Information report for Bo3g107890
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- encodes a gibberellin 20-oxidase.
Homologous
- Brassica napus: BnaC03G0557200ZS, BnaA06G0275300ZS, BnaC02G0026700ZS, BnaA10G0260100ZS, BnaC09G0574300ZS, BnaC03G0032800ZS, BnaA02G0024900ZS, BnaA03G0026800ZS, BnaA03G0486400ZS, BnaC07G0465100ZS
- Brassica rapa: Bra010064, Bra009285, Bra028706
- Juglans regia: Jr10_08820
Gene Resources
- Pfam: PF14226
- UniProt: A0A0D3BFV3
- AlphaFoldDB: A0A0D3BFV3
- OMA: HYRSGWR
- InterPro: IPR005123 , IPR026992 , IPR027443 , IPR044861 , IPR050231
- PANTHER: PTHR47990
- SUPFAM: SSF51197
- PROSITE: PS51471
- Gene3D: 2.60.120.330
- eggNOG: KOG0143
- STRING: 109376.A0A0D3BFV3
- HOGENOM: CLU_010119_16_3_1
Sequences
gDNA Sequence
- >Bo3g107890
TAACTTTGTCCGGCAAGTTTGTTGTCGATAACTTCTTTGCTCCTAAGCCAGTCTGAGAACTTTTGAAGAGTGTTCTTGTCGGATCTATAATGCTTCTGCGTGAACTCAAGAAACATGGACCATGTAAAGTTAGGATACAGCCTTTGGCCGGACACTTCTAGTAGCTCCTTCGGTGGTTTCACCACTTTGTCCATTTGTGGACATAAGAAAAATGCTAATGACATCCCTTCCCTTTCTTTGTTCACCACTGCTCGGTGCAAGCAACTTCTGTATATTCCATTCGTCAACGCCTATAAAAGAAGATACAGACTTTCAATATTCTTCAAAGTTTCTTGCATGATAAGTTTCAGGAAAAATATTTCATATGTATACTACCTGGATAAATTTTTACTTGATGCTATGTCAACACAAAACCAATTTGTAATAACTCGATTAGTCCATATATTTATAAATTACTAGGAGTATACCATGGATACATTTTCGATGAAATGTAATGGTTCCACCATCCTAATAAAGCGACTCACATCTAAAACACGAGACAGTTTTTGTCTTGAGTCTCATGGGTAGTGGGTACAAAAACAATCATTCTCATCATTATGAGATTCTGAATCACGCTTATATATGAGTTTTGTATACACATACAAAATGTCAAAATCTTTGTCTCTTACGTAAAGAAAATGTTAACTTAAAAAAAAATGTTAACTTAATTACCATGAAGGTATCGCCGATGTTAACCACGAATCATTGAGGCTTGGGAGCAATGGATCTCCACTGGTTCTCCACGAAAACCTGAAGACCACCGACGTGGTCTTGATAAAGTATGGTTAGAGAAGTCGGGTCGGTGTGGGGTCCTGTCCCTAATGTATGGTTTGGCTGCTTGCATGGCGGATAGTAATTCAACCTAAGTATCGAATCGTTATCTCGGTAAAACTCTCTCATATAGCGTCTTTCGATCCCAAGACTCATTCCAAGAAACTCTATGATATTTAGCGAAAGAGTGTTCATCGCCTCTGAGTATTCATGAAACACAGTTCTGCATGAAACAATCACAAAATAAATATTATTAACTAGATTAGTCACATATATATCTATTCGTGGGATGTCAATATTAATGTCATGCAGATCAAACCGTGTCCAAATACCCCAATCCATAGTGCATTCAACTTTTTTTACGGATTGTATATATATGATAAACGAGAGAGCATAGATAAATATATTTTACACTACTCTTATCATTTAAATTATTTTCATATAGTATATCTAAACTATTAAAACTGAAGTACATTTTGTACTTAGCCCTGAGTTTTCCTCAATATTTACCATTCCATGCCACTGAAATTAAAACACAACCGTTTAACACATCTTAACCCATTAATTCGCTTTCTGTAAGTCAAGAGAGGATAAATGTTTGCTTAGCCCAATATTTCGCATGTTTGTTTTAGAGTAGCTTAATATGTTTTGGGCTTATTATACCTGCTAGCCCATACCATAATAACACTACAAGAAAACACACGCTTAACGACGAAATTTAACAAGGAAAAACAATCCTCGTAAATTTACGTCGAGTTTACGAGGAATTTACGTGAAAAACTAAAGTCATCGTTATTTCCTCGTAACGTAACGACAAAAGTGTTTCGTCGTAAAGTGGATGTAATTTTACGAGTATTTTACGAGGAAAAACTATTTCCTCGTAAATACGACGTAAACTTTGCGTGGTATTTACGAGGAAATAGTTTACGTGTATTTAGCGAGGAAATTTTTGAATCCACCAACTTTATAGGTGTTACACGTTTTTTTTGCCCACCTAATTAATTTTCGTCGACGGGGCGGGTGTGGGTCGGTCGATTTTGAATCGCGGGTACCCGCTAACCCGCAAAAAAATTCAAAAAATAATATATATTTTCATAAAAAATATATAAAATACTATAAAGTCAGAAAATAATATATAATTTAATTATTTTATTAGAAAAATAAGTATTATATAATTAAAATATAATTAAAATAATTATTTTATTAAAATTTATCTTCAGTTTGTATATATATGTCCAGATCTGGTCCGATACTGGGTTACTCGGACTTGACATCTCAGTATATTTGTTTTAAAAAACAATGAGGAAGAAGATTGTATTACATTTAAAATAAATAGATGTAGATACTAAAAATAAAAATAAAAATAATGTATGATACACTTGTATTCTTATTCAGTTTTTATATTGTCTTTTTTTTTATAACTGGAGATCTCGAACCACTCACTGACAAGACTACTAGTCCCATGAGAAAATCGATACTTATCATTTAAATTTTAAAACGTACATTGTCGCCAACCAATTTTAAAACAACGTGAGGAAAGGAAATTTGAACCACGATTTATCAATTTCTTGTATGAATTCTTTTAATCATCAAACTACCATAAGTTTTTTTTTTTTTTGGATAAAATATTTTCATATAAGTTAGTTAAAACATATATGATTTACTAGTTTATAAATAGTTCTAGATGGCTGATCAATACTTCTCTGTATTTGAACGATTAATGTTTAAGATTTATACATATTCTTATCTATCATTTACTAGTTTTGTTTAGTTTTATTTTTATTGGTATACAATTCATATTTTAAATTTATATTTTAGTTTTAAATCAAATTGAATTAAGTAAAATCTAAAACATCTTTTCCAAATACGGAAGGTGTATTATTACCCAAACTCTTCGTTCCCGTCTCCCATTGTCTTAGAAACGTAATCTTTAACTGTTTCCGTGCCGCTCCTGAGCTTCTCCTCAGCAGAGAATCTAAACGTCAACGTTTCCTTCCACGGAAGCTCCGAGTAGAATCTTCCGGCAAAGCTATCGGCGTAACCGGAGATCTCACCCCATTTCCTTTTGGCTTTCTGTTTCTCCGATGCCGGCAAGTCAAAAAACATTCCCATACACTTGTAGGCACGTGCTAATATCCCCTCCTGAACTCCATGGTTTGTGACGAGGAAGAAGCCGTGAAGCTTCACAGCTTCGGACACGAGCCTAAACACTTGAGAAGTCGCGACATGGTTGTCTTGTCCGGAGAGAAAACTGGAGATGTCGAGGATAGGGACTTGGAGCTCTTTGATGTCGGTGGAAGGTTTGTCTTCGTCGGACCATACGTATTCCGATGGTATGTTGCTTGGTTGGTTGTTTAAGACTCTTGCATCGAAGCCTGGATGGGGAAGATTTGTAATGGAGGACAT
CDS Sequence
- >Bo3g107890
ATGTCCTCCATTACAAATCTTCCCCATCCAGGCTTCGATGCAAGAGTCTTAAACAACCAACCAAGCAACATACCATCGGAATACGTATGGTCCGACGAAGACAAACCTTCCACCGACATCAAAGAGCTCCAAGTCCCTATCCTCGACATCTCCAGTTTTCTCTCCGGACAAGACAACCATGTCGCGACTTCTCAAGTGTTTAGGCTCGTGTCCGAAGCTGTGAAGCTTCACGGCTTCTTCCTCGTCACAAACCATGGAGTTCAGGAGGGGATATTAGCACGTGCCTACAAGTGTATGGGAATGTTTTTTGACTTGCCGGCATCGGAGAAACAGAAAGCCAAAAGGAAATGGGGTGAGATCTCCGGTTACGCCGATAGCTTTGCCGGAAGATTCTACTCGGAGCTTCCGTGGAAGGAAACGTTGACGTTTAGATTCTCTGCTGAGGAGAAGCTCAGGAGCGGCACGGAAACAGTTAAAGATTACGTTTCTAAGACAATGGGAGACGGGAACGAAGAGTTTGGAACTGTGTTTCATGAATACTCAGAGGCGATGAACACTCTTTCGCTAAATATCATAGAGTTTCTTGGAATGAGTCTTGGGATCGAAAGACGCTATATGAGAGAGTTTTACCGAGATAACGATTCGATACTTAGGTTGAATTACTATCCGCCATGCAAGCAGCCAAACCATACATTAGGGACAGGACCCCACACCGACCCGACTTCTCTAACCATACTTTATCAAGACCACGTCGGTGGTCTTCAGGCGTTGACGAATGGAATATACAGAAGTTGCTTGCACCGAGCAGTGGTGAACAAAGAAAGGGAAGGGATGTCATTAGCATTTTTCTTATGTCCACAAATGGACAAAGTGGTGAAACCACCGAAGGAGCTACTAGAAGTGTCCGGCCAAAGGCTGTATCCTAACTTTACATGGTCCATGTTTCTTGAGTTCACGCAGAAGCATTATAGATCCGACAAGAACACTCTTCAAAAGTTCTCAGACTGGCTTAGGAGCAAAGAAGTTATCGACAACAAACTTGCCGGACAAAGTTAG
Protein Sequence
- >Bo3g107890
MSSITNLPHPGFDARVLNNQPSNIPSEYVWSDEDKPSTDIKELQVPILDISSFLSGQDNHVATSQVFRLVSEAVKLHGFFLVTNHGVQEGILARAYKCMGMFFDLPASEKQKAKRKWGEISGYADSFAGRFYSELPWKETLTFRFSAEEKLRSGTETVKDYVSKTMGDGNEEFGTVFHEYSEAMNTLSLNIIEFLGMSLGIERRYMREFYRDNDSILRLNYYPPCKQPNHTLGTGPHTDPTSLTILYQDHVGGLQALTNGIYRSCLHRAVVNKEREGMSLAFFLCPQMDKVVKPPKELLEVSGQRLYPNFTWSMFLEFTQKHYRSDKNTLQKFSDWLRSKEVIDNKLAGQS