Information report for Bo3g048340
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a homeodomain protein that is expressed in the LI layer of the vegetative, floral and inflorescence meristems. Binds to the L1 box promoter element which is required in some proteins for L1 specific expression.
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT4G04890.1
- Brassica napus: BnaA03G0263700ZS, BnaC03G0315100ZS, BnaA09G0234900ZS, GSBRNA2T00015660001, BnaC09G0276000ZS, GSBRNA2T00151602001, GSBRNA2T00094475001
- Brassica rapa: XP_009134323.1, XP_009114537.1, XP_009114536.1, Bra029527
Gene Resources
- Pfam: PF00046 PF01852
- UniProt: A0A0D3B8G4
- RefSeq: XP_013629800.1 , XP_013629801.1
- AlphaFoldDB: A0A0D3B8G4
- KEGG: boe:106335748
- OMA: QIGDPLW
- InterPro: IPR001356 , IPR002913 , IPR009057 , IPR017970 , IPR023393 , IPR042160
- PANTHER: PTHR45654 , PTHR45654:SF98
- SUPFAM: SSF46689 , SSF55961
- PROSITE: PS00027 , PS50071 , PS50848
- Gene3D: 1.10.10.60 , 3.30.530.20
- OrthoDB: A0A0D3B8G4
- CDD: cd00086 , cd08875
- eggNOG: ENOG502QU3P
- STRING: 109376.A0A0D3B8G4
- HOGENOM: CLU_015002_2_1_1
Sequences
gDNA Sequence
- >Bo3g048340
TGTATCATCCAAACATGTTTGAGAGCCATCATATGTTCGACATGACCACAAAGAGTACCTCCGACAACGACTTTGGAATCACCGGAAGCCGTGAAGATGATTTCGAGACCAAGTCAGGCACAGAAGTCACCACCGAGAATCCTTCCGGTGAAGAGCTTCAAGATCCTAACCAACGTCCCAACAAAAAGAAGCGTTACCATCGCCACACGCAACGTCAAATCCAAGAGCTGGAATCGTAAGAAACAAAAATCACTCAAGCTCTAGCTCATATAATTAACAATAGACTTGAAAACATTTTCAAAGTTTAATATTTTGAGTGTTTTGGATTTTACAGGTTCTTTAAAGAATGCCCTCATCCAGATGATAAGCAGCGTAAAGAGTTGAGCCGCGATCTCGGTTTAGAGCCTCTTCAAATAAAGTTTTGGTTCCAAAACAAACGCACGCAAATGAAGGTATATGTAATCACTAACACATAATATATATAGTTAACCATTTTTCATGACAATACTATTAAAGGAAGTTATATTTATCACAATTTATTTGTGTGTAAAATATGTAGGCACAACATGAGAGGCATGATAACCAGATTCTCAAGTCAGACAATGACAAGCTCAGAGCAGAGAACAATAGATACAAAGAGGCACTAAGCAATGCTACATGCCCTAACTGTGGCGGTCCAGCTGCTATTGGAGAAATGTCTTTCGACGAACAGCATCTCAGGATTGAAAATGCTCGCCTCCGCGAAGAGGTAATATATATATCACACATATGTGTGTCTTAATTTAAATTGGATTAATCTGATTCTAGTACCACATGGCCTACAGATTGATAGGATCTCTGCTATTGCTGCAAAATACGTTGGGAAGCCAATAGGATCGTCATTTGCTCCACTAGCAATCAACGCGCCTTCTCGTTCGCTTGATCTTGAAGTTGGCAACTTTGGGAACCAGGCAGGTTTTGTAGGGGAAATGTACGGAACAGGTGACATTCTGAGGTCAGTCTCAATTCCTTCTGAGTCAGATAAGCCTATGATCATAGAGCTAGCGGTCGCAGCTATGGAGGAACTCGTGAGAATGGCTCAAATCGGGGATCCTTTATGGGTTTCTACTGATAATTCCATCGAAGTTCTCAACGAGGAAGAGTATTTCAGAACGTTTCCAAGAGGAATCGGACCAAAGCCATTAGGTTTGAGATCAGAGGCGTCAAGAGAATCAGCTGTTGTTATAATGAATCACATCAATCTCGTTGAGATTCTCATGGATGTGGTAATTAATTAAATTAAATTGTTTCTTGATCTCCAAGTTTTAGTTACTAACTTCTAGTTAACTAATATTTACTTCTGTCTTGTTTTTTTTTTATGTGTAAATAAGAATCAATGGTCTTGTGTTTTCTCTGGGATTGTGTCAAGAGCCTTGACGCTGGAAGTTCTTTCCACTGGAGTTGCTGGGAACTACAATGGTGCTTTGCAAGTGGTATGTATACTAAGTTGATTACTTGCTTCTCAAGAAACTAAACTAAAGAGTGTAGGTTATGTTATTAATGTTGGGTTTGTGTTTTTGTTGTCTGGAATGTAATTAAAGATGACAGCTGAGTTTCAAGTTCCGTCGCCGCTAGTCCCAACACGTGAAAACTACTTTGTGAGATACTGTAAACAGCATAGCGACGGTTCTTGGGCTCTGGTTGATGTCTCTTTGGACAGCCTTAGACCGAACCCGATTTCAAGAACTAGAAGAAGGCCTTCTGGTTGTCTGATTCAAGAACTACCTAATGGTTATTCTAAGGTAAAGCAGAAGATATGAAGGGCTTAGATTGAGTGTTCATGAAATTTAAGGTGAAATTTTGATATTTAGAGAAGTTATGGGGTGATTGTTTTTTGTTGTTTGAAGGTTACATGGGTAGAACATATGGAGGTGGATGATAGATCGGTTCACACTATGTATAAACCGCTGGTTCATTCCGGTTTAGCTTTTGGAGCGAGACGTTGGGTGTCTACACTCGAACGTCAGTGCGAGCGGCTCGCGAGTTCGATGGCCAGCAACATCCCGGCTAGTGATCTTTCCGGTACGTTTTTAGATGGCTATTTCAATGGTTTTGAAAGTGTTGGGGTTGAATTGAGAAGCTGTTAAATTTATTCATGAGAACCTGTCACTTTATGGTAATTGTGAATATGTTGTGGCTTGCTGATTTAAAAAGTTTATAAATTTACTCATTCAGTTACTTTAATTTTATGGAAATTGAACAAGTTGGGGGCTGAACTGAAAGTTTTGAATTTTACTCACAGGGCCTTTAATTTAGTGTTTGTTATTAGGTCCTTTAATTTTGTGGTAATTTTGTTAGATGTTGAGGGCTGAACTGAGAAGTTGTTAAATTTACTCATTAGGTCCTTTAATTTTCGTGGTAATTATGAATATGTTGGGGCTGAAATGAGACTCATTCAGGTCCCTTAATTTGTGGTAAATTATGAATCTGTGTGAGGCTGAACTGAAAAGTTCTTAATTTTACTAATAGGTTCTTTAATTTATGGTAATTTTGTTAATATTTGTTGAATTTACTAATAAGTCCTTTTCTTTTATGGTAATTATGATTGCAGTGATAACGAGTCCCGAAGGGAGGAAGAGCATGTTGAAGCTAGCGGAAAGGATGGTTATGAGCTTTTGCAGCGGTGTTGGCGCGTCGACTGCACATGCGTGGACGACAATGTCGTCAACTGGATCCGATGATGTTCGAGTCATGACCCGAAAGAGCATGGATGATCCGGGTAGACCTCCGGGGATCGTTCTTAGCGCCGCGACTTCATTCTGGATCCCAGTGGCTCCCAAACGGGTTTTCGACTTCCTCCGCGACGAAAATTCAAGAAGCGAGGTAAATAAAATACAGACCGGACCGGTCGGGTCGGTCTGACTTGGAATTATTCTTCTTACTGAATCCGGTTTATATTAGAACAACTGGAGCAGGTGATCCCAGTTGAATTCCAAAACCGGTTTACTAAATTTTGTCAAAAACCGGTTTAATAAATCACATACTTCCTCTGTTTAAAATTAACGATTTTTCCAACTTTTCTCACACTAAAAATTGAAAAGTTAATTATAGCTCAATTATTTTATGTGATTAATAATTTTTGTAACTTTAAACTAATAATAATTCAATAAATTAAATTATTTTGTGAAATTTATAATTTATCATTACTATTAATAAAATGCATAAACTTGTTTTTGTTTTTAAAAAAAAATTCTTAGAAACATTTATTTTTTGGAAAAATGGAGTATTTGATTAGTAATACTACAATATATTATCATTTTCAAATCATGTGCAAGTTTTATATTAGTGTTTTAAAAGAAAATTTCTTTATTTTCAAAAAAAATTCAAGGATATCAAAAATCATTTGTTCTTAATTTGTTTGTGTTTGAAACTTATTCATGCAGTGGGATATTCTCTCAAATGGAGGAATGGTTCAAGAAATGGCTCATATAGCAAACGGTCGCGAACCTGGAAACTGCGTCTCCTTGCTCCGAGTCAACGTAAGATTCTTGTTTGTAATATCAAGATTTTGTTTTTCGATGTCGGACTCAAAATGCTTTCGGTTGTAACAGAGCGGAAACTCGAGCCAAAGCAACATGTTGATTCTACAAGAGAGCTGCACGGACGCATCTGGATCGTACGTGATCTATGCGCCGGTGGATATAGTGGCGATGAACGTTGTTCTAAGCGGAGGAGATCCTGATTACGTGGCGTTGCTCCCGTCTGGTTTCGCTATATTACCCGATGGTTCGGTCGGAGGAGGAGGAGACGGGAATCAAGAAGTGGTTTCTTCTTCTACTGCATCCGAGAGTTGTGGTTCACTGTTAACCGTTGCGTTTCAGATACTTGTTGATTCTGTTCCTACAGCTAAGCTCTCTCTTGGCTCGGTGGCTACCGTTAACAGTCTGATCAAATGTACGGTGGAGAGGATTAAAGCCGCCGTTGCTTGTGACCGAGGTGGAGGAGGACCATAA
CDS Sequence
- >Bo3g048340
ATGTATCATCCAAACATGTTTGAGAGCCATCATATGTTCGACATGACCACAAAGAGTACCTCCGACAACGACTTTGGAATCACCGGAAGCCGTGAAGATGATTTCGAGACCAAGTCAGGCACAGAAGTCACCACCGAGAATCCTTCCGGTGAAGAGCTTCAAGATCCTAACCAACGTCCCAACAAAAAGAAGCGTTACCATCGCCACACGCAACGTCAAATCCAAGAGCTGGAATCGTTCTTTAAAGAATGCCCTCATCCAGATGATAAGCAGCGTAAAGAGTTGAGCCGCGATCTCGGTTTAGAGCCTCTTCAAATAAAGTTTTGGTTCCAAAACAAACGCACGCAAATGAAGGCACAACATGAGAGGCATGATAACCAGATTCTCAAGTCAGACAATGACAAGCTCAGAGCAGAGAACAATAGATACAAAGAGGCACTAAGCAATGCTACATGCCCTAACTGTGGCGGTCCAGCTGCTATTGGAGAAATGTCTTTCGACGAACAGCATCTCAGGATTGAAAATGCTCGCCTCCGCGAAGAGATTGATAGGATCTCTGCTATTGCTGCAAAATACGTTGGGAAGCCAATAGGATCGTCATTTGCTCCACTAGCAATCAACGCGCCTTCTCGTTCGCTTGATCTTGAAGTTGGCAACTTTGGGAACCAGGCAGGTTTTGTAGGGGAAATGTACGGAACAGGTGACATTCTGAGGTCAGTCTCAATTCCTTCTGAGTCAGATAAGCCTATGATCATAGAGCTAGCGGTCGCAGCTATGGAGGAACTCGTGAGAATGGCTCAAATCGGGGATCCTTTATGGGTTTCTACTGATAATTCCATCGAAGTTCTCAACGAGGAAGAGTATTTCAGAACGTTTCCAAGAGGAATCGGACCAAAGCCATTAGGTTTGAGATCAGAGGCGTCAAGAGAATCAGCTGTTGTTATAATGAATCACATCAATCTCGTTGAGATTCTCATGGATGTGAATCAATGGTCTTGTGTTTTCTCTGGGATTGTGTCAAGAGCCTTGACGCTGGAAGTTCTTTCCACTGGAGTTGCTGGGAACTACAATGGTGCTTTGCAAGTGATGACAGCTGAGTTTCAAGTTCCGTCGCCGCTAGTCCCAACACGTGAAAACTACTTTGTGAGATACTGTAAACAGCATAGCGACGGTTCTTGGGCTCTGGTTGATGTCTCTTTGGACAGCCTTAGACCGAACCCGATTTCAAGAACTAGAAGAAGGCCTTCTGGTTGTCTGATTCAAGAACTACCTAATGGTTATTCTAAGGTTACATGGGTAGAACATATGGAGGTGGATGATAGATCGGTTCACACTATGTATAAACCGCTGGTTCATTCCGGTTTAGCTTTTGGAGCGAGACGTTGGGTGTCTACACTCGAACGTCAGTGCGAGCGGCTCGCGAGTTCGATGGCCAGCAACATCCCGGCTAGTGATCTTTCCGTGATAACGAGTCCCGAAGGGAGGAAGAGCATGTTGAAGCTAGCGGAAAGGATGGTTATGAGCTTTTGCAGCGGTGTTGGCGCGTCGACTGCACATGCGTGGACGACAATGTCGTCAACTGGATCCGATGATGTTCGAGTCATGACCCGAAAGAGCATGGATGATCCGGGTAGACCTCCGGGGATCGTTCTTAGCGCCGCGACTTCATTCTGGATCCCAGTGGCTCCCAAACGGGTTTTCGACTTCCTCCGCGACGAAAATTCAAGAAGCGAGTGGGATATTCTCTCAAATGGAGGAATGGTTCAAGAAATGGCTCATATAGCAAACGGTCGCGAACCTGGAAACTGCGTCTCCTTGCTCCGAGTCAACAGCGGAAACTCGAGCCAAAGCAACATGTTGATTCTACAAGAGAGCTGCACGGACGCATCTGGATCGTACGTGATCTATGCGCCGGTGGATATAGTGGCGATGAACGTTGTTCTAAGCGGAGGAGATCCTGATTACGTGGCGTTGCTCCCGTCTGGTTTCGCTATATTACCCGATGGTTCGGTCGGAGGAGGAGGAGACGGGAATCAAGAAGTGGTTTCTTCTTCTACTGCATCCGAGAGTTGTGGTTCACTGTTAACCGTTGCGTTTCAGATACTTGTTGATTCTGTTCCTACAGCTAAGCTCTCTCTTGGCTCGGTGGCTACCGTTAACAGTCTGATCAAATGTACGGTGGAGAGGATTAAAGCCGCCGTTGCTTGTGACCGAGGTGGAGGAGGACCATAA
Protein Sequence
- >Bo3g048340
MYHPNMFESHHMFDMTTKSTSDNDFGITGSREDDFETKSGTEVTTENPSGEELQDPNQRPNKKKRYHRHTQRQIQELESFFKECPHPDDKQRKELSRDLGLEPLQIKFWFQNKRTQMKAQHERHDNQILKSDNDKLRAENNRYKEALSNATCPNCGGPAAIGEMSFDEQHLRIENARLREEIDRISAIAAKYVGKPIGSSFAPLAINAPSRSLDLEVGNFGNQAGFVGEMYGTGDILRSVSIPSESDKPMIIELAVAAMEELVRMAQIGDPLWVSTDNSIEVLNEEEYFRTFPRGIGPKPLGLRSEASRESAVVIMNHINLVEILMDVNQWSCVFSGIVSRALTLEVLSTGVAGNYNGALQVMTAEFQVPSPLVPTRENYFVRYCKQHSDGSWALVDVSLDSLRPNPISRTRRRPSGCLIQELPNGYSKVTWVEHMEVDDRSVHTMYKPLVHSGLAFGARRWVSTLERQCERLASSMASNIPASDLSVITSPEGRKSMLKLAERMVMSFCSGVGASTAHAWTTMSSTGSDDVRVMTRKSMDDPGRPPGIVLSAATSFWIPVAPKRVFDFLRDENSRSEWDILSNGGMVQEMAHIANGREPGNCVSLLRVNSGNSSQSNMLILQESCTDASGSYVIYAPVDIVAMNVVLSGGDPDYVALLPSGFAILPDGSVGGGGDGNQEVVSSSTASESCGSLLTVAFQILVDSVPTAKLSLGSVATVNSLIKCTVERIKAAVACDRGGGGP