Information report for Bra029527
Gene Details
Functional Annotation
- Encodes a homeodomain protein that is expressed in the LI layer of the vegetative, floral and inflorescence meristems. Binds to the L1 box promoter element which is required in some proteins for L1 specific expression.
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT4G04890.1
- Brassica napus: BnaA09G0234900ZS, BnaC09G0276000ZS, GSBRNA2T00094475001, GSBRNA2T00157869001, BnaA03G0263700ZS, BnaC03G0315100ZS
- Brassica oleracea: XP_013611163.1, XP_013611162.1, XP_013611161.1, XP_013611160.1, Bo9g077670, XP_013629801.1, XP_013629800.1, Bo3g048340
- Raphanus raphanistrum: RrC4900_p1
Sequences
gDNA Sequence
- >Bra029527
TGTATCATCCAAGCATGTTTGAGAGTCACCACATGTTCGACTTGACCACAAAGAGTACCTCCGACAACGACTTGGGAATCACCGGCAGCCGAGAAGATGAGTTCGAGACCAAGTCAGGCACCGAGGTCACCACCGATAATCCTTCTGGTGAAGAGCTTCAAGATCCTAACCAACGTCCCAACAAAAAGAAGCGTTACCATCGCCACACGCAGCGCCAAATCCAAGAGCTAGAATCGTAAGAAACAACACTTAATTAAGCTCTAGCTCACATAACAATAGATACGACACATTTTAAAAAAGTTTCATATTTGTATTTATATTTATATTGGCTTTACAGGTTCTTTAAAGAATGTCCTCATCCAGATGATAAGCAACGTAAAGAGTTGAGCCGCGATCTCTGCTTAGAGCCTCTTCAAGTAAAGTTTTGGTTCCAAAACAAACGCACACAAATGAAGGTATATATTTATGTAACAAATAACATCCTCTTCATTAAATTCTTATTAAATTAAAAATGAATTCTTATATAGTAAACTAATTAATATCATAATTATAATATACTGAAATAATTTATATTAATCTCATTTCGTGTGTGTGTGTGTGTAATATCTATAGGCACAACATGAGAGGCATGAGAACCAGATTCTTAAGTCAGACAATGACAAGCTCAGAGCAGAGAACAACAGATACAAGGAGGCTCTAAGCAATGCTACATGCCCTAACTGTGGCGGTCCAGCTGCTATCGGAGAAATGTCCTTCGATGAACAGCATCTCAGGATCGAAAATGTTCGCCTCCGCGAAGAGGTAGTTAATCTTATCATATACGTGACTTAAGTTGAATTCGACCAACCTGATTCTATCAACACTTGAACCTACAGATTGACAGGATCTCCGCCATTGCTGCAAAGTACGTTGGGAAGCCAGTAGGATCTTCATTCGCTCCACTAGGGATCCACGCGCCTTCTCGTTCTCTGGAACTTGAAGTTGGGAACTTCGGGAACCAGACGACAGGTTTTGTAGGGGACATGTATGGAACAGGTGACATTTTGAGGTCGGTTTCAATCCCTTCTGATACAGACAAGCCTATGATCGTCGAGCTAGCGGTTGCAGCTATGGAGGAACTCGTGAGAATGGCTCAAGCTGGGGATCCATTATGGGTTTCGACCGGTAACTCGATGGACCTTCTGAACGAAGAAGAGTATTTCAGAACGTTTCCAAGAGGAATCGGACCAAAGCCACTAGGGTTGAGAACAGAAGCGTCAAGAGAATCAGCTGTTGTTATAATGAATCACATCAACCTCGTTGAGATTCTCATGGATGTGGTAAATTAATTAAATTGTTTCTTGATCTCCAAGTTTTATTGACTAACTTTTAAACCCTAGTTAGCTAATATTTTACTTTTGTCTTGGGGATACAGAATCAATGGTCTTGTGTGTTCTCTGGGATTGTCTCAAGAGCCTTGACACTTGAAGTTCTGTCTACTGGAGTTGCTGGGAACTACAATGGTGCATTGCAAGTGGTATGTAAACCTAGCTGATTACTTGCTTCTCAAGAAACTAAACCGAACAGTGTAGTAATCGGTTTTTAAACCTTTTTTGTGGTTTGGTTTGTGTTGCAAAGATGACAGCTGAGTTCCAAGTTCCGTCGCCGCTAGTCCCGACACGTGAGAACTACTTTGTGAGATACTGTAAACAGCATAGCGACGGTTCTTGGGCTGTGGTTGATGTCTCTTTGGACAGCCTTAGGCCGAACCTAATCTCAAGAACAAGAAGAAGGCCGTCAGGTTGTCTGATTCAAGAACTGCCTAATGGTTATTCTAAGGTAATTCAGAAGATGTAATGGGTTTAATTGACTGATTCTGAAGTTTAGGGTGAAATTTTAAAATTCATTTTTGTGTTTGAAGGTTACATGGATAGAGCATATGGAGGTGGATGATAGATCGGTTCACACAATGTATAAACCGTTGGTTCATTCCGGTTTAGCTTTCGGAGCTAAACGTTGGGTGTCTACACTCGAACGCCAGTGCGAGCGGCTCGCAAGTTCGATGGCCAGCAACATTCCGGCGAGTGATCTTTCGGGTACGTGTTTCTTTTGTTAATATTGAAAATGTTGGGGCTGAATTGAAATTTCTTTTAAGTTTACTCATTAGGTCCTTCAACTTTGTGGTAATTATGCAGTTATTACGAGTCCAGAAGGGAGGAAGAGCATGTTGAAGCTGGCGGAGAGGATGGTGATGAGCTTCTGCAGCGGTGTTGGCGCGTCGACTGCACACGCGTGGACAACAATGTCGTCGACGGGATCCGATGATGTTCGGGTGATGACCCGAAAGAGTATGGATGATCCGGGGAGACCTCCGGGTATTGTTCTTAGCGCTGCGACGTCGTTCTGGATTCCCGTTGCTCCGAAAAGGGTTTTCGATTTCCTCCGCGACGAAAATTCAAGAAGCGAGGTAAAAAATGTTTGGGTTTTGGTTTTGGTGTAGATTTTATGAATGCGGCCAATGTTTTAGAAAAACAAACCGAACCCCCCGGTCCGACTTGGAATAGTTCTTGCTGTGTCCGGTTTACATCAAAACTTACTGTTTTAAGTTAAAACCGACATAACTACTAAAACTGGTTATCCGAGTTTAATTTTAAACCTGGTTTACAAATTAATAAGAGCAACTCTTGAAATTTAATAAACAATATAATATAATAATTAAAAAAATTAATTATATAATTAAATTTTAATATTAAAAGATCACAAAAGTTTTCATAAAAGTATTTAGTAGGTTCTCAAATGAAACCTTCTCTTCATTTTTAATATAAGTTCTTTAGAGAAAAAAAAAAGAAAACAACTTTGTTTTGGACAGTTTACTAAATCACATATTTATATATTGATAATTTTTTTTTTTTTTTGTAAGTATTGCAATGATATAAAAGAATCCTTTGTTATTAATTTGTGTTTTCTGAAATTTATTCATGCAGTGGGATATTCTGTCCAATGGAGGAATGGTTCAAGAAATGGCTCATATAGCAAACGGTCGTGAACCTGGAAACTGTGTCTCCTTACTCCGAGTCAATGTAATATTCCTTCTCCTTGTTCAAGTTATTTCTGTGTTTGCTTTCTCCATATTAGTGATCCAAAGTTGTTCGTTCCGTTTCTTTGTAACAGAGCGGGAACTCGAGCCAGAGCAACATGCTGATACTACAAGAGAGCTGCACGGACGCGTCTGGATCGTACGTGATTTATGCGCCGGTGGATATAGTGGCGATGAACGTTGTCCTAAGCGGAGGAGATCCTGATTACGTGGCGTTGTTGCCGTCAGGTTTTGCTATATTACCGGATGGTTCAGTCGGAGGAGGAGATGGGAATGATCAGGAAGTGGTTTCTTCTTCTACTACTGCTTCTGGGAGTTGTGGTTCACTTTTAACCGTTGCGTTTCAGATACTTGTTGACTCTGTTCCTACAGCTAAACTCTCTCTTGGTTCCGTGGCTACGGTTAATAGTCTCATCAAATGTACTGTGGAGAGGATCAAAGCCGCCCTTGCTTGTGACGTAGGTGGAGGAGCACCGTAA
CDS Sequence
- >Bra029527
ATGTATCATCCAAGCATGTTTGAGAGTCACCACATGTTCGACTTGACCACAAAGAGTACCTCCGACAACGACTTGGGAATCACCGGCAGCCGAGAAGATGAGTTCGAGACCAAGTCAGGCACCGAGGTCACCACCGATAATCCTTCTGGTGAAGAGCTTCAAGATCCTAACCAACGTCCCAACAAAAAGAAGCGTTACCATCGCCACACGCAGCGCCAAATCCAAGAGCTAGAATCGTTCTTTAAAGAATGTCCTCATCCAGATGATAAGCAACGTAAAGAGTTGAGCCGCGATCTCTGCTTAGAGCCTCTTCAAGTAAAGTTTTGGTTCCAAAACAAACGCACACAAATGAAGGCACAACATGAGAGGCATGAGAACCAGATTCTTAAGTCAGACAATGACAAGCTCAGAGCAGAGAACAACAGATACAAGGAGGCTCTAAGCAATGCTACATGCCCTAACTGTGGCGGTCCAGCTGCTATCGGAGAAATGTCCTTCGATGAACAGCATCTCAGGATCGAAAATGTTCGCCTCCGCGAAGAGATTGACAGGATCTCCGCCATTGCTGCAAAGTACGTTGGGAAGCCAGTAGGATCTTCATTCGCTCCACTAGGGATCCACGCGCCTTCTCGTTCTCTGGAACTTGAAGTTGGGAACTTCGGGAACCAGACGACAGGTTTTGTAGGGGACATGTATGGAACAGGTGACATTTTGAGGTCGGTTTCAATCCCTTCTGATACAGACAAGCCTATGATCGTCGAGCTAGCGGTTGCAGCTATGGAGGAACTCGTGAGAATGGCTCAAGCTGGGGATCCATTATGGGTTTCGACCGGTAACTCGATGGACCTTCTGAACGAAGAAGAGTATTTCAGAACGTTTCCAAGAGGAATCGGACCAAAGCCACTAGGGTTGAGAACAGAAGCGTCAAGAGAATCAGCTGTTGTTATAATGAATCACATCAACCTCGTTGAGATTCTCATGGATGTGAATCAATGGTCTTGTGTGTTCTCTGGGATTGTCTCAAGAGCCTTGACACTTGAAGTTCTGTCTACTGGAGTTGCTGGGAACTACAATGGTGCATTGCAAGTGATGACAGCTGAGTTCCAAGTTCCGTCGCCGCTAGTCCCGACACGTGAGAACTACTTTGTGAGATACTGTAAACAGCATAGCGACGGTTCTTGGGCTGTGGTTGATGTCTCTTTGGACAGCCTTAGGCCGAACCTAATCTCAAGAACAAGAAGAAGGCCGTCAGGTTGTCTGATTCAAGAACTGCCTAATGGTTATTCTAAGGTTACATGGATAGAGCATATGGAGGTGGATGATAGATCGGTTCACACAATGTATAAACCGTTGGTTCATTCCGGTTTAGCTTTCGGAGCTAAACGTTGGGTGTCTACACTCGAACGCCAGTGCGAGCGGCTCGCAAGTTCGATGGCCAGCAACATTCCGGCGAGTGATCTTTCGGTTATTACGAGTCCAGAAGGGAGGAAGAGCATGTTGAAGCTGGCGGAGAGGATGGTGATGAGCTTCTGCAGCGGTGTTGGCGCGTCGACTGCACACGCGTGGACAACAATGTCGTCGACGGGATCCGATGATGTTCGGGTGATGACCCGAAAGAGTATGGATGATCCGGGGAGACCTCCGGGTATTGTTCTTAGCGCTGCGACGTCGTTCTGGATTCCCGTTGCTCCGAAAAGGGTTTTCGATTTCCTCCGCGACGAAAATTCAAGAAGCGAGTGGGATATTCTGTCCAATGGAGGAATGGTTCAAGAAATGGCTCATATAGCAAACGGTCGTGAACCTGGAAACTGTGTCTCCTTACTCCGAGTCAATAGCGGGAACTCGAGCCAGAGCAACATGCTGATACTACAAGAGAGCTGCACGGACGCGTCTGGATCGTACGTGATTTATGCGCCGGTGGATATAGTGGCGATGAACGTTGTCCTAAGCGGAGGAGATCCTGATTACGTGGCGTTGTTGCCGTCAGGTTTTGCTATATTACCGGATGGTTCAGTCGGAGGAGGAGATGGGAATGATCAGGAAGTGGTTTCTTCTTCTACTACTGCTTCTGGGAGTTGTGGTTCACTTTTAACCGTTGCGTTTCAGATACTTGTTGACTCTGTTCCTACAGCTAAACTCTCTCTTGGTTCCGTGGCTACGGTTAATAGTCTCATCAAATGTACTGTGGAGAGGATCAAAGCCGCCCTTGCTTGTGACGTAGGTGGAGGAGCACCGTAA
Protein Sequence
- >Bra029527
MYHPSMFESHHMFDLTTKSTSDNDLGITGSREDEFETKSGTEVTTDNPSGEELQDPNQRPNKKKRYHRHTQRQIQELESFFKECPHPDDKQRKELSRDLCLEPLQVKFWFQNKRTQMKAQHERHENQILKSDNDKLRAENNRYKEALSNATCPNCGGPAAIGEMSFDEQHLRIENVRLREEIDRISAIAAKYVGKPVGSSFAPLGIHAPSRSLELEVGNFGNQTTGFVGDMYGTGDILRSVSIPSDTDKPMIVELAVAAMEELVRMAQAGDPLWVSTGNSMDLLNEEEYFRTFPRGIGPKPLGLRTEASRESAVVIMNHINLVEILMDVNQWSCVFSGIVSRALTLEVLSTGVAGNYNGALQVMTAEFQVPSPLVPTRENYFVRYCKQHSDGSWAVVDVSLDSLRPNLISRTRRRPSGCLIQELPNGYSKVTWIEHMEVDDRSVHTMYKPLVHSGLAFGAKRWVSTLERQCERLASSMASNIPASDLSVITSPEGRKSMLKLAERMVMSFCSGVGASTAHAWTTMSSTGSDDVRVMTRKSMDDPGRPPGIVLSAATSFWIPVAPKRVFDFLRDENSRSEWDILSNGGMVQEMAHIANGREPGNCVSLLRVNSGNSSQSNMLILQESCTDASGSYVIYAPVDIVAMNVVLSGGDPDYVALLPSGFAILPDGSVGGGDGNDQEVVSSSTTASGSCGSLLTVAFQILVDSVPTAKLSLGSVATVNSLIKCTVERIKAALACDVGGGAP