCTTCCTAATGCAATTGAGTTTGGGCTTGAAATTTTGCTACATATGCTATTTTTGTAGAATGTATTTTGCACCATAAGGGTGTTTTTCACCTCATATTTTACCGGTTTGTAATGTTATTTCTATTTCTATCCTAATGAGTTCTACTAGCATAAAATTTTAATGATTGCTTGTCAAATATTGCACAGGTTTATTGTCAATCTGGCTAATCTTGAACGCTCGTGAAGAACTGTTTGTTGCACACGTAAACGCTTTCTAAAGTTGAAGTCTTGTCAATAGAAAAATATCATGGGTGCTCTCTGTGATTACTGTGGGGAGCATAGGTCTATGGTTTACTGCCGATCAGATGCAGCATCTTTGTGCTTGTCATGTGACCGCAATGTGCATTCAGCTAATGCTCTTTCTCGGCGCCATACAAGGACTCTTCTTTGTGACCGGTGTGCTTCACAGCCTGCCATGGTGCGCTGCCTAGAAGAGAACACCTCACTTTGCCAGAATTGTGACTGGAATGGGCATAGTGCTGGATCCCCCGATGCTGGACACAAACGGCAGAATATAAACTGCTACTCTGGGTGTCCATCATCTGCAGAGCTTTCAAGGGTCTGGTCATTCATTTTAGATATTCCTAATGTGGCTCCTGAGCCGAATTGCGAGCAAGTAATAAGCATGATGAGCATCAGTGACAGTGCTGTCAGCAATGAAGACAACGCTCCAGGGGGCAACAGTTTCTTAGATATAGCTAGTGCAACACTTAGTAGTGATCATAATAACGATGACAAGCTTAAGACTGTGATAGGGTCATCTTCTGAAGCTGGTGTGAACCTTCTTCCACATGCTACTGGTCAGACAGCCGTATCTGTGGATTCCACAACAGCTAAGGTACTATAAGATTTTCACATATCCTTCTATATGTAGAGTTTGTAATTCACTTACGCTGTTGCATATTCTATTCCCCATATACCTTGGGTTTTATGTAACCAATAGCGTTCCTTCCTACAGTTGACAATTATCATTTGCTTGCACAATATGCCATGATTTTATTTTTTTGTTTGAGACCTATTTTCTGCTTTGATATTGCAACCTTTTTTATAAAAAAACTCCCAATTTGTTTCCCAAAATAACCACTGCCGTGGCGTTACAAATGAATGCTGCAATGTCACAGGTAAGCCAGAACTCATTTGAAAAAAAAAAAAGAACCCAGCTTGCTACTTATTGCTTGACAAGGTTCACTTGCCATGCCTGCAAGGCACTAACAGTAGAATGGCAAGGTATGATTCATTTTTTGGAAACAAATTAAGGTTGGGTTATTTTAGTGTAAAGGTCGTGTGAATTTCCTTAACAAATAATGAGGTATATTTTATGTTTAACTATGTTTGTTAACAAGCTTATCAATGGATTGTATGGCTCCACGAAAAGACAAAATAGGGGTGCAAACTTTCCTGAAACTGTGTAATGCATAATTGCATATCCATATTGTCTAACATCGACGTACGAGGTACGAGCAGCAATCCCTTCTTGAAGGCGTTGTCTTGGAGTACCATACTTGTTGTTGGGTTCCATGTTCTAGCGGTGAATGTCCCTGACGATAGGCTGTGGTAGGTGATGGGAGATTATGGTTGTCGCTTGGCTAGTCAAAGATGATGGCCTTGGGTTTTTATTTCTCTTTTTGGTAAGCTGATTTGTTTGCATTGATGCATGGCATCTTCTTAATAAAATAATGGTTGTGTGCATCCGAGGATGCAGAGGCCAGGAGGCTTTGCCTTCCTTTTCGAAGAATATTTTTTTTGTCTAACATGGACTGATACATGGATGCACTTTGATCAGGGGTTAATATAAAATGAACATTAACAGCCAGGTGATAACAAGTTAATACCATGCTTAATTGGAATGACATGATTGCCAAATTAATAAGGTAATACATAGTAACCTGTGAAATGTGGCCATTTAATCGTGGTCAATGAATGGTCCACATGAAAGTTGGCGTACCATAAAAACATTCTGGGAAATCTTGCTATCCCTTTTTCTGCCTTTGGCAGCAACAGTTAATGGAAAGAAATAAGTTCATTTTACCCCCCTCAACTAATTGATAAGTCCAAGAAACACCCTAAACTATGAAACCGGGTATTTAACCCCCCCGAACTATCAAAACCGGGCACCCGACCCCCCTGTGCCTGTTTCCTGCTGGTCTGGGCGGTTTTGACCATGTTGACCGCCACGCTGGCAACAAGTGTCTGTCCCGAGCCCTCCTAACCCCGCGCCTAGACCTCTATCTCTCTTCTCAAATTCCAAATCAGGAACCCTAGCTCTGGCATCGGCGGGGGCTGGACGACGCAGGCCTTGTGGAGGCGGACACTGGGCGTTGGGGCGGCTGCTAATCGACTGCTGGAACCTGCGCCCGCCCCTCTTCTTCCTCCCCGACGCCGGTGCCTGCTGCTCAGTGAGTTCATCTGCTTTTTTCTTCTTCTTTTTCCCTCTCCTTCTGCTCCTCTGCTCGATGCTTAGCTTGCTGCATTTGCTTCTGTTCTTACAGAGCAATGGAAGATGACCTAGACTGCAACTAGAATTGCAAACAGATTTGAGAAGATGATTAAGGCTAAAAATCAGAAGGGAAACCAGCGGAGGAAAAGAGAAGGAAAACCGAATCGAATAACGGCTAACTCTGGTCGCAGGAGCTAAAGAACAGAAGAGAGAGAGAGAGAAGACAGAGACGGGAGAGAGAAGTCTGGGCAGATGGGCTCGGGACAGCCACTTGCCAGCCTGGCATGCCAGCATGGCGGTCAACATGGTCAAAACCGCCCAGACCAGCAGGAAACAGGCACAGGGGGGTTGGGTGCCTGGTTTTGATAGTTCGGGGTGTTAAATACCCGGTTTCATAGTTTAGGGTGTTTTTTGGATTTCTCGATTAGTTGAGGGGG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CDS Sequence
- >BRADI_1g43220v3
ATGGGTGCTCTCTGTGATTACTGTGGGGAGCATAGGTCTATGGTTTACTGCCGATCAGATGCAGCATCTTTGTGCTTGTCATGTGACCGCAATGTGCATTCAGCTAATGCTCTTTCTCGGCGCCATACAAGGACTCTTCTTTGTGACCGGTGTGCTTCACAGCCTGCCATGGTGCGCTGCCTAGAAGAGAACACCTCACTTTGCCAGAATTGTGACTGGAATGGGCATAGTGCTGGATCCCCCGATGCTGGACACAAACGGCAGAATATAAACTGCTACTCTGGGTGTCCATCATCTGCAGAGCTTTCAAGGGTCTGGTCATTCATTTTAGATATTCCTAATGTGGCTCCTGAGCCGAATTGCGAGCAAGTAATAAGCATGATGAGCATCAGTGACAGTGCTGTCAGCAATGAAGACAACGCTCCAGGGGGCAACAGTTTCTTAGATATAGCTAGTGCAACACTTAGTAGTGATCATAATAACGATGACAAGCTTAAGACTGTGATAGGGTCATCTTCTGAAGCTGGTGTGAACCTTCTTCCACATGCTACTGGTCAGACAGCCGTATCTGTGGATTCCACAACAGCTAAGGTGCCCTATACGCCCGACAAACATATGTTCAGCAAGGATACAATATATGAAGATTTCTCTATGGATGATATTGACCTGAGTTACGAAAATTATGAAGAACTTTTTGGTAACTCTCACATTCAAACAGAGGAACTCTTTGATGATGCTGGGATTGACAGTTACTTTGAAATGAAGGAAGTGCTTGCTGGGAGTTCTGATGAGCAGCCAAAGCCGATGCAGCCAGCGGCTAGCAATGCAGTATCTGCTGATTCTGGGATGTCAAATCCAGGAGTAAAAGATGATTCCAGTCTTTGTATTCCTGTAAGGCAAGCTCTTTCATTTTCTGGTTTTACTGCTGAGAGCAATGCTGGAGATTACCAAGATTGTGGGGTATCATCATTGCTCCTTATGGGCGAGCCTCCTTGGCTTCCTCCTGGCCCTGACGGCTCATTTGCCGGAATTAGAGACAGCGCTATCACACGATACAAGGAGAAGAAGAAGAGAAGAAAATTTGACCACAAGATCAGGTATGAATCTCGAAAGGCTAGGGCAGATGTGAGAAAGAGAGTCAAGGGACGGTTTGTTAAAGCCGGTGAAGCATATGACTATGACCCACTTGACACAAGGAGCTACTGA
Protein Sequence
- >BRADI_1g43220v3
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