Information report for Bra007985
Gene Details
Functional Annotation
- RNA 3′end鈥損rocessing factor of antisense FLC transcript. Mediates silencing of the floral repressor gene FLC.
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT1G71800
Gene Resources
- Pfam: PF14327 PF14304 PF00076
- UniProt: A0A816WWW8
- EMBL: HG994356
- AlphaFoldDB: A0A816WWW8
- OMA: QDHMMQP
- InterPro: IPR000504 , IPR012677 , IPR025742 , IPR035979 , IPR038192
- PANTHER: PTHR45735 , PTHR45735:SF10
- SUPFAM: SSF54928
- PROSITE: PS50102
- Gene3D: 1.10.20.70 , 1.25.40.630 , 3.30.70.330
- CDD: cd12398
Sequences
gDNA Sequence
- >Bra007985
TGGCTTCTTCTTCTTCTTCATCCCAACGACGCTGCGTCTTCGGTACTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCCTTGGATTTCAATCCCTTTCGATTTTTAAAACAATCGATCTTTCATATTCTTCTCAGTTGGGAACATTCCTTACGACGCAACGGAAGAACAACTCCGAGAGATTTGCGGAGAGGTTGGACCCGTTGTCTCCTTCAGGTCAGCCTCCTTCTTCTTCAATTAAGAACTTAAAATCGTGTTTAGAGTTTTGATAAAGGAACCACCTTTTCTTCTTCCTGGTTTCAGATTGGTTACTGATAGAGAAACGGGTAAACCAAAGGGATACGGGTTTTGCGAGTATAAAGACGAAGAGACAGCGTTGAGTGCTCGTCGTAATCTCAAGAGTTATGAAATCAACGGTCGTCAGTTAAGAGTTGATTTTGCTGAGAATGATAAAGGAACCGACAAACCCCGAGATCAGGTTCTACTCCTCTCCTTATGTCTAAATGTCGAAGCTCCCATCTTAGGACAATAAGTTATAACTAAAGGTGGTAACTTTTTGATTAAGGGTCAAGGAGGAACTGGTTTACCTCCTGCTGTTGCTGCTACTGGTATGTTTTTGTCAATGTTCTAAAAATCGGTTTAGTTAAGAACAATTAATTCTTGAATGTTTTTTTTTAAAAAATTTGGTATAGATGCCTAATCAATAATTTCATATAAAACGCCTAATTACCCCATAGCTATTTCTTGAACATTGGTTTTTGTTTTAGTATGTGAAACTTTACTTGACTAGAACTGTCTTTAGAGAAATAAAACTTGTGGCTGTTGTTTGGTGACAGAGTCTCAAAAGCAGGTTGGAGGGGCTGTGGATTCGAGTATGCATCAGCCGGTTGGTATTCACCTTGCTATGCAGGCTGCGTCTGTTATGGCTGGTGCGCTAGGTGGTCCACAGGTGGGTTCGCAAAGTACGCTGCAGGTTCCAGCTAGTGATCCCCTGACTCTTCATCTTGCCAAGATGTCTAGAACTCAGCTCTCTGAAATTATATCGTCCATTAAGGTGTGAATGTCAACATGGGTTGTTTTCTTAGTTATTTGTTGACGTTTTGTTGAACTATTGTGTACTAGTAGTAGTGGTGTGAATGTGATTGTGACTGTGTTTTTTTCTTAATGGTCAGTTAATGGCTACGCAGAATAAGGAAGAAGCTCGACAGTTGTTGGTTTCAAGACCTCACTTGCTAAAAGCTGTCTTTCTGGTACTACTTTCACATCTCCTGATTCTGCAAATCATTTGTCTCTTGTGCAATCTTTCCAATGCTATAATAAGGTAGTGTTGGTGATATATCATGGAAGTTAGGAGGGAACAATCAGTTTAGTTTCGCCATTTACTGACCTTAGTATTCCCTTAACTAGATGAGTCAATCTCCCAGGGTGTATTACATTATGTTTTGTACACCATCTTTTGAACCTATACCTTCTCTGCTATTGTAGGCACAAATAATGCTTGGAATTGTGAGTCCACAAGTCGTAAGTTTCCATCTCTCTGAATAGTTTTGTGCGTCTTCCTTTTCTATCTATCTGCTATTTCTTAAGAGGGCTGTTTCCATTCTTGAACTGTGCAGTTACAGACGCCAAATATTGTTCAGGCCCCAAACCATATGACAGGATCTTCAATTCATGACACACATCTCTCTGGATCTAGTCAAAGCCTTTTACCACCACTTGCACAAAGACCGCAACAGCTAAACCGCCCTCCCCATAGTCAGTTTCCCGTTCAACAGTCTTCTAAACAACCTCTCAGTCAGATTCCACAACCAGGCGTGAATCCTCCTCCTAGATCCCAAGTTAAAGGTCTCAGCGAAACCGCTGCTCCATTCCAACGCCAAAAACAAGTGCTTCCAGCTTCTAATGCTATCCAACCATCTCAAGTACCTCGGCCACCATTAACAAGCTCTGTGATGCAGGTGAGTTTTCAGTGGGCTATATGATCCTATTCATTACTTTCTTACTTTTATTTGTGTGTTTAGATTCTGTGTGGAGATTACTTAACATCTGTGTATATATATATATATATACTTTACAGCAAGGTGGGCAAATGGCATCACTAAACTATGGCAAAAGAATAAACAATGAGGGACCTCATGAATCAATAGATAGACCATCGAAGATGATGAGAGTGGACGATCGGAGAACCACTCCATTTCATACAGGCCATGCGTCTAACACAATGCTTCCAAATCCACTACAGCTACAAGAGAAAGCGCCTCAGGTACCACCAGCTCACATAATTTGGAAGCTTAATTAGATGAAAGAATTGTTTGATTGATTGTTTTTTTTTTGGTCTAGGCACTTCTGTCCCCGGATGTTCAGTCAACATTGCTCCAGCAAGTGATGAACCTTACGCCGGATCAGCTGAGGATGCTGACCCCAGAACAACAGCAAGAGGTGCTGAAGCTGCAGCAAGCTCTCAAGCAACAGGACCACGTGATGCAGCCTTCATAG
CDS Sequence
- >Bra007985
ATGGCTTCTTCTTCTTCTTCATCCCAACGACGCTGCGTCTTCGTTGGGAACATTCCTTACGACGCAACGGAAGAACAACTCCGAGAGATTTGCGGAGAGGTTGGACCCGTTGTCTCCTTCAGATTGGTTACTGATAGAGAAACGGGTAAACCAAAGGGATACGGGTTTTGCGAGTATAAAGACGAAGAGACAGCGTTGAGTGCTCGTCGTAATCTCAAGAGTTATGAAATCAACGGTCGTCAGTTAAGAGTTGATTTTGCTGAGAATGATAAAGGAACCGACAAACCCCGAGATCAGGGTCAAGGAGGAACTGGTTTACCTCCTGCTGTTGCTGCTACTGAGTCTCAAAAGCAGGTTGGAGGGGCTGTGGATTCGAGTATGCATCAGCCGGTTGGTATTCACCTTGCTATGCAGGCTGCGTCTGTTATGGCTGGTGCGCTAGGTGGTCCACAGGTGGGTTCGCAAAGTACGCTGCAGGTTCCAGCTAGTGATCCCCTGACTCTTCATCTTGCCAAGATGTCTAGAACTCAGCTCTCTGAAATTATATCGTCCATTAAGTTAATGGCTACGCAGAATAAGGAAGAAGCTCGACAGTTGTTGGTTTCAAGACCTCACTTGCTAAAAGCTGTCTTTCTGGCACAAATAATGCTTGGAATTGTGAGTCCACAAGTCTTACAGACGCCAAATATTGTTCAGGCCCCAAACCATATGACAGGATCTTCAATTCATGACACACATCTCTCTGGATCTAGTCAAAGCCTTTTACCACCACTTGCACAAAGACCGCAACAGCTAAACCGCCCTCCCCATAGTCAGTTTCCCGTTCAACAGTCTTCTAAACAACCTCTCAGTCAGATTCCACAACCAGGCGTGAATCCTCCTCCTAGATCCCAAGTTAAAGGTCTCAGCGAAACCGCTGCTCCATTCCAACGCCAAAAACAAGTGCTTCCAGCTTCTAATGCTATCCAACCATCTCAAGTACCTCGGCCACCATTAACAAGCTCTGTGATGCAGCAAGGTGGGCAAATGGCATCACTAAACTATGGCAAAAGAATAAACAATGAGGGACCTCATGAATCAATAGATAGACCATCGAAGATGATGAGAGTGGACGATCGGAGAACCACTCCATTTCATACAGGCCATGCGTCTAACACAATGCTTCCAAATCCACTACAGCTACAAGAGAAAGCGCCTCAGGCACTTCTGTCCCCGGATGTTCAGTCAACATTGCTCCAGCAAGTGATGAACCTTACGCCGGATCAGCTGAGGATGCTGACCCCAGAACAACAGCAAGAGGTGCTGAAGCTGCAGCAAGCTCTCAAGCAACAGGACCACGTGATGCAGCCTTCATAG
Protein Sequence
- >Bra007985
MASSSSSSQRRCVFVGNIPYDATEEQLREICGEVGPVVSFRLVTDRETGKPKGYGFCEYKDEETALSARRNLKSYEINGRQLRVDFAENDKGTDKPRDQGQGGTGLPPAVAATESQKQVGGAVDSSMHQPVGIHLAMQAASVMAGALGGPQVGSQSTLQVPASDPLTLHLAKMSRTQLSEIISSIKLMATQNKEEARQLLVSRPHLLKAVFLAQIMLGIVSPQVLQTPNIVQAPNHMTGSSIHDTHLSGSSQSLLPPLAQRPQQLNRPPHSQFPVQQSSKQPLSQIPQPGVNPPPRSQVKGLSETAAPFQRQKQVLPASNAIQPSQVPRPPLTSSVMQQGGQMASLNYGKRINNEGPHESIDRPSKMMRVDDRRTTPFHTGHASNTMLPNPLQLQEKAPQALLSPDVQSTLLQQVMNLTPDQLRMLTPEQQQEVLKLQQALKQQDHVMQPS