Information report for Bra025411
Gene Details
Functional Annotation
- Agamous-like transcription factor. A target of SPL10, AGL79 knockdowns show defects in leaf shape, shoot branching, and flowering time.;MADS-box transcription factor
Homologous
- Brassica napus: BnaA06G0369700ZS, BnaC07G0322600ZS, GSBRNA2T00144478001, BnaC02G0480300ZS, GSBRNA2T00082884001, BnaC09G0031400ZS, BnaA09G0045700ZS, GSBRNA2T00109576001
- Brassica oleracea: XP_013596539.1, XP_013619388.1, XP_013619387.1, Bo2g149440
- Raphanus raphanistrum: RrC14020_p1, RrC6330_p1, RrC18900_p1
Gene Resources
- Pfam: PF00319 PF01486 PF04849 PF09074
- UniProt: A0A816SVP8
- EMBL: HG994360
- AlphaFoldDB: A0A816SVP8
- InterPro: IPR002100 , IPR002487 , IPR033896 , IPR036879 , IPR050142
- PANTHER: PTHR48019
- SUPFAM: SSF55455
- PROSITE: PS50066 , PS51297
- Gene3D: 3.40.1810.10
- SMR: A0A816SVP8
- CDD: cd00265
Sequences
gDNA Sequence
- >Bra025411
TATGACATCCGTTTCACCTTCTTTGTTAGATGTTTCTTCAGTTCTTTGAGTTCCTTCTCCTATGCCAGCAAAAGATCGCACAGAGTTATATATATTAAATTCGTTGGAGCTCAAGTGCTCTAGATCTTAAATCTGGATTTTTGTTTCTCATATATAGTCCAAGCATTTTGATTTGTACAAACCAAATAGCCAAGAAAATACCGGCAGATACTCAAAGACGGTTGCTTGGTACAAACAGATAACATAGACTTATTTTCTGTAAACCAGTCTATTACCTTTTTCTGGAGCTGCGTTATGGACTCTACCATGAGCTGGTTCTGTGCTCCCAAACCAAAACAAAGCTACATAATTAGATATTGTATATCTATATTTATGTGTAAATAAATGCATACACATGTATACTGAACATTATTAGACGCACTTTTGTACAAATGATCCATGCATACAAGATGAAAGATAATGCTTTTATGGATATAGATAAATCACCTTTCTTGAGCGAATTCTCTTGAGGGAAGTATCAAGTTGCACTTCCAGACCCTGGAGCTCTCTGATACTTAGAGCATCAACCTCTTCTCCTTTCAAGTGCCTTGTTATGTGAAGTAAACAAATTAATCAATGAAGATGCATTTTATTATATTGTATAATATTAGAAACATGTGTTGACTTAAACTTGAAGTTAACATAAAGTTGTTCTAATGAGTTTAGGAAATTATCCTATTGTGTTTACTAATGAGTTTAGGAAATTAGGTTAACTATATAAAGAGATGTTATGATGTGATAAAGCTTGAGAGTTGTGAGCTTTAGTTTTGTGATAAGTTTTTCTAAAGGAATAAGAAATTTGAGTTTGAGTTCTTGAGTTTTTAATCGTTGAGTTACGGTCATATTATTTGGTTTCAATAATTGGTATCAAAACTAGGTTGAAATCAAATACGGGTGAGAAGAAGAGAAGATCAACAAGTGTAATTTGGTTTCAATAACATGTGTAATTTATATATGGATGAACCTGAGCTAAATATTTTTTTAAAAATTCCAACCTTAAGCTTCTTTGCATAGCATCAATCATCCTCAAGAGCTTCGAACATTCTGTTGAGCACTCACCCTACGAAAAAAAAAAATTAGACAAACAATAGTTAGCAAAATTTGGAACAGACAATTGTTCATCATACATATGTAATACTTATCAAACAAAAATGTAATATATATTTGTGTGCTTAAACCTGTGAATCCAAACTTGGTGTAGGAATATTTTGACCGGCGAATGAACATCTCTCATATCGATCAAGAATGCTTTCCATGCTAACATCGTTTAATTAAACTTGAATGAATACTTGATGTACATACTATCATCATACATCATACTGAACATGATGAATAATTATTTTTTTACTTTAGTGTGTATATATAGACATTTCTAGATCATATGCATCACACATATAATGGTTAGTGCTATATATTGAGAACATTCATATCTACATTTCATACATTCTAAATACTATATATGTATGGATTTAGAACATGATATTTATATTCGTCGAAGCGCAAGAGAGAACATGACCTTCAGTAAAGGGTTTCTCACAAACCTACTGTGGGTAAAGACTCAAATCCTAGGCATAAGTGACTATATATGTAGCCTACACGCAGAGTTTAATCAAAGTGAAATCAAACGAGTTAGTATGTCCTTCCTTATACTCAATACAACTGTACCACACACGGGATTTTATCACTATTTTACAGTATTCCTTAGACTAAAACAATAATTAAATCAAACTTCAAAAAAAATCTTACAACATTTTTGCAAGAATACTTATTCTTGGACATACTACTTAATTCTCAGAAGCTATAAAAGTAACATCATCTGGGTGTATATATTTTCATGTGAAGATCGAGGTTAATCCTAGGTTGAACCAGGAAAAAGACAAAGCAAGGCCCAAAGCTCCATGGCAAAGGCTTGTCATGCTTCCAACAACATTTCACTGTATATCGTAAAGGTTATCAACACAGTACCACGTAATGAAATCTACTTTCATGTTTACTATTAGTACACTCATGACTGAAAGCATACGCTATTTATAGTAGATTTGGTTTCTCTATTTAGTAATTTTGTGTACATTTAGATACTTTCAGTATGAAATCCATCCCAATTGCACCAAATTTTATATAATATGTTCTTCCTATATTTAGTAGGATTACTTCTTTTACTGGCAGTTCATTTACACTAATGAATGATAGCGTGTATCAAAAGATGAGATCTATTATAATTTACATGAACTTAGGACATTGCGAAAATTTGCAAGGTGTCATCATAATATGTCTCTTCGTATTTTATTTTATTTTATTTTTAGTGTTCTGCTTGGACAATTACCCTTCTAATTTGAGCTTAGCTGGATTATGTCAGATCGCCAGATTGATTCAAAAAAGGACTTGCAATTTAAAAATTCTGTTCATTTTTTATACTGAATAGTCAGATAAAATAAGATAACAAATTTAATAAAATAAACTTCAATCTAACGCAGAAAACCAAAAACTTCAATAAAACGCAGAAAATCCAGTAAGAAAACTTCGATCTAACATGATTGTATCTTTAATTAAACATTAGATCTTCTCATTGCTCCAAACCCTACAGGTGTGAACTAAAAAAAACCATTTGTAGATTTTAAATCAAATTTGCTCTTCAGCCTTATTTTTTCCCTATAAAATCTCATTTTCCATAAGGTTGAAGAACAAAAACACACACGTGAATTAATAGAAGTAAACTTATTTATGTTTACAGTTATCAAATTCTCCACCATATGTTTCTGGATATTCATATAATCAAAGGAACTGCATGTTCTCAAACTTATGGTTTAATCACAAAAGAAAAACTATCTACTCACTTCTGTTCATTGATTTATATATATAGGATATATATTTCACTTTTTATGTTCTCCCTAACTTAGAGATGCAAAAACTAATTAAGCAGATAAGCAAATATGTGCATTAGTGTCTCTCACACACGTACATATCTATAAACTCATCTATTTAATCAAGTTATCTCAGCCAAAGTTCATATCAATCTCCACTAGCTAGAACCTACCACTTGCCTCAGTCTGTGAAAACATGAAATATAAGCTGATATATGTGTAGATAAAAAAGAATATTATATGCGGTCTTATAAAAAAGTAAGCAGATGGTAAAATAAGGTTCGAAGTAAACTAATTTGTCTAGGAAGAAATTCAAACCTGGAACCAGCAGAGTACTCAAACAGCTTGCCTTTTGGAGAGAAGACAATCAAAGCAACATCAGCATCACATAACACTGAGATCTCCTGAACTTTCTTCACCAAACCCGTTCTTCGCTTTGAAAATGTCACTTGTCTCCTTATCTTGTTCTCGATCCGCCGTAACTGAACCCTTCCCCTTCCCAT
CDS Sequence
- >Bra025411
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Protein Sequence
- >Bra025411
MGRGRVQLRRIENKIRRQVTFSKRRTGLVKKVQEISVLCDADVALIVFSPKGKLFEYSAGSSMESILDRYERCSFAGQNIPTPSLDSQGECSTECSKLLRMIDAMQRSLRHLKGEEVDALSIRELQGLEVQLDTSLKRIRSRKNQLMVESITQLQKKEKELKELKKHLTKKVKRMS