Information report for Bo1g020110
Gene Details
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Functional Annotation
- Floral homeotic gene encoding a MADS domain transcription factor. Specifies floral meristem and carpel and stamen identity. Binds CArG box sequences. It is the only C function gene. It interacts genetically with the other homeotic genes to specify the floral organs.
Homologous
- Brassica napus: GSBRNA2T00107731001, BnaC01G0121700ZS, BnaC03G0708200ZS, GSBRNA2T00131396001, BnaA01G0099500ZS
- Brassica rapa: XP_009132395.1, XP_009132380.1, Bra013364, XP_009132388.1, XP_009132372.1, XP_009132365.1, XP_009132356.1
- Raphanus raphanistrum: RrC152_p3
Gene Resources
- Pfam: PF01486 PF00319
- UniProt: A0A0D3A490
- AlphaFoldDB: A0A0D3A490
- OMA: QDQPPIQ
- InterPro: IPR002100 , IPR002487 , IPR033896 , IPR036879 , IPR050142
- PANTHER: PTHR48019
- SUPFAM: SSF55455
- PROSITE: PS00350 , PS50066 , PS51297
- Gene3D: 3.40.1810.10
- CDD: cd00265
- eggNOG: KOG0014
- STRING: 109376.A0A0D3A490
- HOGENOM: CLU_053053_0_0_1
Sequences
gDNA Sequence
- >Bo1g020110
CTCACCCTTCCATTTTCTGCAACTTCTCCAAATCTCATACTTTCCAGAAAATCATTTTCCCAAGAGAAATAAAACTTTCCTCTTTGTTCATCTCTCTCCCCCCAACAGGTCAGTCTAATAATTTGGTGTTCCCCAATCCTTTCAAACATTATCTTCTTCATGATATTACTTTGCTTCACTTCTTTTGGTCCTTATACCAAATCTATGTTCTTCTTTAGTTTCATTATTTCCTGTTTTAGTTTGATTCTTTTATGTTTCTTTGAGATAAACAGATCCAATATTCCTTCATCTTCTTTGCTCTTCAAAATTGTCTTTTAATTGTTTCTTCCTACAAAAAACCCGATGATTAATTAACTCTTGTTTGCATACTATGAATGTAAGATCAATAAAACTAACTTCCTTTATTAAACTAAATCGTTCTGATCTAACTTTTGATCTGAACCAAAATTCAAAAGAGTATTAAACGTAACAAATCTAGACTATTTTTCAAGAAACTGTGTTTATGAGTTTCTTGGATTCTTGATTTTGGATTAATCAATCTTGCCCTAAACTCTATTTTTTTTTGGCTTAGGAGCAGCAAACATGGCTTACCAAATGGAGCTAGGAGGAGAATCCTCTCCACAGAGGAAAGCTGGGAGAGGAAAGATCGAAATCAAACGGATCGAGAACACAACGAACCGTCAAGTTACTTTCTGCAAACGCAGAAATGGTTTGCTCAAGAAAGCTTACGAACTCTCTGTTCTTTGTGATGCTGAAGTCGCACTCATTGTCTTCTCTAGCCGTGGGCGTCTCTATGAGTACTCAAACAACAGGTTTCTTCTTAAATTAATTTCTGATCTTTTCTTAATTAGAATTTTTAATAGATTTATTACTTTAAACTGAGTCATCGTGTTAGGGTTATGTTAGAGGTCGAATCTTTACTAGGGTTCTCGATCTTCTATGCTAGATTTGATTCTATTCTTCTTTGATGGGCGATCCCTCTTCCGTGTTGAGTTAATTATTTTTTCACTTTTTTCTTGATATTCCATATATAAACACACTTAACACTTGTGAGAATCTTTGCTGGTACATATGTTTATGTTAATTACTTTGCGATTTTATTCATAGATTTTGTGCTTAATTATTTTCTAGATCTGGCTTCTTCTTCATGTGTCTCTTTTCCCTTTATTAGACTAAAGACTTTTCAATAGGTAAAACTTGTTATATATTAAGTGATGAAAATGGTACAAAAGTTATGGAGATCTGAGTGAGTGTTAGATAATAAATGAAAAGAAAATAAGAAACAATCAGAGTTTTCTAATGTGGAGTTTTAGATTCAGTTTTGTAGAACTAAGATTCACTTTGTTGGGGTTTTTTTCATCACTCCTTTCTATTATATATAATATATTTTATAACTTTCTATTTTCCCTACTAACAAGTACTCCAAGATTTAGATGTATTTTTAGATCTGGTGTTGTAATAGGTAAAATCTTGATTTTTATGACTATAACAGTAAGTTTTGGGAAACAATTTGAGAGCGTAAGGACTATGAGGTCATATCTTCTGTTTTTGTGATCATATACCCATCCTCCATTGTTGCTAATGTCTGTGTCTCTCTTTCCCTTCTCTTCTTTCTCTTACTTTCCTTTCTCATCTTTGCCTATTTTCTCTCTCATGAATTATCATATTTGATGCAACAACATGTGATGCTATGTGAGAGTAAATAAGGTGAAAGATATAGATTTTTGAGTGTCCAAAAATTTAAATTAATTAGTGCCAGAAATAATGGAAAGTACAAGCTAAGTAGGACAATATGTTTTGTCTTGGGGAATGTTAAGTTTTATTTATTTTGTAGTTATGGAAAATATCAAATATCTTTGAGCTTAGATTAGTTAGAAGTGGTTATAGCTAAAAGAAAAAAAAAAAATTCAACTCCAAACAATACAAGATTTTGATTTTCAGGTGGAGTATTAAGATTTAAAATAGACAATCAAACAAAGAGATATTTAAGAAAAATAAGCTCATGGAGTCTCTCTTTTTTCCTTCAAAATACTCTTTTTAAATTAAATATAATCAAAACACAGTTCGAATTATATTACTCAAACTGGTAATCTCTAATTCTACACGTAATTCCCAATATTTGTTAGAATCCACGTGATTTTCTCTTCTCTCAAACATAAAACATGTCAAAAGTGAATGCTGTAAACAAAGTCTTATTTTCCTAATAGCTTACAGTTGTCAACTCATGTCCAAAGAAAGAAAAGCTAACAAAGACTTCTAAGCTAAACATACGTTTCATATATTCTTGTTTTCAAGATTTTTTACCTTTATTTAGAGGTCGGTATTGAGCGCAATATTAGGTTTGGTCTCTGTAAGATTTGTTGTCTTTGTTACAGAATCTTTGATCACGTCATCACTCAGATATCATTTACTTTTATTTATCACTTATATTTATTAGTAGTATAAAGTTTTGATAGTTTCAGTTCTTGACTTCTGACAAGAAGGTTTATGTCATCATGAATTACTTGATAAATTCGAAAATCTCATATTACTACTTTTGACCATTTAATACTAGATTTCGCATTTGGTCAATACCTAATATAATTATCCCTTCTCAAGAAAGCCAAATCAGAATTCAATTCACATTATGTGTACTGTGTACATCTACACAGAGACAAATAATAAAAGGATATACTTAATAGTGTTTCATAGTTCTAAGAATCTTATTAAGATTAATGATCGTTGAATCAAGTAACTTTGGTATAGAAGAAGAGCGTTGGAGTTGCTTCAACATCTTTGATGTAGATACATTTGTGCAATTTCATTTTCTTTGTTTTTAAATTATTTTTTTGGTCTAACGAGAGAAAGTTAGGGCTTTTCTCATTTTCTCTCGCCTCATGGACTAAAAAAGTCTTTTGAATAAATAAATAAAATTAAGACTTTTTTTTATGTCTTCTGTGATGCTATAATGAACGGCTATGGATCCTCCCATCGAAGGGTCAGGCAACAAAATTTATAATATGTCATTGTACTTAATATGTATATGTGTATGTATTAATGTATCTGTATACTTTACAGACGACTCAGAAAACGATAAATGGGTCGAATGGTAATTGAATGATATTCCAATTAAGGAAAGTATGGAACGTTGTGATGTTACTCGGACAAGCCATTTAGTTACATCACAATTAAATTAATCCGATGGTTAAGAACTATAATCTATCAAATGTCTACTGGATTTACCATTGTGCAATGGGTTTTCGACACGTGTCGGAAACCCTAGACATGTTCAGACCAATCATGTCACTCAATTCCGCCAGCATGAAAGTTGTAGCCAATCACCAGCTTCATAAATTTAAGGTTTCAGTAAATGATTCTTTATTTGTTACAACTTTGAGGAATATTTAATCAACGATAATTTATTTCTTGTATCTACCTTTTTCTTCACCTCATGTGTCACGTTATGTTTCATTTGTTCTGACTCAAAAGAACCGATGTTTGCTTTTAAGGTTTCGTATTAAAATCATTTATCTGAGCAAGTGGATGATTTGACCCTTAGTTATTTTTCTTATTAATCGAAATGCTGATTTAAGTTTTAATTGTATAGCTAATACTTCTAATCAACTTATTAATTCCATTTCAAAAATTATTGCAGTGTAAAAGGGACAATTGAGAGGTACAAGAAAGCAATATCGGATAATTCTAACACCGGATCCGTGGCAGAAATTAATGCACAGGTAACTTTAGTATTACAAGTACGATTTTAAGTTTTTTTCCCAAAAATGTGTGTGCTAATAATATAACACTTCTTTTCAAGTATTATCAACAAGAATCTGCCAAATTGCGTCAACAAATTATCAGCATACAAAACTCGAACAGGTTAATATTTTTTAAATGACTTGAAATGCTTTTGATTAATTCAATAGCTTCGTTGGTACCAACTATCTTAGATATCAATACTTTTTGTAAAATAAATTAGGCAATTGATGGGTGAGACGATAGGGTCAATGTCTCCCAAAGAGCTTAGGAACTTGGAAGGAAGATTAGACAGAAGTGTTAATCGAATCAGATCCAAGAAGGTAATTGTATTTGATAAATACTTACAAATTCAATTTATTATCTAGGAAGTATATATATTCAGTTTTACTAAATTTATTAATTATTATTTTATATTTTTGTATAGAATGAACTCTTATTCGCCGAAATTGACTACATGCAGAAGAGAGTAAGAAACCATGTTATATCCAATTTTATTTTCATTGTTAATTTGTATTTATGATAATTTGGCTCATTTGTAAAGTCTGTGCAGGAAGTTGATTTGCATAACGATAACCAGCTTCTTCGTGCTAAGGTATTGTGTACATTTGGCTGTTTCTGTGTATTATTTTACTATAACAACAAAAAGGTTATTAGAATGATTAAATACTAACCAAATACATGTGCGTAAATGTGTGTGTATATATAGATAGCTGAAAATGAGAGGAACAATCCAAGTATGAGTCTGATGCCAGGAGGATCTAACTACGAGCAGATCATGCCACCGCCTCAAACGCAACCTCAACCGTTTGACTCACGGAACTATTTCCAAGTCGCGGCATTGCAACCTAACAATCACCATTACTCATCCGCAGGTCGCGAAGACCAAACCGCTCTTCAGTTAGTGTAAGAAAACAAAAAAAATTGTTATATAAATATTTCTAGGCATAAATTTGATATTTTTGTTTCATGTATACTTTGCAGGTAA
CDS Sequence
- >Bo1g020110
CCTCACCCTTCCATTTTCTGCAACTTCTCCAAATCTCATACTTTCCAGAAAATCATTTTCCCAAGAGAAATAAAACTTTCCTCTTTGTTCATCTCTCTCCCCCCAACAGGAGCAGCAAACATGGCTTACCAAATGGAGCTAGGAGGAGAATCCTCTCCACAGAGGAAAGCTGGGAGAGGAAAGATCGAAATCAAACGGATCGAGAACACAACGAACCGTCAAGTTACTTTCTGCAAACGCAGAAATGGTTTGCTCAAGAAAGCTTACGAACTCTCTGTTCTTTGTGATGCTGAAGTCGCACTCATTGTCTTCTCTAGCCGTGGGCGTCTCTATGAGTACTCAAACAACAGTGTAAAAGGGACAATTGAGAGGTACAAGAAAGCAATATCGGATAATTCTAACACCGGATCCGTGGCAGAAATTAATGCACAGTATTATCAACAAGAATCTGCCAAATTGCGTCAACAAATTATCAGCATACAAAACTCGAACAGGCAATTGATGGGTGAGACGATAGGGTCAATGTCTCCCAAAGAGCTTAGGAACTTGGAAGGAAGATTAGACAGAAGTGTTAATCGAATCAGATCCAAGAAGAATGAACTCTTATTCGCCGAAATTGACTACATGCAGAAGAGAGAAGTTGATTTGCATAACGATAACCAGCTTCTTCGTGCTAAGATAGCTGAAAATGAGAGGAACAATCCAAGTATGAGTCTGATGCCAGGAGGATCTAACTACGAGCAGATCATGCCACCGCCTCAAACGCAACCTCAACCGTTTGACTCACGGAACTATTTCCAAGTCGCGGCATTGCAACCTAACAATCACCATTACTCATCCGCAGGTCGCGAAGACCAAACCGCTCTTCAGTTAGTGTAA
Protein Sequence
- >Bo1g020110
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