Information report for Bo7g092860
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a cytosine methyltransferase MET1. Required for silencing of FWA paternal allele in endosperm. Two lines with RNAi constructs directed against DMT1 have reduced agrobacterium-mediated tumor formation.
Homologous
- Brassica napus: BnaC07G0337100ZS, BnaA06G0355700ZS, BnaC08G0440500ZS, BnaA09G0589100ZS, BnaC04G0443400ZS, BnaA04G0150800ZS
- Brassica rapa: Bra010026, Bra039939, Bra030191
- Manihot esculenta: MANES_13G119400
- Populus trichocarpa: POPTR_T046100v3, POPTR_004G134000v3, POPTR_018G138000v3
- Prunus avium: Pav_sc0000113.1_g130.1.mk
Gene Resources
- Pfam: PF01426 PF00145 PF12047
- UniProt: A0A0D3DC84
- RefSeq: XP_013594964.1
- AlphaFoldDB: A0A0D3DC84
- KEGG: boe:106303172
- OMA: PWHEPIL
- InterPro: IPR001025 , IPR001525 , IPR017198 , IPR018117 , IPR022702 , IPR029063 , IPR031303 , IPR043151 , IPR050390
- PANTHER: PTHR10629 , PTHR10629:SF52
- SUPFAM: SSF53335
- PROSITE: PS00094 , PS00095 , PS51038 , PS51679
- Gene3D: 2.30.30.490 , 3.40.50.150 , 3.90.120.10
- OrthoDB: A0A0D3DC84
- CDD: cd04708
- eggNOG: ENOG502QPKK
- STRING: 109376.A0A0D3DC84
- HOGENOM: CLU_002247_0_0_1
Sequences
gDNA Sequence
- >Bo7g092860
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CDS Sequence
- >Bo7g092860
ATGGAAGAAGAATCTTCTAATGGCCATGTGGTCAACCAGCCTCGTAGGATTGTTCACAATTGGGCTCTGTACAACTCTGAAACAAGGTTGATATCCCTCGAGCTTCTTCCTATGATGAGGCCTACGGATGAAACTATCTTTGGAGCTGGTTTGCTGGCTGAGGATGATGGAAGTAGCTGGTTTTGTCTTGATGGCTCTGACATCTCTACGCAGTCCCATGATTGTAAAGGGATCCCCATATACCTCAATCAAATAAAGGAATGGATGATTGAGTATGATTCATCAATGGTATCGATTTCAATACGTACAAATGTGGCCTGGTATCGACTTGGGAAGCCATCAACGCAATACGCCCCTTGGCATGAACCTATACTGAAAACAGCAAGGGTTGCGTTCAGCATTATTTCCTTGCTGGTGAAGCAAGCTAGAATGGCTAGGCTTTCATTTAGAGATGTCATCAAAAGAGTGTCCCAGTTGCAAAAAAATGATAATAAAGCTTACATTTCTTCTGATCCCTCAGCTGTGGAGAGATATTTGGTCCTCCATGGGAAAGTTATTTTGCAGATTTTTGCAAAACACCCTAAAAAGGAACTCAAAAAGTGTGCATTTATTACTGGTCTTGCAAGTAAAATGGAGGAAAGACACCACACAAAATGGGCAATCAAGAAGAGGAGGAAAATATTGCCAAAGAAACCCAAGAATAAAATATTGCCAAAGAAACCGAAGAGGAAACTAAGGATAGGTAAGGGATATGTGGCATCCAAGAGGAGTGCTATGCAAGCAACAAAAACTCACCTGGTTGATAGAATTTGGGGACAGTATTACTCAGAATTTGAGGCCATTGGTGCAGAAAATGGCAAGGAAAAGGTTCAAGAGGAGAGACAAAACGAAGAAGAAAATGATGTAGAGGAACCTTCGGTCATGGAAACAAGATGGGAAGGTGATATTCTAGGAAGAACATCTGCTGGTGAGCCTCTCTATCAACAAGCCCTCGTTGGAGGAGAGGTAGTGGCTGTAGGTGGTGCTGTCCTCTTGGAAGTCAATGAAACTTCGGTCATCTACTTTGTGGAGTACATGTTCGAAAGTTCAGATCACTGCAAAATGCTACATGGAAGACACCTACAAAGAGGATCCGAGACTGTTCTAGGGAACGCTGCTAACGAGAGGGAACTATTCCTGACCAATGCATGCATGACTGTTCAGCTTAAGGACATAAAAGGAACAGTCAGTTTCGAGATTCGATCAAAACCATGGGGACATCAGTATAGGAAAGAGAACAACGCTGCGGATGAGCTTGACCGAGCACGAGCAGAAGAGAGAAAAGCACAACACTTGCCGGCAGAATATTTCTGCAAATGCTTATATTCACCTGTGAGAGGGGGTTTCTTTAGTCTTCAACCCAACGACGACATAAGTAGTGGTTCAGGATCCTGCACTTCGTGTAAGATGAGGGAGGAGAAAAATGAACGGTCAAAACCCAAGCTCAATGCAAAAAAGACCAGGTTTGTCTTCAACGGGGTTGATTATTGCATGGAGGATTATGCATATGTCAACCATAAATTTTTCTATAAACCGGAAGAGGAAAAAAAGTTTGAGACGAACGTTGATTCAAAATCCTTCGTCGTCTGTCAACTACTAAAAGTAGTTGTCTCAAAGGTATCGTCATTAAATGATTTATTTGAGGTTATAGTGAGGAGATTTTATAGGCCAGAAGATATGTCTCCAGATAAGGCTTTTACTTCAGACATCCAAGAAGTGTATTACAGTGAGGACGTATATAATCTCCCTCCAGGGGCTTTTGAAGGCAAATGTGAAGTAAGGAAGAAACATGATATGCCCTTAAGCAATGACTATCTAACATTAGACAATATCTTCTTCTGTGAACTTTTCTATGACTCTTCTAGAGACTCTCTCTATCAGATGCCTGTCCATATCAAACCAAAGTTCTCTAGCATTAAAGACGATACACTTCTTAGAAAGCTAAAGGGGGAGGGAATAGAGGGTGAAACTGATTATGATGAGTTACCTAAGGAGATGCGTCTAGCGACACTTGATATCTTTGCTGGTTGTGGTGGCCTGTCTAAGGGACTGGAACAGTCAGGTGTATCTGAAACAAAGTGGGCTATTGAGTATGAAGAGCCAGCAGGGCAGGCTTTCAAACAAAACCATCCTGAGTCAACGGTTTTTGTTAACAACTGCAATGTGATTCTTAGGGCTATAATGGAAAAATGTGGAGATAAAGATGAGTGTCTCTCTACTACAGAGGCAAATGAACTTGCAGCTAAACTTGATGAAGAACAGAAGCTTGCTCTGCCATTGCCTGGTCAAGTGGATTTCATCAACGGAGGACCTCCATGCCAAGGATTCTCTGGTATGAACAGGTTCCAGGAAGGCTCTTGGAGTAAAGTTCAGCGTGAAATGATACTAGCATTCTTGTCCTTTGCTGAGTATTTCCGGCCAAGGTATTTTCTTCTGGAGAACGTGAGGAACTTTGTGTCATTCAATGGAGGGCAGACATTTAAACTCACTCTGGCTTCTCTTCTTGAAATGGGTTACCAGGTGAGGTTTGGAGTGTTGGAGGCAGGTGCATATGGAGTTTCTCAATCTCGCAAAAGAGCTTTTATTTGGGCAGCTGCACCAGGAGAAGTTCTTCCAGAATGGCCTGAGCCTATGCATGTCTTTGGTACTCCAGAGTTGAAAATAAAACTATCCAAAAGATCACACTATGCTGCTGTTCGTAGTACTCAATATGGTGCACCTTTCCGCTCAATCACTGTGAAAGACACCATTAACGATCTTCCACCTATAGAAAATGGTGAATCAGAGACCAACAGAGAGTATGGAGCTGATCCAGTCTCTTGGTTCCAAAAGAAGATAAGAGGAAACATGTTTGTTCTCACTGATCATATATGCAAAGAGATGGATGAAACAAACCTCATCCGGTGTAAAAATATACCAAAGACTCCAGGTGCTGATTGGCGTGACCTCCAAAATCTCAAAAAAAAAAAGATTAAGTTATCAAGTGGGAAGATGGTAGATATGATTCCAGCCTGGCTGAGAAACAAAGCTAAGACTCACAACGGGTGGAAAGGAATCTTTGGGAGATTAGACATGGAAGGAAGCTTTGCAACTTCCATCACCGATCCTCGGCCAATGGGTATGGTTGGAATGTGCTTCCATCCTGAACAAGACAGGATTATTTCTGTCCGTGAATGCGCCCGATCTCAGGGGTTTCCGGATAGCTATGAGTTTGCAGGGAAGATACTAGACAAACATAGGCAGATTGGAAATGCAGTGCCTCCACCATTGGCTTTTGCTCTAGGTCGTAAGCTCAAAGAAGCCGTTCTTCTCAAGAAACTTCCTCTTCAACAATAA
Protein Sequence
- >Bo7g092860
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