Information report for Bra003578
Gene Details
Functional Annotation
- Mutant has early-flowering phenotype, encodes a putative nucleoporin. Required for the activation of downstream defense pathways by the snc1 mutation. Involved in basal resistance against bacterial pathogens.
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT1G80680
Sequences
gDNA Sequence
- >Bra003578
TGCCTAAGGTGAGCACAGATATACTGCCAATTCAAACAGTAGCTAAATTTTCAACAGTGCTTCAGCCTCATCATTCTCCTTCCCAATCCGGAGGTTCAGAAACTTCCTCAGAACCTCAGGGAGCTACTTCTCCTCAGGATAGCTCCATTGCTTTCGAACACTTGTTTCCTAGTGCCAAGTCAACTTCAGCCTCTACACTAGCAGGTTCACCATCTGCTCACACTACTCCAGCCCAAGTTATGGACAATGTTCCATCTGCTATTATCAGTAATGAGGGTGCTACACCCTCAGGAAATGATCCAACAATCATGACCCCTCACTCAACCAAGTTTATCCAAGAGCATGGTAATATGGAAAGTGATTTCCATATTAATGAGCAAATGGATGAATATGGAAGTGTGTCAAGAGGGGGTAGGCTGCTCAAGCGTACACAAAGGTACCAAGAGATGGAATGGCATACCGTTCGTGGACGAGGAAACCGAGGTCGTAAGGGTCGAGGTTCCTAATCAAGCGCACAAGAAACCTTTTAAGTTTGGTTAAACTAAAGAGTTGTTCTAACTCATTGGGTTTCTATAGCTCTTTCAATGCTTACTTTATGTACTAAACTTTTTCAAACTATGTGACTTAACAAATCACATCTTGTACTTTGTTTTTTAATTGAAAGCCTTTTTACAAAAAAAAAAGAGTTCTTCTTAAGCCATGAAGGAAGCAAAGAATCATCAACTAAACCTGATTGTCCCAGGAAGTGGCGACGAGTACATCAGCTCTTGGACTAAAACTCAAGCTCGAGATAGAATCCGATGGAGATGGAGTAACCTGCACGAAAATCGAAACCAGTACGTGAAGATACGAATCTTGTAAACCTAAAGCTTAATATCGCAACGCAGTAACAGAACAACACACTAAATACTAAGCGAATCAAACAGAGTAATCAACCGCCATAGAAGAAATCACCTCAAAGGATTTGTTAGGGTTAGTGTTCGCCGTCGCACCAAAGGTAACCATTATCGCGAGCCGAGGTCGTTACGGAATCACTGTAGAAAAAAAGGTTCGATTTAGGAGATAAGAGTAATGCTCGTCAACGAACGAGGTTTATGAGAGAGAAGAATCGAAAGAGAGATACCTAGAGAGAGAGAGGAAGAGGAAGGTCCGTCGTCGGAGATGAGTCTTTGCCGTTAAAGCAGATGAAGAGGAGGGAAAACGAATTGAGTCGAGAAGCTATATATAAAGGGGTCCCACCCCTGCGTCTTGTTTACGTCCCCGCGAAACGTTTATCTGACGCTACTCACACAAAAATGAAAAATGGGCCTAAACGTTGGGCTTTTTGGCCCATTTATTAACAATTACATGTATATGTTTTTAGTCGGGTCGGATCAGAAAACGGATCCTAACCAAACTTGCCAGATCTATTGAGCGCTTTACCTCCTTTTCCATCAGCGACTTAGAGTGTATAGTAGAAGACGAAGAAGCAAGAGGGTTTTAGATCGTCGTCGCCGCCGTCCGTGAGCAACGGATTCGTTGTAGCGATCTGGAAAAAGGCACAGGAAAAACCCTAGGCTGATGGCGTCTCTTTCTATTCTTCCAGCTCCAGGTAACTCTTTTGAATCTGTTTTCCAGTGGAGCTTGTGTATGGTATTGATGTTTAAGCGTAGAATCATGCTTGCGAGCTTCAATCTATCACTGTATCGACTCCGTCTGTTGATTCATTAAGTTTCAAAGGATTCGTTTGCGTTGCTGATCTTGAATTTGAACTTTGTTGACAGAGATTTCAACGATGGCTACAAGTTTGGACTCACGAAAGAAAAGAAGGATCTCTTTAGATGAAGATTCTATGGTATCTGAACATTACGAAGGCATCAGAGATTCGTTCCCTTCGTTGAGTTCACTCGACTACTTCTTGAAGCCGTCCATGAACGAGCTGGTGGAGCGAGAAATTGAAAGCCCTGGTTATTGCAGCCGTGTTCCTGATTTCACTATTGGGAGGATTGGTTACGGTTTTATAAAGTTTCTTGGAAGTACAGATGTTAGAAAGTTAGATCTGGATCAGATTGTTAAGTTTCGAAGGCACGAGGTGGTTGTTTACGATGATGAGAGCTCCAAGCCTGCTGTTGGCGAGGGGCTTAACAAGGCTGCTGAGGTCACTCTGTTCGTGGACATAGCTTGTGGGAAAGAGCGGGCTGGCCATGTTTCTTCTAAGTTACAACAGAGTGCTGAAAGACAAGGGGCAACATTCATCTCATTTGATCCTGAGGATGGTTTATGGAAGTTTCTGGTTCCTCATTTCAGCAGATTTGGGTTGAGTGATGATGAGGCAGAAGATATGGCTACGGATGATAATACCCCAGGTTTGGAGAGTCGTGTAGGATTGAATGGGGATATGGTGGTTGCTGACATTGATAAAATGGAAACTTCTGAGCCAGAGCTTTCTCATTCTCTTCCGGCCCATCTGGGACTTGATCCAGGAAAGATGAGAGAAATGAGGATGCTTATGTTTCCTAATGAAGATCTTGACGAAAGTGAGGATCTTAGAGATCAAACTTCCTTTCACATGACATCCTTGAGTAAACAAAACGCAAGACCTTCACAGAGAAGTTCTCAAAGAAGTAGTCATCAAGATACTCCACCGGTTGTGAGGAAAACACCGCTTGCTTTGCTGGAGTATAACCCTGGTAATGATAAAAGCTCTCCAGGCAGTATCCTGATGGTCCAACAAAACAAGAACTTGGCAGTGAGGAAGTCGAAAATGGGAGGTTTCGAGCTTGACATCAGCCATGAGACGCCAGTAACTGATAATTATTCCCGTAATGTTGTAGATGCAGCGTTGTTCATGGGAAGGTCGTTCCGTGCAGGTTGGGGCCCAAATGGCGTCATTCTTCACACTGGCAAGCCAATAGGCAGTTCTAGTTCCCAGAGAGTATTGTCTTCTGTGATCAGTGTAGAAAAGGTAGCAGTTGACAAAGTCGTTCGAGATAAAAAGGAAAAAGTTCAGAAAGAACTTATTGACTCTGCCTTTGAGACTCCCTTAAGCCTCCACAGGGAATTATATCATGAAGAAGATGAAGTCAGGTTTGGCTCTTTTAGTCTTAAGCTTCAGAGAGTTGTCACTGATCGTGTGGTTCTTTCAGATATCTGCCGAAACTATATTGATATAATCGAGAAACAGCTGGAGGTTCCTGGGTTGTCCACCTCAGCGAAGCTGTTTTCGACTCACCAAGTCATGGTGTGGGAACTCATAAAAGTTCTCTTTTCTGAGAGACAGAGTACTGAACGTTTGAGTTATGCAGCTTCGGATAATGAGGAAGACATGATGCAGGATGTGAAAGAAGAGTCTGCAGAAGTTGATACAGAAGCTCTTCCACTTATCCGAAGAGCAGAATTCAGTTGCTGGCTCCAAGAGTGTGTCAGTCACCGTGTACAAGAAGATGTGAATGATTTAAATGGTTCTGGCTACCTTGAGCACTTGTTCTTTCTTCTTACTGGACGAGAGCTTGATTCAGCTGTGGAACTTGCCGTATCTAAGGGAGACGTTAGACTCGCTTGTTTGTTGAGCCAGGCTGGTGGTTCAACTGTAAACCGCAATGATATCATGCAGCAGCTTCACCTTTGGGGAAGGAACGGGCTGGATTTTAACTACATTGAGAAGGATAGAGTAAAGCTGTACGAATTGCTTGCTGGTAATATCCACAATGCGTTACAAGATTTTGCAATTGACTGGAAGAGATTCCTAGGGCTGTTAATGTGGCATCATCTGTCTCCGGACAGTTCATTGCCTGTCATCTTCAGAAATTATCAACTCCTATTAGATCAGGAGAAAGCTCCCTGGCCCGTCCCAATATATATTGACGAAGGAACTGCAGATGGCGTTGTAAGCAACACCAACCATTCTGACATCTTGTATTATCTTATGCTTCTACACAGCAGAGAAGAGGAAGAAATTGGTTTTCTGAAGACCATGTTCAGTGCCTTCTCTTCAACTGACGATCCTCTTGACTATCATATGATCTGGCACTACCGGGGAATCTTAGAAGCAGTGGGAGCTTTCACTTCAGATGACCTTCACGCTATCGATATGGGATTTGTTGCACAGCTTCTCTCTCAGGGCCTTTGCCATTGGGCTATCTACGTTGTTCTTCACATACCCTACCGCAAAGATCAACCATATCTACACGTCATTGTCATTCGAGAAATCCTGTTTCAATACTGTGAAACTTGGAGTTCTATGGAATCACAGCGGCAATTTATCAAGGACTTGGGTATCCCTTCCGAATGGATGCACGAAGCTCTGGTAAGGACACTATAGAAAGCCTTTTTCTATCTAATACCGATGTGCTAATTGCTATTTTATTTTCTTTTATCGCAGGCAGTTTATTACAATTACAACGGAGATTTCTTAAAGGCTCTTGACCACTTCATCGAATGCGCAAACTGGCAAAAAGCTCATTCCATTTTTATGACATCAGTTGCTCATTCATTGTTTTTGTCAGGTAAGCTCTTTCATTTCCTTATATGCAGACTCTTTTGCTCAACTGAAACACGATTCAAGTGTAGTGTAGGAAGGATCTGTTTGGAGTGATATGTTTAATCTTTGATAAATGCAGCTAACCATTCAGAAATATGGAGAATTGCCACGTCAATGGACGATCGCAAGTCTGAGATTGAAAACTGGGACTTGGGTGCTGGGATTTACATGTCTTTCTATTTACTAAAGAGTTCTTTGGAAGAAGATGCTGATACAATGCTAGAACTGGTACGTTTACTTCGTTAGAATCTTAAATTTGAGATTAAACTCCTGAAGCTCTCAAATTGCTTAAACTTCAATTTGACGGGTGTTGATCAAGCTGGCTGTACAATATATAGGTTATTGTACTGATACTCACCGAAATTGCTTCAAACTCCCTATGATCATGGCCATAATGATCTCTTTCTCGAATTGTAAATTATATGCATAACACGAGCAACACAACTTTTGCTTCGACAGGATTCCCCTGAGAGCAGAAACG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CDS Sequence
- >Bra003578
ATGCCTAAGGTGAGCACAGATATACTGCCAATTCAAACAGTAGCTAAATTTTCAACAGTGCTTCAGCCTCATCATTCTCCTTCCCAATCCGGAGGTTCAGAAACTTCCTCAGAACCTCAGGGAGCTACTTCTCCTCAGGATAGCTCCATTGCTTTCGAACACTTGTTTCCTAGTGCCAAGTCAACTTCAGCCTCTACACTAGCAGGTTCACCATCTGCTCACACTACTCCAGCCCAAGTTATGGACAATGTTCCATCTGCTATTATCAGTAATGAGGGTGCTACACCCTCAGGAAATGATCCAACAATCATGACCCCTCACTCAACCAAGTTTATCCAAGAGCATGGTAATATGGAAAGTGATTTCCATATTAATGAGCAAATGGATGAATATGGAAGTGTGTCAAGAGGGGGTAGGCTGCTCAAGCGTACACAAAGGTACCAAGAGATGGAATGGCATACCGTTCGTGGACGAGGAAACCGAGGTCAGATTTCAACGATGGCTACAAGTTTGGACTCACGAAAGAAAAGAAGGATCTCTTTAGATGAAGATTCTATGGTATCTGAACATTACGAAGGCATCAGAGATTCGTTCCCTTCGTTGAGTTCACTCGACTACTTCTTGAAGCCGTCCATGAACGAGCTGGTGGAGCGAGAAATTGAAAGCCCTGGTTATTGCAGCCGTGTTCCTGATTTCACTATTGGGAGGATTGGTTACGGTTTTATAAAGTTTCTTGGAAGTACAGATGTTAGAAAGTTAGATCTGGATCAGATTGTTAAGTTTCGAAGGCACGAGGTGGTTGTTTACGATGATGAGAGCTCCAAGCCTGCTGTTGGCGAGGGGCTTAACAAGGCTGCTGAGGTCACTCTGTTCGTGGACATAGCTTGTGGGAAAGAGCGGGCTGGCCATGTTTCTTCTAAGTTACAACAGAGTGCTGAAAGACAAGGGGCAACATTCATCTCATTTGATCCTGAGGATGGTTTATGGAAGTTTCTGGTTCCTCATTTCAGCAGATTTGGGTTGAGTGATGATGAGGCAGAAGATATGGCTACGGATGATAATACCCCAGGTTTGGAGAGTCGTGTAGGATTGAATGGGGATATGGTGGTTGCTGACATTGATAAAATGGAAACTTCTGAGCCAGAGCTTTCTCATTCTCTTCCGGCCCATCTGGGACTTGATCCAGGAAAGATGAGAGAAATGAGGATGCTTATGTTTCCTAATGAAGATCTTGACGAAAGTGAGGATCTTAGAGATCAAACTTCCTTTCACATGACATCCTTGAGTAAACAAAACGCAAGACCTTCACAGAGAAGTTCTCAAAGAAGTAGTCATCAAGATACTCCACCGGTTGTGAGGAAAACACCGCTTGCTTTGCTGGAGTATAACCCTGGTAATGATAAAAGCTCTCCAGGCAGTATCCTGATGGTCCAACAAAACAAGAACTTGGCAGTGAGGAAGTCGAAAATGGGAGGTTTCGAGCTTGACATCAGCCATGAGACGCCAGTAACTGATAATTATTCCCGTAATGTTGTAGATGCAGCGTTGTTCATGGGAAGGTCGTTCCGTGCAGGTTGGGGCCCAAATGGCGTCATTCTTCACACTGGCAAGCCAATAGGCAGTTCTAGTTCCCAGAGAGTATTGTCTTCTGTGATCAGTGTAGAAAAGGTAGCAGTTGACAAAGTCGTTCGAGATAAAAAGGAAAAAGTTCAGAAAGAACTTATTGACTCTGCCTTTGAGACTCCCTTAAGCCTCCACAGGGAATTATATCATGAAGAAGATGAAGTCAGGTTTGGCTCTTTTAGTCTTAAGCTTCAGAGAGTTGTCACTGATCGTGTGGTTCTTTCAGATATCTGCCGAAACTATATTGATATAATCGAGAAACAGCTGGAGGTTCCTGGGTTGTCCACCTCAGCGAAGCTGTTTTCGACTCACCAAGTCATGGTGTGGGAACTCATAAAAGTTCTCTTTTCTGAGAGACAGAGTACTGAACGTTTGAGTTATGCAGCTTCGGATAATGAGGAAGACATGATGCAGGATGTGAAAGAAGAGTCTGCAGAAGTTGATACAGAAGCTCTTCCACTTATCCGAAGAGCAGAATTCAGTTGCTGGCTCCAAGAGTGTGTCAGTCACCGTGTACAAGAAGATGTGAATGATTTAAATGGTTCTGGCTACCTTGAGCACTTGTTCTTTCTTCTTACTGGACGAGAGCTTGATTCAGCTGTGGAACTTGCCGTATCTAAGGGAGACGTTAGACTCGCTTGTTTGTTGAGCCAGGCTGGTGGTTCAACTGTAAACCGCAATGATATCATGCAGCAGCTTCACCTTTGGGGAAGGAACGGGCTGGATTTTAACTACATTGAGAAGGATAGAGTAAAGCTGTACGAATTGCTTGCTGGTAATATCCACAATGCGTTACAAGATTTTGCAATTGACTGGAAGAGATTCCTAGGGCTGTTAATGTGGCATCATCTGTCTCCGGACAGTTCATTGCCTGTCATCTTCAGAAATTATCAACTCCTATTAGATCAGGAGAAAGCTCCCTGGCCCGTCCCAATATATATTGACGAAGGAACTGCAGATGGCGTTGTAAGCAACACCAACCATTCTGACATCTTGTATTATCTTATGCTTCTACACAGCAGAGAAGAGGAAGAAATTGGTTTTCTGAAGACCATGTTCAGTGCCTTCTCTTCAACTGACGATCCTCTTGACTATCATATGATCTGGCACTACCGGGGAATCTTAGAAGCAGTGGGAGCTTTCACTTCAGATGACCTTCACGCTATCGATATGGGATTTGTTGCACAGCTTCTCTCTCAGGGCCTTTGCCATTGGGCTATCTACGTTGTTCTTCACATACCCTACCGCAAAGATCAACCATATCTACACGTCATTGTCATTCGAGAAATCCTGTTTCAATACTGTGAAACTTGGAGTTCTATGGAATCACAGCGGCAATTTATCAAGGACTTGGGTATCCCTTCCGAATGGATGCACGAAGCTCTGGCAGTTTATTACAATTACAACGGAGATTTCTTAAAGGCTCTTGACCACTTCATCGAATGCGCAAACTGGCAAAAAGCTCATTCCATTTTTATGACATCAGTTGCTCATTCATTGTTTTTGTCAGCTAACCATTCAGAAATATGGAGAATTGCCACGTCAATGGACGATCGCAAGTCTGAGATTGAAAACTGGGACTTGGGTGCTGGGATTTACATGTCTTTCTATTTACTAAAGAGTTCTTTGGAAGAAGATGCTGATACAATGCTAGAACTGGATTCCCCTGAGAGCAGAAACGAGTCGTGCAGAAGTTTTGTCGGTCGTTTAAACGAGTCATTGGCTGTTTGGGGTGATAGATTACCAGTTGAGAGCAGAGTCGCATACTCGAAGATGGCAGAGGAAATCTGCGAGTTGCTTCTGTCAGGTCTGAGTGTGTATCCTGATAGAGACTCTCAGCTAAGCTGTTTTGTGACAGCCTTCAAAGCTCCTTTACCAGAAGATGTAAGATCATCACATCTGCAAGATGCTGTCTCTCTCTTCTCTCTATATCTCTCAGAGACAGGACAAGCACCAGCTTAG
Protein Sequence
- >Bra003578
MPKVSTDILPIQTVAKFSTVLQPHHSPSQSGGSETSSEPQGATSPQDSSIAFEHLFPSAKSTSASTLAGSPSAHTTPAQVMDNVPSAIISNEGATPSGNDPTIMTPHSTKFIQEHGNMESDFHINEQMDEYGSVSRGGRLLKRTQRYQEMEWHTVRGRGNRGQISTMATSLDSRKKRRISLDEDSMVSEHYEGIRDSFPSLSSLDYFLKPSMNELVEREIESPGYCSRVPDFTIGRIGYGFIKFLGSTDVRKLDLDQIVKFRRHEVVVYDDESSKPAVGEGLNKAAEVTLFVDIACGKERAGHVSSKLQQSAERQGATFISFDPEDGLWKFLVPHFSRFGLSDDEAEDMATDDNTPGLESRVGLNGDMVVADIDKMETSEPELSHSLPAHLGLDPGKMREMRMLMFPNEDLDESEDLRDQTSFHMTSLSKQNARPSQRSSQRSSHQDTPPVVRKTPLALLEYNPGNDKSSPGSILMVQQNKNLAVRKSKMGGFELDISHETPVTDNYSRNVVDAALFMGRSFRAGWGPNGVILHTGKPIGSSSSQRVLSSVISVEKVAVDKVVRDKKEKVQKELIDSAFETPLSLHRELYHEEDEVRFGSFSLKLQRVVTDRVVLSDICRNYIDIIEKQLEVPGLSTSAKLFSTHQVMVWELIKVLFSERQSTERLSYAASDNEEDMMQDVKEESAEVDTEALPLIRRAEFSCWLQECVSHRVQEDVNDLNGSGYLEHLFFLLTGRELDSAVELAVSKGDVRLACLLSQAGGSTVNRNDIMQQLHLWGRNGLDFNYIEKDRVKLYELLAGNIHNALQDFAIDWKRFLGLLMWHHLSPDSSLPVIFRNYQLLLDQEKAPWPVPIYIDEGTADGVVSNTNHSDILYYLMLLHSREEEEIGFLKTMFSAFSSTDDPLDYHMIWHYRGILEAVGAFTSDDLHAIDMGFVAQLLSQGLCHWAIYVVLHIPYRKDQPYLHVIVIREILFQYCETWSSMESQRQFIKDLGIPSEWMHEALAVYYNYNGDFLKALDHFIECANWQKAHSIFMTSVAHSLFLSANHSEIWRIATSMDDRKSEIENWDLGAGIYMSFYLLKSSLEEDADTMLELDSPESRNESCRSFVGRLNESLAVWGDRLPVESRVAYSKMAEEICELLLSGLSVYPDRDSQLSCFVTAFKAPLPEDVRSSHLQDAVSLFSLYLSETGQAPA