Information report for Bo9g077670
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a homeodomain protein that is expressed in the LI layer of the vegetative, floral and inflorescence meristems. Binds to the L1 box promoter element which is required in some proteins for L1 specific expression.
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT4G04890.1
- Brassica napus: BnaC09G0276000ZS, BnaA09G0234900ZS, GSBRNA2T00157869001, GSBRNA2T00094475001, BnaA03G0263700ZS, BnaC03G0315100ZS
- Brassica rapa: XP_009114537.1, XP_009114536.1, Bra029527
- Raphanus raphanistrum: RrC4900_p1
Gene Resources
- Pfam: PF00046 PF01852
- UniProt: A0A0D3E855
- RefSeq: XP_013611160.1 , XP_013611161.1 , XP_013611162.1 , XP_013611163.1
- AlphaFoldDB: A0A0D3E855
- KEGG: boe:106317899
- OMA: QCPHPDD
- InterPro: IPR001356 , IPR002913 , IPR009057 , IPR017970 , IPR023393 , IPR042160
- PANTHER: PTHR45654 , PTHR45654:SF101
- SUPFAM: SSF46689 , SSF55961
- PROSITE: PS00027 , PS50071 , PS50848
- Gene3D: 1.10.10.60 , 3.30.530.20
- OrthoDB: A0A0D3E855
- CDD: cd00086 , cd08875
- eggNOG: ENOG502QU3P
- STRING: 109376.A0A0D3E855
- HOGENOM: CLU_015002_2_1_1
Sequences
gDNA Sequence
- >Bo9g077670
TGTATCATCCAAGCATGTTTGAGAGTCACCACATGTTCGACATGACCACAAAGAGTACCTCCGATAACGACTTGGGAATCACCGGCAGCCGAGAAGATGAGTTCGAGACCAAGTCAGGCACCGAGGTCACCACCGAGAATCCTTCTGGTGAAGAGCTTCAAGATCCTAACCAACGTCCCAACAAAAAGAAGCGTTACCATCGCCACACGCAGCGCCAAATCCAAGAGCTAGAATCGTAACAAACAACACTTAAGCTCTAGCTCACATAACAATAGATACGACACATTTTAAAAAAGTTTCATATTTATATTAAAATTTATATTGGCTTTACAGGTTCTTTAAAGAATGTCCTCATCCAGATGATAAGCAACGTAAAGAGTTGAGCCGCGATCTCTGCTTAGAGCCTCTTCAAGTAAAGTTTTGGTTCCAAAACAAACGCACACAAATGAAGGTATATATTTATGTAACAAATAACATCCTCTTCATTAAATTCTTATTAAATTAAAAATCAATTCTTATATAGTAAAATAATTAATATCATAATTATAATAGATTGAAATAAATTATATTAATCTCATTTCGTGTGTGTGTGTGTGTGCTATATCTATAGGCACAACATGAGAGGCATGAGAACCAGATTCTTAAGTCAGACAATGACAAGCTCAGAGCAGAGAACAACAGATACAAGGAGGCTCTAAGCAACGCTACATGCCCTAACTGTGGCGGTCCAGCTGCTATCGGAGAAATGTCCTTCGATGAACAGCATCTCAGGATCGAAAATGTTCGCCTCCGCGAAGAGGTAATATAATCTATACACATAATCTTATCATATATGTGACTTAAGTTGAATTAGACCAACCTGATTCTATCAACACTTGAACCTACAGATTGATAGGATCTCTGCCATTGCTGCAAAGTACGTTGGGAAGCCAGTAGGATCTTCATTCGCTCCACTAGAGATCCACGCGCCTTCTCGTTCTCTGGAACTTGAAGTTGGGAACTTCGGGAACCAGACGACAGGTTTTGTAGGGGACATGTATGGAACAGGTGACATTCTGAGGTCGGTTTCAATCCCTTCTGATACAGACAAGCCTATGATCGTCGAGCTAGCGGTTGCAGCTATGGAAGAACTCGTGAGAATGGCTCAAGCTGGGGATCCATTATGGGTTTCGACCGGTAACTCGATGGACCTTCCGAACGAAGAAGAGGATTTCAGAACGTTTCCAAGAGGAATCGGACCAAAGCCATTAGGGTTGAGAACAGAAGCGTCAAGAGAATCAGCTGTTGTTATAATGAATCACATCAACCTCGTTGAGATTCTCATGGATGTGGTAATTAAACTAAATTGTTTCTTGATCTCCAAGTTTTATCGACTAACTTTTAAACCCTAGCAAACTAATATTTTGCTTTTGTCTTGTTTTTTCTGACATGTGAATAAAGAATCAATGGTCTTGTGTGTTCTCTGGGATCGTGTCAAGAGCCTTGACACTTGAAGTTCTGTCGACTGGAGTTGCTGGGAACTACAATGGTGCATTGCAAGTGGTATGTAAACCTAGTTGATTAATTGCTTCTCAAGAAACTAAACCGAACATTGTAGTAATCGGTTTTTAAACCTTTTTTTGTTGTTTGGTTTGTGTTGCAAAGATGACAGCTGAGTTTCAAGTTCCGTCGCCGCTAGTCCCGACACGTGAGAACTACTTTGTGAGATACTGTAAACAGCATAGCGACGGTTCTTGGGCTGTGGTTGATGTCTCTTTGGACAGCCTTAGGCCGAACCTAATCTCAAGAACAAGAAGAAGGCCTTCAGGTTGTCTGATTCAAGAGCTGCCTAATGGTTATTCTAAGGTAATTCAGAAGATATAATGGGCTAATTTGACTGTTTCTGAAGTTTAAGGTGAAGATTTTAATATTTATATTTTGTGTGTGTTTTAAAGGTCACATGGATAGAGCATATGGAGGTGGATGATAGATCGGTTCACACAATGTATAAACCGTTGGTTCATTCCGGTTTAGCTTTCGGAGCCAAACGTTGGGTGTCTACACTCGAACGCCAGTGCGAGCGGCTCGCGAGTTCGATGGCCAGCAACATTCCGGCGAGTGATCTTTCGGGTACGCGTTTCTTTTGATAATATTGAAAATGTTGGGGCTGAATTGAAATTTCTTTTAAGCTTACTCATTAGGTCCTTCAACTTTGTGGTAATTATGCAGTTATTACGAGTCCAGAAGGGAGGAAGAGCATGTTGAAGCTGGCTGAGAGGATGGTGATGAGTTTCTGCACCGGTGTTGGCGCGTCGACTGCACACGCGTGGACAACAATGTCGTCGACGGGATCCGATGATGTTCGGGTGATGACCCGAAAGAGTATGGATGATCCGGGTAGACCTCCGGGTATTGTTCTTAGCGCTGCGACGTCGTTCTGGATTCCGGTTGCTCCGAAAAGGGTTTTCGATTTCCTCCGCGACGAAAATTCAAGAAGCGAGGTAAAATGTTTGGGTTTTGGTTTAGGTGTAGATTTTATGAATGTGGCCAATGTTTTAGAAAAACAAACCGAACCCCCCGGTCCGACTTGGAATTGTTCTTCCTGTGTCCGGTTTACATCAAAACTTACTGTTTTAAGTTAAAACCGACATAACTAGTAAAACTGGTTATCCGAGTTTAATTTTAAACCTGGTTTACATATTTATAAGAGCATCTCTTAAAATTTCATAAACAATTTAATATCTATATTATTAAAATAAAAGTACAAATATAATTTAACCCTTAATTTTTCAAATTATTTAAATCATATGTCACTGAAGTAATAAATTTACCTACCTTTTAGTATTCTTATCTTTTATAGTTTAATTAATGCATTTTCCTAAAATAAAGTATAACAAATTATGTTTACTTATTTAAAAAATATTTCCTATAATCTAGCTAAACAATAAATTATACTTAATCAAAGTCAAAAATATAACAAGATTTTATTATTACGAGGTGGTTATTTTTTATTTTGGTATATTAACTATGTCTAAAAAACATAAAAGTGTTATAAAAATACATAATATAAACCACAAAATTGTAAATAATATATTGAATTATTTAATCGTATAAATAAAATATAAAAATAGATAACCATTTTATTTTACATTAAAATTTTGATCCATAAAAAAAACATTTACTCGAACACACGGGTTATATTTTAAGAATATGGTTGTAACAGTTGACGGATCAAAAAATAAAATAAAATTATTCATTATAAATTATAAAATGATTCTGTTTAGAAATATATTAAATAATTATTTAATATATATGAATTTTAAAAATGTATATTACCATTTATATAAGAAAAATATTTTGTTTTGCTAAGCAAAAATGAATACCCGAGCGGGTGCGCGGATCAAGCTCTAGTAATAATTAAAACAGTTAGTTATATAATTTAATTTTAATATTAAAAGATAATAAAAGTTTTCATAAAATTCATAAGTATTTAGTAGGTTCTCAAATGAAACCTTCTCTTCATTTTTAATATAAGTTCTTTAGAGAAAAAAAAACAAACTTTGTTTTGGACAATTTACTAAATCACATATTTAATTGATAAACTTTGTTTTGTTTTTGTAAGTATTGCAATGATATAAAAGAATCCTTTGTTATTAATTTGTGTTTTCTGAAATTTATTCATGCAGTGGGATATTCTGTCCAATGGAGGAATGGTTCAAGAAATGGCTCATATAGCAAACGGTCGTGAACCTGGAAACTGTGTCTCCTTACTCCGAGTCAATGTAATATTCCTTCTCCTTGTTCGAGTTATTTCTGTGTTTGCTTTCTCCATATTAGTGATCCAAAGTTGTTCGTTTCGTTTCTTTGTAACAGAGCGGGAACTCGAGCCAGAGCAACATGCTGATACTACAAGAGAGCTGCACTGATGCGTCTGGATCGTACGTGATTTATGCGCCGGTGGATATAGTGGCGATGAACGTTGTCCTAAGCGGAGGAGATCCTGATTACGTGGCGTTGTTGCCGTCTGGTTTTGCTATATTACCGGATGGTTCTGTCGGAGGAGGAGGAGGAGATGGGAATGATCAGGAAGTGGTTTCTTCTTCTAGTGCTTCGGGAAGCTGTGGTTCACTTTTAACCGTTGCGTTTCAGATACTTGTCGACTCTGTTCCCACAGCTAAGCTCTCTCTTGGCTCGGTGGCTACGGTTAATAGTCTCATCAAATGTACTGTGGAGAGGATCAAAGCCGCTCTTGCTTGTGACGTAGGTGGAGGAGCACCGTAA
CDS Sequence
- >Bo9g077670
ATGTATCATCCAAGCATGTTTGAGAGTCACCACATGTTCGACATGACCACAAAGAGTACCTCCGATAACGACTTGGGAATCACCGGCAGCCGAGAAGATGAGTTCGAGACCAAGTCAGGCACCGAGGTCACCACCGAGAATCCTTCTGGTGAAGAGCTTCAAGATCCTAACCAACGTCCCAACAAAAAGAAGCGTTACCATCGCCACACGCAGCGCCAAATCCAAGAGCTAGAATCGTTCTTTAAAGAATGTCCTCATCCAGATGATAAGCAACGTAAAGAGTTGAGCCGCGATCTCTGCTTAGAGCCTCTTCAAGTAAAGTTTTGGTTCCAAAACAAACGCACACAAATGAAGGCACAACATGAGAGGCATGAGAACCAGATTCTTAAGTCAGACAATGACAAGCTCAGAGCAGAGAACAACAGATACAAGGAGGCTCTAAGCAACGCTACATGCCCTAACTGTGGCGGTCCAGCTGCTATCGGAGAAATGTCCTTCGATGAACAGCATCTCAGGATCGAAAATGTTCGCCTCCGCGAAGAGATTGATAGGATCTCTGCCATTGCTGCAAAGTACGTTGGGAAGCCAGTAGGATCTTCATTCGCTCCACTAGAGATCCACGCGCCTTCTCGTTCTCTGGAACTTGAAGTTGGGAACTTCGGGAACCAGACGACAGGTTTTGTAGGGGACATGTATGGAACAGGTGACATTCTGAGGTCGGTTTCAATCCCTTCTGATACAGACAAGCCTATGATCGTCGAGCTAGCGGTTGCAGCTATGGAAGAACTCGTGAGAATGGCTCAAGCTGGGGATCCATTATGGGTTTCGACCGGTAACTCGATGGACCTTCCGAACGAAGAAGAGGATTTCAGAACGTTTCCAAGAGGAATCGGACCAAAGCCATTAGGGTTGAGAACAGAAGCGTCAAGAGAATCAGCTGTTGTTATAATGAATCACATCAACCTCGTTGAGATTCTCATGGATGTGAATCAATGGTCTTGTGTGTTCTCTGGGATCGTGTCAAGAGCCTTGACACTTGAAGTTCTGTCGACTGGAGTTGCTGGGAACTACAATGGTGCATTGCAAGTGATGACAGCTGAGTTTCAAGTTCCGTCGCCGCTAGTCCCGACACGTGAGAACTACTTTGTGAGATACTGTAAACAGCATAGCGACGGTTCTTGGGCTGTGGTTGATGTCTCTTTGGACAGCCTTAGGCCGAACCTAATCTCAAGAACAAGAAGAAGGCCTTCAGGTTGTCTGATTCAAGAGCTGCCTAATGGTTATTCTAAGGTCACATGGATAGAGCATATGGAGGTGGATGATAGATCGGTTCACACAATGTATAAACCGTTGGTTCATTCCGGTTTAGCTTTCGGAGCCAAACGTTGGGTGTCTACACTCGAACGCCAGTGCGAGCGGCTCGCGAGTTCGATGGCCAGCAACATTCCGGCGAGTGATCTTTCGGTTATTACGAGTCCAGAAGGGAGGAAGAGCATGTTGAAGCTGGCTGAGAGGATGGTGATGAGTTTCTGCACCGGTGTTGGCGCGTCGACTGCACACGCGTGGACAACAATGTCGTCGACGGGATCCGATGATGTTCGGGTGATGACCCGAAAGAGTATGGATGATCCGGGTAGACCTCCGGGTATTGTTCTTAGCGCTGCGACGTCGTTCTGGATTCCGGTTGCTCCGAAAAGGGTTTTCGATTTCCTCCGCGACGAAAATTCAAGAAGCGAGTGGGATATTCTGTCCAATGGAGGAATGGTTCAAGAAATGGCTCATATAGCAAACGGTCGTGAACCTGGAAACTGTGTCTCCTTACTCCGAGTCAATAGCGGGAACTCGAGCCAGAGCAACATGCTGATACTACAAGAGAGCTGCACTGATGCGTCTGGATCGTACGTGATTTATGCGCCGGTGGATATAGTGGCGATGAACGTTGTCCTAAGCGGAGGAGATCCTGATTACGTGGCGTTGTTGCCGTCTGGTTTTGCTATATTACCGGATGGTTCTGTCGGAGGAGGAGGAGGAGATGGGAATGATCAGGAAGTGGTTTCTTCTTCTAGTGCTTCGGGAAGCTGTGGTTCACTTTTAACCGTTGCGTTTCAGATACTTGTCGACTCTGTTCCCACAGCTAAGCTCTCTCTTGGCTCGGTGGCTACGGTTAATAGTCTCATCAAATGTACTGTGGAGAGGATCAAAGCCGCTCTTGCTTGTGACGTAGGTGGAGGAGCACCGTAA
Protein Sequence
- >Bo9g077670
MYHPSMFESHHMFDMTTKSTSDNDLGITGSREDEFETKSGTEVTTENPSGEELQDPNQRPNKKKRYHRHTQRQIQELESFFKECPHPDDKQRKELSRDLCLEPLQVKFWFQNKRTQMKAQHERHENQILKSDNDKLRAENNRYKEALSNATCPNCGGPAAIGEMSFDEQHLRIENVRLREEIDRISAIAAKYVGKPVGSSFAPLEIHAPSRSLELEVGNFGNQTTGFVGDMYGTGDILRSVSIPSDTDKPMIVELAVAAMEELVRMAQAGDPLWVSTGNSMDLPNEEEDFRTFPRGIGPKPLGLRTEASRESAVVIMNHINLVEILMDVNQWSCVFSGIVSRALTLEVLSTGVAGNYNGALQVMTAEFQVPSPLVPTRENYFVRYCKQHSDGSWAVVDVSLDSLRPNLISRTRRRPSGCLIQELPNGYSKVTWIEHMEVDDRSVHTMYKPLVHSGLAFGAKRWVSTLERQCERLASSMASNIPASDLSVITSPEGRKSMLKLAERMVMSFCTGVGASTAHAWTTMSSTGSDDVRVMTRKSMDDPGRPPGIVLSAATSFWIPVAPKRVFDFLRDENSRSEWDILSNGGMVQEMAHIANGREPGNCVSLLRVNSGNSSQSNMLILQESCTDASGSYVIYAPVDIVAMNVVLSGGDPDYVALLPSGFAILPDGSVGGGGGDGNDQEVVSSSSASGSCGSLLTVAFQILVDSVPTAKLSLGSVATVNSLIKCTVERIKAALACDVGGGAP