Information report for Bo6g068410
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- Encodes a AP2 domain transcription factor that can repress flowering. SMZ and its paralogous gene, SNARCHZAPFEN (SNZ), share a signature with partial complementarity to the miR172 microRNA, whose precursor is induced upon flowering.
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT3G54990
Gene Resources
- Pfam: PF00847
- UniProt: A0A3P6H1J4
- EMBL: LR031880
- AlphaFoldDB: A0A3P6H1J4
- OMA: VMKFGSH
- InterPro: IPR001471 , IPR016177 , IPR036955
- PANTHER: PTHR32467 , PTHR32467:SF177
- SUPFAM: SSF54171
- PROSITE: PS51032
- Gene3D: 3.30.730.10
- SMR: A0A3P6H1J4
- CDD: cd00018
Sequences
gDNA Sequence
- >Bo6g068410
CACTTGCATGTTGTCAACTTTGTATTTCCCGATGACGATGAAATACCAAGACTTAGTTCAAGGTCGCTGTGAGCATTTCCTGGAAGATAAAAATGTTAATGAATCATATATGAATGGAGATCTATTATTCTGTACTAATTAAATTGCTTAAAGACAAAGGCAAAAGGTTTAGCTAGCTAGGGTTTGCTTGATTTAATCAAAAGTAAATGTTAATTTTGTGGTTAGTGTTGTAACTTTCACTTAAATTGATCAATCAACGTCAGTAGATGTAAACGTTGTGATCCATATATATGAATTACCTTTAATATGGGAACCAAACTTCATGACTCCCTTTCCCAGCTCATTGTATTTGATTGCTGCTGCATCCCATCCCCTGTGAATATTCACACATGTATAATATCTCAAAACCATTTACAACATAGTATTAACTCTTTGGTTTCTTTGTGTGCCTATAATGGTGTTCATCTAATCATCTGTAAAGCTTATACGATGAAACATAAAATCTACAGAAATGTGATTTGATCAGCTGATTCAGTCAAACTGAAAAAAGTAACTGTGAAATATTAATTAACTGTGAAATATTAATTAAATATTTTTCTCATAAAAAGTGAGAGATAGGCTTTGAATGGTAAACAATAGATTAAAACAAATGGAGTATGGGTGGACAGAACATTAATGATTGACGAATACTTGTATATGTAAGCAGACAACTATTGCACTTTTTAAACCTGTTAACGAAGAATTTACAAAAGTATGATAATATTACACACGTGTAACAAAATATGATAGTGTTCAGTGAAGTGTTTTTAACATGAGATTAGATAAGAGTTGCGGTAAACCTGTTTTGGAATAGATGAATCTGATCATGATGGTTTTTGAATTGTGTGCATTTCTGAAGAGTTAAGCCTTTGTATTTGGAACTCCCTCTTCCGAAACTCGCACTCTCTCGCCTAAGTGTTTGCACGAACTCCACTTTATCTAAATTCTTCATCTATATGCAATTGATCATTTAGAATCCATAATTAATTCGACAAACGACAAACAAATATATACAATAGATAATTCAGCTTCATATATTTCAAGGGACGTATTTCTTGCACGTTTATATATACAATAGATAATTCAGCTTCATATATTTCAAGGGACGTATTTCTTGCACGTTTATATATGATATAGACTATTATATGTTTAACCTTGTCCATGTCTTGTCTGTAATCATCCACGACGAAGTTGATATCTGCATCGTGACCACGGAATTTGATAGCAGCTCGGTCGTACGCCCTGGTATATATATTCATATTCATTTATTAATAATCAACTAATATTTTTTAATATACTGTAATGTGTATACGTTGACAAAACCAAATCATACTAAAAATAGGAATGTTGTCACAAATAATATTTTTATATATTGTGTCTATTGTGTATATCAAAATTTCTCGTACCTTGCTGCTGCGTAGGCAGTATCAAACCCGCCTGTTGCGACAAACCATTATAAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAGGCTAGGTTAATAAATAGATAATCAACAGAATGTTTAGTTAGAAATTCATCGTTTATGTCTAATAGACATACACACGCGATTAATACGACCCGGTCGATAAAAAGATTGATCATACTTACCCAAGTAAACTTGCTTTCCACAATCCCTATAAATCATCAAGTCCCAGAACAAAAGTTAGGTTTCGATTGATAATTATTAAAATAAATAATAAAACTAATTAATAAAAAGCAATGAAATGAATAAAATAGAAAATAAGTTAAAAATTGAGGAAAGAATATGATTTTTTGTGAATAAATTCTTAAATTTAGTGATGATTATATGTATTTTTTTAAAATTAATAAATTTAAAATGTGTTTTTAAAGGTAATTTTATAAAATAAGTAATATATTTGTAAGAGAAGTATAATGATCTCGGGTACTCACATCTTAAGGATCAGTACACTACTAAAGTTTTTTTTATATTTTCCTCATTGAAAAGTACTGTATTGATTATCAAAAGAAACAAAAATATATTTTTTTTTTATTTGTAACTTAAAATAATTTTATTTTGGTTAGTACCAAATATGAGATTCCCAACGACCGGTGCGACGGTAAAAAGTGACGCCACGATAGTGAGAACTTCGTGACCTTGGTCCTCTTCTGCCCTTCTTCACCATTTGCTGATTACTCCTATGTAACGACGACAGATTCAACCAGTGTCTGTCGTCTCCGGAGAATTCAATATTCCGGCGAGCATCAGCCACAGGGAAAAGACCTTCTGCTTCCTTGAGAGGAACAACATCTCCGTCACGTTTGAGAATCCCGAAGGTGATGAAAGGTTTGTCGGTGGCAGAATCTGTGGATGATGATGAATATAAGGAGAGGTTAGATTCTTCTTCACCGGCAGTTGAGATTAGTGGTACTCTACGATCATGATCTTCTTGATAGTAAGAGAAGGTTCCAAGGTTGAGATCCAACAT
CDS Sequence
- >Bo6g068410
ATGTTGGATCTCAACCTTGGAACCTTCTCTTACTATCAAGAAGATCATGATCGTAGAGTACCACTAATCTCAACTGCCGGTGAAGAAGAATCTAACCTCTCCTTATATTCATCATCATCCACAGATTCTGCCACCGACAAACCTTTCATCACCTTCGGGATTCTCAAACGTGACGGAGATGTTGTTCCTCTCAAGGAAGCAGAAGGTCTTTTCCCTGTGGCTGATGCTCGCCGGAATATTGAATTCTCCGGAGACGACAGACACTGGTTGAATCTGTCGTCGTTACATAGGAGTAATCAGCAAATGGTGAAGAAGGGCAGAAGAGGACCAAGGTCACGAAGTTCTCACTATCGTGGCGTCACTTTTTACCGTCGCACCGGTCGTTGGGAATCTCATATTTGGGATTGTGGAAAGCAAGTTTACTTGGGCGGGTTTGATACTGCCTACGCAGCAGCAAGGGCGTACGACCGAGCTGCTATCAAATTCCGTGGTCACGATGCAGATATCAACTTCGTCGTGGATGATTACAGACAAGACATGGACAAGATGAAGAATTTAGATAAAGTGGAGTTCGTGCAAACACTTAGGCGAGAGAGTGCGAGTTTCGGAAGAGGGAGTTCCAAATACAAAGGCTTAACTCTTCAGAAATGCACACAATTCAAAAACCATCATGATCAGATTCATCTATTCCAAAACAGGGGATGGGATGCAGCAGCAATCAAATACAATGAGCTGGGAAAGGGAGTCATGAAGTTTGGTTCCCATATTAAAGGAAATGCTCACAGCGACCTTGAACTAAGTCTTGGTATTTCATCGTCATCGGGAAATACAAAGTTGACAACATGCAAGTGA
Protein Sequence
- >Bo6g068410
MLDLNLGTFSYYQEDHDRRVPLISTAGEEESNLSLYSSSSTDSATDKPFITFGILKRDGDVVPLKEAEGLFPVADARRNIEFSGDDRHWLNLSSLHRSNQQMVKKGRRGPRSRSSHYRGVTFYRRTGRWESHIWDCGKQVYLGGFDTAYAAARAYDRAAIKFRGHDADINFVVDDYRQDMDKMKNLDKVEFVQTLRRESASFGRGSSKYKGLTLQKCTQFKNHHDQIHLFQNRGWDAAAIKYNELGKGVMKFGSHIKGNAHSDLELSLGISSSSGNTKLTTCK