Information report for Bo1g054910
Gene Details
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Functional Annotation
- Involved in the promotion of the transition of the vegetative meristem to reproductive development. Four forms of the protein (alpha, beta, delta and gamma) are produced by alternative splicing. Involved in RNA-mediated chromatin silencing. At one point it was believed to act as an abscisic acid receptor but the paper describing that function was retracted.
Homologous
- Actinidia chinensis: CEY00_Acc33056, CEY00_Acc22900
- Brassica napus: BnaC01G0239900ZS, BnaA01G0189100ZS
- Brassica rapa: Bra038446
- Citrullus lanatus: Cla97C06G113890
- Cucumis melo: MELO3C021258
- Juglans regia: Jr12_10090, Jr12_10140, Jr12_10120, Jr12_10130
- Manihot esculenta: MANES_03G206500, MANES_15G001500
- Populus trichocarpa: POPTR_010G147900v3
- Prunus persica: PRUPE_1G114600
- Rosa chinensis: RchiOBHm_Chr4g0425821
- Vitis vinifera: VIT_05s0077g00710
Gene Resources
- Pfam: PF00076 PF00397
- UniProt: A0A0D3A7P3
- RefSeq: XP_013602530.1
- AlphaFoldDB: A0A0D3A7P3
- KEGG: boe:106309916
- OMA: HPANTIP
- InterPro: IPR000504 , IPR001202 , IPR012677 , IPR035979 , IPR036020
- PANTHER: PTHR24012
- SUPFAM: SSF51045 , SSF54928
- PROSITE: PS50020 , PS50102
- Gene3D: 2.20.70.10 , 3.30.70.330
- OrthoDB: A0A0D3A7P3
- CDD: cd00201 , cd12637
- eggNOG: KOG0144
- STRING: 109376.A0A0D3A7P3
- HOGENOM: CLU_020343_0_0_1
Sequences
gDNA Sequence
- >Bo1g054910
TGTCACGTTTCGACGAGGATGACGAAGGTTTCAGCCGCCGTCGTCGCCGTGGAAACAGCCCTAGCAATTATCAAGTTGGAATTGGGGACAGAGGAGGTGGCGATCGACGCTGGGAAGATGACGGCCCCACGGATCGTAATTTTCACAGAGAAGGCGTTGGAGGAGGTTTCCGGCCGATGAACGCTCCTCCAGGGAGAGTAGATTTTCAGCCTATGGGTTATGGCTTCGACGGAGGTTTTCCGCCGATGAGTCGCGACGGAGGATTTCGGCCTAACGTGCCAGTGAATTTTCCGCCATCGGAAAGTCCAGATGCAGGGGGATATTCCGGCGGCAGGGGATTTCAATCAACGGGGCCTGATTACTCTGTGAGATTGACTTCACCGCCGATCCAGCAGCCTCTTTCTGGTCAGAAAAGAGGTCGTCCTCTCTCGGAGCAGAGTAGCTTTACTGGAACTGGTAAGCTTGGGCTCACTCTACTGTAATCGAGTTGTTTAGAGTTAACAGTGGTTCATTTATACTTGTATGTGATAATCAGAGCTATTTCCAAACTAAATTACGTTTACTGGATCATTCGTTTTGCAGATTTTACTGATCGTAGCAGTATGGTGAAGCTTTTTGTTGGCTCTGTACCAAGGACAGCTACAGAAGAAGAAGTGAGTTCATCTTTTTGATTATTTTCCTAATTTCTTCTCAATATATATGCACTTTGTTGAGGCAATCTAAACCACGAAGCTCGTAGACTCTGTTCATAAGCCGTTCTTGTTTATCTTTTTGGTTTTCATAGGTCCGTCCCTTTTTCGAACAACACGGAAATGTTCTTGAGGTTGCTTTTATCAAGGACAAGAGAACAGGACAGCAGCAAGGTATGTTTATCTCCATTTTACTAGGAATCAGTCGTGATTTATGCTTCTAAAATTTTCAGGTCTCCTGAAAAGGCTGATGGGAAGCAACCCCAGTCTCATCATTGGCCTCCATTAGTTTTCAACAATTTTCGGGCTTTTGCTTATGCTAGCGAGCGTCTTATCTGTGTTCGTTTGGCACAGAAGAAGGCTGCCTGTTTAGTTTACTAAGAAAGGGTTTTTGTATTGACCTTGGTAAAATAGTTTTTGCGACTTGTGTCCATCCTAGAACCTTAGTTGTGTTTGAACAGTGTAGCAGACTTTATCATGTTTTAGAGTTGGAGTTAATGTACATAAAATTGAACAGATGTTTTACTGTTGCCTTTTAGTTGGCACTGGTTTAAAGAACGTTGTTTTTTCCTTTCGTATTGAATTCAGTATCTCTTTACTCTTCCTTTCGATGAATGAAAATGGTGTATATGGTCTTGACTGGATGAATGTATTTTTACTTGGTAGTCTTACAACGTTCATAAAATGGTTTGATTGATAAACCACCCCTGCTAGTCAATATTTGGCAGTTTCTTAGTGATTATATCATGTTGGATGTTTTGTTTCTTTAGTTTCTTTAATATCAACTTTGGATGTACCGTCTCTATTGGTTGATGATGAAATTATTTTTTACCATTTTGGATGCTTGATGCCTTAATGAATGATCTTTCCTTTTTTTCTTATTGTGGATGGCCGAGGAACTATAATGAATGTTCTCTTCGCTTTTTTTGAATGGCCTGGGATGTGGACTTCTTGTATGTTCTCACTTTCATTGATGAATGACTGTTTCGTTGAGTAGCTCTATTGTTCTGTATGGTAACGCTAACACTGCTGATCTACATTATGTGGAAGAGATCATATGTCTAATGATATTTTTTTTCTATGTACCTTTCACCAACCAAGCTCAAAAGCTTGGTTTCAGTTTTTAGTGGTCTTATTCTATATAGAGCTTGGTTTCAGTTTTTAGTGGTCTTATTCTATATATTGAGATTGCTCTTGAAAAATTCCATCAAAGTTCTGTCTTTATGATGCAAGTGTGAAGAATTACTAGATGATGAGTGATGTATTATTTAATAATTCGGGACTTTCCAAGAAGTTATTGTACGGTGACATAAAAGCTTTTACTCATCCCGTTATCACGGTTTGACTGTAGTAGATTTGACACATTCCTTGGTTTGAAATGTTAGATGGTGCTAAGATATGGAAGGCAACGATTATTATAATTTCTTAGAAATACGTCTTAGCGTTCACTCGCTCTCATTGCTTCGATCAGCATCAGGCATGAGCCGCCTTAGTATGTATTTAATGAAGCAAGTGTCATTCTTCTCTATATGCAACTATTACCAATGAATTGACGTTGGGTTGTGGTTATGTCTCTCAGAACTGTAATTCTTTTTGTGAATGTCGTCAAATGTGTGGTGTATGTTGTATGGTGTATGGTGACGAAAATGTGATGTATGGCTCTAGTTTTAATTATATCATTTGTTACTTAGCAGTGATTGAGAACTCTTAACTTGTAATTTTATCTAATTTTTTTTTGCAGTGATTGGATCTTTTTGCGTAATATATATTTTATTTGCAAATACCGACTGTGTTCTTTTTAAATAGTTTAAAGGCATATGCTTTATTTGAAGACATTAGTTTATTATTCTCTCCATCAAATCTACTACAGTAATCTAAGTCGAGGCTGTCAGGACATGTCTTATGATTTTCGTACTGAAACTTATGTGCTTTCAATGTGGTCGTGGCTTGTACATTTGTAAAGAAACTATTTACTAGTATCTCTTGATGTTTGATGGAGGGACAAGTGGAACCTTGAACAGAAGCTTATGTAGCAGTCTTTAATGCAGGCTGTTGTTTTGTAAAATATGCAACTTCTGAAGATGCGGATAGGGCCATTAGAGCATTGCACAATCAGATCACTCTTCCTGGGGTAACTACCATTGATGCCTTCTCTTATCAAGGACAGGAAAATACAGGTTAACTCATCTTTTACAATTTGCTGATTCCCAGGGAACTGGCCTTGTTCAAGTTCGATATGCTGATGGGGAGAGAGAACGCATAGGTAATCAACTTTCGCGCCATATTATCTGAATCTGGCCTTCATTGTCTGGTATACATAGGGTGACCATACGCTGTACAAATTCAAATTACGAGAATTGAGATAATGTGGAAAACTATATGAATCTTAAGGAAGTGGATCCTTTTTTCTGTGGTCCTTGCCTCACTCTCAAGTATTAACTGATTGAATTTACTTCTTCTGAAGGTGCGGTAGAGTTTAAGCTTTTTGTTGGTTCCTTGAACAAGCAAGCCACTGAAAACGAGGTTGAGGAGGTATGTCTCATATCCTACTTTTTGATGGAAAGTAATTACTTATGTCTGATTTACAAAGAGGGAAGCGTTCTAAATTTAGATATTACCGTATCCCCTGTCGCCTTAGCTGGTAATTTTAGTGATTATATGACAATTTAGTAGTCCTCTTGGAAGGGTCAGCGGCTTGAAATTTTGTGTCAACTATTCGAGCGCTTACACATTTTACTAACTGAGTGATCTCTTCTTTCAAATGGACTGACTGAGTGATCTCTTCTTCCAAATGGATGTAACTTTTTGGCTGTCAGCTTTCTTTTCTCAGTAAATATGATGAAGATGTGAACGGCTACTTTGTCCTGTTGTTGCTTTAACAGCTCTTTTTGCAATTTGGTCGCGTGGAGGATGTCTATCTCATGCGTGATGAATATAGACAGAGTCGTGGTATGTCTGGTAACTGCTACTAGATTCTATAAATTGTTTGATGGTGTTGATATGGTCAAACTGTTTTTGACACTCATTTAGGATGCGGGTTTGTTAAATATTCAAGCAAAGAGACGGCCATGGCAGCTATCGATGGTCTCAATGGAACTTATACCATGAGAGTAAGCTGTGAATCACATGAGTATCTCACTTTCTCTCATTATCCCCTCTAGACCTGTTTTGTTTACTGGCCTCTTTCCCTTCTCCAGGGTTGCAATCAGCCGTTGATTGTTCGGTTTGCTGATCCAAAGAGGCCTAAACCGGGCGAGTCAAGGTATTGCCTTGGAGACTATATTTTGAATTCATTATAATGCTAATATCAAGAAAATTGTGTCTACTGTCATTGTTTGTTCTATTGAGTTACATTTATGAGAATCTTTTGGGGCATGGGTGGAGGAGAGCTGCGAACCTTATTCCTTCTCCAGTTATTACTTGAATGCGATGAATTTCTTTCTATATATCCATAACTAGTTTCTGTTTCCAGGGAAGTGGCACATCCTGTTGGACTTTGTTCAGGGCCTCGTTTTCAAGCTTCAGGACCAAGGTGACTGGGGTGAAAGGAGATCGTTGTTTTTGTCATCAATTAATTATATATTTTGACTAAACCTGGTCTCCTTATCTTCATTTGTTAGGCCTACATCTAACCTTGGTGACCTTAGTGTGGATGTAAGCCACACAAATCCTTGGCGTCCTATGAATTCACCAAACATGGGGCCACCTGGTAACACTGGGATCCGTGGTACCGGAAGTGACTTGGCTACTAGGCCAGGTCAAGCCACATTACCTTCAAATCAGGTAAGAACAGCTTGATGATCATGTATATTATCTTATATGTACACACCCAATCACACATAAAGTAATCGGGCATAAGGTTTTACATGTATTGTGTGAGTAGGACGAACATAATTTATATGCTGCACATATATGAGCGTATGGACTCTTGAAAAGAAGCATGAAGTTCCGACCTTCCAGCTTTTCATATGATGCAGCAAACTTGATGTGTTTTGCATTGAAATGATATGGCTTTGATTTGCATTTTGTCAGTTTCTAAGGAGTTTTTTTCTTCAATAATTTCTACTTCTGATGTTAGCTTTATTTGTGGCATTCTATAATGTTAGGGAGGTCCATTGGGTGGTTATGTTGTTCCTGCCCTTAACCCTCTACCAGTCTCATCCTCTGCCACATCGCAACAGGTACTTCAGCTGAATTTTTCCAATAAAGAAAATCTGAAAATGTTGTGTTGATCAGTTAATTTCAACTGTTTCTATTCCATAGCAAAACCGGGGAGCTGGCCAGCATATGTCACCATTACAAAAACCTCTT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CDS Sequence
- >Bo1g054910
ATGTCACGTTTCGACGAGGATGACGAAGGTTTCAGCCGCCGTCGTCGCCGTGGAAACAGCCCTAGCAATTATCAAGTTGGAATTGGGGACAGAGGAGGTGGCGATCGACGCTGGGAAGATGACGGCCCCACGGATCGTAATTTTCACAGAGAAGGCGTTGGAGGAGGTTTCCGGCCGATGAACGCTCCTCCAGGGAGAGTAGATTTTCAGCCTATGGGTTATGGCTTCGACGGAGGTTTTCCGCCGATGAGTCGCGACGGAGGATTTCGGCCTAACGTGCCAGTGAATTTTCCGCCATCGGAAAGTCCAGATGCAGGGGGATATTCCGGCGGCAGGGGATTTCAATCAACGGGGCCTGATTACTCTGTGAGATTGACTTCACCGCCGATCCAGCAGCCTCTTTCTGGTCAGAAAAGAGGTCGTCCTCTCTCGGAGCAGAGTAGCTTTACTGGAACTGATTTTACTGATCGTAGCAGTATGGTGAAGCTTTTTGTTGGCTCTGTACCAAGGACAGCTACAGAAGAAGAAGTCCGTCCCTTTTTCGAACAACACGGAAATGTTCTTGAGGTTGCTTTTATCAAGGACAAGAGAACAGGACAGCAGCAAGGCTGTTGTTTTGTAAAATATGCAACTTCTGAAGATGCGGATAGGGCCATTAGAGCATTGCACAATCAGATCACTCTTCCTGGGGGAACTGGCCTTGTTCAAGTTCGATATGCTGATGGGGAGAGAGAACGCATAGGTGCGGTAGAGTTTAAGCTTTTTGTTGGTTCCTTGAACAAGCAAGCCACTGAAAACGAGGTTGAGGAGCTCTTTTTGCAATTTGGTCGCGTGGAGGATGTCTATCTCATGCGTGATGAATATAGACAGAGTCGTGGATGCGGGTTTGTTAAATATTCAAGCAAAGAGACGGCCATGGCAGCTATCGATGGTCTCAATGGAACTTATACCATGAGAGGTTGCAATCAGCCGTTGATTGTTCGGTTTGCTGATCCAAAGAGGCCTAAACCGGGCGAGTCAAGGGAAGTGGCACATCCTGTTGGACTTTGTTCAGGGCCTCGTTTTCAAGCTTCAGGACCAAGGCCTACATCTAACCTTGGTGACCTTAGTGTGGATGTAAGCCACACAAATCCTTGGCGTCCTATGAATTCACCAAACATGGGGCCACCTGGTAACACTGGGATCCGTGGTACCGGAAGTGACTTGGCTACTAGGCCAGGTCAAGCCACATTACCTTCAAATCAGGGAGGTCCATTGGGTGGTTATGTTGTTCCTGCCCTTAACCCTCTACCAGTCTCATCCTCTGCCACATCGCAACAGCAAAACCGGGGAGCTGGCCAGCATATGTCACCATTACAAAAACCTCTTCACAGTCCACAGGATGTGCCCCTTCGACCACAAACTAATTTCCCTGGGGCCCAAGCATCCTTGCAGAATCCTTATGGTTATAGCAGCCAGTTGCCTACTTCTCAGCTGCGGCCACAACAAAACGTCACTCCTGCAACAGCTCCTCAAGCTCCTTTGAACATCAACCTACGGCCAACACCTGTATCTTCTGCAACTGATCAATTGCGCCCTCGTGCTCAGCAGCCACCGCCACAAAAGATGCAACATCCTCCTTCTGAGCTAGTTCAGCTCTTGTCACAACAGACTCAGACTCTACAAGCAACCTTCCAATCATCTCAGCAAGCATTTTCTCAACTGCAGCAGCAGGTGCAGTCCATGCAGCAACCAAACCAAAATTTACCAGGCTCACAGACTGGCCATGGTAAACAGCAGTGGGCTGGATCTGCAATTCCGACAGTTGTTAGCACCACTGCTTCTACACCAGTTAGCTATATGCAAACAGCTGCACCTGCAGCAACTCAGAGTGTTGTTTCTCGCAAATGTAACTGGACCGAGCATACCTCGCCTGATGGATTTAAGTATTATTACAACGGTCAAACCGGTGAAAGCAAGTGGGAAAAACCTGAGGAAATGGTATTGTTCGAACGTCAGCAACAGCAGCCAACTATAAATCAGCCCCAGACCCAATCACAGCAGGCTCTTTATTCCCAGCCGATGCAGCAACAACCACAACAGGTTCACCAGCAATATCAGGGCCAATATGTACAGCAGCCTATTTATTCTTCAGTGTATCCAACTCCAGGGGTCAGCCAGAATGCTCAGTATCCGCCGCCATTGGGAGTTAGTCAAAATAGCCAGTTTCCTATGTCAGGCACCGGTCAAAATGCTCAGGAATTTGGGCGGACAGATACACCAGTGGGGGTTGCTTCCATCAATAATCCGTCACGAACTCAACAGGTACATGAAAGGAGGAGCTGA
Protein Sequence
- >Bo1g054910
MSRFDEDDEGFSRRRRRGNSPSNYQVGIGDRGGGDRRWEDDGPTDRNFHREGVGGGFRPMNAPPGRVDFQPMGYGFDGGFPPMSRDGGFRPNVPVNFPPSESPDAGGYSGGRGFQSTGPDYSVRLTSPPIQQPLSGQKRGRPLSEQSSFTGTDFTDRSSMVKLFVGSVPRTATEEEVRPFFEQHGNVLEVAFIKDKRTGQQQGCCFVKYATSEDADRAIRALHNQITLPGGTGLVQVRYADGERERIGAVEFKLFVGSLNKQATENEVEELFLQFGRVEDVYLMRDEYRQSRGCGFVKYSSKETAMAAIDGLNGTYTMRGCNQPLIVRFADPKRPKPGESREVAHPVGLCSGPRFQASGPRPTSNLGDLSVDVSHTNPWRPMNSPNMGPPGNTGIRGTGSDLATRPGQATLPSNQGGPLGGYVVPALNPLPVSSSATSQQQNRGAGQHMSPLQKPLHSPQDVPLRPQTNFPGAQASLQNPYGYSSQLPTSQLRPQQNVTPATAPQAPLNINLRPTPVSSATDQLRPRAQQPPPQKMQHPPSELVQLLSQQTQTLQATFQSSQQAFSQLQQQVQSMQQPNQNLPGSQTGHGKQQWAGSAIPTVVSTTASTPVSYMQTAAPAATQSVVSRKCNWTEHTSPDGFKYYYNGQTGESKWEKPEEMVLFERQQQQPTINQPQTQSQQALYSQPMQQQPQQVHQQYQGQYVQQPIYSSVYPTPGVSQNAQYPPPLGVSQNSQFPMSGTGQNAQEFGRTDTPVGVASINNPSRTQQVHERRS