Information report for Bra017587
Gene Details
Functional Annotation
- Part of autonomous pathway complex (AuPC) containing FLD, LD, SDG26nts, EFL2, EFL4 and APRF1.
Homologous
- Brassica napus: BnaC08G0472900ZS, BnaA09G0617500ZS, GSBRNA2T00089266001, BnaA07G0334500ZS
- Brassica oleracea: Bo6g087910, Bo17718s010, Bo8g104850, Bo6g091370
- Gossypium hirsutum: Gohir.A05G140500, Gohir.D05G142700, Gohir.A10G053100
- Prunus avium: Pav_sc0004305.1_g110.1.mk
- Prunus persica: PRUPE_3G042600
- Rosa chinensis: RchiOBHm_Chr2g0094381, RchiOBHm_Chr2g0145141
Gene Resources
- Pfam: PF07011
Sequences
gDNA Sequence
- >Bra017587
TGTCTAAGTTTATTACTGGTGAAAGTAAATTTGAACAGAATCTGATGCGTCTCCAAAATCCGATGTCTAACTGGTGGGAGTCCCTTTCTTGGCTTTGTTTGTTTATATGCCTTTGACATGGTTTCTACTCATGTTATTGCATCTTACAGGAATATAATTTTGATCTTGGTGGGAAAAAAATGGAGCTTTGTGAATGTTCAAGAGCTGCAGAGTTTCCAGAAGAGCTTTGTGAATGTTCAAGACATTTTGGATCAGAACCGGCTGTTGATCAACGAGATCAATCAGAACCATGAGTCCAATCAACCTGAAAACTTGCAATCTAAAGGCAAGTTTATTACACTGAAAACACCATTCTTCTGGTCTGCAAAGATACCAAATCGTAAAACTCCAGTTCGGTCCTGTTTTAGTTTCCTTGTGCCTTTGTACTCTCATATGTAAGTGAATTTTTGTTTTCCTCAATGCAAGACACCCTTGAGACTTTGTCCATATCAGTGATATTCTTCTTCGTCTTCACCTACATTTATCTCTCTAAATCTGTCTCTAAATATATACTACTATAAATCTGTGTCTATATATATACTACTAGTTATTAGTTGTCTTGGGTCTGTGTGTGATAGTGCTGAATCTAAAAAATGTTCAGGTAAGAAGGAAGTTGTGTCTACAGATAAAGCACCACCTACTGTAGGACCATACTCTCAGGCCATCAAAGCCAACGGTTTCGTTTTCGTTTCAGGTGTTCTTGGACTTGTGCCTGAGGTTTGTTTCACGTCTTTTTAGAATAAGTAGTCTTGAGTTTTGGTTTACCTTTTTGATTATATATTCTTCATCTTCTATGTTTGTTCTGGACACTGCTCGAGTACACGCTTTCATCGCTTCCTTTTCCACATAGAAACCAATAGCTACTGGTTAGTTCAATATCATTGATCAATTTGAAGTTTTTTGATTGTGCATTGTGGTAAAGTTTGTTGTAATGAAAGTGTTTTATAATTTTTTTTAAGAACCCATAATTAAGATACTTGCAATAAACCACTTAAATGTTCAAATCTCTTTCTAAGTCTCTTAACTCACTTTTACACTTTAAAAATTATTAAAAATTAATTAAGAGACCCTTTTAGGGGTTTTGGGATAATGATGCTCTTATAGATTTCTCTTTCCTATTTTTCATTATTTATTTTTTTCAACAGACCAAATACCATCAATATATGCCCGTTAGAGCTGTTCTTATAGAGCTCCGATGCTTACTAGCAAACCTTGGCTCGACCCTACACAGATCCTTGTACAAGTAAAGTTAAATAAGGCAGATGAAGAAGACTGGCGCCTACACATGCATGCAAGTCGATCAGTTCGCCGTTTCGCCTATCGGCAAAGGATTGTTCATGGAACTACTATCGAGATTCTTCGGACCATCTTTCCTAGTCTCATCTCGATGTTCAGTCGGGCGGCGGCCGTTAGGTCTCCTATTTTGAGTCCTATTAAGAATGAGAGTGGCTCTATCACTATGGTTGATGTGTTATACTCATGACTGCCATCTAAATTTTCTAATTGCGGTCTTTTGGGACACAAAGCTTCTCGCTGCCTACGTAAGCTTCCTCCAAGACAACAAGATAAGCCCTCCACTAATGCTGACATTGCTTCAGATGATGTCTCACTGTCCAAACCTTTTCCTACTTTGCCTTTTAAGTGAACCAGATTCAAGTTTTAAAGCTTCAGTCACCACTACTGGTGAAAGTGTTATCTCAATAGCAACATCTAAATCTCAAGCTGCAATTATTTCTACTCCAGAGGTAATTGAGTTTATCTCACCGTCTGCAGCAGATAATGCTGTAAATCAGTTTGCAATTGCTACCTCAACAAAATCAGTCAGCACCATGATATCTCCACCAATCAGTCATCATGATACATGTAATGAATCAAATATGTTTGAACCCGTTACTTCTGCTAATGTGGAAGACCTGATTTCTTTAGCTACTGTTACGAACTTGAGAACATGTATGTTTCTCCTACTTTTATTTGTATTAATGAAGTTGTTGTGTCTCCGAGTATGGAGTCCACTCGATCCTTGCCAATCACTGATACTCCGATAGCTCAAGTACCTCCAGCGGTCCAAAGAGAAAGTAGCGGAATAGCTCGACTTGTTTTAGGCTCAAACAAGTTTGCCTTGTTGATATATTTGCAAGAGGAAGAAGAAGACCCAGTGGGTTTTACCTCAGAGACGAACTCGATGGATCTTATGACACCTTCTGGGAAAAGAACCCTTCGAGAAAGACCAGTTAAGCCATCAGAAAAAGCTAGAGAGATGCACTTCCGGTTCACAGGTAGCGGCCGAGGAAACCATGGACAACGTGGACATGGAGGTGGAAATGGCTAA
CDS Sequence
- >Bra017587
ATGTCTAAGTTTATTACTGGTGAAAGTAAATTTGAACAGAATCTGATGCGTCTCCAAAATCCGATGTCTAACTGGAATATAATTTTGATCTTGGTGGGAAAAAAATGGAGCTTTGTGAATGTTCAAGAGCTGCAGAGTTTCCAGAAGAGCTTTGTGAATGTTCAAGACATTTTGGATCAGAACCGGCTGTTGATCAACGAGATCAATCAGAACCATGAGTCCAATCAACCTGAAAACTTGCAATCTAAAGGCAAGTTTATTACACTGAAAACACCATTCTTCTGGTCTGCAAAGATACCAAATCGTAAGAAGGAAGTTGTGTCTACAGATAAAGCACCACCTACTGTAGGACCATACTCTCAGGCCATCAAAGCCAACGGTTTCGTTTTCGTTTCAGGTGTTCTTGGACTTGTGCCTGAGATCCTTGTACAAGTAAAGTTAAATAAGGCAGATGAAGAAGACTGGCGCCTACACATGCATGCAAGTCGATCAGTTCGCCGTTTCGCCTATCGGCAAAGGATTGTTCATGGAACTACTATCGAGATTCTTCGGACCATCTTTCCTAGTCTCATCTCGATGTTCAGTCGGGCGGCGGCCGTTAGGTCTCCTATTTTGAGTCCTATTAAGAATGAGAGTGGCTCTATCACTATGCTTCTCGCTGCCTACGTAAGCTTCCTCCAAGACAACAAGATAAGCCCTCCACTAATGCTGACATTGCTTCAGATGATGTCTCACTGTCCAAACCTTTTCCTACTTTGCCTTTTAAGTGAACCAGATTCAAGTTTTAAAGCTTCAGTCACCACTACTGGTGAAAGTGTTATCTCAATAGCAACATCTAAATCTCAAGCTGCAATTATTTCTACTCCAGAGGTAATTGAGTTTATCTCACCGTCTGCAGCAGATAATGCTGTAAATCAGTTTGCAATTGCTACCTCAACAAAATCAGTCAGCACCATGATATCTCCACCAATCAGTCATCATGATACATTTGTTGTGTCTCCGAGTATGGAGTCCACTCGATCCTTGCCAATCACTGATACTCCGATAGCTCAAGTACCTCCAGCGGTCCAAAGAGAAAGTAGCGGAATAGCTCGACTTGTTTTAGGCTCAAACAAGTTTGCCTTGTTGATATATTTGCAAGAGGAAGAAGAAGACCCAGTGGGTTTTACCTCAGAGACGAACTCGATGGATCTTATGACACCTTCTGGGAAAAGAACCCTTCGAGAAAGACCAGTTAAGCCATCAGAAAAAGCTAGAGAGATGCACTTCCGGTTCACAGGTAGCGGCCGAGGAAACCATGGACAACGTGGACATGGAGGTGGAAATGGCTAA
Protein Sequence
- >Bra017587
MSKFITGESKFEQNLMRLQNPMSNWNIILILVGKKWSFVNVQELQSFQKSFVNVQDILDQNRLLINEINQNHESNQPENLQSKGKFITLKTPFFWSAKIPNRKKEVVSTDKAPPTVGPYSQAIKANGFVFVSGVLGLVPEILVQVKLNKADEEDWRLHMHASRSVRRFAYRQRIVHGTTIEILRTIFPSLISMFSRAAAVRSPILSPIKNESGSITMLLAAYVSFLQDNKISPPLMLTLLQMMSHCPNLFLLCLLSEPDSSFKASVTTTGESVISIATSKSQAAIISTPEVIEFISPSAADNAVNQFAIATSTKSVSTMISPPISHHDTFVVSPSMESTRSLPITDTPIAQVPPAVQRESSGIARLVLGSNKFALLIYLQEEEEDPVGFTSETNSMDLMTPSGKRTLRERPVKPSEKAREMHFRFTGSGRGNHGQRGHGGGNG