Information report for Bo9g009030
Gene Details
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Functional Annotation
- Agamous-like transcription factor. A target of SPL10, AGL79 knockdowns show defects in leaf shape, shoot branching, and flowering time.;MADS-box transcription factor
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT3G30260.1, AT3G30260
- Brassica napus: GSBRNA2T00109576001, BnaA09G0045700ZS, BnaC02G0480300ZS, GSBRNA2T00082884001, GSBRNA2T00144478001
- Brassica rapa: XP_009111804.1, Bra036201, XP_009129675.1, XP_009151758.1
- Raphanus raphanistrum: RrC6330_p1, RrC14020_p1
Gene Resources
- Pfam: PF00319 PF01486 PF04849 PF09074
- UniProt: A0A0D3E0P8
- RefSeq: XP_013610595.1
- AlphaFoldDB: A0A0D3E0P8
- KEGG: boe:106317301
- OMA: SFEYMKL
- InterPro: IPR002100 , IPR002487 , IPR033896 , IPR036879 , IPR050142
- PANTHER: PTHR48019
- SUPFAM: SSF55455
- PROSITE: PS00350 , PS50066 , PS51297
- Gene3D: 3.40.1810.10
- OrthoDB: A0A0D3E0P8
- SMR: A0A0D3E0P8
- CDD: cd00265
- eggNOG: KOG0014
- STRING: 109376.A0A0D3E0P8
- HOGENOM: CLU_053053_0_2_1
Sequences
gDNA Sequence
- >Bo9g009030
TGGGAAGGGGAAGGGTTCAGCTACGGCGGATCGAGAACAAGATAAGGAGACAAGTGACATTTTCAAAGAGAAGAACGGGTTTGGTGAAGAAAGCTCAAGAGATCTCAGTGTTATGTGATGCTGATGTTGCTTTGATTGTCTTCTCCCCTAAAGGCAAGCTCTCTGAGTACTCTGCTGGTTCCAGGTTCGAATTCTTTCCTAAATGACTAATTTACTTCGGATCTTATTTTACCCTCTTACTTTTCGTTTTTATGATTGCAAATCTTTTTTTTTGAGCAAACCGCTAGTACTAGTGGGAACAAAACCTCATAGGTTTTAGGCTGTAATCTATTTTTATCTATCTACATAGGAATATCAGCTTATATTTCATGTTTTGACAGATCGGGGAAAATGTTTTATAGGTTTTAGGCTTTTAGCTAGTGGAGAATGTGAAATTGGCTGAGATATTTTGATTACATAGATGAATTTGTAGCCATGTATGTGTATGTGAGAGATTAATATACACATGTTGAATTCTTGCATCTCTAAACTAGAGATGAACATGCAAAATGAGATATTATATATCATATATAAATCAAATTAACAGAGGTAAGTAGATACAACTGACATCAAACCATAACTGTGAGATATAACATTTCGTTTGATTATATGAATTATTCAGAAACATATGGAGGAGAATATGCTAACTGTAAACCAAACTTAAGTTGAACATACCATGAAATGATAAGATATTTCTTTATATTTAGGTGTGAGTTTGTTCTTCAACCTTACGGAAAAGGTTATTTATGGGGAAAAAGTTCAAGCCTTCTTTTTTTTTGTTGGAAGCATGTACAAGCCTTCTTTTTTTTGACTAAAGGCTTTTGTTTTTTAATGGAGCAAGACTTTGTTATGGAGCTTTGTGCCTTGCTTTGTCTTTTTGTTTGTCGAACCTAGGACTAACCTCGATCTTAAAATGAAAACATATACACACCCATGAAGATGTTACTTTTCTAGCTTCTTAGTTTTAATAAGCAGTATGTCAAAATGAAACTTCTTGTAAACATGTTGTAAGAAATTTGGTTAAGTTTGATCTAATATTTATCTTAGTCTAAGGAATACTGTAAAATACTGTATGAAATCCCACACGTGGGGTGGTATTGGGTATATGGAAGGACTCGTTACAATCTTAAATTTCATTTCACAGTGTGTAAACTCTGCGTGTGGGCTACATGGTCACTAATGCCTTGGTTAGAATGCTTAACCCACAGTAGGTTGTGATATCTCTTAACCAAAGGGCATGTTCTCACTCAAAATTAGTCTGGCATGAAATCAAAATCGATCTGGTTCCAAATATATAGTGTTTAAAAATGTATGAAAATGTATATCAGTCTTCTCGATACTACCAAACATTAAATGTGTGATCACTGTGATGTATGAATCCAGAAATGTTTTTGTTAAATTTTACAAAACTAAAAAAAGAAGAAGTTTAGAACTATATTATTTATGTTCAGTATGCGGTGTGATGATAGTATCTACAAATCTGAGTGGTCATTGAAGTTTAATTAAACGATGTTTAGCATGGAGAGAATTCTCGAACGGTATGAGAGATGTTCATACGCCGGTCAAGATGTTACTACACCAAGTTTGAATTCACAGGTTCTTAAGCACATCAATCAGTATCTATTACATATGAATCATTGTTGTAAATTTAATATTGTCTGTCTACTTCTGGTTGTTTGTAGGGTGAGTGTTCAACAGAATGTTCGAAGCTTTTGAGGATGATTGATGTTATGCAAAGAAGCCTAAGGTTAGAAACTTATTACTAAAGGATCTCCATCCATAAATATATAAATGCACACATATAATAAAATAAACAGAAATACCATATGACAACAATAAAATACATTTTTGTTCTAAAATTAATACACAAAGGGAAAAACCCCCAAAATAAATTAACTAAATTTTTTTTTTTAAATATGTTTTATATTTGGATTTAGGTTTCATAATTACTAGGGTTTAAATATTTAGGGGGTGGGATTAGGGTCAAGATTTAGGATTTTGATTGATTTAATCATTTTACTCGGTGTTATATTGATTTATATATTTTGATTGATTTAGAAATCCATACAATATTTATAAATTTAAGTAAAATATACAAATTTTCAAATTCTCTCAGATTAGTATTTACAAATCTGGAGGTTTGCCCTCGGATTTGAATCTTTCTAATTTTAACAAAAAAATCTATGCAAATCCATTCAAATCTATTATGAAATCAAATCTACTAGTAAATCTCTATGATTGAATAACACTTGATTTGAATTAGAATTTATGAATCATTAAGCCAATAACACATGATTTCAATACATATTTTAAAATCATAGAACCAATAACACTAAATTTAGTTTGGATTTTCAAATCAATCGAAATACACCAACCAATAACCCCCACTTAATTAGTGCTATTTTGAGAAGTTTTCTATTTTTATGCTTTGTTGTCATAGACTCATAATATTTCTAAGGGATTTGGCTATATAAATTGTACCTTCATTTATTTAACCTATTTATTTCATATCAGGCACTTAAATGGAGAAGAGGTGGATGCTCTAAGTATCAGAGAGCTTCAGGATCTGGAGATGCAACTTGATGCTTCACTCAAGAGAACTCGCTCTAGAAAGGTTATTCACATATATCCATAAAGCATTATCTTATATCTTGCATACATGTATTCGCAGATCATTTCTACAAGTATTTGTTTAATAATGTTTAGTGTCTGTATGCATATAGTCACACATATATAGATATACTACATCTAATTAATCATGTGGCTATTGTTTTGTTTTGGGAGCACAGAACCAGCTCATGGTAGAGTCCATAGCACAGCTCAAGAAAAAGGTAATATATTGGTTTAGAGACGATTACTCATTTTAATGGTTTTGTACCTTGCAAACGTCTTTGCGTACCTGTCGGTCTTTTTCGCTATTGGGTTTGTGTTTTTATGAGTGTGTTTTTTTTTTCCTTTTTGCAATTAAGAAACACAATTTCATATCGAGAATACTTTGAGTTTCCAACGAATTAATTTAGTAAATGTGTGATCTTTTGTTGACACACATAGGAAAAGGAACTCAAAGAATTGAAGAAACAGCTACAAACGAAGGTGAAACGGATGTCATCATCATCTTTGACTATTCACATATATATATATATATATATATATGTTATTTCGATTCTACTTTATGTGGAGTTAAAAGTTTCAGAGATTAGTCTAGGTTTTAGTCTAAAATCTCCCCATTGCATATATATAATTTATGTGAAAACAACTAGAAAACGAAAAAAATAGTAACTATAACAAGTATTGAATTTAGCAGGCTGATCCAAGAGAAGACTTTGAGCCGCAAACCCTCAACCAAGGATTAGCCTCATTGGCAACGCCACCATGCGAGCCACCGCACCCGTTGCCCGGACCTATATCTCCCCGTCGTCCTCTATCTCTTGGGTACTCTACATATCAATTTCACTTGGCTACGCATATATGAAAAATACCAACTTTAATGTGTTACTATATTGACTAATAATAAGAGTAAGTTAGTGTTACTCATAAACATCACAAATTTATAACTTGTATCCAGTATTTGCGTAGTTACTAGCAAATTGTGTATCATTTATATGGAATGAATTAATATTGTTACTTATAGGGACACATTGCAAAGGAACGAAGATGGAGAAGTAGATGCCGGAACCCTAATTAGGCTGACAAATACAACGTTGCCGCACTGGATGCCCCGGCTCACTGGAGAATAG
CDS Sequence
- >Bo9g009030
ATGGGAAGGGGAAGGGTTCAGCTACGGCGGATCGAGAACAAGATAAGGAGACAAGTGACATTTTCAAAGAGAAGAACGGGTTTGGTGAAGAAAGCTCAAGAGATCTCAGTGTTATGTGATGCTGATGTTGCTTTGATTGTCTTCTCCCCTAAAGGCAAGCTCTCTGAGTACTCTGCTGGTTCCAGCATGGAGAGAATTCTCGAACGGTATGAGAGATGTTCATACGCCGGTCAAGATGTTACTACACCAAGTTTGAATTCACAGGGTGAGTGTTCAACAGAATGTTCGAAGCTTTTGAGGATGATTGATGTTATGCAAAGAAGCCTAAGGCACTTAAATGGAGAAGAGGTGGATGCTCTAAGTATCAGAGAGCTTCAGGATCTGGAGATGCAACTTGATGCTTCACTCAAGAGAACTCGCTCTAGAAAGAACCAGCTCATGGTAGAGTCCATAGCACAGCTCAAGAAAAAGGAAAAGGAACTCAAAGAATTGAAGAAACAGCTACAAACGAAGGCTGATCCAAGAGAAGACTTTGAGCCGCAAACCCTCAACCAAGGATTAGCCTCATTGGCAACGCCACCATGCGAGCCACCGCACCCGTTGCCCGGACCTATATCTCCCCGTCGTCCTCTATCTCTTGGGGACACATTGCAAAGGAACGAAGATGGAGAAGTAGATGCCGGAACCCTAATTAGGCTGACAAATACAACGTTGCCGCACTGGATGCCCCGGCTCACTGGAGAATAG
Protein Sequence
- >Bo9g009030
MGRGRVQLRRIENKIRRQVTFSKRRTGLVKKAQEISVLCDADVALIVFSPKGKLSEYSAGSSMERILERYERCSYAGQDVTTPSLNSQGECSTECSKLLRMIDVMQRSLRHLNGEEVDALSIRELQDLEMQLDASLKRTRSRKNQLMVESIAQLKKKEKELKELKKQLQTKADPREDFEPQTLNQGLASLATPPCEPPHPLPGPISPRRPLSLGDTLQRNEDGEVDAGTLIRLTNTTLPHWMPRLTGE