Information report for Bo4g102530
Gene Details
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Functional Annotation
- Sequence suggests this encodes a MADS-box transcription factor. Negatively regulates the FLC/MAF clade genes and positively regulates FT in Arabidopsis.
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT2G45650.1
- Brassica napus: GSBRNA2T00074919001, GSBRNA2T00149230001, BnaA04G0012300ZS, BnaC04G0060300ZS
- Brassica rapa: XP_009138791.1, XP_009138792.1, XP_009138793.1, XP_009143157.1
- Raphanus raphanistrum: RrC4693_p4
Gene Resources
- Pfam: PF01486 PF00319
- UniProt: A0A0D3BWI1
- AlphaFoldDB: A0A0D3BWI1
- OMA: ERYYRCK
- InterPro: IPR002100 , IPR002487 , IPR033896 , IPR036879 , IPR050142
- PANTHER: PTHR48019
- SUPFAM: SSF55455
- PROSITE: PS00350 , PS50066 , PS51297
- Gene3D: 3.40.1810.10
- CDD: cd00265
- eggNOG: KOG0014
- STRING: 109376.A0A0D3BWI1
- HOGENOM: CLU_053053_0_4_1
Sequences
gDNA Sequence
- >Bo4g102530
TGGCAAGAGGGAGAGTGGAAGTGAAAAGAATAGAGAACAAGGTCAATAGACAAGTAACCTTCTCCAAAAGAAAAGGTGGTTTGCTCAAGAAAGCCTACGAACTCTCTGTTCTATGTGATGTCGAGGTTGCTCTTATCATCTTCTCCAGCAGTAGCAAGCTCTATGAGTTCAGCAGTGATGCGTATGTAAATATATACCCATTTTAATCATCAAAATGCTTAATTAAGGTTCTTATAAGAAAATAAATGTATTTTTTTCAAAAGATTCAGTGGTCAACTAAGATAAGCTAGGTTTGACTTGTGTCCGTTTTTTCAGATTCAAGAAAACCAAAGTTGTGTGTTTTAAGTATTTTAAGAGGTTGTGTCTTTTTTCTCTCAAATCCTAACCAGTTAAGTTTCATCACGTTTCGACCTCTCGAATCCATGAGACGCATGGGTCAGCTTTAGCTTTTAGATCCGACAAATCTTTAAGATCAGAATTTAATTGATTGATTATCGGCTAAAACGTTTTTATCATCAGCTTCTTCTTTTTTGATATGAGTATGTCCTTAAGATTTCAAGAAAACCATAAGTTTTGCCTTTTAAAATGGTTGTATCTTTCTAATTCTAATTAGAGATAGTAGTTAGGGTTCATCATACATCGATCTCATAGACTCATTACGCAAATATATGCAATAAATGACAGATCCATTAAGTTTTGTGTAATTAGGGTTTGCTTTAGACATTTAGATCAACTAATCTCTTGTGATTTCTTTTGTTTAATAATCTGTAGAATGGAGAAGACAATTGAAAGGTACAGTCGCTGTAACAACAACATTTTGGACAATAATAGACCTGAAGAGTCTACACAGGTCAATTTTTCTTTTTCCAAGTCTTCACATCCCAAGTTAATGTTATATACAAAAAAAAAGCAATTATAATTAATGAGCTAAGATAGAATTTAATTGATCTTTATTAATTCTTTGGTGCAGAGGTGGTCTCAAGAGGTGACAAAGCTCAGATCCAAATATGAATCTCTTCTTCGCACTCATAGGTTTAGTTAATCATATCCCTTTTATATCATTATTACATATAACTGTACATCTCCTAGCTAGTTTCCACAATTAAGCAATATTTTGAATCGTTGGAATAAAAAGGTATTTGCTTGGGGAAGATCTTGGAGAGATGAGTGTCAAAGAATTGGAGACGCTCGAGAGACAGCTTGAAGGAGCTCTCTCGGCGACCAGGCAACGCAAGGTATAACATTTTGTATACATCGACAAATCTTATTTAGTTGTAATCATTTCTAAATTAAGATATATATATAAAATCAAATTGTTTAGCAAAAAAAAGATATAGAAAAAATTGTATAAAGATCCCTTTTGAGAAACATTGCAACATTTTTTTGTAGCCACGTATCATCATGAGAATGAAACTCAGAATTCTTAGAAAATAGGTTGGTCCATCTTAACATATATTATAACTAACTATCAAATAGATTATTAGTATACAAAAGTATATTCTCGCACTTTCCTTAAATAAAAACTGTGAAATTACCTAATATGATTAACATATATATGACAATTAATGATTATGAATAATAAATAAATATATGATAACAATTTTTGTATCTTACCTCTTTTTTTTTAAGTTTATATTATTAAAATATATTAAACAATCACATTAACCATATAATAAAAAAAAATTAAAATTTTTCTTATATATTATATTTTGAATTTTTAAAATGACTATAAATTACTAAAAATATTAAATGTCTCACACTAAAATTTTTTGATCAATAGTTTAATTTTTTTTTGTAATAACAAAATACAAATGTTCATAAAATCGTATGAATATGAAGTCTCATTTAATAGACATTCATATTATATATTAATATAGTTTAAATATAACATATAAAAATATATAAATATGTTTATTTCAAAAAATTTATTGAAAAAGTATTGAAACCTTAATATTTTAATTTTGAAATTTGCATTGAAAAATTAGAAATTTTGTATTTATCATATGAGTACGAATTCTCAATAATAAATATTTATATTAAATTAGATCATATATCTATGTTCATATCATTGAAATTTAGTTATATACCATATAAAATAAATAAAATGATTGTTTTGATTTATTTACCAAAAAAATATCGTAAATAAACGAGATGTGTTGTTTTGATTTATGTGCTTACTCTAATTTAATTATATACATGATACGTAAATGAGCACAAATCAATAATAATGTATAAAAATTATTTTTATATATAACATTCACAATCGCGCGGTTCTAAACCTAGTATATGTATATACGCAGACGCAGGTTACTATGGAACAAATGGAAGACCTTCGTAGAAAGGCAAGTCTGTTACATCCACTTACATTTTGAACGTAACATATATTTAGTCATTGTATTAATAGCCTAGTATATAATTAATGTTTCTATTTGTATATAACTATATATACATTATAATGTTATTGACTTGGATTTGGAATTACAGGAGAGGCAGCTCGGAGATATAAACAAGAAGATGAAGGTTATTATTTTTTTAATATCTAGACTTGGAGATTGCAAATGATACCTCTCATAAAGTGTTAGGTTAGACTTCAGTATTTCGTGTTAATGGACTATTTTTTTCATAATCAGCTTGA
CDS Sequence
- >Bo4g102530
ATGGCAAGAGGGAGAGTGGAAGTGAAAAGAATAGAGAACAAGGTCAATAGACAAGTAACCTTCTCCAAAAGAAAAGGTGGTTTGCTCAAGAAAGCCTACGAACTCTCTGTTCTATGTGATGTCGAGGTTGCTCTTATCATCTTCTCCAGCAGTAGCAAGCTCTATGAGTTCAGCAGTGATGCAATGGAGAAGACAATTGAAAGGTACAGTCGCTGTAACAACAACATTTTGGACAATAATAGACCTGAAGAGTCTACACAGAGGTGGTCTCAAGAGGTGACAAAGCTCAGATCCAAATATGAATCTCTTCTTCGCACTCATAGGTATTTGCTTGGGGAAGATCTTGGAGAGATGAGTGTCAAAGAATTGGAGACGCTCGAGAGACAGCTTGAAGGAGCTCTCTCGGCGACCAGGCAACGCAAGACGCAGGTTACTATGGAACAAATGGAAGACCTTCGTAGAAAGGCAAAGGCAGCTCGGAGATATAAACAAGAAGATGAAGCTTGA
Protein Sequence
- >Bo4g102530
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