Information report for Bra035952
Gene Details
Functional Annotation
- MADS box gene negatively regulated by APETALA1;agamous-like MADS-box protein AGL8 homolog, Agamous 8-Like gene b
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT5G60910.1
- Brassica napus: GSBRNA2T00094717001, BnaC09G0064500ZS, GSBRNA2T00075532001, BnaA02G0391500ZS, BnaC02G0523700ZS, GSBRNA2T00086507001
- Brassica oleracea: XP_013607377.1, Bo9g014400
Gene Resources
- Pfam: PF01486 PF00319
- UniProt: A0A078FVN6
- EMBL: LK032067
- AlphaFoldDB: A0A078FVN6
- KEGG: bna:106366064
- OMA: HESTGSW
- InterPro: IPR002100 , IPR002487 , IPR033896 , IPR036879 , IPR050142
- PANTHER: PTHR48019
- SUPFAM: SSF55455
- PROSITE: PS00350 , PS50066 , PS51297
- Gene3D: 3.40.1810.10
- OrthoDB: A0A078FVN6
- SMR: A0A078FVN6
- CDD: cd00265
- STRING: 3708.A0A078FVN6
Sequences
gDNA Sequence
- >Bra035952
TACTCATTTGAACGTAGCATCCAAGCTGGAAGAAGAGAGTTTGGTTCAATCAACGACGATGCACCGCCGTTCTCTCCCACAACTCTCTCCACAAGGCCATCTCTGCCCATTAAATAATTACGAATCAGAATCTTCCATAGCTAGAGATGTATATTACACAATTAATCATAATCTAAATGTAATTAAGAATGCTACTGAGAGGGAGAGAGAGGAAACCTGGAGGCGGTTACGCAGTACTGGGGCTGAAGAACTGAAGAATTGTTGGAGCATTGGATTAATTGTCCTTCTTGCTGACCCGTGTTCTTCTCCTTTTCCTTCTCCTTAATCTATCATTATTATAGTTTTAGTCGTTGTTAATACTACAGATGTACGAATTGCATGTTCTGTTTCATATTTACTTACTATATAAATATAATTAGTATTATATGTTCTATACAGTAAAAACATAACCACTCTGAAGTTTACAAGTATAGTTGCGTATAGTTGAATATAATACCCAGAAGTTAACAAAAGCAATATATATTTGTATGTTTTATCAAGGTTCTAAATATTAGATCAATTAATGAACCAAACTGTATAATATAGTTTTACAACTAATCGGTGTTTAGTTGGCTGTATCAAAAAGTACAAACGATTGTACTGTTAGTGCCTTTATATCTATGTTTTCAACATTGGTATTTATTAGAAATACTAATAATAAATAAATAATCACTTTCTAATGCTAAAAGGGTATTAAAAACACTACTACTAATAAATAAATAAATACAAATTAACCACTTCTATTGCTAGCATATTAGTAACCATTTAAAAAAAAAAATATTGTAGGGACTACTAAGTACTAACATACAATACAATTCTTCATGTATATCAGTATTAACCACTTCTATTGCTGATATTTTTATAAAACTTGTAGAGAATTATTTAGTAAATTAATATTTTAGAGACATATGTTCATATATATATATATATATATATTCTTATGCTATAGTAATATAGTTAAAATAATCTTTAGATGTAAAATTTGGTGAGATACTGATATAACATATTATTGTAAATTATTTCATTTTCAACCTTTAGTCCCGTTTTAAATTAAATATAACCATTTAATTCAAAACTAACCTTTTTGAGAAGCGTATTATTGTGATCTTGCAAGGCCTTATCCTGATACATTTAAATGAAATAAAATATTTTTATTATTATTCTTTTTTTTTGTGGAACACAAATAAAATAAGCAAGTTATATATATAAAAATAAATTGTTTTGATGATGTATCTAATTGAGACACTTTACCTTCTTCTGGAGCGCTGATATGGATTCGAACATAGCTTGGTTCTGCAAATATTACAAATTCATTAAACAAAACTATCACAGATTTCAGCTCAAACTCATAGCCAAAAACCTCACTTTTCGATCTAAATATTTACATAGACATGTAGATGTACTAACGTTCTCGTATTACGTACCTTTCTTGACCTAATGCTCTTGATAGCAGCGTCGAGCTGATGCTCCAAGCTTTGAAGCTCCTTTATGCTCAAGGAATCAAGATCTTCCCCCATAAAATTCCTGCACATTTCAGTTTTCTGATTAGTAATTACTGATGTAACCAGTGTACTTGTAATTATGTTACCTCGCTACCTATCTGATATTACGCCAAGTTTTACCATCAATTTTCCATACAGAAAATGAACATTGTGAGGATCCAAGACACAAATAGCAAGTCTAGTTTAACTTATGTGTAATGTGTTACGATTTCTTACCATTAGGACTAACAAATTGAATAAGTTTACGTTAAACTGCGATTTGATTAAAGCACAGATTGATCTACAATCTTAATTTGACATAATGCACTTGAAGACGATATGGCACTACATATGTATTTATAATATACCTTTTATTCTTTTCAAGTACCTCAACTCTTGCCTTGAGCTTAGCATGCTCTAGAACCCAATTTTCCTACAACATTAATTGATATATGATAGAAACTAGTTACTACAAAATACACATAACTGAGCAAGACTTATGAACATAAACATCTAGAAGAAACAAAGCTTAAAACTTACACTTTGTGAAATGTCTCGGCCAACAAGTTGTTTGTCTGAATATAAATAGCGATCATATCGCTCAAGTATCCTTTCCATGCTATATTTCAGAGAAAAAACAATCAAAATATACTTCATTAATTTGATCCATGTATATCAGATTAGATTTCAAACGCGTTGTAATGTGTAACATTAATTTGTCACAAAGTGTTAGCCAAGAGCTTACATTGTTTGGTATGCTGACAAAGGATCGCTAAAAGTTAGCATATAACACAAAAATGTATATAAAACCTGGCTTTGGTGAGTCCACGAGTCATCATAGAAAATATGCGTACAAATTCAATCTCAATTACCTGACTCGGTTATCTAAGCAAACGGTATGATATATATATAATGTATATGATCGTACAAACAAATATATGTACACTTTAACTCAAAAAGATATATGTACACACTCAAAAATGCATTTATATCAGTACGAACTTACATATATGTTAGTATCCAATGGATTATAGCATATCCTTGTAAATGCTTATTCCATTGTTTCAAATCAACCTTTCTTTTGCTTTCAAATGTATGTTATTGATTAACTATATTATACACGTTATATACATATATATATTATCCTACGTGTCTGTGTGCACGTCCTTGCATACATCAAAAGAGGCAATCAAATCGTGAGTCTGTGTACTAAGTATCATAATTTCATGCTATTTTCTATACATAAACAGCTTTTTCATGCGTCCGTACGTAAAATCCCCAAAAAACCCTAATTTCTCGAGCCACTTCTTAGGGAAAAAACAAATCTACAGTAGATATGCAACACAAAGGGACAAGATTTAGATCTAGATTGAGACATACGCTTATGAAACAAATCTTACTAAAAAATCAAGAAAGCAGATGGATAAGATCGATGTGAATATATAATATAATATATGGTTTACGAATGAAACCAATAGATAATAATTACCTAGAGTCAGTGGAATATTCGAAGAGTTTGCCTTTGGAAGAGAAGACAACGAGAGCAACCTCAGCATCGCAGAGAACAGAGATCTCATGAGCTTTCTTGAGCAAACCAGACCTTCTCTTTGAGAAAGTAACTTGCCTATTGATCTTGTTCTCTATCCTCTTCAGCTGAACCCTACCCCTTCCCAT
CDS Sequence
- >Bra035952
ATGGGAAGGGGTAGGGTTCAGCTGAAGAGGATAGAGAACAAGATCAATAGGCAAGTTACTTTCTCAAAGAGAAGGTCTGGTTTGCTCAAGAAAGCTCATGAGATCTCTGTTCTCTGCGATGCTGAGGTTGCTCTCGTTGTCTTCTCTTCCAAAGGCAAACTCTTCGAATATTCCACTGACTCTAGCATGGAAAGGATACTTGAGCGATATGATCGCTATTTATATTCAGACAAACAACTTGTTGGCCGAGACATTTCACAAAGTGAAAATTGGGTTCTAGAGCATGCTAAGCTCAAGGCAAGAGTTGAGGTACTTGAAAAGAATAAAAGGAATTTTATGGGGGAAGATCTTGATTCCTTGAGCATAAAGGAGCTTCAAAGCTTGGAGCATCAGCTCGACGCTGCTATCAAGAGCATTAGGTCAAGAAAGAACCAAGCTATGTTCGAATCCATATCAGCGCTCCAGAAGAAGGATAAGGCCTTGCAAGATCACAATAATACGCTTCTCAAAAAGATTAAGGAGAAGGAAAAGGAGAAGAACACGGGTCAGCAAGAAGGACAATTAATCCAATGCTCCAACAATTCTTCAGTTCTTCAGCCCCAGTACTGCGTAACCGCCTCCAGAGATGGCCTTGTGGAGAGAGTTGTGGGAGAGAACGGCGGTGCATCGTCGTTGATTGAACCAAACTCTCTTCTTCCAGCTTGGATGCTACGTTCAAATGAGTAA
Protein Sequence
- >Bra035952
MGRGRVQLKRIENKINRQVTFSKRRSGLLKKAHEISVLCDAEVALVVFSSKGKLFEYSTDSSMERILERYDRYLYSDKQLVGRDISQSENWVLEHAKLKARVEVLEKNKRNFMGEDLDSLSIKELQSLEHQLDAAIKSIRSRKNQAMFESISALQKKDKALQDHNNTLLKKIKEKEKEKNTGQQEGQLIQCSNNSSVLQPQYCVTASRDGLVERVVGENGGASSLIEPNSLLPAWMLRSNE