Information report for Bo4g151270
Gene Details
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Functional Annotation
- Represses photomorphogenesis and induces skotomorphogenesis in the dark. Contains a ring finger zinc-binding motif, a coiled-coil domain, and several WD-40 repeats, similar to G-beta proteins. The C-terminus has homology to TAFII80, a subunit of the TFIID component of the RNA polymerase II of Drosophila. Nuclear localization in the dark and cytoplasmic in the light.
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT2G32950
- Brassica napus: BnaC04G0141600ZS, BnaA05G0112800ZS
- Brassica rapa: Bra005541
- Gossypium hirsutum: Gohir.D11G159400, Gohir.A11G152500
- Juglans regia: Jr01_18280
- Malus domestica: MdCOP1
- Prunus avium: Pav_sc0000108.1_g880.1.mk
- Prunus persica: PRUPE_5G031300
- Solanum lycopersicum: Solyc12g005950.2
- Solanum tuberosum: PGSC0003DMG400013893
Gene Resources
- Pfam: PF00400 PF00097
- UniProt: A0A0D3C1D7
- AlphaFoldDB: A0A0D3C1D7
- InterPro: IPR001841 , IPR013083 , IPR017907 , IPR042755
- PANTHER: PTHR44080 , PTHR44080:SF1
- SUPFAM: SSF57850
- PROSITE: PS00518 , PS50089
- Gene3D: 3.30.40.10
- CDD: cd16504
- eggNOG: KOG0297
- STRING: 109376.A0A0D3C1D7
- HOGENOM: CLU_814698_0_0_1
Sequences
gDNA Sequence
- >Bo4g151270
CAGAAGTCTGATTGCGTGATTTTGAAGTCCGGAAAGCATATATGTAACGTTTCTATCCTCTCCAATTCCGTCGCAAAGCTTGGCCAAGCTTGGGGGTCTTTTATCATTGCAATCAGTTCCTTACAGTCTGTCCCGAACCTTGATATCTGATGAATCTTATAAGTTTTAGATTCATATTTTAGCTTATTATGATCATTTTAGGTTGCATTTAGGTCTTTGTGATGTATTTGCATACTCATTTGCATATCATAGGGGTTGGAATGCTTATTTGGAAGTTTGGGGAGAAATTCAAGGGCTAAGCTGCACACTATGGAAGTCTGGGGTCAAATATGAAGTTATCCAAAGTTCAGGGACCAAGGTTGCAGTTTCAGAATATTCCCTTGGGTTAGATTGCACAATCAAAAGCTTTGGGGTTGACTCGGGTGGACCTTTCTGCACATTTGATAGTTTTGGGGTCGAAAAGTTAAATATCCAAAAGTCTAAGGGCCAGATGTGCAAAAAGGGCAAAAATCACCATTGGAGCTCTCAAGCTTCACGATCTGAAGATGTCCACGACGATGGAGCTCGGCGAGGAGTGAATTGACGACGAGGATGACTCCGACGAGGTATTCCGGCGGCGCAGCCTCGGGATTGGTTGAAGATCGCTCCTGAGCTCGAGGTTCATCAATGGCTGTTGAGAAAGCTTGGTCACGGTGAGGTTCGTAGCCGAGACAGACGCGACGACCATGGCAGAGGAGCTGTCGAGCTTCTCGATCTGAAGCTCAGCCTCGACAGAGTTGCAGAGGGCGAGTCCGGTGCTGCTGGCTGGAGCACAAACTGAACCACCACCACGAGCTTGGCCAAGACGAAGAAGTGCCACGGCGGCTAGGTGAGGGCTGTTGCTTGGCCGCTCGCTCTATATCACCTCCCTGTTTGATATCGACATGATACAGCGGTCAAAGGTAACCGCTGCGAGCTTGGTAGCGGCTTGCTGGAGCGGGAGAAAGAACCCGCTCGCGGTCGAGATTTTGAGCTGTTGACCGGTTTAATCCGGTTTGACCCGGTTTAATTCAACTAAACCAGGACGAGTTTAGACCTCTTATAAATAGTTTTAGCTTCCAAAACCCTAGTTTTATCTCATTTTTCTCTTAAGACTTTGTCTAAACTTGTAAAAGCTTGAATCTTTCTATAATCTAAGGAACTACTTCATCTTATAATAATTGTGTTTCTCTTGCTCATTAACATGATTAGCATTGATCCTTACATGAGTTTAAAGTTTCTCATGGAGATTATTGAGTAGACATATTTTGGATTCATGGGTTAAGGTAGATTAGGGTGATTAAGCTAGATCTAAGGTGTTTTAGTATAGATCCATCTTGTTCCTTGCTAGTAGAGTGCTTTTAATGCAACTCTAGAGTTGGCCTCTCTAAAGTTGAGCTCTAGGCATTTCATACCCGGAAGGTGTTTGATGAAATGCCTGAACCAACTCTCCTAAGTTTTTAACATTCTTTACCAAAGGAATTTGTTGTTAAAGGTGTTAAGATGGCTAGTAGACTTGAGATTAATGATTACTTAGATAACATTCAACCAAAGGAATTTGATGCTTGAGTTATCTAGGTAAATGAGCATTCATCTAGGGATAGAGTTTGTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAGGTGCATTGGCTCAACCTTTTGATATTTATGATTAGAAAGCACACAATGTCAAGCTAGAGACTTAAAACAAGCTCACTTGGGAGGAAATCCCATGTTTATCCATTGTATATATATATTTTTTTTATCTTCTCTTTTTAGGTTATTTAATAAGCATGGTTGAGGTTTTTCAGGCCAAGTCTTACTTGCCTTGGCTGATGTGAAGCATTGTGAATTTAGACACCTTCTTTCACTTCTCCGCTTCAGCCCATGTCTACAAGTGAAATAAATCTGAGGCCAAGGGTCCTCTACCACCCAATTCAGCCAATAACTCCAAGTAAGTGTCACTCCAACCTTGTAAATATTTAGTTTTTATGTTTATTTCTTTCCCTTAGATCTCTTCTTTGAGCTTACTCTCACACAAGGGACTATGTGAAGTAAGTTTGGGGGGGAGTCTACTATCTTACATCATTTTATCCCTTAGATCTCTTCTTTGAGCTTACTCTCACACAAGGGACTATGTGAAGTAAGTTTGGGGGGGAGTCTACTATCTCACATCATTTTATGTTTTGTTTACTTGTCATGAGTCTTATGCATTGCATTGTGAATACTTATTTGCATATAAAATCCATAAAATTTTGATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAACTTTTAGACAGAGAATTGGTTTTACTCCAAATAATTAATCTGAATAAACCAACTAAAAGAGGAAGAGTGAAATACAAAGGCTTGTCAAGAACCGACCCGTTGTAATGCGTCCCGAAACTGATCCAAAGGCGATGCCGTTTTCGACACATGCCGAGCTGAAGTTTTCTTCAACAGCTACACAGACAGTACAAAGTAAGTCATACAATAAGCTGCACATTTCACACATAGATAGTTTCAATCTACAACAGTTTATTTCGATATTCAAGAAATTGCTAGCAGGGCTTTCTAGAGGATTATTGTTTAGGCGGACGCATAAATTTAAAAAAATCATTCTAGAATAATTGTTTTACTTAGACCCGATTTGACGACTAGACGAAGCCTATACGGATTTTTAGAACATTAGATTCTTTAACCAAGTTTCTGTTACAAGTTCAACAAAACAACACTTCTATGAGTCTAGGCAAGATTAGAAAGAGAGACCTTATCGAGTAAGAAATTAGGGTAAAGCTGCTTATTTGTGAGGTGCTGGCTACAACAGGGACAATCGCTCTTGTTCTTAAGGTGCGTGATGATGCACATGTAGCAGAAGCTGTGTCCACACGCCGTGAGGAAAGCGTCCTTTATAACCTGCATACAAATCGGACAGAGCAAGTCCTTATCCAGATCCGGAGCTCCAATCTCCAAACCACCGCTTCCTCCTTCGTCGTTTTCGTGGCGGCGGTTGGGGCCTTCTCCGATGGAGGAGGTTCTCGGATCGGGTTTCACAGCCGGAACTAGCGGATCCTTCCTAATCTCTTCCATAATTCGTTTCCTTTTTGCTCTCAATTTTTTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN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CDS Sequence
- >Bo4g151270
ATGTGGATGGGTATGGATGGACAGTGCTGGAAACATTCAACTTATGGGGACAAAAAAATTTTCGCAATGCGAATCAGCTTTACATTCGGAAGTAGAAGCACTGCGATGGGCGATGGAGAACATGCTTCAACATTCAACATGTCAGAGGATCCGCTAGTTCCGGCTGTGAAACCCGATCCGAGAACCTCCTCCATCGGAGAAGGCCCCAACCGCCGCCACGAAAACGACGAAGGAGGAAGCGGTGGTTTGGAGATTGGAGCTCCGGATCTGGATAAGGACTTGCTCTGTCCGATTTGTATGCAGGTTATAAAGGACGCTTTCCTCACGGCGTGTGGACACAGCTTCTGCTACATGTGCATCATCACGCACCTTAAGAACAAGAGCGATTGTCCCTGTTGTAGCCAGCACCTCACAAATAAGCAGCTTTACCCTAATTTCTTACTCGATAAGCTGTTGAAGAAAACTTCAGCTCGGCATGTGTCGAAAACGGCATCGCCTTTGGATCAGTTTCGGGACGCATTACAACGGAGCGAGCGGCCAAGCAACAGCCCTCACCTAGCCGCCGTGGCACTTCTTCGTCTTGGCCAAGCTCGTGGTGGTGGTTCAGTTTGTGCTCCAGCCAGCAGCACCGGACTCGCCCTCTGCAACTCTGTCGAGGCTGAGCTTCAGATCGAGAAGCTCGACAGCTCCTCTGCCATGGTCGTCGCGTCTGTCTCGGCTACGAACCTCACCGTGACCAAGCTTTCTCAACAGCCATTGATGAACCTCGAGCTCAGGAGCGATCTTCAACCAATCCCGAGGCTGCGCCGCCGGAATACCTCGTCGGAGTCATCCTCGTCGTCAATTCACTCCTCGCCGAGCTCCATCGTCGTGGACATCTTCAGATCGTTCGGGACAGACTGTAAGGAACTGATTGCAATGATAAAAGACCCCCAAGCTTGGCCAAGCTTTGCGACGGAATTGGAGAGGATAGAAACGTTACATATATGCTTTCCGGACTTCAAAATCACGCAATCAGACTTCTGA
Protein Sequence
- >Bo4g151270
MWMGMDGQCWKHSTYGDKKIFAMRISFTFGSRSTAMGDGEHASTFNMSEDPLVPAVKPDPRTSSIGEGPNRRHENDEGGSGGLEIGAPDLDKDLLCPICMQVIKDAFLTACGHSFCYMCIITHLKNKSDCPCCSQHLTNKQLYPNFLLDKLLKKTSARHVSKTASPLDQFRDALQRSERPSNSPHLAAVALLRLGQARGGGSVCAPASSTGLALCNSVEAELQIEKLDSSSAMVVASVSATNLTVTKLSQQPLMNLELRSDLQPIPRLRRRNTSSESSSSSIHSSPSSIVVDIFRSFGTDCKELIAMIKDPQAWPSFATELERIETLHICFPDFKITQSDF