Information report for BRADI_1g08340v3
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- Floral homeotic gene encoding a MADS domain protein homologous to SRF transcription factors. Specifies floral meristem and sepal identity. Required for the transcriptional activation of AGAMOUS. Interacts with LEAFY.Binds to promoter and regulates the expression of flowering time genes SVP, SOC1 and AGL24.;MADS-box transcription factor;MADS-box gene
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT1G69120
- Glycine max — Glyma.16G091300
- Oryza sativa — LOC_Os03g54160
Gene Resources
- Pfam: PF01486 PF00319
- UniProt: I1GN76
- RefSeq: NP_001288319.1
- EMBL: CM000880 , KF469327
- AlphaFoldDB: I1GN76
- KEGG: bdi:100842079
- OMA: HESTGSW
- InterPro: IPR002100 , IPR002487 , IPR033896 , IPR036879 , IPR050142
- PANTHER: PTHR48019
- SUPFAM: SSF55455
- PROSITE: PS00350 , PS50066 , PS51297
- Gene3D: 3.40.1810.10
- OrthoDB: I1GN76
- SMR: I1GN76
- CDD: cd00265
- eggNOG: KOG0014
- STRING: 15368.I1GN76
- HOGENOM: CLU_053053_0_2_1
Sequences
gDNA Sequence
- >BRADI_1g08340v3
CTCAGATCCCTTTAAAACCCCCCTCCCCTTGCCGGAACCCTCGTTCCGCGACCCACTCTCCGGCTCTCTTCCCCCTAATCCGCCTAATGGCACAGCATCCACGGCGGGAGTAACCGTCGCGGTCGCTGGCTGGCTTGTTGCGGCTGGGTTCGTGTCTCGATTCCGGGAGGAGATGGGGCGCGGGAAGGTGCAGCTGAAGCGGATCGAGAACAAGATCAACCGGCAGGTGACCTTCTCCAAGCGCCGCTCGGGGCTGCTGAAGAAGGCGCACGAGATCTCCGTGCTCTGCGATGCCGAGGTCGCGCTCATCATCTTCTCCACCAAGGGCAAGCTCTACGAGTTCGCCACCGACTCATGGTACGCACGCCTACGCTTAAGTAATTTAGTTCTGTCGAATCCGCCTTCGATTTCCTGACCTTCGAGCTCAGCGAAGCGCTAGATGCCGCCCCCTTGGATGTTTGGGCTTGCCTGTCTGCTCCATTTCCAGCTGTTCGGTTGACTGGGGTTTGCTCTCGGTGTTTCGCTGCTCTCAGTTCTGCCGCTGCTGCTGCTTGCTTTTGCTTGCTTGATTGCCTAGAATCGATGGAGTTAGCGCCAGTATTATGGTTGCGATTTCTGGCCTTGAGATTACGGTGTGAGACGGGTTCCTGCGCTATTTTATGCTCCGCTATCGCCAGGGAAGGTGTTCATGTGCTTTATTTTGGGGGAAATTTTGGTTCCAGAAGCTGAATGACGAGGCGGGTAGCCGGCAATTGCTTCCAAGTGGAAGGGTTAGGACAGTAATACATAGAGGAAGGGTTAGGACGGTAATATACTGGAAGGGTTAGGGCGGTAATATCTTACTTGCCACGTCCCGTTGCCGACAGGGGTATTTATTTCTCAATTTTATTTTTGGGATTAAAGTGACATTTGTAAATAGAATTTAGCATGCACCTTCATCGCCTCAGCTGGAACCTTATTTGATATGGTATGTTGCTCCTCGCTTCTTTCCAAGCGTTTGTCTTACAGGCTTCGATTGCTAGCTCCGGCGGTATGTTTTTGTTGTTTGCTTGGAGATGCCTGTCCGCGATAAGCATGGACACACAAGCTAATAGCCATGCCAAATTAAGAGCTCATCTGCGTTCTTAGTTTGCCCGTGAGATATATAAGTCAGCGATGGCGTGGATTCTGGTAAAAAAATGAGGGAGATCCACTTTATTACTCCGTATCTTATTCCGCTGACATTACTCCGTGTTAATTTATGACTTCTATCTGCTTCGATCGTTTCCAGTCGGTGAATACAAGTAGTAGCATATCTCATGAGAAGTACTACTGTTTTTGGTAAATATCCGACGTTGTTTATAATCTTGTTGACAAAGCGAAATTTCCCTTTGCTTCATGCATATTAGCACGGACGTGTAGGTTAAAGTGCTAGATCTCATGGACTCGTTACCGTGACGGAATTAAAGGCGCTAATGAAAGAATATCGCAAAGTCTGATTGCTTTAGCTTGAGCTGCTGAGTTGTTTTACTGAACGAAGATGCACACAGGCAGTGGAAAAGTCACTGGACAGATTAATGCTTGCGTGCATGTATCAAGCTGGACACGTGATTTGTCTGTTTGTAAGAGTGTGTACAGGTCAGTTACGGAGTACTCACTCCCTCCCATATGAAGTGACGAAATATTACATGTATCTAAATGATTTTTAGATATACATACATTCATATTTGTGCAAATTTGAGTCACTTAATATGTGACAGAGGTAGGGAGTACACTAGTTGGTACTGTACTGTAGGCTAAGTATCTGAGATCACAATATTGAGTAGATAAGAGCACAAACGTTTTAACTGGCAGCCAGGCATTTATCAGGTGTGCGTTGCGGCTTTGTTTTCTTCTCGCATGATACGCAAGTCTCTTTGTAGTTAGTAGCTGCATCACGAGAGTACACTATTCCCCGGTTTATTTTGTCGGAACTAGTATAGCTGAGCTAGCTCTGATATATAGTTGCTGAACCTTGAGGATTGAGATCTCACAAATACAGGTACACACGAAGTAGTTCAGTGTTTATAGCCTGATTAAGGCCGACTCAGCACAAAACCTGCAGCACTGATCAAGCCACAATCGACCTGTGCATACACTAGCTAAAATGCAGCCAGTCATGGTTTGGGACCCAATTGTTGTTGTTCACTCTATATCCACTCCTTTTAAATCTGCCAGATCAAAACTCACATTAAGACCTACTCGTCTAATCATTTTAATAAACACCAATAAAGGTGCGAGGGAACCTATGTTGGATCTAAGTTACCTCTGCTGCGTCTCTGCAGTGCCTTTTCAAGTCTGGGTATCGATTATCCTCTAGATATTTTTGTATCTCTGAGCACTTGCTTTTAGTAAAGCTAAGTCATGTGTAAAAATATCTCTGAAGTATTCGAATTCCATTTTTACTCTTGCCATATCTTTCCCAGTCCACAGACAACGCTTAGATTTTCTAGTAGCCTAGGACCATATATAGTTGGTTAATTGTATGTCATGTTCTATCCGCCATGTATTTAGGCAGGTTATCTTTGCCAAATTCGAATAAGATTAATCCGGTCAATAGAATAAAGTGACCTCCCACAATCTCGAAGCTTGTTAGATCCTTACAAATTTTTCTACCGGGAGTTTCGTCATATTTTCTGGGACTGGCAGGCAGCAAATAGGAGAAGGCATGCAAATACTGTAGACATAGGATAATAAATCCACCATCATACAACCCTGGCCGCTCACCTTGCTACTACTGGCTCATAGCTACTTCATCAATCATCAACCAACTAAAGAGCTAAACTGTACTCTAGACCTTAGTCAGTCAAGGTTCAACAACTATTGGTCTCAATTCACCCTTGATGCGTGACATTTATTTTAATAAAAATATAGCTATGGGCGTCCAAGAACACAGATGCTAGGAAGTTTTGACTTCATTTTCGAAAAAATGAATCACATCAGTGCCATGAAATAGAAAAGGAAAATGTATTATGCTCCAACATGGGTGAATCTTGCTAGATGCTTTAAGTTTTAACTGTGCGAGATGTGCATAATTTGTTTGTATAACCTTGTTGTATTTTACCAAAATGATATTCAGGTAGTTCTGGCCATCCACAACCAATTGATGAAAACATTTTATGGCTTTTAATTGTTATCTTACAATCACATTAGTAATCAGACATATGACTCATATCATGAAATTTTTTCATTGTGAAGTAACTAATAAAAAACTTCGGTGTTCCATTTGTTTGCATTAATGGATTTTAATATTTTATTGTTCCTACGTGTCATGTCTTTATTTTGAGCAAAATTAACAAACTGCGGTTATGAACTATGAGTTTCATTTCAACATATTAAATTAATTAAACTAAATACATTTGTGATTCTTATACTCTGGATTTCAAAATCAAATTTTGAATTTAGAAAATTCAAGTGTCTAATTCGAAAATTACTTTTAATTTTAACTTTTAAAATTTTGGAACTTTTTCAAAATCTCGATATTTTAGTCTAGAATTTTGGGTACCTAAAAATCAAATCAAAAATTGAGTTTGAATACTCAAATTTTGAAATGTTTGAAATATTATGAAATTATTTCGCTGTTTTCATTGAACTAGCATAGTCGACCATACTTCAAATTTGTATTTTATTTTAATTTCAAATTCAGCGGAATGTTGTATGAAGGGAGAGCATAAGCTTAGTAACCAAACAGATTCACTAATGAATTAACACAAAACGAAGGAAATTCATACAGGTGCTTCTAGGTGAGACACCTTTTACCGCAGCTCTCCACCATTAGAGGAGCGCTTTATTGAACAGACACTTTTGGACTGGATCTGTCGCATAACAACACATAATACATGCAGATTGAAGCTTGCAAAATATGCCCTTTTAAAGTTTGTGCTGGAAAGAGAGAAAACTCATGTAATTATTCGTATATAGTTCTGATAGAGAAAAATTCATTATTCGGGTCACTTGACTGCAGGATATCATTGTTTATTAGGATTGCTGTTCTAAATTCAGTGATATTTCTCCCACGCATATATCGCTTCTTTTGCTTTTCTTTGCTTGCTTTTTTTAGACTCTTTTCATTCTTTTGGTTTCATTCCTGTTGATGTAGATTTACTTTAGTCCCGTTCTCAATATCACATGTGTGTTTCTTTGTCGGTTGTCATTCCACAGAACCTCCTGTTTTTTGCCAAGGTACATAGGATACTCAGGGTATGGTTGGTTCATGTCCAACATAGCCCTACAAAATCTTGGAAAATTTTGGCTTGCCTTTTTTGGCCAACAATTCTTGAGCCCATATTTGGCTTAAGATTTGACAAAAATCTGTGAGAGGTGTGGTTAGATGCTCATTGGCACTAAAACTTTGGAAACAAACAAACAAGTACCAAATTTTCACAGGCTGCCAATATTTTGGCATGGCTGGCTCAAAACCCATCACAACCGAGGTCTTCACTTTGCCAAGGAGAATTTGGCCACATGGCTCAAGACAAACATATGCGTTGTTGAGCTTGGATGGGAAGAAATTTGATTGGTTTAATTAATATGTAGGCACAATAGTACATGCTCTCTTCAAAAAGTAAAATAAAGACGTACAACTTAAATAGTGAATATGTGTATAGTTTGTTATTCAAGGTACACCACAAATTTTCTAAGTGTACACATGGTCTTAAGTGTTGTACACTCATGATTTATTTGATTATTATTTTCAGTTGGACAAACATATTTCAGTATAGGGGTGACCGAACATACGTACAAAATATGGTTAGATCGCTCTATGTTGGACCGTGTTGTATCTCTACACAAATGAGGCAGTAAGATGTTGAGAAAAATTGCATCTTCAGAATCGATGTATTTTAGACATGCACGTCCAGGAATATGTATGAGAAAACTGATGATTTGGCAATAAGTGGGTCTAGTTCCGAGAAAATGCAAGTTTTATGCTCCCTCCGTCCCATATTAAGTGACTCAAATTTGTCTAAAAATGAATATATCTATGTACTAAAATACGTCTAGATACATGTAATATTTCGGCACTTAATCTGGGATGGAGGGAGTATGTAGTGCTGCGAGACATAAAATATATATTAAGAGAATCTAGATAATGTGAATGTCATTAGATTGTGCATACAAATATTCATGCTTTCACATCTTTTCATATTGTCTTAGCAATTTGTCATGTGTATGTTATTCTTTTCTAAGAAGGGAAAATCAAATCCCTACTTCCCACCAAGTATCATCATTGTCCACTTAATCCTTGCAGAGCGTGGGTATTGGCCGGTGCTGACGACATCCCTTTGACCTTCCGCCAGTTCTTGTTCATCGTCAATCTCCAGCATGTATTCATAGCCTAATTAGGGTTCCAATCAGAAACGACATGACTGCAATAGTCCTACCTAGATTTTAGTGTTAAAATGCACCAATTGTCCTAATTCTTTTGTAAAGGTGACAGGTCCAAAAACTTCTTTAAGTGGTTCATCATAGGACGTAAGTGTGTTTGCTCCCATCTGACCGGGTTGACGTGGCGGTTTGACCAAGCCCTCCTTGTCCACTTCTCCCTAGGCGTCTCTAGCATCGACAAGGAGCGCGTCCATAATGTCGTATACCGCGGTGTCGAACTCAGAAGGGAGCCTGAACTTCCTTCTCGTTGTGGCTTCCATCTCTGAGTACCCCCCTGTCCCTCATTCCCATCGCCGCACCTCCCCGTGCTCCGCCATGAAGGCCTCCCACCTTCGCTTGCAGTCGCTGATGGCCGTCATCAAATCCCTACTTCACGCTAGGGCTTGGTTACTCAAGTTTCTTACTAGGTGAATTGTTGTTTATTTTGCTGTTTCTTCTGTTCTTAAATGCAAGATGCAGTTTCGCCACCATTGCTCATAGGGTCAGGTCACCGAATAAGCTAGCGTTGTGCCTGGCATCACTATCTTTGGCTCACTGCATCCTGCTCCCTGTGGAGAACGTTGGAGTGTGTTGTAATGTCCAGGTAGATTGTGCCCTCAGTTCGGTGGCCTTTTGACACAAGTTGTGTTGAGACACTTGATGATATACAAAGTATATAGACAAGGGAAAGGAGCCATATCAAACACTAGAAAATCTAGATCCCTAATAACTTCAAGTATCACTTCCCAGCTAAAATCTCAGGCGTCGCTAGCCACTCCATATGGCTGACAGTTTTGCAATTTTCAGTTCAGCAAAGGGACTACCTCCTTTCCCTTCCATTTGTAGCAGTCACTGATCCCGATGAGTGCCAAATCCGCATCTGGGCATAGCAGCTGCCACGACTTTAATATGCACTTCTTACAAAACTTCATAGGCCAAATCATTGCTGACCTTGGAAACAAAACTTGAACCAGAAACATCAAATTAAAAATCAAGTGCATGGTCTTTCAGCTTTGGCTATTTAACTTTTCATGAGTTCCATTTTAAACAAATTGACCAGAATGTTTTATGCAGTGTGGGAATCCAATTTGCATGTCACTACAAAACAACCATTATGGTAAAATCACGACATATCAAAAGGGAGCATACATCTATTCTTGCAATTGTGTGTATACCCCATATAGTCAATCATGTTTGGATGTACTCCGAGTGACCAGTCGTTTTGTGCAGTATTTACATATGCTTCCAGTGACCAGACATTTCTTTCTCCTTTACACAGTATGGACAAAATTCTTGAACGCTATGAGCGCTACTCCTATGCAGAAAAGGTTCTCGTTTCAACGGAATCTGAAATTCAGGTAAAAATAATGGCAAATGGTTTCTTTGCTTTAGCTAGCTGTAAAGCAAATTGTTAGTGATGGACTTTATTTCACTGAAACACTGTATATTTTAATTTCATTTCATGAGATATGATGTTACTTCACTTGCAACTACGGATTGGTGGTCCATTTTGATTCTCTCTACTTAGTTTGTCCTTTATGAATGCTTAGGCATACCAAATGATGTAATAAAAGGCTGCTTGACTTATTTACATGGCATAGCAAATGATCATGGCTACTCAACTTGGTTAGCATACTAATTCCTTCGTACTACTATCTTTCGAAAGAATTAGAACAATAAGATTTCATTTTTACCAATACGATTTCAGGAGTAAGCTGAAATGATGCCAAGATTGGCAACTTTACATTAGCTTACCGATTTTCTTAAAGCTTAGAAACAAAAATAGGCAGGCATGTTATAACGGGATTAAAATACTATGTGTGCATATCTGACATCACTATGTTTTGATTGAAGTTACCAAAGACATTCCTAAATCAACATGACTTTCCATCCCACTAGATTGATCATTGATCTTAACTTAGGATATGCTCCCTCCGTTCCATAATTCTCGTCTCAAATTTGACCAAAAATGGATGTATTTATTTCTAAAAAGTGTCTAGATACATGTAATAATTCGACAAGAATTATGGAACGGAGGGAGTAGTACCTTAGAATCTCTGCACCTTTCGTTGTATAATGCTACTAATGGCCATTAAGGATCACCCTTGACATCAGTTCTCACCTCTAGTTTTGCTATGATGGTTGCTATATTGCTTCAGTTTCTTCTTACAGCTTGTCTGAGACTTGCTGCCATCCTCTAGGTTAAAAATGTTAATCCTTCTTTAGAAGTTATTGGTCGAGGGAAGTTAAGCCATCCAATGAGGCTCGGCATTAGTATTTTGTAGCTCAGAGCACCGCACCCCTACCGATAGATTTTGGCCAATTTCCAATCATTTCTAATGATATTTTGTATAAAGCACCGTTGTAACTCAAACCAAGAGATCTTGCCAGCTTTATCTGATTTCTTACTGATAGATTCAGCATGCATGCATGATAAAGAATATTGAAGTATGTTATTTGTGTCAAAAAAATGAGTGCATTTATATTGATATTTTGCAGCCTTTTTGGTATTACGAAATCTAATTTTCACATCTGATAGTAACACTTCTTGCAGTGACATAATTGATTTTAAGTTACAAAAATTCAAGTTCAGCCGACAGAACAATCCTTCCTTCCTACTTTATTCTCCCTGGCGATAATGTTGTTAAGTCTCTTTGTTCAATTCTGAATTACTGAACTTAGTTATAGCATTTATGTCACTGTTCCTTCATGTTTTTCACTCAAGAGTTAGTAATGCAAATCGTATTTGCTCGTGCAGGGAAACTGGTGTCACGAATATAGGAAACTGAAGGCGAAGGTTGAGACAATACAGAAATGTCAAAAGTAATTCGTGGTGATTTTAGTTGGTTGAGTAGTACTTTGCTGAAGATAAATGTGGCTGAACTTCATCCTGCACCTGCAGACACCTCATGGGAGAAGATCTTGAGTCTTTGAATCTCAAGGAGTTGCAGCAACTGGAGCAACAGCTGGAAAGTTCACTGAAACACATCAGATCCAGAAAGGTAGTATTTTATATGAGTTAATACAGTAGCAGAATATATCGAAAGAATAAGAAGACCACCAGAAAAGAAGTACAGTAAAGTACTCTGTTCCATAATTCTTGTCCAAATATTACATGTATCTAGATGCTATTTAGGAATAGATACATCCATATTTGGGCAAATTTGAGACAAGAATTATGGGACGGAGGGAGTATATCTGAAATCAGATTCTAGACTGAGATATTTGTATGCATTTTGCAATTTACAGTCATATTTCCTGTATGTTCAAGAGCTGACGCTTACAAATTCTTTGTATGTGCAGAACCAGCTAATGCACGAGTCGATTTCTGAGCTACAAAGGAAGGTAAAGTATCAATCTTGCTTGCACCACACATCGCTTGTTCCCTTCCTTGCGACAAACAATACACGCAACTGCTCTATGTACTTACACAAAACCTCATTCGTGCTGCAGGAGAGGTCACTGCAGGAGGAGAATAAAGCTCTGCAGAAGGAAGTAAGCTGTACACCTTACATCCCATTATTGTCCATCCGGTCTAAGCAACCTAAATTGACTGAAACCCTTTCTGCAGCTTGTGGAGAAGCAGAAGGCCCATACACAGCAAGCTCAGTGGGAGCAAACACACCCGCAAACTAGCTCTTCTTCCTCCTCCATGCAGAGGGAAGCTCCGCCAACAACAAATATCAGGTGATGTGTACATCAGAGTCAATTCCTATTCGAGTTCTCTTGAAGAAACCAATGACCGGCAAACTCAACCAAGAATCTGGCAACGACCAAGTAACCAGAGTTTATGTCCTGCTTGTAGTCCAACCTCTAAATCTTAAGTCAAATTTTGAGCAATTTTTTTTGAACTAGCATATCCCTCGTGCCCTATCTCGTGGGTAGATTAGTAACCGGAATAAGGTCTTTTGCTTTCTAGCCAAGGCAGGGTAGACCGGGCCTATTGAGATTTTCTTTCAATTTGATCCGAGTTCTTGACAAAGTTATTTTCGGAAGATAAGAGTTTCCTTCCTTGACATTTTAAGTAACAAAATAATACGCTTGTCTTCGGTCGGTTGTGCAGTAATCGCCCAGCAGCGGCCGGCGAGAGGACAGAGGAGGCAGCAGGACAGGCTCAGGCCCGCGTGGGGCTTCCACCATGGATGGTGAGCCACATCAGCGGCTAAAGGGCTTCCCAGTTCATACATTATTCAGTACAAGTAACAAGTTGCACCGGCCGGCCTGGTGGATCATCATTGTCTGCTTGCTAGCAAGCTGACTACTTCGATAAGAAAAGAAGAAAATCCAGCGAAAAGTAGGAAGCTGCAATGTGTATATTTCAATTAGGTTCAGTCCCTTCAGTGACCCTCATGCCTGTGCTGAGATGGCTGTACGTGTAATTTACCATGTAAAAGTTTTCCAGTTCCCCTGACACATTCACTTTCTGTGAATTAAATCAATACGAGCATTGTATAAATCGTGGTTTTGTAAATAAATAAACCGCAAATCTTTTTGTCTTTTTT
CDS Sequence
- >BRADI_1g08340v3
ATGGGGCGCGGGAAGGTGCAGCTGAAGCGGATCGAGAACAAGATCAACCGGCAGGTGACCTTCTCCAAGCGCCGCTCGGGGCTGCTGAAGAAGGCGCACGAGATCTCCGTGCTCTGCGATGCCGAGGTCGCGCTCATCATCTTCTCCACCAAGGGCAAGCTCTACGAGTTCGCCACCGACTCATGTATGGACAAAATTCTTGAACGCTATGAGCGCTACTCCTATGCAGAAAAGGTTCTCGTTTCAACGGAATCTGAAATTCAGGGAAACTGGTGTCACGAATATAGGAAACTGAAGGCGAAGGTTGAGACAATACAGAAATGTCAAAAACACCTCATGGGAGAAGATCTTGAGTCTTTGAATCTCAAGGAGTTGCAGCAACTGGAGCAACAGCTGGAAAGTTCACTGAAACACATCAGATCCAGAAAGAACCAGCTAATGCACGAGTCGATTTCTGAGCTACAAAGGAAGGAGAGGTCACTGCAGGAGGAGAATAAAGCTCTGCAGAAGGAACTTGTGGAGAAGCAGAAGGCCCATACACAGCAAGCTCAGTGGGAGCAAACACACCCGCAAACTAGCTCTTCTTCCTCCTCCATGCAGAGGGAAGCTCCGCCAACAACAAATATCAGTAATCGCCCAGCAGCGGCCGGCGAGAGGACAGAGGAGGCAGCAGGACAGGCTCAGGCCCGCGTGGGGCTTCCACCATGGATGGTGAGCCACATCAGCGGCTAA
Protein Sequence
- >BRADI_1g08340v3
MGRGKVQLKRIENKINRQVTFSKRRSGLLKKAHEISVLCDAEVALIIFSTKGKLYEFATDSCMDKILERYERYSYAEKVLVSTESEIQGNWCHEYRKLKAKVETIQKCQKHLMGEDLESLNLKELQQLEQQLESSLKHIRSRKNQLMHESISELQRKERSLQEENKALQKELVEKQKAHTQQAQWEQTHPQTSSSSSSMQREAPPTTNISNRPAAAGERTEEAAGQAQARVGLPPWMVSHISG