Information report for Bo2g161210
Gene Details
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Functional Annotation
- MADS box gene negatively regulated by APETALA1
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT5G60910.1
- Brassica napus: BnaC02G0523700ZS, GSBRNA2T00086507001, GSBRNA2T00075532001, BnaA02G0391500ZS, GSBRNA2T00025013001
- Brassica rapa: XP_009130138.1, Bra029347
- Raphanus raphanistrum: RrC13077_p1
Gene Resources
- Pfam: PF01486 PF00319
- UniProt: A0A0D3AY38
- RefSeq: XP_013618485.1
- AlphaFoldDB: A0A0D3AY38
- KEGG: boe:106325014
- OMA: SHEYFIW
- InterPro: IPR002100 , IPR002487 , IPR033896 , IPR036879 , IPR050142
- PANTHER: PTHR48019
- SUPFAM: SSF55455
- PROSITE: PS00350 , PS50066 , PS51297
- Gene3D: 3.40.1810.10
- OrthoDB: A0A0D3AY38
- SMR: A0A0D3AY38
- CDD: cd00265
- eggNOG: KOG0014
- STRING: 109376.A0A0D3AY38
- HOGENOM: CLU_053053_0_2_1
Sequences
gDNA Sequence
- >Bo2g161210
TATTCATTCGTCGTAGGGCGTAACATCCAAGCCGGAAGAAGAGAGTTTGGTTCCGTCAATGACGATGCTCCACCATTCTCTCCCCCAACTCTCCCCACAAAGCCATCTCTGCCCATTTAATAATTAATTAAACTGAATCATTCACATCTAGATATGTATATTACACAATTAATCAATCTCCAAATCTAATTTGAAGTATCATCGAAAAGAGAGGAGACCTGGAGGAGGTTAAACAGTACTGGGGCTGAACAATTGAAGAATTGTTGGAGCAATGGTTTAGTTGTCCTTCTTGATGACCCGTTTTCTTCTCCCTCTCCTTAATCTTATCATATCAGAAGTTTTTTCATTGTTAATATATACTACATGATTACTATGTGAATATACTTCTTATGATAAATTTTATACAAATATAAAATAATCACTGGAGTTTACAAATACACTATGCATCTAGTAAAATTTACGCAAGAGATAATAAAAGCAATAGTTTTATCAATGTTCGAGGTCAATTAATCGATCAATCTATATATATATATAGTTCTACAACTTATATTGACGCCTATGTAGCTATGTTTTCAGCTTTTTTTTTATAGAAACACAACTACTCTATCAGTTTCACTCTATCAGCATTTTTTTTTATAGAAACACAACTACTCTATCAGTTTCACTCTATAATTGATGAAATACTTAGGCAATTATCTCATTCACAGCTCTTTAAATTTCACTTTAACTCAAAACAAAACCATGTAATTCAAAAAAGTTGCACTAACCTTTTTGAGAAGCGTATTATTGTGATCTTGCAAGGCCTTATCCTGATACATTTTAAATAAAAGACGTAAAGTTACATATACAGAAATTCATTGTTCTGATGATATAATTTATTGCGACACTTTACCTTCTTCTGGAGCGCTGATATGGATTCGAACATAGCTTGGTTCTGCAGATATGCCAAAATTCTTAAAATAAGACCATCACAAAATTCACTCGAATTCATAGCCAAACCCAACTTTTTGGTTAAAACTTATCTTCATATGTAGCTGTATTTATTAACGTTATCATATTACCTTTCTTGACCTAATGCTTTTGATAGCAGCATCGAGCTGATGCTCCAGGCTTTGAAGGTCCTTTAAACTCAAAGATTCAAGTTCTTCCCCCATAAAATTCCTGCCAATTTTCATTTTTGTGACTACTGATTATACAAGAATTGTGATTGTTATGTTATCTTATTACCTATGTGATATTACGCCTATGTTTTGTGATCAAAGAACATTGTGAGGATACAAGACACATCAGCAAGTTCCTCTATTACTGTATATTATCAAGAGATCTAGAAGATGACTACATTTTGAATCAAGATAGAATTTGTTATTCTTTTTTTACTTTTTTAAGAATTTTTTAATCTAAATTATGAGAAATGACGAAGTCCATGAATGTCATGATGCATTCCCTCTGAAGTTATGTGCTATGTATTATTATTTTTAACGATCTGACTACGGAGGTAAGTTGAATACATTTGAAGTTTATGTTCAACTCAAAGTCAGTTGACTTCGGACAACTGTTGACTTCGGACAACTCTTGTTAAAATTAATACGTTTAGTTGCGGTTTGATATTGCTTAGTAATTTTAATTTAACATTATGAAATAGAAGACACTGTAGTATTAAAATGTATTTACAATATACCTTTTGTTCTTCTCAAGTACCTCAACTCTTGCCTTGAGCTTGGCATGTTCTAGAACCCAATTTTCCTACAACAGTAATTGGTATATGATATATGATATACACTAGTTACTACAACAAAGATACATAACTGAATGAAACTTGTGAAATAAACAGCTGGAAATTAAACCATATCTTAAAACTTACAATCTGTGAAATGTCTCTGCCAACAAGTTCTTTATCTGAGTACAAATAGCGATCATAGCGTTCAAGTATGCTTTCCATGCTAGGTTTCAGAAAATAGAAATGTAATTAATTAATTGATCAATATGCATCAGAGTATATAATTTCACATGTTGTAATGTGTTTACTTTAAAGTGTTAGCCAATTAAAAGGTTACCTTGTTTGGCAACACAATAATGTATGCAAAACCTGGTTTTTGGTGAGTCCACAAAACATCATAAAAACATACGTACATATTGAATGTCAAGATTCGAGTTTCGCTCTTGACTCAGTTATCTAAGCAAACCGTATGATCATTGTAAATGTATATGATCGTACAAACAAACATATATAAACACACAAAACGCATTTACACCAGTACGAAGTACTTTATGATTAACCCCCGGTCTGTTAGCCGACTTCTTAACTCATGATTTGACACATTTTTTTTACATTTTTCGGATAAGAGACGGCTCTTATATACTAAGAAAAGCTAAGAGCATGATTAATGGGGGAGGAATTCAGAGAATCATGTTCTAAAAACTCCAGTTAAAAGACCGAGATTAATCATGGTCTTACGTACATGTTGAACATCATATTATTGTCCATTGGATTATAGCATCTCCTTGTAAAAGCTTTATTTCATTGGGTTTTTTTTTCATTGTGTAATCAATTCTTTCAAATATATGATATTAATTAAGTATTATACACGGTAAATGCATACATAAGCGTACGTGCCTGTGTGCACGTGCTTCCATACACCAAAAGAGGCAATCAAATCGTGAGTCTGTGTAACTAAGTATCATAATTTTATGCTAGTTTCATCTGAGTAAAACAAGGAAACATAAACAGCCTTTTTCATGCGTTCGTACGTAAAATCCCAAAAAAACCCTAATATCTCGAACCATAGACCATGATTAACCTGGGGTTATTACAGGAAGTTAACTTTTTCTTAACTTTTAAGTAAAAAAAACTAACAACCGGTTTTTAAAGATTAGTCATGCTCTTAGGGAACTAACAAATCTGCAGTAGATATGCAGCACACAAGGACAAGATTTAGATTTGTTTTCAAGGCTGACGATTTAGATCAAGACGTACGAATATAAAGAAAATCTAATTAAAATTTAAAAATCAAGAAACCAGATGGATATGATCGATGTGAATATATAATATAATATATAGTTTTTTTTTTCTTGTAACTTATAATATATAGTTTATGAGTTAAATAAAAATATAATAATTACCAAGAGTCTGTGGAATATTCGAAGAGTTCGCCTTTGGAAGAGAAGACGATGAGAGCAACCTCAGCATCGCAGAGAACAGAGATCTCATGAGCTTTCTTGAGCAAACCAGACCTTCTCTTTGAGAAAGTAACTTGCCTATTGATCTTATTCTCTATCCTCTTCAGCTGAACCCTACCCCTTCCCAT
CDS Sequence
- >Bo2g161210
ATGGGAAGGGGTAGGGTTCAGCTGAAGAGGATAGAGAATAAGATCAATAGGCAAGTTACTTTCTCAAAGAGAAGGTCTGGTTTGCTCAAGAAAGCTCATGAGATCTCTGTTCTCTGCGATGCTGAGGTTGCTCTCATCGTCTTCTCTTCCAAAGGCGAACTCTTCGAATATTCCACAGACTCTTGCATGGAAAGCATACTTGAACGCTATGATCGCTATTTGTACTCAGATAAAGAACTTGTTGGCAGAGACATTTCACAGATTGAAAATTGGGTTCTAGAACATGCCAAGCTCAAGGCAAGAGTTGAGGTACTTGAGAAGAACAAAAGGAATTTTATGGGGGAAGAACTTGAATCTTTGAGTTTAAAGGACCTTCAAAGCCTGGAGCATCAGCTCGATGCTGCTATCAAAAGCATTAGGTCAAGAAAGAACCAAGCTATGTTCGAATCCATATCAGCGCTCCAGAAGAAGGATAAGGCCTTGCAAGATCACAATAATACGCTTCTCAAAAAGATTAAGGAGAGGGAGAAGAAAACGGGTCATCAAGAAGGACAACTAAACCATTGCTCCAACAATTCTTCAATTGTTCAGCCCCAGTACTGTTTAACCTCCTCCAGAGATGGCTTTGTGGGGAGAGTTGGGGGAGAGAATGGTGGAGCATCGTCATTGACGGAACCAAACTCTCTTCTTCCGGCTTGGATGTTACGCCCTACGACGAATGAATAG
Protein Sequence
- >Bo2g161210
MGRGRVQLKRIENKINRQVTFSKRRSGLLKKAHEISVLCDAEVALIVFSSKGELFEYSTDSCMESILERYDRYLYSDKELVGRDISQIENWVLEHAKLKARVEVLEKNKRNFMGEELESLSLKDLQSLEHQLDAAIKSIRSRKNQAMFESISALQKKDKALQDHNNTLLKKIKEREKKTGHQEGQLNHCSNNSSIVQPQYCLTSSRDGFVGRVGGENGGASSLTEPNSLLPAWMLRPTTNE