Information report for Bo4g108070
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a novel Myc-related bHLH transcription factor, which physically associated with APRR1/TOC1 and is a member of PIF3 transcription factor family. Involved in shade avoidance. Functions as negative regulator of PhyB. Protein levels are modulated by phytochrome B.
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT3G59060.1, AT3G59060.4, AT3G59060.3, AT3G59060.2
- Brassica napus: GSBRNA2T00110371001, GSBRNA2T00064456001, BnaC04G0288000ZS, BnaA09G0539200ZS, GSBRNA2T00121872001
- Brassica rapa: Bra007430, XP_009116576.1
- Raphanus raphanistrum: RrC975_p2
Gene Resources
- Pfam: PF00010
- UniProt: A0A0D3BWY9
- AlphaFoldDB: A0A0D3BWY9
- InterPro: IPR011598 , IPR036638 , IPR044273 , IPR047265
- PANTHER: PTHR46807 , PTHR46807:SF7
- SUPFAM: SSF47459
- PROSITE: PS50888
- Gene3D: 4.10.280.10
- CDD: cd11445
- eggNOG: ENOG502QTIX
- STRING: 109376.A0A0D3BWY9
- HOGENOM: CLU_599023_0_0_1
Sequences
gDNA Sequence
- >Bo4g108070
TGGGCTTTCAATTGGATCTTCTAATACCACCTTATCCCGAGAAGCCACAAACGATAGAAGATACTATTAAACATGAGGCTCAAGCTATGGCTCCTCCTAAGTTTAGGTCCTCGGTTGTAACCGTTGGAACAAGCCATTGTGGGAGCAACCAGTCTACAAATGATCATCAGGTGACACATCCTCAGTTTCCTATGAGTGATAGAAGCAAGAACGTCGAACAAAGACTTGACACTTCGTCTGGTGGCTCGTCCGGTTGCAGCAAAGAAAATGAGAGTGGAAGAAGCGTAACCATTAGCCGTAAAAGAAAACATGTAATGGACACTGATCAAGAATCTGTGTCTCAATCTGATGTTCGTCTTATGTCAACCGATGATCAAATTATGGGTAACAACAAATCCAGCCAACGGTCAGGATCTACCAGAAGAAGTCGTGCAGCTGAAGTTCATAATCTCTCAGAAAGGGTACGTTCTTGTCCATTACATATTAATTATTATGTGTTACGTGAACTTGCTAGTTAAAGTTATAAAAATTTTGCTATTTTTCTGATAATGGTTTATTACAGAAGAGGAGAGATCGGATCAATGAGAGAATGAAAGCTCTTCAAGAACTTATACCTCATTGCAATAGAGTAAGTTCCATTTAAGACAAAACAAGATTAAAAAAACTGGAGTGAGTTTAGTTGGGAAATTTGGGATTCTATTTCTGTCTATGTATTTGATTAGTTATATGTATTTAATCTTGTAGACTGATAAAGCGTCGATTTTGGATGAAGCCATAGACTACTTGAAATCACTTCAAATGCAACTCCAAGTGATGTGCATGGGAAGGGGAATGGCAGCAGCAGCAGCGACTCCGATGATGTTTCCAGGTGTACAATCATCTCAGTACATTAATCAAATGGCTATGCAGAGTCAGATGCAACAGCCACAATTTCCGGTTATGAACCGGTCTGTTGCACAGAGTCATCCCTGTTTAGCATGTCAAAACCCGGTTATGCAGCTGCAGATGTAAGCACAGAACCATATCTTATCTGAGCAGCTTTCGAGGTACAGGGGTGGCTTTCCACCGATGCCCGCGACTACTCAGGTTAGTGAACACGTCATCGTTTTGATTTTATTTTTTTTAAATAAAATTGATTGATATTTGACATGTCATGTTTACATTAAATGTAGGTGCAACAACAACCTATGGAAGAAACTCAAATCATTAAAAAATGATACTGGCTCCTAAGATTGTATCATTTAGTTACTTGCCTGATGTTAGAAACTACTGAAACAGCTCTTTTGTTTTTGTTTTTTCAGATTTTGTTGTGTGGTTCTGTGAGTGACCAGGCCGTTTGCTTGTGTTAGCTGATTCCTCTGTGGCCTCGACTATCTCCATACTCGCTGTTCTACTCTTTCTGTTCCTCCGCTCCTACAGAAACAAAACACATCTTTACTGATATAGTGATATGGGTTGCTCAAGATTTGGACCATTGCTAGTTAAAACTTAAACAGTAATAAAGTTTTAAATAAACCCAGTGAATCTAAGTATTATGCATACCTCGCCAAAAGGGTTGTCATCCGATTCATGCACCAAATTAACAAACACATTCATTACTCTTGGATACAAATGACAAAGCAGACGTGATTAGGCTACCTCATTAGCTGGACGTTCATAGTCAACTGGATCTCTTCCAGTTATAGCTTCCAGAAGCAGGACACCAAAGCTATAGATGTCACACTCATCTCATTTAAAAGACTTGTATTAGCATATTCGGGTGTTACATACCTGATACACATACGCACATGACCTTATCACAAGGATATCAAACAGATACCAAAACGATACCATCATCACTAAAGCAGATACAGATCTTTAACTTACCCAAATGTGCCCATGACCAGGGGCGAAGCTAGACTTCTTTTTGACTGGGTGCAAAATAGTTTATAAAAAGGTAACCCATGACTATCATCATCAATCTTGATATTGCTTGCTTTTATGTCTGTAGACTACTTTTGGTTCTATAGCTTCATGTAAATAAGTAAGCCTGTTGAATTGTGGTGCAGGCCATGTTATTATCCACTTCAAGAGCTAAAGCTAGAACTTCAAGCAAAAGTATACATCTTAACCACTTACGCTTGTGCAATGCCTCCCAGGTGAGAGTGTTGTGTTTCCCCATGTCTCCATGTAACCATTGTTCTAAGTTACCACTGTTCATATACTCATAAACAAGAATCATGCATACATCGCCTAATCAACCATGCATACTCACCCTTTCACACGTATTTTTTTTTTAATTCATGAACGGAGCACCTTTTCAGATTCTTCTTTTTTCATATTTGAACAACACACCTTTTTAATTAATTGATACAGTGAAGTGTTTGGTTATCTTTAATTCTTCTGACACACCAGCATCATTTAAAGCTAACGAGTACTCTCTATTCACTGTTTGGTTATCTTTAATTCTTCTGACACACCAGCATCATTTAAAGCTAACGAGTACTCTCTATTTTCTGAAAGTAGATTTTCTAAATTTATTTTTTTGTTCCAAAATGATAGATTTTCTAAAATTTTAAAGTACTTTTATTAGTTAATGTTGAAAAATGATATACTTTTAAGAAACATTAATTGAAAATATTTAATTTGGTTGAATACTATTGGTTGATATTTATTGGAAAATGTATAGTAAAATAAATAATAAAATTAATTGTTTTTTTAATATGCGTGAATACTCTAGAAAATCCTTGTTTCGGGAACAGAGGGAGTGTATTTTTAGAAGAAAAAAAACATATTCGTAGACGAAAAGATAACCTTTTTAAAAACTGATGCAATTTTTATGATGAAAATATGAAAAGTCATCTTTAGACATTTTGTCAAACTCTTAAAAATCAGTGCAACTTCTTAATAAAAAGACACATCTTTAAACATTTGTTTAGATAGTGATATATGGTGTCTTTGGCATCTTGTATATATGTTTTCTAATTGGTTTTCAAGTTTTTATCGAGTCTTCCTAGTCCTTTTCGAGTCATTACAGGTCTGGAGTTTCATTGGATGAGAGATGTACCAGCCGGAACAAAAGAGGCAGAAAACAGTGCAATTTGGTGATTTTCACGCAGAACAGTCGAGCGGAGCAACCCGAAGTGTCTGTTCCAGCGGCAGAGATTTTTAAGGAAGTTTCCAAATATTTCGGGATTTTACCTAGGACTTACCCCTTTTCCTCCTTGGCCATTAGAGACCTGCATATATATCTTTTCTTATTTTTTTACTATCATTCGACGCTAGTTTTTACACAAGAAACCATTGGAGACTTTTGTATTTGAAGATTTGCTACTTTGAAAGGGAGAAGGCTTCATCTCTCTCATCTTGAGAAGATTCCTGAATTCTATTTTATTTATTTATTGATTCAGCATGTTTTCTTCATATATTGTCTCTGTGATTTCTCTGTTCATGGATGAGTAGTCGCTTGTTAGGTTTAGGGTGTTAGGGATCATGGATCAATGAGCTAGACACAAATAGGATTGGTATTCCTTTGATATCTCTGTCTATTGCTAATCTTAATGCTTGTGTTAAACTTGCCATTTATCATCTGATCATAGGTTTAATCTAATCATCAAAAGTGTTTTAGATTGCTAGAAAAAGTATAGATAAGCGATTTGTCCTTAGCCAACGAAAGCCGATGTTAAGGCAAATCGTGAACCAATTGAATCCAAACTTAATGCTTGTCATCATTCTCTAATCCAAACGACAGTTTAGGCGTTAGGATTGCTCGATAAATTGGTAGACACCGCGACAGTGGATTTATCTATTCTTGTTGTTCAAGTTCTAGATTGGCTCTTATTGCCTTCATGAATAGTTGTGTGGCTTATGGTCCTAAGTATCCCAATAAATCACCCTGAACTTAGCTCTATTAATCATCTGAAAACCTTTAATTAATCTTGTTACTTGCGTGTCACGAAACCCTCAAATCTTAAAACACCCATATTGTTTTAGCTTGATATTGATCCCATAGAAATAAAGTGTAATCGTTGGTCTCTGTGAATTCGATGCTAAAGTGCTACATCGACATACCATTCGATTGTGGTAGTGTGCGTATACACGTAATACCAATTTGGCGCCGTTGCCGGGTACCATCTTTTTACCTTTATTTTTCGGTTATTTATTTAGTCTAATACCTCTAACTTGCTCTATCCTTTTTGTTGCAGCTAATTTTTTAGGTGCATGACCAGTAGACATACTCGGATAAACGCACAAGGAGAGTTACATTTAACGACCATGAGCTAGCAAGGTTAGAAAGAACAAACTGTCAACAATCAGGGCCGAACAACGCCATAATGGGCGACTATGGCAATCAAGAGCAACTCACTGCTCAGTTGCAACATATGCAACAACAGATGATTCAAATGCAGCAGACCATCCAAGCTCAACAGGATGCTGCTGAACAGGCTGCTCTCGCGCGGCATGAACAACAGGCGCAGACTGCTTCGATTGGGGAGATAAACCTTCTGCGTAACATCCCTACTGCACGCTCTGCCATTGTTCCTCCCTCTGCCTCAGACAGGACTTCGAGATCAAGCTTTCTTTGA
CDS Sequence
- >Bo4g108070
ATGGGCTTTCAATTGGATCTTCTAATACCACCTTATCCCGAGAAGCCACAAACGATAGAAGATACTATTAAACATGAGGCTCAAGCTATGGCTCCTCCTAAGTTTAGGTCCTCGGTTGTAACCGTTGGAACAAGCCATTGTGGGAGCAACCAGTCTACAAATGATCATCAGGTGACACATCCTCAGTTTCCTATGAGTGATAGAAGCAAGAACGTCGAACAAAGACTTGACACTTCGTCTGGTGGCTCGTCCGGTTGCAGCAAAGAAAATGAGAGTGGAAGAAGCGTAACCATTAGCCGTAAAAGAAAACATGTAATGGACACTGATCAAGAATCTGTGTCTCAATCTGATGTTCGTCTTATGTCAACCGATGATCAAATTATGGGTAACAACAAATCCAGCCAACGGTCAGGATCTACCAGAAGAAGTCGTGCAGCTGAAGTTCATAATCTCTCAGAAAGGAAGAGGAGAGATCGGATCAATGAGAGAATGAAAGCTCTTCAAGAACTTATACCTCATTGCAATAGAACTGATAAAGCGTCGATTTTGGATGAAGCCATAGACTACTTGAAATCACTTCAAATGCAACTCCAAGTGATGTGCATGGGAAGGGGAATGGCAGCAGCAGCAGCGACTCCGATGATGTTTCCAGGTGTACAATCATCTCAGTACATTAATCAAATGGCTATGCAGAGTCAGATGCAACAGCCACAATTTCCGGTTATGAACCGGTCTGTTGCACAGAGTCATCCCTGTTTAGCATGTCAAAACCCGGTTATGCAGCTGCAGATGCCATGTTATTATCCACTTCAAGAGCTAAAGCTAGAACTTCAAGCAAAAGTATACATCTTAACCACTTACGCTTGTGCAATGCCTCCCAGGTCTGGAGTTTCATTGGATGAGAGATGTACCAGCCGGAACAAAAGAGGCAGAAAACAGTGCAATTTGGTGATTTTCACGCAGAACAGTCGAGCGGAGCAACCCGAAGTGTCTGTTCCAGCGGCAGAGATTTTTAAGGAAACATACTCGGATAAACGCACAAGGAGAGTTACATTTAACGACCATGAGCTAGCAAGGTTAGAAAGAACAAACTGTCAACAATCAGGGCCGAACAACGCCATAATGGGCGACTATGGCAATCAAGAGCAACTCACTGCTCAGTTGCAACATATGCAACAACAGATGATTCAAATGCAGCAGACCATCCAAGCTCAACAGGATGCTGCTGAACAGGCTGCTCTCGCGCGGCATGAACAACAGGCGCAGACTGCTTCGATTGGGGAGATAAACCTTCTGCGTAACATCCCTACTGCACGCTCTGCCATTGTTCCTCCCTCTGCCTCAGACAGGACTTCGAGATCAAGCTTTCTTTGA
Protein Sequence
- >Bo4g108070
MGFQLDLLIPPYPEKPQTIEDTIKHEAQAMAPPKFRSSVVTVGTSHCGSNQSTNDHQVTHPQFPMSDRSKNVEQRLDTSSGGSSGCSKENESGRSVTISRKRKHVMDTDQESVSQSDVRLMSTDDQIMGNNKSSQRSGSTRRSRAAEVHNLSERKRRDRINERMKALQELIPHCNRTDKASILDEAIDYLKSLQMQLQVMCMGRGMAAAAATPMMFPGVQSSQYINQMAMQSQMQQPQFPVMNRSVAQSHPCLACQNPVMQLQMPCYYPLQELKLELQAKVYILTTYACAMPPRSGVSLDERCTSRNKRGRKQCNLVIFTQNSRAEQPEVSVPAAEIFKETYSDKRTRRVTFNDHELARLERTNCQQSGPNNAIMGDYGNQEQLTAQLQHMQQQMIQMQQTIQAQQDAAEQAALARHEQQAQTASIGEINLLRNIPTARSAIVPPSASDRTSRSSFL