Information report for Bo4g149800
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a nuclear protein that acts as a floral repressor and that functions within the thermosensory pathway. SVP represses FT expression via direct binding to the vCArG III motif in the FT promoter.
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT2G22540.1
- Brassica napus: BnaC04G0438900ZS, GSBRNA2T00149752001, BnaA04G0147200ZS, GSBRNA2T00078179001, GSBRNA2T00127429001
- Brassica rapa: XP_009140365.1, Bra030228, XP_009112514.1, Bra038511
- Raphanus raphanistrum: RrC7998_p1
Gene Resources
- Pfam: PF01486 PF00319
- UniProt: A0A0D3C189
- RefSeq: XP_013631060.1
- AlphaFoldDB: A0A0D3C189
- KEGG: boe:106336690
- OMA: RYSAHAN
- InterPro: IPR002100 , IPR002487 , IPR033896 , IPR036879 , IPR050142
- PANTHER: PTHR48019
- SUPFAM: SSF55455
- PROSITE: PS00350 , PS50066 , PS51297
- Gene3D: 3.40.1810.10
- OrthoDB: A0A0D3C189
- SMR: A0A0D3C189
- CDD: cd00265
- eggNOG: KOG0014
- STRING: 109376.A0A0D3C189
- HOGENOM: CLU_053053_14_1_1
Sequences
gDNA Sequence
- >Bo4g149800
TGGCGAGAGAGAAGATTCAGATCAGGAAAATCGACAACGCGACGGCGAGACAAGTAACTTTCTCTAAACGAAGAAGAGGTCTTTTCAAAAAAGCTGAAGAGCTCTCCGTTCTCTGCGACGCTGATGTTGCCCTCATCGTCTTCTCTTCCACCGGAAAGCTCTTCGAGTTTTGTAGCTCCAGGTCTCTCTCTCTCTCTCTACCTTGTGTCTCTCTCGTTCTCTTTAGATTTCTCAAAACCTCTAAAGAATCGTCTCTAGATCCAGAATAAGCTTAGTTCTTACATGTGTATGTCATACACAAAAGTTTACTGTATCAAACCCGTATTGGACCACTAACTTTTTTATATAAGAATACCAAAAATGCATAAATAGTACCATGGTAAACTCTTTATTTAGGCAAATAAGCTTATCTACGTACAGTAATATTCAAGATAATGCAAATGTTTTAGTCATTTAATATAATACTCTATATTTTTTTGTATAATTATGTATATATATTTATTGTGGTTGATATATGGAAAGCCATCAATGTCATATTTATTTATAAATATGTGGTGACTATATGTTTATATAGATGTTGGGAATCTAAAACCACTTATCATAAAGATATGATTTTGGATTTCTGACCCACGAGTTATCAGTTCAGTTCCTATCTTCGGGACATCTATACATACACGCTGACATATAAGTATATAGATAGATGTTAATTATTAAAAACGACAGTGTTTAACATGAAATACTGTCTGTTTGAGAATTATATTGTTTTGTGAATTTAGATTGTGTCTTTTGATTTCACATTTTGGGTACATTGTTGCTATTTTTTATATCTAAGTACAAGGACATATCAATAATGTTGATGTTTATAACATAATGGTATATCATTTATAGTCTTATATAGTAAGGTACTTATTGGAATGTGTTTTCATTATATAATGAAGCATGAGGGAAGTATTAGAGAGGCATAATTTGCAGTCAAAGAACTTGGAGAAGCTTGATCAGCCATCTCTTGAGTTACAGGTTAGCTTTGCTATTCTCTAGCTTATAAAATCTATTCCGTTATATTACCATTTTTAATTAATGTATCCTCATGTACATAAATTTTATCAAGAAACTTTAAAACATTATACTAATAGGACCCAAGCATTATATTGATTGTATGCGATTACATTATATTTTGACTATATGCGATCCAAACAAACTAAGAGTGTTTAAAAGACTTTGTTTGTGATTCTCTGTATAATCAGTTTGGTTTAAAACCTTTTTTACATGAATGGTTGCGCGCTCTCTAAGGCTAGCTAGACATGTAGAATTAGTCAATGTGTATAGATTAACATGAATGGGTTTGCTTAAGTTCTTAAGTCAATGTTTTACTTGTTAGCTGGTTGAGAACAGTGAAAATTCCCGGTTGAGCAAAGAAATTGCAGACAAGAGCCACCAACTAAGGTACACTACATATGCATATTCTACAAAAAAACGTTACCAACTATCATATTTCTAAGTACATGTTTATATATAATTAAATATAGGCAAATGAGAGGAGAGGAACTTCAAGGACTTAGCATAGAAGAGCTGCAACAGCTGGAAAAGGCCCTTGAAGCTGGTTTGACGCGCGTGATTGAAACAAAGGTTGTTCTCACTTATGACTTATTGATGTTAAAAGTAGTAAATCGTATGATACAATGTATATCATTCTCGAAGCTTACGAATGCGAGATGTTGTTTGCAGAGTGAGAAGATTATGAGTGAGATCAGTGACCTTCAAAGAAAGGTAAAATATCGAAAAGAGGTTTATTACTTATTGATTCAAATGATTTTGGCAATTTTGAGAGTTCAAATCTCGCTTTTTGGTGTTTAGGGAATGAAATTGATGGATGAGAACAAGCGGCTAAGGCAGCATGTACACATCTTATCCTTTCTCCTATAACACATATCTTTGATCATACTTTGACATAAACGGTTAAACCAAGTGGTTAGCATGGTTAAATAGTGTCTTATCTCTATGGAAAATTAATATAGTTAGTTAGCCTTAATGTAAAACTTTTGGACATTCATCCAGTAAAAAAATATAAATTCATCTGTGGACACTTGGTCCAAGATGTAGAGTGTGCATTGTTTTGTTTCAACTTGAGGTTAATATATATATTTTCCTTTTTTTTTCTTTTATGTTTTTCAATCTTGATTTTGCAGGGAACACAACTAACAGACGAGAACGAGCGACTAGGCAAGCAAGTAAGTCGGTATTATTTCAAGTTTAATGCTAAATTTGGAACTTTTGTTTAATGCTAAATTTGGAACTTTTGTTTGTGTTATGGTGAAGATATATAATAATATGCATGAAAGATACGGTGGTGTTGAGTCGGAGAAGACCGCCGTGTACGAGGAAGGGCACTCGTCAGAGTCCATTACTAACGCCGGAAACTCCACCGGCGCTCCTGTTGACTCCGAGAGCTCCGATACCTCTCTAAGGCTCGGGTAATTCATTATTTTTCACCATGGCTTAATTTTGGTTATTTTCCTGATTTAATAAGTTGACATGATTTTTGTTTGTAAAACTAATATTATCTAAAAAAGAAAAGAAGAGTATATGGCCTAAAAAATCACATGTTAATCATTTCTTCGTAAAATGATAAAAGGATTGAAAATAAGTTGACATAATTTCGTCTATGTTTTTAACAATGATCTTGCTATTTTATCTTACGGCCCCTATTATATATGATATGCAGCAACGACAAAAAAAAAATGATATGCAACATTTTATTTAAATCCAACGTGAAAAATAGACCACTAATTTACGTTTGTTTTGCATATGTTAGTATGAAAATAAATATATAATTTAATGTTTGGTTTCTTGCAGCTTACCGTATGGCGGTTAG
CDS Sequence
- >Bo4g149800
ATGGCGAGAGAGAAGATTCAGATCAGGAAAATCGACAACGCGACGGCGAGACAAGTAACTTTCTCTAAACGAAGAAGAGGTCTTTTCAAAAAAGCTGAAGAGCTCTCCGTTCTCTGCGACGCTGATGTTGCCCTCATCGTCTTCTCTTCCACCGGAAAGCTCTTCGAGTTTTGTAGCTCCAGCATGAGGGAAGTATTAGAGAGGCATAATTTGCAGTCAAAGAACTTGGAGAAGCTTGATCAGCCATCTCTTGAGTTACAGCTGGTTGAGAACAGTGAAAATTCCCGGTTGAGCAAAGAAATTGCAGACAAGAGCCACCAACTAAGGCAAATGAGAGGAGAGGAACTTCAAGGACTTAGCATAGAAGAGCTGCAACAGCTGGAAAAGGCCCTTGAAGCTGGTTTGACGCGCGTGATTGAAACAAAGAGTGAGAAGATTATGAGTGAGATCAGTGACCTTCAAAGAAAGGGAATGAAATTGATGGATGAGAACAAGCGGCTAAGGCAGCATGGAACACAACTAACAGACGAGAACGAGCGACTAGGCAAGCAAATATATAATAATATGCATGAAAGATACGGTGGTGTTGAGTCGGAGAAGACCGCCGTGTACGAGGAAGGGCACTCGTCAGAGTCCATTACTAACGCCGGAAACTCCACCGGCGCTCCTGTTGACTCCGAGAGCTCCGATACCTCTCTAAGGCTCGGCTTACCGTATGGCGGTTAG
Protein Sequence
- >Bo4g149800
MAREKIQIRKIDNATARQVTFSKRRRGLFKKAEELSVLCDADVALIVFSSTGKLFEFCSSSMREVLERHNLQSKNLEKLDQPSLELQLVENSENSRLSKEIADKSHQLRQMRGEELQGLSIEELQQLEKALEAGLTRVIETKSEKIMSEISDLQRKGMKLMDENKRLRQHGTQLTDENERLGKQIYNNMHERYGGVESEKTAVYEEGHSSESITNAGNSTGAPVDSESSDTSLRLGLPYGG