Information report for Bo1g054910
Gene Details
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Functional Annotation
- Involved in the promotion of the transition of the vegetative meristem to reproductive development. Four forms of the protein (alpha, beta, delta and gamma) are produced by alternative splicing. Involved in RNA-mediated chromatin silencing. At one point it was believed to act as an abscisic acid receptor but the paper describing that function was retracted.
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT4G16280
Gene Resources
- Pfam: PF00076 PF00397
- UniProt: A0A0D3A7P3
- RefSeq: XP_013602530.1
- AlphaFoldDB: A0A0D3A7P3
- KEGG: boe:106309916
- OMA: HPANTIP
- InterPro: IPR000504 , IPR001202 , IPR012677 , IPR035979 , IPR036020
- PANTHER: PTHR24012
- SUPFAM: SSF51045 , SSF54928
- PROSITE: PS50020 , PS50102
- Gene3D: 2.20.70.10 , 3.30.70.330
- OrthoDB: A0A0D3A7P3
- CDD: cd00201 , cd12637
- eggNOG: KOG0144
- STRING: 109376.A0A0D3A7P3
- HOGENOM: CLU_020343_0_0_1
Sequences
gDNA Sequence
- >Bo1g054910
TGTCACGTTTCGACGAGGATGACGAAGGTTTCAGCCGCCGTCGTCGCCGTGGAAACAGCCCTAGCAATTATCAAGTTGGAATTGGGGACAGAGGAGGTGGCGATCGACGCTGGGAAGATGACGGCCCCACGGATCGTAATTTTCACAGAGAAGGCGTTGGAGGAGGTTTCCGGCCGATGAACGCTCCTCCAGGGAGAGTAGATTTTCAGCCTATGGGTTATGGCTTCGACGGAGGTTTTCCGCCGATGAGTCGCGACGGAGGATTTCGGCCTAACGTGCCAGTGAATTTTCCGCCATCGGAAAGTCCAGATGCAGGGGGATATTCCGGCGGCAGGGGATTTCAATCAACGGGGCCTGATTACTCTGTGAGATTGACTTCACCGCCGATCCAGCAGCCTCTTTCTGGTCAGAAAAGAGGTCGTCCTCTCTCGGAGCAGAGTAGCTTTACTGGAACTGGTAAGCTTGGGCTCACTCTACTGTAATCGAGTTGTTTAGAGTTAACAGTGGTTCATTTATACTTGTATGTGATAATCAGAGCTATTTCCAAACTAAATTACGTTTACTGGATCATTCGTTTTGCAGATTTTACTGATCGTAGCAGTATGGTGAAGCTTTTTGTTGGCTCTGTACCAAGGACAGCTACAGAAGAAGAAGTGAGTTCATCTTTTTGATTATTTTCCTAATTTCTTCTCAATATATATGCACTTTGTTGAGGCAATCTAAACCACGAAGCTCGTAGACTCTGTTCATAAGCCGTTCTTGTTTATCTTTTTGGTTTTCATAGGTCCGTCCCTTTTTCGAACAACACGGAAATGTTCTTGAGGTTGCTTTTATCAAGGACAAGAGAACAGGACAGCAGCAAGGTATGTTTATCTCCATTTTACTAGGAATCAGTCGTGATTTATGCTTCTAAAATTTTCAGGTCTCCTGAAAAGGCTGATGGGAAGCAACCCCAGTCTCATCATTGGCCTCCATTAGTTTTCAACAATTTTCGGGCTTTTGCTTATGCTAGCGAGCGTCTTATCTGTGTTCGTTTGGCACAGAAGAAGGCTGCCTGTTTAGTTTACTAAGAAAGGGTTTTTGTATTGACCTTGGTAAAATAGTTTTTGCGACTTGTGTCCATCCTAGAACCTTAGTTGTGTTTGAACAGTGTAGCAGACTTTATCATGTTTTAGAGTTGGAGTTAATGTACATAAAATTGAACAGATGTTTTACTGTTGCCTTTTAGTTGGCACTGGTTTAAAGAACGTTGTTTTTTCCTTTCGTATTGAATTCAGTATCTCTTTACTCTTCCTTTCGATGAATGAAAATGGTGTATATGGTCTTGACTGGATGAATGTATTTTTACTTGGTAGTCTTACAACGTTCATAAAATGGTTTGATTGATAAACCACCCCTGCTAGTCAATATTTGGCAGTTTCTTAGTGATTATATCATGTTGGATGTTTTGTTTCTTTAGTTTCTTTAATATCAACTTTGGATGTACCGTCTCTATTGGTTGATGATGAAATTATTTTTTACCATTTTGGATGCTTGATGCCTTAATGAATGATCTTTCCTTTTTTTCTTATTGTGGATGGCCGAGGAACTATAATGAATGTTCTCTTCGCTTTTTTTGAATGGCCTGGGATGTGGACTTCTTGTATGTTCTCACTTTCATTGATGAATGACTGTTTCGTTGAGTAGCTCTATTGTTCTGTATGGTAACGCTAACACTGCTGATCTACATTATGTGGAAGAGATCATATGTCTAATGATATTTTTTTTCTATGTACCTTTCACCAACCAAGCTCAAAAGCTTGGTTTCAGTTTTTAGTGGTCTTATTCTATATAGAGCTTGGTTTCAGTTTTTAGTGGTCTTATTCTATATATTGAGATTGCTCTTGAAAAATTCCATCAAAGTTCTGTCTTTATGATGCAAGTGTGAAGAATTACTAGATGATGAGTGATGTATTATTTAATAATTCGGGACTTTCCAAGAAGTTATTGTACGGTGACATAAAAGCTTTTACTCATCCCGTTATCACGGTTTGACTGTAGTAGATTTGACACATTCCTTGGTTTGAAATGTTAGATGGTGCTAAGATATGGAAGGCAACGATTATTATAATTTCTTAGAAATACGTCTTAGCGTTCACTCGCTCTCATTGCTTCGATCAGCATCAGGCATGAGCCGCCTTAGTATGTATTTAATGAAGCAAGTGTCATTCTTCTCTATATGCAACTATTACCAATGAATTGACGTTGGGTTGTGGTTATGTCTCTCAGAACTGTAATTCTTTTTGTGAATGTCGTCAAATGTGTGGTGTATGTTGTATGGTGTATGGTGACGAAAATGTGATGTATGGCTCTAGTTTTAATTATATCATTTGTTACTTAGCAGTGATTGAGAACTCTTAACTTGTAATTTTATCTAATTTTTTTTTGCAGTGATTGGATCTTTTTGCGTAATATATATTTTATTTGCAAATACCGACTGTGTTCTTTTTAAATAGTTTAAAGGCATATGCTTTATTTGAAGACATTAGTTTATTATTCTCTCCATCAAATCTACTACAGTAATCTAAGTCGAGGCTGTCAGGACATGTCTTATGATTTTCGTACTGAAACTTATGTGCTTTCAATGTGGTCGTGGCTTGTACATTTGTAAAGAAACTATTTACTAGTATCTCTTGATGTTTGATGGAGGGACAAGTGGAACCTTGAACAGAAGCTTATGTAGCAGTCTTTAATGCAGGCTGTTGTTTTGTAAAATATGCAACTTCTGAAGATGCGGATAGGGCCATTAGAGCATTGCACAATCAGATCACTCTTCCTGGGGTAACTACCATTGATGCCTTCTCTTATCAAGGACAGGAAAATACAGGTTAACTCATCTTTTACAATTTGCTGATTCCCAGGGAACTGGCCTTGTTCAAGTTCGATATGCTGATGGGGAGAGAGAACGCATAGGTAATCAACTTTCGCGCCATATTATCTGAATCTGGCCTTCATTGTCTGGTATACATAGGGTGACCATACGCTGTACAAATTCAAATTACGAGAATTGAGATAATGTGGAAAACTATATGAATCTTAAGGAAGTGGATCCTTTTTTCTGTGGTCCTTGCCTCACTCTCAAGTATTAACTGATTGAATTTACTTCTTCTGAAGGTGCGGTAGAGTTTAAGCTTTTTGTTGGTTCCTTGAACAAGCAAGCCACTGAAAACGAGGTTGAGGAGGTATGTCTCATATCCTACTTTTTGATGGAAAGTAATTACTTATGTCTGATTTACAAAGAGGGAAGCGTTCTAAATTTAGATATTACCGTATCCCCTGTCGCCTTAGCTGGTAATTTTAGTGATTATATGACAATTTAGTAGTCCTCTTGGAAGGGTCAGCGGCTTGAAATTTTGTGTCAACTATTCGAGCGCTTACACATTTTACTAACTGAGTGATCTCTTCTTTCAAATGGACTGACTGAGTGATCTCTTCTTCCAAATGGATGTAACTTTTTGGCTGTCAGCTTTCTTTTCTCAGTAAATATGATGAAGATGTGAACGGCTACTTTGTCCTGTTGTTGCTTTAACAGCTCTTTTTGCAATTTGGTCGCGTGGAGGATGTCTATCTCATGCGTGATGAATATAGACAGAGTCGTGGTATGTCTGGTAACTGCTACTAGATTCTATAAATTGTTTGATGGTGTTGATATGGTCAAACTGTTTTTGACACTCATTTAGGATGCGGGTTTGTTAAATATTCAAGCAAAGAGACGGCCATGGCAGCTATCGATGGTCTCAATGGAACTTATACCATGAGAGTAAGCTGTGAATCACATGAGTATCTCACTTTCTCTCATTATCCCCTCTAGACCTGTTTTGTTTACTGGCCTCTTTCCCTTCTCCAGGGTTGCAATCAGCCGTTGATTGTTCGGTTTGCTGATCCAAAGAGGCCTAAACCGGGCGAGTCAAGGTATTGCCTTGGAGACTATATTTTGAATTCATTATAATGCTAATATCAAGAAAATTGTGTCTACTGTCATTGTTTGTTCTATTGAGTTACATTTATGAGAATCTTTTGGGGCATGGGTGGAGGAGAGCTGCGAACCTTATTCCTTCTCCAGTTATTACTTGAATGCGATGAATTTCTTTCTATATATCCATAACTAGTTTCTGTTTCCAGGGAAGTGGCACATCCTGTTGGACTTTGTTCAGGGCCTCGTTTTCAAGCTTCAGGACCAAGGTGACTGGGGTGAAAGGAGATCGTTGTTTTTGTCATCAATTAATTATATATTTTGACTAAACCTGGTCTCCTTATCTTCATTTGTTAGGCCTACATCTAACCTTGGTGACCTTAGTGTGGATGTAAGCCACACAAATCCTTGGCGTCCTATGAATTCACCAAACATGGGGCCACCTGGTAACACTGGGATCCGTGGTACCGGAAGTGACTTGGCTACTAGGCCAGGTCAAGCCACATTACCTTCAAATCAGGTAAGAACAGCTTGATGATCATGTATATTATCTTATATGTACACACCCAATCACACATAAAGTAATCGGGCATAAGGTTTTACATGTATTGTGTGAGTAGGACGAACATAATTTATATGCTGCACATATATGAGCGTATGGACTCTTGAAAAGAAGCATGAAGTTCCGACCTTCCAGCTTTTCATATGATGCAGCAAACTTGATGTGTTTTGCATTGAAATGATATGGCTTTGATTTGCATTTTGTCAGTTTCTAAGGAGTTTTTTTCTTCAATAATTTCTACTTCTGATGTTAGCTTTATTTGTGGCATTCTATAATGTTAGGGAGGTCCATTGGGTGGTTATGTTGTTCCTGCCCTTAACCCTCTACCAGTCTCATCCTCTGCCACATCGCAACAGGTACTTCAGCTGAATTTTTCCAATAAAGAAAATCTGAAAATGTTGTGTTGATCAGTTAATTTCAACTGTTTCTATTCCATAGCAAAACCGGGGAGCTGGCCAGCATATGTCACCATTACAAAAACCTCTT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CDS Sequence
- >Bo1g054910
ATGTCACGTTTCGACGAGGATGACGAAGGTTTCAGCCGCCGTCGTCGCCGTGGAAACAGCCCTAGCAATTATCAAGTTGGAATTGGGGACAGAGGAGGTGGCGATCGACGCTGGGAAGATGACGGCCCCACGGATCGTAATTTTCACAGAGAAGGCGTTGGAGGAGGTTTCCGGCCGATGAACGCTCCTCCAGGGAGAGTAGATTTTCAGCCTATGGGTTATGGCTTCGACGGAGGTTTTCCGCCGATGAGTCGCGACGGAGGATTTCGGCCTAACGTGCCAGTGAATTTTCCGCCATCGGAAAGTCCAGATGCAGGGGGATATTCCGGCGGCAGGGGATTTCAATCAACGGGGCCTGATTACTCTGTGAGATTGACTTCACCGCCGATCCAGCAGCCTCTTTCTGGTCAGAAAAGAGGTCGTCCTCTCTCGGAGCAGAGTAGCTTTACTGGAACTGATTTTACTGATCGTAGCAGTATGGTGAAGCTTTTTGTTGGCTCTGTACCAAGGACAGCTACAGAAGAAGAAGTCCGTCCCTTTTTCGAACAACACGGAAATGTTCTTGAGGTTGCTTTTATCAAGGACAAGAGAACAGGACAGCAGCAAGGCTGTTGTTTTGTAAAATATGCAACTTCTGAAGATGCGGATAGGGCCATTAGAGCATTGCACAATCAGATCACTCTTCCTGGGGGAACTGGCCTTGTTCAAGTTCGATATGCTGATGGGGAGAGAGAACGCATAGGTGCGGTAGAGTTTAAGCTTTTTGTTGGTTCCTTGAACAAGCAAGCCACTGAAAACGAGGTTGAGGAGCTCTTTTTGCAATTTGGTCGCGTGGAGGATGTCTATCTCATGCGTGATGAATATAGACAGAGTCGTGGATGCGGGTTTGTTAAATATTCAAGCAAAGAGACGGCCATGGCAGCTATCGATGGTCTCAATGGAACTTATACCATGAGAGGTTGCAATCAGCCGTTGATTGTTCGGTTTGCTGATCCAAAGAGGCCTAAACCGGGCGAGTCAAGGGAAGTGGCACATCCTGTTGGACTTTGTTCAGGGCCTCGTTTTCAAGCTTCAGGACCAAGGCCTACATCTAACCTTGGTGACCTTAGTGTGGATGTAAGCCACACAAATCCTTGGCGTCCTATGAATTCACCAAACATGGGGCCACCTGGTAACACTGGGATCCGTGGTACCGGAAGTGACTTGGCTACTAGGCCAGGTCAAGCCACATTACCTTCAAATCAGGGAGGTCCATTGGGTGGTTATGTTGTTCCTGCCCTTAACCCTCTACCAGTCTCATCCTCTGCCACATCGCAACAGCAAAACCGGGGAGCTGGCCAGCATATGTCACCATTACAAAAACCTCTTCACAGTCCACAGGATGTGCCCCTTCGACCACAAACTAATTTCCCTGGGGCCCAAGCATCCTTGCAGAATCCTTATGGTTATAGCAGCCAGTTGCCTACTTCTCAGCTGCGGCCACAACAAAACGTCACTCCTGCAACAGCTCCTCAAGCTCCTTTGAACATCAACCTACGGCCAACACCTGTATCTTCTGCAACTGATCAATTGCGCCCTCGTGCTCAGCAGCCACCGCCACAAAAGATGCAACATCCTCCTTCTGAGCTAGTTCAGCTCTTGTCACAACAGACTCAGACTCTACAAGCAACCTTCCAATCATCTCAGCAAGCATTTTCTCAACTGCAGCAGCAGGTGCAGTCCATGCAGCAACCAAACCAAAATTTACCAGGCTCACAGACTGGCCATGGTAAACAGCAGTGGGCTGGATCTGCAATTCCGACAGTTGTTAGCACCACTGCTTCTACACCAGTTAGCTATATGCAAACAGCTGCACCTGCAGCAACTCAGAGTGTTGTTTCTCGCAAATGTAACTGGACCGAGCATACCTCGCCTGATGGATTTAAGTATTATTACAACGGTCAAACCGGTGAAAGCAAGTGGGAAAAACCTGAGGAAATGGTATTGTTCGAACGTCAGCAACAGCAGCCAACTATAAATCAGCCCCAGACCCAATCACAGCAGGCTCTTTATTCCCAGCCGATGCAGCAACAACCACAACAGGTTCACCAGCAATATCAGGGCCAATATGTACAGCAGCCTATTTATTCTTCAGTGTATCCAACTCCAGGGGTCAGCCAGAATGCTCAGTATCCGCCGCCATTGGGAGTTAGTCAAAATAGCCAGTTTCCTATGTCAGGCACCGGTCAAAATGCTCAGGAATTTGGGCGGACAGATACACCAGTGGGGGTTGCTTCCATCAATAATCCGTCACGAACTCAACAGGTACATGAAAGGAGGAGCTGA
Protein Sequence
- >Bo1g054910
MSRFDEDDEGFSRRRRRGNSPSNYQVGIGDRGGGDRRWEDDGPTDRNFHREGVGGGFRPMNAPPGRVDFQPMGYGFDGGFPPMSRDGGFRPNVPVNFPPSESPDAGGYSGGRGFQSTGPDYSVRLTSPPIQQPLSGQKRGRPLSEQSSFTGTDFTDRSSMVKLFVGSVPRTATEEEVRPFFEQHGNVLEVAFIKDKRTGQQQGCCFVKYATSEDADRAIRALHNQITLPGGTGLVQVRYADGERERIGAVEFKLFVGSLNKQATENEVEELFLQFGRVEDVYLMRDEYRQSRGCGFVKYSSKETAMAAIDGLNGTYTMRGCNQPLIVRFADPKRPKPGESREVAHPVGLCSGPRFQASGPRPTSNLGDLSVDVSHTNPWRPMNSPNMGPPGNTGIRGTGSDLATRPGQATLPSNQGGPLGGYVVPALNPLPVSSSATSQQQNRGAGQHMSPLQKPLHSPQDVPLRPQTNFPGAQASLQNPYGYSSQLPTSQLRPQQNVTPATAPQAPLNINLRPTPVSSATDQLRPRAQQPPPQKMQHPPSELVQLLSQQTQTLQATFQSSQQAFSQLQQQVQSMQQPNQNLPGSQTGHGKQQWAGSAIPTVVSTTASTPVSYMQTAAPAATQSVVSRKCNWTEHTSPDGFKYYYNGQTGESKWEKPEEMVLFERQQQQPTINQPQTQSQQALYSQPMQQQPQQVHQQYQGQYVQQPIYSSVYPTPGVSQNAQYPPPLGVSQNSQFPMSGTGQNAQEFGRTDTPVGVASINNPSRTQQVHERRS