Information report for Bra020742
Gene Details
Functional Annotation
- Agamous-like transcription factor. A target of SPL10, AGL79 knockdowns show defects in leaf shape, shoot branching, and flowering time.;MADS-box transcription factor
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT3G30260.1
- Brassica napus: BnaA02G0357100ZS, GSBRNA2T00082884001, BnaC02G0480300ZS, BnaA09G0045700ZS, GSBRNA2T00109576001, GSBRNA2T00144478001
- Brassica oleracea: XP_013619388.1, XP_013619387.1, Bo2g149440, XP_013596539.1, XP_013610595.1, Bo9g009030
- Raphanus raphanistrum: RrC6330_p1, RrC14020_p1
Gene Resources
- Pfam: PF00319 PF01486 PF04849 PF09074
- UniProt: A0A078I922
- RefSeq: XP_013696019.1
- EMBL: LK032641
- AlphaFoldDB: A0A078I922
- OMA: WGDEYGI
- InterPro: IPR002100 , IPR002487 , IPR033896 , IPR036879 , IPR050142
- PANTHER: PTHR48019
- SUPFAM: SSF55455
- PROSITE: PS00350 , PS50066 , PS51297
- Gene3D: 3.40.1810.10
- OrthoDB: A0A078I922
- SMR: A0A078I922
- CDD: cd00265
- STRING: 3708.A0A078I922
Sequences
gDNA Sequence
- >Bra020742
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CDS Sequence
- >Bra020742
ATGGGAAGGGGAAGGGTTCAGCTACGGCGGATCGAGAATAAGATACGGAGACAAGTGACGTTTTCAAAGCGAAGAACAGGTTTGGTGAAGAAAGCTCAAGAGATCTCAGTGTTATGTGATGCTGATGTTGCTTTGATTGTCTTTTCTCCAAAAGGCAAGCTCTTTGAGTACTCTGCTGGCTCCAGCATGGAGAGAATTCTGGATCGATATGAGAGGTGTTCATACGCCGGTCAAGACATTCCTACACCCAGTTTGGATTCGCAGGGTGAGTGTTCAACCGAATGTTCGAAGCTCTTGAGGATGATTGATGCTATGCAAATAAGCTTAAGGCACTTAAAAGGAGAAGAGGTAGATGCTCTAAGTATCAGAGAGCTTCAGAGTCTGGAGATGCAACTTGATACTTCCCTCAGGAGAACTCGCTCTAGAAAGAACCAGCTCATGGTAGAGTCCTTAGCACAGCTCCAGAAAAAGGAGAAGGAACTCAAAGAACTGAAGAAACAGCTAACAAAGAAGGTTGATCAAGGTGAAGACATTGAGCCGCAAAACATCAGCCAAGGGTTAGACTCAACACCACCATGTGAGACACCGCACCTGTTGCCAGGACCTATTTCTCCCCACCCTCCCTTGTCTATCGGTGGACCTGAGCTAGTTGCAAAATACCAGTTCTACTGTCGATCACCTTTCACAATAGATGATAAGGCTTATCTCGAAGAAGGAGTTACCGAAGAGCAACATCGACAAGCTATACGAGGTTCGGTTCTGATAATCCACAAACTTTATATACTGGTAGCAAATGTTATAGGAGCCCTAACTGTATTTAATTTCAAATTTTTGCAAGACTTGGTTGGTGGTCATCCAATCGTTTGTAGCAAGCATATGTTGGAGATAATGTTCAATGAACCACAACTCCTAATCGTCTTCCGCGTTGCTCTAGAGATAGAAATGGTTTATTCTTTCCCCGACGAGCAAGGGGTAACTGAAGATCCAGCTGACTTTCCTAGCCTAACCATCGATGACATTATCGATATGGAGCAAGGTTACACCTTATCACCGGTTGAGCCGAGCAACTATGAACCTGGCGATGAAGTGCTGTACGGAGAACCGGTGAGTCTAGAGGAGATGGAAAATGCAGAACGCAATTTCGCCGGAACAATCATTCTTCACCAACCAACCCCTTTGGAAGTCGAACCAGTTAACATATGGAGGGGAAATACGCAAGAAGAGCCATACTGGGATGGTATGATGGAGGAAGAAGACAACTATGAGGTCTACGTAACACAGTCACCACACCCAAGTCAGGGAGTTGAACCTCTGCCACTTGCTCCAAATCGAAGGGTGAATGCTCCACAACCAGCTACAATAATCATGATCGATGATGAAGATGATGGATCATACACCGGCTCTTCTGAGGGGGTTAACGAGAACGATAATATCAGTAACCCCCCTCCACCAGAAGAAATTGGAGTCATTGCCAACGAGCAAACGAAAAGTGCACCAGCTAGTAGGAAAGGTGAATCGTCTGGCGAAGTAGACCAAAACAAAACAGCACCATCGAATGAAGTTGTCGTTGCCTTACCAGCAGCTCCAATTCCCAGTAATGAAGAACTCTGCCTTGATCTCACACTTGGCGTGGGAAAAAACATGAGCACCTCTAGAGGTGTTACCTTGGTTGACGTCGACGACTCTGTCTCTGAAGGTGATGAGGGCAGTGGTGGGTTTGATCCCCTCTTTTAA
Protein Sequence
- >Bra020742
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