Information report for Bra029347
Gene Details
Functional Annotation
- MADS box gene negatively regulated by APETALA1
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT5G60910.1
- Brassica napus: GSBRNA2T00075532001, BnaA02G0391500ZS, BnaC02G0523700ZS, GSBRNA2T00086507001, GSBRNA2T00025013001
- Brassica oleracea: XP_013618485.1, Bo2g161210, XP_013594261.1, Bo7g098190
- Raphanus raphanistrum: RrC13077_p1
Gene Resources
- Pfam: PF01486 PF00319
- UniProt: A0A078HYV2
- EMBL: HG994356 , LK032536
- AlphaFoldDB: A0A078HYV2
- OMA: YASDSCM
- InterPro: IPR002100 , IPR002487 , IPR033896 , IPR036879 , IPR050142
- PANTHER: PTHR48019
- SUPFAM: SSF55455
- PROSITE: PS00350 , PS50066 , PS51297
- Gene3D: 3.40.1810.10
- SMR: A0A078HYV2
- CDD: cd00265
- STRING: 3708.A0A078HYV2
Sequences
gDNA Sequence
- >Bra029347
TATTCATTCGTCGTAGGTAACATCCAAGCCGGAAGAAGAGAGTTTGGTTGCGTCAATGACGATGCACCACCATTCTCTGCCCCAACTCTCCCCACAAAGCCATCTCTGCCCATTTAATAATTAATTAAACTGAATCATTCACATCTAGATATGTATATTACACTATTAATCAATCTCCAAATCTAATTTGAAGTATCATCGAAAAGAGAGGAGACCTGGAGGAGGTTAAACAGTACTGGGGCTGAACAATTGAAGAATTGTTGGAGCAATGGTTTAATTGGCCTTCTTGATGACCCGTTTTCTTCTCCCTCTCCTTAATCTTATCATATCAGAAGTTTTGTCATTGTTAATATATACTACATGATTACTATGTGAATATAGTTCTTATGATAAATTTTATACAAATATAAAAATAACCACTGGAGTTTACAAATACACTATATGCATCTAGTAAAATTTACGCAATAGATAATAAGAGCAATAGATATATGCATGTTTTATCAATGTTCTAGGTCAATTACTCGATCAATCTATATATATATAGTTCTACAACTTATATTGACGCCTATATATAGCTACGTTTCAGCATTTTTTTTATAGAAAACAACTACTCTATCAGTTTCACTCTATAATTGATGTTTTATAGCTTTTTTTTGTTTCAGAATAGATGATTTATACTTCAAGTATCTATGCAGTAATTCCATGATATTTGTTGTTTGTATTATGCAGTTCTATTTCTAATTGGTTGAGTTACCTGTAGTAATGCCATTTTTTTATGCAAAAGAAGATAAATTGAATAAACATTAATAGTTACATAGTCAGCGTGCAAAACCCTTAAAATCACTTAATAAATATTTAAAACAAGCAAATTAACAATCACCATAAATATATGGTATTGTAAATACTACATACATAGAATACATTTTTCCACATTTATATATCTATATCAAATTTTGATAAAAATTCCTATTGTAGTAGTATAAAACTTGTACACATTTCTATAGTAAATTAATTTAATTACAGAAATATATATATTCATATTCTTATGTGATAATATATTGTTGAAATAATATTTTACTGTAAAATTTGGTGAGGTGAAATACTTAGGAAATTATCTCATTCACAGCTCTTTCAATTCCACTTTAACTCAAAACAAAACCATGTAATTCAAAAAGTTGTACTAACCTTTTTGAGAAGCGTATTATTGTGATCTTGCAAGGCCTTATCCTGATACATTTTAAATAAAAGAAGTAAAGTTACATATACAGAAATTCATTGTTCTGATGATGTAATTTATTGCGACACTTTACCTTCTTCTGGAGCGCTGATATGGATTCGAACATAGCTTGGTTCTGCAGACATCATAAATTTTTTAAAATAACACCATCATAAAATTCACTCGAATTCATATAATCGAACTCAACTTTTCGATCTGAAACTTATCTTCATATGTAGCTGTATGTATTAACGTTCTCATATTACCTTTCTTGACCTAATGCTCTTAATAGCAGCATCGAGCTGATGCTCCAAGCTTTGAAGCTCCTTTAAACTCAATGAATCAAGATCTTCCCCCATAAAATTCCTGCGAATTTTCATTTTTGTGATTATATAAGCATTGTGGTTGTTATGGTACATTGCTATCTATGTGATATTACGCCTAAGTTTGTGATCAAATTCCCTTACAGAAAATATTGAACATTGTGAGGATACAGGACACAAACAGAAAGTTCCTCTATTATTGTATATTATCAAGAAATCTCGAAGATGAGTACATCTTGAATCAATATGGTACGTGTTACTATATATATGTCATGAGAATAACGAAATCCATGAATTGTATGATGCATTTCCCCTTAAGTTATGTGTTTATGGACGCAAGTTGTAAACATTTATGCTCAACCCAAAGTGTAGTTGACTTCGGGTACTCTTATATATAACTAGTACGTTTAATTGCGATTTTATTAAAATTTGGATTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCCTGATTGCTTCGGAATCTTAATTTGAATATATGCAATAGATAGAAGACACTATAGTACTAAAAATGTATTTTTAATATACCTTTTGTTCTTCTCCAGTACCTCAACTCTTGCCTTGAGCTTAGCATGTTCTAGAACCCAATTTTCCTACAACAGTAATTGGTATACGATAGATACTAGTTACTACAACGAAGATATATAACATAGTGATACTTGTGAAATAAACAGGTAGAAGTAAAACCATATCTTAAGACTTACACTCTGTGAAATGTCTCGGCCAACAAGTTGTTTATCTGAGTACAAATAGCGATCATAGCGTTCAAGTATCCTTTCCATGCTAGGTTTCAAGAAATAAAATAAAAATAAAAGTGTACTTTATTAATTGATTAATATACATACTACAATTTCACATGTTCTAATGTGTAACATAACATTAAATGTTGATTAAAAGGTTACCTGGTTTGGTAAACTGACAAACATCACTAAAAGTAAGAATATAACACAAAAATGTATATAAAACCTGGTTTATGGTGACTGGTGAATCCACAAAACATCATAGAAATATACGTACATATTGAATGTCAAGATTCGAGTTTCCCTCTTGACTCAGTTATCTAAGCAATATATGTATATGATCGTACAAACAAACATATATAAACACACAAAACGCATTTACACCAGTACGAACTTACATACATGTTGAACGTCATAATATGTCCATTGGATTATACCATATCCTTCTAAATGCTTTATTTTATTGTTTTTTTTTTCATTGTTTCAATCAATTCTTTCAAATATATGTTATTAATTAAGTATTATATATTGTATTTGCATACATAAGCGTACGTTCCTGTGTGCACGTGCTTCCATACACCAAAAGAGGCAATCAAATCGTAAGTATCATACTTTTATGCTAGTTTCATCTGAGTAAAACAAGGAAAATAAACATACGTAAAATCCCAAAAAAAACCCTAATTTCTCTAGCCACTTCTTAGGGAACTCACAAATCTACAGTAGATATGCATCACACAAGGACAAGGTTTAGATTTGTTTTCAAGGCTGACGACGATCTAGATCAAGACGTACGAATTGAATGATAAAACAAATCTAGTTAAAATTTAAAAATCAAGAGAGCAGATGGATATGATCGATGTGAATATATAATACAATATATAGTTTATGAGTTAAATAAAAAGATAATAATTACCAAGAGTCTGTGGAATATTCGAAGAGTTTGCCTTTGGAAGAGAAGACGATGAGAGCAACCTCAGCATCGCAGAGAACAGAGATCTCATGAGCTTTCTTGAGCAAACCAGACCTTCTCTTTGAGAAAGTAACTTGCCTATTGATCTTATTCTCTATCCTCTTCAGCTGAACCCTACCCCTTCCCAT
CDS Sequence
- >Bra029347
ATGGGAAGGGGTAGGGTTCAGCTGAAGAGGATAGAGAATAAGATCAATAGGCAAGTTACTTTCTCAAAGAGAAGGTCTGGTTTGCTCAAGAAAGCTCATGAGATCTCTGTTCTCTGCGATGCTGAGGTTGCTCTCATCGTCTTCTCTTCCAAAGGCAAACTCTTCGAATATTCCACAGACTCTTGCATGGAAAGGATACTTGAACGCTATGATCGCTATTTGTACTCAGATAAACAACTTGTTGGCCGAGACATTTCACAGAGTGAAAATTGGGTTCTAGAACATGCTAAGCTCAAGGCAAGAGTTGAGGTACTGGAGAAGAACAAAAGGAATTTTATGGGGGAAGATCTTGATTCATTGAGTTTAAAGGAGCTTCAAAGCTTGGAGCATCAGCTCGATGCTGCTATTAAGAGCATTAGGTCAAGAAAGAACCAAGCTATGTTCGAATCCATATCAGCGCTCCAGAAGAAGGATAAGGCCTTGCAAGATCACAATAATACGCTTCTCAAAAAGATTAAGGAGAGGGAGAAGAAAACGGGTCATCAAGAAGGCCAATTAAACCATTGCTCCAACAATTCTTCAATTGTTCAGCCCCAGTACTGTTTAACCTCCTCCAGAGATGGCTTTGTGGGGAGAGTTGGGGCAGAGAATGGTGGTGCATCGTCATTGACGCAACCAAACTCTCTTCTTCCGGCTTGGATGTTACCTACGACGAATGAATAG
Protein Sequence
- >Bra029347
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