Information report for Bra028245
Gene Details
Functional Annotation
- Encodes snf1‐related kinase interactor 2 that interacts with HDR1 and phosphorylates Hd1
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT5G39440
- Brassica napus: GSBRNA2T00114336001, BnaA04G0107400ZS, GSBRNA2T00105035001
- Brassica oleracea: Bo4g138000, Bol040106
Gene Resources
- Pfam: PF00069 PF02149
- UniProt: A0A817ASR7
- RefSeq: XP_013746718.1
- EMBL: HG994358
- AlphaFoldDB: A0A817ASR7
- KEGG: bna:106449516
- OMA: GSWLKMA
- InterPro: IPR000719 , IPR001772 , IPR008271 , IPR011009 , IPR015940 , IPR017441 , IPR028375
- PANTHER: PTHR24346 , PTHR24346:SF82
- SUPFAM: SSF103243 , SSF56112
- PROSITE: PS00107 , PS00108 , PS50011 , PS50030 , PS50032
- Gene3D: 1.10.510.10 , 3.30.310.80
- OrthoDB: A0A817ASR7
- SMR: A0A817ASR7
- CDD: cd12122 , cd14079 , cd14335
Sequences
gDNA Sequence
- >Bra028245
TGAATGGATCATCGAGTCAAATTTCCAGTAAGAGGAAATCAGTTCTACCAACTTATAAGATTGGTAAAACTCTTGGACAAGGATCTTTTGCGAAAGTGAAATTAGCTGTGCATAAAACTACTGGACACAACGTTGCTATCAAAATCCTTAATCGTGAGAAGATTAAGCAGATGGGAATTGAAGCAAAAGGTATATAACTTCAGTATATCTAGAATAAAACTACAAGATTGTGGCAATCCTTCCATGGTAATCAATAGCTAATGTATGCTCTTGATAGTACAACTAGTTGGTATGGAATGTATACGAATCTTTCTCATACTCGATTTCGAAAACTGACCTGGAATGTGACTATGACATATAACCTAATTGATAGTTTGTGCTATTGTTGTCGATGTGTTACATATTCTACAAAAAAAAAAAGAATTAAGTTGAATGTCTTGGTATATGCATAAGATCACTTTTTCGTTTAATCTTCACTTTTTTTTTTTTTTTTTGACGTCGGTTTAATCTTCACTTATATATATACAAATTAGTGTTTCCAATATGTCGTTACCTATATTCGACAGACAAAATTTATACTATGTTTTTTAGGTACATAAGATCACTCTTTTATTGTTTCATATTTGTTTATACGTATGTTTTTTTATATACGCGGTACGTAAAACAACATAGTAGAAATTTTGTCTGTCGAATATAGGTAATGACATATCTTACGTACGTAAGATCAATCTTTTTCATTTAACCTTGATTAATGCATTCTTTAACCTTATAGTGGAGAGGGAGATCAAAATTATCAGATTGTTGATGCATCCTCATATCATCCGTCAATATGAAGTTATAGAGACACCAGAAGACATTTACGTTGTCATGGAGTATGTTAAGGCTGGCGAACTGTTTGACTATATTGTAGAGAAAGGTAAATTACATGAAGACGAGGCTCGCTATCTTTTTCAGCAGGTTAGTTTTTCTTTTAACTTTTTACGGTATTTTGCAAAATATATCTTACCTTCTTTGATTTCTAGTATTTTCTTAAAATCTTTTTCTTATTCAGATCATATCTGGTGTGGAGTATTGTCACCGCAATATGATCGCTCATCGAGATCTCAAACCGGAGAATATACTCATGGATACGAAATTCAACATAAAGATTGCAGATTTTGGATTGAGTAATGTCATGCATGATGGTCACTTTTTGAAGACCAGTTGTGGAAGCCCTAACTATGCTGCTCCGGAGGTATATATCATTTGGAAAAACTAATAATCATTTCATTAAATTCAGTTTCTATATCAAGTTTCAATTAATGACATCCGAAAATTTGTTTTCATAGGTTATTTCAGGAAAACTGTATGCGGGACCAGAAGTGGATATTTGGAGCTGTGGAGTCATATTATACGCTCTACTATGCGGTAATCTTCCTTTCGATGACGAAAATATGCCTGGTCTATTCAGCAAAATCAAGGTATATTATCCAACGATCTTTCGCAAAATCATCTATTATACATGTTTAGCAGTCAAATATTTATGTTCTTTTTTTTCAGAAGGGAGAGTATATTCTTCCAGATCATTTATCGTACGCCGCTAGAGATTTGATACCGAGAATTCTTACGGTTGATCCTATGATGAGAATTAGCATTCCTGGGATTCGTCAACATCCTTGGTTCAGTAGTAAACTTCCCCCTTATCTTGCTGCTCCTCCATTGGATACTACAGAACAAGCTAGAGAGGTTAGAGCCCTTTTCATTTTATCGTAGCAAAATAATATCATTCGTATGAATTAGTGAAGTTCACATATATTTTTTTCCAGATTAATGAGGAGATCATTCGAGACGTGGTCAACCTAGGGTTTGTTGAAAAACACGTTAAGGAATCTCTTTTAAACAGAATCCAAAACGAGGTATAAAGTATTTTCTCAATAATTAGTTAGGTATGTTTATACCTTAAATAGTTTTAAAAAGATTACTGAGGCTTCATATTTCACTGTTTTAGGCAACCGTTGCATACTATCTGTTACTGGACAGTCGACGTCGTAGTCCCAGTGACTATTTCGAGTCCAATGTTAATAGGATTTCGGTATTAATTTGCTCTCTTTCTCTACAACATAAACTCTAAACGAATTAATAAAACTATATAATTAAAAAAACATGGATGTTTTTACCAAAAAAAGACATGGATGCAATAACACTACCAGTTACTCATTTGATCTTACCATTTGTTGTATTGGTCTCTAATAGCCTGTGTCGTAATTTCTTTTAGAGTTTTAATTCGACGATTCCAGCTCAAACGGTTGCTCCGTTTCCTGCATTGGTTAATCATCACCTCATGGCTGGACTAAGACCACGGGTTAGCGCTGATAAAAAATGGACCCTTGGACTTCAGGTCAGTCCATGGTTGTTGAACCTTTGTCATTAATTTGACTTTTCATTTATTTTATGGCTGGAAATTTAGGACAATTGATAATCGTGGAATCTCTCTCCATTATACTTTTTAATGTAACCTCTCTCTCCTCTATACAGACATTATACTTTTCGACTTAATCGTTTTTGTTTGTAGAATACAATTATATAATACTAAAATAACTTTTAGTGTGTACTACTTATCTAAACTGCTATAGTTTAGTTTGAATTGTTACAGCTTAACTAATATAGTATATTGAGTATGTTTTCATATATCTTTTATTTCTCACTTCCATCGTAAATACTTTTGGATTGCACATGTTGTTACTTTATAACTTTTACCAGTCAAAACTTAGGATTGCTGTAGTTTAAGTTTTGTTCTTTCTATGTTGACAGTCTCAAGCGCGTCCTAAGGACATCATGACTGCTGTTTTTAAGGCTCTTCAAGACCTTAAAGTGAGCTGGAAACAGATTGGAGAGTACAACATAAAATGCAGATGGGTTCACCAAAGTAGTATCTCCAAAGAGAAATCTAACATGATGGAAGCTGAACTTGCGATGATCTCACCAACCGTTCTCAAGTTTGAACTTCAGGTATATATACATGGTTTATCGAATAAAGTTAAATCGAAAATAATTTGTATCTTTTTGTGTTTATAGCTGTACAAAGCAGGTGAGGGAAAGTACGTGCTGGACATCCAGATAGCTGATGGACCTCAATTTCTCTTCTTGGACCTGTCCGTCTCTCTTCTCAGAGAGCTAAATGTGGTCTGA
CDS Sequence
- >Bra028245
ATGAATGGATCATCGAGTCAAATTTCCAGTAAGAGGAAATCAGTTCTACCAACTTATAAGATTGGTAAAACTCTTGGACAAGGATCTTTTGCGAAAGTGAAATTAGCTGTGCATAAAACTACTGGACACAACGTTGCTATCAAAATCCTTAATCGTGAGAAGATTAAGCAGATGGGAATTGAAGCAAAAGTGGAGAGGGAGATCAAAATTATCAGATTGTTGATGCATCCTCATATCATCCGTCAATATGAAGTTATAGAGACACCAGAAGACATTTACGTTGTCATGGAGTATGTTAAGGCTGGCGAACTGTTTGACTATATTGTAGAGAAAGGTAAATTACATGAAGACGAGGCTCGCTATCTTTTTCAGCAGATCATATCTGGTGTGGAGTATTGTCACCGCAATATGATCGCTCATCGAGATCTCAAACCGGAGAATATACTCATGGATACGAAATTCAACATAAAGATTGCAGATTTTGGATTGAGTAATGTCATGCATGATGGTCACTTTTTGAAGACCAGTTGTGGAAGCCCTAACTATGCTGCTCCGGAGGTTATTTCAGGAAAACTGTATGCGGGACCAGAAGTGGATATTTGGAGCTGTGGAGTCATATTATACGCTCTACTATGCGGTAATCTTCCTTTCGATGACGAAAATATGCCTGGTCTATTCAGCAAAATCAAGAAGGGAGAGTATATTCTTCCAGATCATTTATCGTACGCCGCTAGAGATTTGATACCGAGAATTCTTACGGTTGATCCTATGATGAGAATTAGCATTCCTGGGATTCGTCAACATCCTTGGTTCAGTAGTAAACTTCCCCCTTATCTTGCTGCTCCTCCATTGGATACTACAGAACAAGCTAGAGAGATTAATGAGGAGATCATTCGAGACGTGGTCAACCTAGGGTTTGTTGAAAAACACGTTAAGGAATCTCTTTTAAACAGAATCCAAAACGAGGCAACCGTTGCATACTATCTGTTACTGGACAGTCGACGTCGTAGTCCCAGTGACTATTTCGAGTCCAATGTTAATAGGATTTCGAGTTTTAATTCGACGATTCCAGCTCAAACGGTTGCTCCGTTTCCTGCATTGGTTAATCATCACCTCATGGCTGGACTAAGACCACGGGTTAGCGCTGATAAAAAATGGACCCTTGGACTTCAGTCTCAAGCGCGTCCTAAGGACATCATGACTGCTGTTTTTAAGGCTCTTCAAGACCTTAAAGTGAGCTGGAAACAGATTGGAGAGTACAACATAAAATGCAGATGGGTTCACCAAAGTAGTATCTCCAAAGAGAAATCTAACATGATGGAAGCTGAACTTGCGATGATCTCACCAACCGTTCTCAAGTTTGAACTTCAGCTGTACAAAGCAGGTGAGGGAAAGTACGTGCTGGACATCCAGATAGCTGATGGACCTCAATTTCTCTTCTTGGACCTGTCCGTCTCTCTTCTCAGAGAGCTAAATGTGGTCTGA
Protein Sequence
- >Bra028245
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