Information report for Bra018948
Gene Details
Functional Annotation
- Member of the class III HD-ZIP protein family. Contains homeodomain and leucine zipper domain. Critical for vascular development and negatively regulates vascular cell differentiation.
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT1G52150.1, AT1G52150.2
- Brassica napus: GSBRNA2T00029833001, BnaA06G0020300ZS, GSBRNA2T00088278001, BnaC06G0062700ZS, GSBRNA2T00114236001
- Brassica oleracea: XP_013592012.1, Bo6g027650, XP_013621760.1, Bo3g181130
- Raphanus raphanistrum: RrC974_p5
Sequences
gDNA Sequence
- >Bra018948
TGGCAATGTCTTGCAAAGATGGGAAGATGGGGTGCTTGGACAACGGGAAGTATGTGAGGTACACACCTGAGCAAGTTGAAGCACTTGAGAGGCTTTATCATGACTGTCCTAAACCGAGCTCTATCCGCCGTCAGCAGTTGATTAGAGAGTGTCCTATTCTCTCTAACATTGAGCCTAAACAGATCAAAGTTTGGTTTCAGAACCGAAGGTAATAATGATACTAACACTCCTTAATGCAGTAAATGGAAGTTTCTCTGATCTAATCTTTTATGTACTTCAGATGCAGAGAGAAACAAAGGAAAGAGGCTTCACGGCTTCAAGCTGTGAATAGGAAGCTGACGGCAATGAACAAGCTGTTGATGGAGGAGAATGATAGGTTGCAGAAGCAAGTGTCACAGCTGGTTCATGAAAACAGCTACTTCCGTCAACACACTCCCAATGTGAGAATCCTGTCTTTAAGATTCATATAATGTTTCATATTGATTTTGTTTTATCTTTTGGTTCCAGCCTACCCTTCCAGGTAAAGACACAAGCTGTGAATCGGTTGTGACGAGTGGTCAGCACCAATTAGCATCACAGATTCCTCCAAGAGATGCTAGTCCTGCAGGGTTAGTTCTTTAGTGAGAGAACATGTTACTCTCTTAGTTACATTATATTCTGAATTAAATTTTGTGTTTGCAGACTTTTGTCCATTGCAGAAGAAACTTTAGCAGAGTTTCTTTCAGAGGCAGCTGGAACCGCTGTTGAGTGGGTTCAGATGCCTGGAATGAAGGTATGTTCCTCTAATTGTGAATCATCAATGAGTTCTTCTTCTTCCTCTCTGTAACGGTTTGCCTTTATGTTTTTGTAACAGCCTGGTCCGGATTCCATTGGAATCATTTCTATTTCTCACGGTTGCGCTGGTGTGGCAGCACGCGCCTGTGGCCTAGTGGGTCTCGAGCCTACAAGGGTACGTGTAGAGATAGAACCATTCCTTATGCAATCTTCTACTACTCTACCTTAGATTAATCTGCTTTCTCTTTATTTACAGGTCGCAGAGATCGTCAAGGATCGGCCTTCGTGGTTCCGCGAATGCCGAGCTGTTGATGTTATGAATGTTTGCCCAACCGCCAACGGTGGAACCATTGAGCTGCTCTATATGCAGCTCTATGCACCAACTACGTTAGCTCCACCACGCGACTTCTGGTTGTTGCGTTACACATCTGTTCTAGAAGATGGCAGCCTTGTGGTGTGCGAGAGGTCTCTTAAGAGCACTCAGAACGGTCCTAGCATGCCACTGGTTCAACATTTTGTTAGAGCAGAGATGCTCCCTAGTGGGTACTTGATACGTCCTTGTGATGGTGGTGGCTCCATCATACACATTGTTGATCATATGGATTTGGAGGTAATAACAATCTTCACTCTATACTATTCAATGCATCAGAGAATGTTAAACCTGACTGTTTTGTTAAATAGGCTTGTAGTGTCCCTGAGGTCTTGCGTCCGCTCTACGAGTCACCAAAAGTACTTGCGCAGAAGACAACAATGGCAGTAAGTGAACTTAAAACTATTCCTAACATTGCCTTTTTGATGTTTTTAATCATTGTTTTTTTTTGTTCAAAGGCGCTGCGCCAACTCAAGCAAATAGCACAAGAGGTGTCTCAGACTAACAGTAGCGTCAATGGCTGGGGACGGCGTCCTGCTGCCTTACGAGCTTTGAGTCAAAGGCTAAGCAGGTTTTTGATACACTTCACTTTTTCCTTTTTTATTGATTTAGTAAATTGCTTTGTCTAATACATTTTTTTGTTTGTTTCCTTACAGAGGCTTCAACGAGGCTGTGAATGGTTTCACTGATGAAGGATGGTCAGTGATAGGAGACAGCATGGATGATGTCACAATCACTGTGAACTCTTCTCCAGACAAGCTGATGGGTTTGAACCTTACGTTTTCCAATGGCTTTGCTCCTGTTAGCAATGTGGTCTTATGCGCAAAAGCCTCCATGCTTTTACAGGTTCCTGCACCATTTTTTTTTGTTATAGATCAATTTATGTTTATTTCAACACTTTTTCTTACTCTTTTGTTTTGGATTTTTTTTGCAACTTTAGAATGTTCCTCCGGGGATCCTGCTTCGGTTTCTGAGGGAGCACAGATCAGAATGGGCTGACAACAACATTGATGCATATTTGGCAGCAGCTGTTAAAGTAGGACCTTGTAGTGCCAGAGTTGGAGGATTCGGTGGGCAAGTTATACTTCCACTTGCTCACACTATTGAGCATGAAGAGGTCAGTTCAAGCTTCTTATATACTATTTGATTGTTTGTTCTTTTGAGATTTGGTTTTTAATGATAAAACCTCTAAACTATTTTTGAATCGGAAGATAACCTTCAACTAACATTCTAACGTTGTAAACCCTCAATTTACTAACCGTTAACATTTTGTCATTCTCCGTCTATAATTCCATCTAAGGGGTTAAAAACTTATAGAACAGTTTATAAAATGGTTTAGAAAATCACTAAAAATGAATAAAACATTTATAATCACTTCTACATTATTTTAAATTATTAGAACCAATTTATAATCTTTTAAATTAATTTATAAATCATTATACATTATCTTAGTAATTTTATAAACCGATTTAAAAGGTTTCATAAATATTTTACCAAGCTTTTTTAGAAATGATTAATAAGGCTTTATCAGTGATTTTATAAGCCTTCACAATCCTACTACATCTCTTATAAATTTTTTTATAAATGATTTGTGGTGTTTCTTTGTTATTAGTCCATGGAAGTCATCAAATTGGAAGGTCTTGGCCACTCCCCTGAAGATGCAATCGTCCCAAGAGATATCTTCCTTCTACAAGTAAGTACTTTAGATTGTCTTGTCTGAATGAGTTTTAACGTGGATCACTGATAAATACATTCGTCTTGTGATCAGCTTTGTAGCGGCATGGATGAAAATGCTGTTGGAACATGCGCTGAACTCATATTTGCTCCAATTGATGCTTCCTTTGCTGATGATGCGCCTCTGCTTCCTTCTGGTTTCCGTATCATCCCTCTTGACTCCACAAAGGTTAGAACAAATAATCTTTTTACCACTTAAAAGTTTTCAGACTCTTAAAGCTTTGTCTCGAACCTAAAAGCAGGAAGTATCAAGTCCAAACCGAACCTTGGATCTTGCTTCAGCACTGGAGATTGGTCCAGCTGGAACAACAAAAGCATCAACCGATCAATCAGGAAACTCCGGTACATGTGCAAGATCTGTGATGACAATAGCGTTTGAGTTTGGTATTGAGAGCCATATGCAAGAGCATGTAGCTTCCATGGCTAGGCAGTACGTTCGTGGTATCATCTCATCGGTTCAGAGAGTTGCATTGGCTCTCTCTCCTTCTCACATCAGCTCACAAGTCGGTCTGCGCACTCCTTTGGGTACTCCTGAAGCCCAAACACTTGCTCGTTGGATCTGCCAGAGTTACAGGTGCTACATGGGCGTTGAGCTACTTAAATCAACAAGTGAAGGCAATGAATCTATTCTGAAGAATCTTTGGCATCATACAGATGCTATAATCTGCTGCTCAATGAAGGTACTGACTTAAACGTCAAACACTCAATGAATGTTTTATTATTCACTGATCCTCTTTTAATCTTTTTTTGTTTAGGCCATGCCAGTCTTCACATTTGCAAACCAGGCGGGGCTAGACATGCTTGAGACTACATTGGTTTCTCTTCAAGATATCTCTTTAGAGAAGATATTTGATGACAATGGAAGAAAGACTCTCTGCTCTGAGTTCCCACAGATCATGCAACAGGTTTTTTAACAACGTTCTGGTCTGATTTGTGTATGTAGTTTGATGAGGTTTTATCTGACTTTTTAACTTGAATGTTTTGGTTTAGGGCTTTGCGAGTCTTCAAGGTGGGATATGTCTATCAAGCATGGGGAGACCAGTTTCATACGAGAGAGCAGTTGCTTGGAAAGTACTCAATGAAGAAGAGAACGCTCATTGTATCTGCTTTGTGTTCATCAACTGGTCCTTTGTTTGA
CDS Sequence
- >Bra018948
ATGGCAATGTCTTGCAAAGATGGGAAGATGGGGTGCTTGGACAACGGGAAGTATGTGAGGTACACACCTGAGCAAGTTGAAGCACTTGAGAGGCTTTATCATGACTGTCCTAAACCGAGCTCTATCCGCCGTCAGCAGTTGATTAGAGAGTGTCCTATTCTCTCTAACATTGAGCCTAAACAGATCAAAGTTTGGTTTCAGAACCGAAGATGCAGAGAGAAACAAAGGAAAGAGGCTTCACGGCTTCAAGCTGTGAATAGGAAGCTGACGGCAATGAACAAGCTGTTGATGGAGGAGAATGATAGGTTGCAGAAGCAAGTGTCACAGCTGGTTCATGAAAACAGCTACTTCCGTCAACACACTCCCAATCCTACCCTTCCAGGTAAAGACACAAGCTGTGAATCGGTTGTGACGAGTGGTCAGCACCAATTAGCATCACAGATTCCTCCAAGAGATGCTAGTCCTGCAGGACTTTTGTCCATTGCAGAAGAAACTTTAGCAGAGTTTCTTTCAGAGGCAGCTGGAACCGCTGTTGAGTGGGTTCAGATGCCTGGAATGAAGCCTGGTCCGGATTCCATTGGAATCATTTCTATTTCTCACGGTTGCGCTGGTGTGGCAGCACGCGCCTGTGGCCTAGTGGGTCTCGAGCCTACAAGGGTCGCAGAGATCGTCAAGGATCGGCCTTCGTGGTTCCGCGAATGCCGAGCTGTTGATGTTATGAATGTTTGCCCAACCGCCAACGGTGGAACCATTGAGCTGCTCTATATGCAGCTCTATGCACCAACTACGTTAGCTCCACCACGCGACTTCTGGTTGTTGCGTTACACATCTGTTCTAGAAGATGGCAGCCTTGTGGTGTGCGAGAGGTCTCTTAAGAGCACTCAGAACGGTCCTAGCATGCCACTGGTTCAACATTTTGTTAGAGCAGAGATGCTCCCTAGTGGGTACTTGATACGTCCTTGTGATGGTGGTGGCTCCATCATACACATTGTTGATCATATGGATTTGGAGGCTTGTAGTGTCCCTGAGGTCTTGCGTCCGCTCTACGAGTCACCAAAAGTACTTGCGCAGAAGACAACAATGGCAGCGCTGCGCCAACTCAAGCAAATAGCACAAGAGGTGTCTCAGACTAACAGTAGCGTCAATGGCTGGGGACGGCGTCCTGCTGCCTTACGAGCTTTGAGTCAAAGGCTAAGCAGAGGCTTCAACGAGGCTGTGAATGGTTTCACTGATGAAGGATGGTCAGTGATAGGAGACAGCATGGATGATGTCACAATCACTGTGAACTCTTCTCCAGACAAGCTGATGGGTTTGAACCTTACGTTTTCCAATGGCTTTGCTCCTGTTAGCAATGTGGTCTTATGCGCAAAAGCCTCCATGCTTTTACAGAATGTTCCTCCGGGGATCCTGCTTCGGTTTCTGAGGGAGCACAGATCAGAATGGGCTGACAACAACATTGATGCATATTTGGCAGCAGCTGTTAAAGTAGGACCTTGTAGTGCCAGAGTTGGAGGATTCGGTGGGCAAGTTATACTTCCACTTGCTCACACTATTGAGCATGAAGAGTCCATGGAAGTCATCAAATTGGAAGGTCTTGGCCACTCCCCTGAAGATGCAATCGTCCCAAGAGATATCTTCCTTCTACAACTTTGTAGCGGCATGGATGAAAATGCTGTTGGAACATGCGCTGAACTCATATTTGCTCCAATTGATGCTTCCTTTGCTGATGATGCGCCTCTGCTTCCTTCTGGTTTCCGTATCATCCCTCTTGACTCCACAAAGGAAGTATCAAGTCCAAACCGAACCTTGGATCTTGCTTCAGCACTGGAGATTGGTCCAGCTGGAACAACAAAAGCATCAACCGATCAATCAGGAAACTCCGGTACATGTGCAAGATCTGTGATGACAATAGCGTTTGAGTTTGGTATTGAGAGCCATATGCAAGAGCATGTAGCTTCCATGGCTAGGCAGTACGTTCGTGGTATCATCTCATCGGTTCAGAGAGTTGCATTGGCTCTCTCTCCTTCTCACATCAGCTCACAAGTCGGTCTGCGCACTCCTTTGGGTACTCCTGAAGCCCAAACACTTGCTCGTTGGATCTGCCAGAGTTACAGGTGCTACATGGGCGTTGAGCTACTTAAATCAACAAGTGAAGGCAATGAATCTATTCTGAAGAATCTTTGGCATCATACAGATGCTATAATCTGCTGCTCAATGAAGGCCATGCCAGTCTTCACATTTGCAAACCAGGCGGGGCTAGACATGCTTGAGACTACATTGGTTTCTCTTCAAGATATCTCTTTAGAGAAGATATTTGATGACAATGGAAGAAAGACTCTCTGCTCTGAGTTCCCACAGATCATGCAACAGGGCTTTGCGAGTCTTCAAGGTGGGATATGTCTATCAAGCATGGGGAGACCAGTTTCATACGAGAGAGCAGTTGCTTGGAAAGTACTCAATGAAGAAGAGAACGCTCATTGTATCTGCTTTGTGTTCATCAACTGGTCCTTTGTTTGA
Protein Sequence
- >Bra018948
MAMSCKDGKMGCLDNGKYVRYTPEQVEALERLYHDCPKPSSIRRQQLIRECPILSNIEPKQIKVWFQNRRCREKQRKEASRLQAVNRKLTAMNKLLMEENDRLQKQVSQLVHENSYFRQHTPNPTLPGKDTSCESVVTSGQHQLASQIPPRDASPAGLLSIAEETLAEFLSEAAGTAVEWVQMPGMKPGPDSIGIISISHGCAGVAARACGLVGLEPTRVAEIVKDRPSWFRECRAVDVMNVCPTANGGTIELLYMQLYAPTTLAPPRDFWLLRYTSVLEDGSLVVCERSLKSTQNGPSMPLVQHFVRAEMLPSGYLIRPCDGGGSIIHIVDHMDLEACSVPEVLRPLYESPKVLAQKTTMAALRQLKQIAQEVSQTNSSVNGWGRRPAALRALSQRLSRGFNEAVNGFTDEGWSVIGDSMDDVTITVNSSPDKLMGLNLTFSNGFAPVSNVVLCAKASMLLQNVPPGILLRFLREHRSEWADNNIDAYLAAAVKVGPCSARVGGFGGQVILPLAHTIEHEESMEVIKLEGLGHSPEDAIVPRDIFLLQLCSGMDENAVGTCAELIFAPIDASFADDAPLLPSGFRIIPLDSTKEVSSPNRTLDLASALEIGPAGTTKASTDQSGNSGTCARSVMTIAFEFGIESHMQEHVASMARQYVRGIISSVQRVALALSPSHISSQVGLRTPLGTPEAQTLARWICQSYRCYMGVELLKSTSEGNESILKNLWHHTDAIICCSMKAMPVFTFANQAGLDMLETTLVSLQDISLEKIFDDNGRKTLCSEFPQIMQQGFASLQGGICLSSMGRPVSYERAVAWKVLNEEENAHCICFVFINWSFV