Information report for Bo8g087280
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a AP2 domain transcription factor that can repress flowering. SMZ and its paralogous gene, SNARCHZAPFEN (SNZ), share a signature with partial complementarity to the miR172 microRNA, whose precursor is induced upon flowering.
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT3G54990.1
- Brassica napus: GSBRNA2T00108914001, BnaC08G0350200ZS, GSBRNA2T00069921001, BnaA09G0508900ZS, GSBRNA2T00124534001
- Brassica rapa: XP_009116196.1, Bra007123
- Raphanus raphanistrum: RrC4601_p1
Gene Resources
- Pfam: PF00847
- UniProt: A0A0D3DT73
- RefSeq: XP_013601987.1
- AlphaFoldDB: A0A0D3DT73
- KEGG: boe:106309498
- OMA: SSMSTCF
- InterPro: IPR001471 , IPR016177 , IPR036955
- PANTHER: PTHR32467 , PTHR32467:SF177
- SUPFAM: SSF54171
- PROSITE: PS51032
- Gene3D: 3.30.730.10
- OrthoDB: A0A0D3DT73
- SMR: A0A0D3DT73
- CDD: cd00018
- eggNOG: ENOG502QSBE
- STRING: 109376.A0A0D3DT73
- HOGENOM: CLU_035462_3_1_1
Sequences
gDNA Sequence
- >Bo8g087280
TATGGATCAAAACTAGTGGACATGGAGGAAGAGGAGGATGTGGTCATGGTGATAAAAGGGAATCCTGATGATGCTGCAACTGTCTTTAAAGGGTTCATGGTCGTCACCGGTAAATAGATCGGTAAGTGCTTACCGAATAAACCCATCGCGGATTGGTTAATACCTTTGTAGAAGTCGCTTGTTGTCATCTTTATATTTTGCGATGATGATGAAATGCCAAGACTTAATTCAAGATCATTGTGAATATTTCCTGAAGGAGAAAAGAAAACAAAAGTTAATGAATCAGATATACTGAAGTTGCTAAAAGACAAAGTAAAAAAGGTTAGCTGCTAGGGTTTGCTTGATCTAATCAAAAGTAAATGTGACATTTATGGTAAGGGTTATATAAATTGGTTTCACCTAACTTCATCAATCAACCTTACAATATCTAAACATTGTGACCCAGACTTATCCATTACCTTTAATAGGGGCACGAGACTTCATGACTCCTCCCTTTCCCAACTCATTATTGTATTTGATCGCTGCTGCATCCCATCCCCTGTGAATTTTCATGCACGTACGTATAATATCTCAGAGTTATTTACAACATAAGAATAAGTCTTTGGTTTCATTTTATTTTGTTAATAATGTGTTCATCTGTGACATTTAAACTAGATTAAGGAAAACCGTCCCCGATAGGACAAGTATCAAACTCGTAAACAAAAGCGACTAACTACTACCTCCATTTTTTTCAAAACAAAAAGTTTGCAAATAAAAAATGTGTAACATAAATGACTTTAGCTTGGTATTAGTTTTAGGGGAATAACTAAAACTTCGTGTAACATAACACTATCCATACGATTCACTTAGGAAAATAAAATTGAGTAGAAAAGATCGTATACTACTCAAAGTCTTTTTATACTGCTCAAAGTTTCATAACAGTTTTGTTTAGTGTGACCTAAGTTTTTAAAATAGATTATGTTCAACCATGTTGATATCTTAACAAAATGAGTAAAAATGGTTTTTAGATCAATTTTAAAATTTTATAAACAAGTTTGAAATATAATGTTATTATTAGTATTTGCCAAGTTAATGCCGTTTTTAAGTTGTAAAATCTATTTCAATTTGTAAAAGCTATTATTGCTATTACTATTTGTCATATTAAACTTTTGAACAAAAAAACTAAAGATATGTGATGATCTGATTGGATCAAGCTGAAAAAAATAGTTTTCCTTTAGAATATGTAAACAAATGTTTAAGTTTGTTCTAACTTTTCTTAGTAACTATGAAATTTTGTAGAGCTAAATGCTATCTTTTAAAAAGTGAGTGTTGGGCTTTATAATGGCAAGCAATAGAATAAAACAAATAGAATATGGACGAACAGAAGGCAAGTGGTTAGGGGAATATTGCCGTTCCTTTCATATTCCATCAACCGAGTGGGAAGTTTTTCCGAAGGTTTTTTTATCATAATAAATAGTAAAATTCAGCTAAGTAATCAGACAACAGTTTTAAACGTGTCTGAGTAAATATTAAATTTGTTAATTAAGGATCTTCAAAATTAAGATAAGATTGCATGTGTCTAACAATTACGAAAGTACTAAAATGTTTTCAGTGAAGTGTTGGTTAGATAAGAGTAACGGTACCTGTTTTGGAAGAGATGAATCTGATCGTGATGAGTTTTGAGTTGGGTGTTTTTTTGAAGAGTCAAGCCTTTATATTTGGAACTTCCTCTTCCGAAACTCGCACTTTCTCGCCTAAGTGTTTGCACAAACTCCACTTTATTCATATTCTTCATCTATATAAATGTAATTGAGAATTTAAGACCCACAATTAGTTCGACAAAACAAAAAACAAAAATATACTAATAGCGTATATAATATACACTTATATGTATAACCTTATCGAGGTCTTGTTTGTAATCCTCCACAACGAAGTTGATATCTGCGTCGAGACCACGGAATTTGATAGCAGCTCGGTCGTAGGCCCTGGTATACATATTTATATTCAATTATTAATAATCAACTAATATTTCTTTAATGTATCTTCAAACAATAATGTGTAATTTGACAAAATTAAACCATACTATAGCGGCGAATGTTCACACATAATATCATATATATATTAATTCTTTTACCTTGCTGCTGCGTAGGCAGTATCAAACCCGCCTGTTGAAACAGAACATTAGGTTAAAAACAGAAGAATGATAGTTGATACAATCAACAAGTTTGTGTTTTAAGCAAAGAAGAAAAGACAAGTTTGTGTTCAATAAAACGTGTATGATAGAAGTAACAAACATCGGAAATGAGCTGTAATAGTCTACTATGTTTTGTCTTTTACATAAAAATATAGGTATATTTAAAAATAAATTGCAGTAGTTGACGTTTTGTAAAAAGAAAAATCCTAACATTTACTTGTTAACAGATGTTGTCAGACAAAATATAAAAGTTTATAACAGGAATATGATAGCTAGAAAATCATCGTTTTTTTTTTTTTTTGAACACAGAAAATCATCGTTTATGCCTATATATAGACAGACACACACACGACGTAATTAAGAAGACGAAATAATTAGAAAGGGTTTGATATAAGTATATACTTACCCAAATAAACTTGCTTTCCACAATCCCTACAAAATCATCAAGTCCAAGAACATAAATTAGGGATTTATAATTATATAGCAATAATTGGATGGAATTAATTGTCAAAAACTAAACAAAACAAATTAATTAATTTTTGTAATACCAAATATGAGATTCCCAACGACCGGTGCGACGGTAAAAAGTGACGCCACGATACTGGGAGCTTCGTGACCTTGGTCCTCTTCTGCTCTTCTTTGCCACTTGCTGCTTGTTCCTCTGTAAAGACGACAGTCTCAACCAGTGACCGTCGTCTGCGGCGAACTCAATGTTCCGGCGAGCATCAGCCACGGGGAAAAGATCTCCGGTTTCTCTAGAAGGAGGAGGAGGAGGAACGACATCATCGTCGCGTTTGAGAATCCCAAAGGTGATGAAATCTTTTCCGGCGACGGAATCTTTGGAAGACGAAGAGGAGATGTTAGATTCTTCGTCACCGGCGGTTGAGACAAATGGTACTTTGCGATCTTGATCTTCTCCATAGTTAGAGAACATACCAAGACTGAGATCCAACAT
CDS Sequence
- >Bo8g087280
ATGTTGGATCTCAGTCTTGGTATGTTCTCTAACTATGGAGAAGATCAAGATCGCAAAGTACCATTTGTCTCAACCGCCGGTGACGAAGAATCTAACATCTCCTCTTCGTCTTCCAAAGATTCCGTCGCCGGAAAAGATTTCATCACCTTTGGGATTCTCAAACGCGACGATGATGTCGTTCCTCCTCCTCCTCCTTCTAGAGAAACCGGAGATCTTTTCCCCGTGGCTGATGCTCGCCGGAACATTGAGTTCGCCGCAGACGACGGTCACTGGTTGAGACTGTCGTCTTTACAGAGGAACAAGCAGCAAGTGGCAAAGAAGAGCAGAAGAGGACCAAGGTCACGAAGCTCCCAGTATCGTGGCGTCACTTTTTACCGTCGCACCGGTCGTTGGGAATCTCATATTTGGGATTGTGGAAAGCAAGTTTATTTGGGCGGGTTTGATACTGCCTACGCAGCAGCAAGGGCCTACGACCGAGCTGCTATCAAATTCCGTGGTCTCGACGCAGATATCAACTTCGTTGTGGAGGATTACAAACAAGACCTCGATAAGATGAAGAATATGAATAAAGTGGAGTTTGTGCAAACACTTAGGCGAGAAAGTGCGAGTTTCGGAAGAGGAAGTTCCAAATATAAAGGCTTGACTCTTCAAAAAAACACCCAACTCAAAACTCATCACGATCAGATTCATCTCTTCCAAAACAGGGGATGGGATGCAGCAGCGATCAAATACAATAATGAGTTGGGAAAGGGAGGAGTCATGAAGTCTCGTGCCCCTATTAAAGGAAATATTCACAATGATCTTGAATTAAGTCTTGGCATTTCATCATCATCGCAAAATATAAAGATGACAACAAGCGACTTCTACAAAGGTATTAACCAATCCGCGATGGGTTTATTCGGTAAGCACTTACCGATCTATTTACCGGTGACGACCATGAACCCTTTAAAGACAGTTGCAGCATCATCAGGATTCCCTTTTATCACCATGACCACATCCTCCTCTTCCTCCATGTCCACTAGTTTTGATCCATAA
Protein Sequence
- >Bo8g087280
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