Information report for Bo1g011580
Gene Details
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Functional Annotation
- Involved in vernalization. Required for epigenetic silencing of FLC, and for vernalization-mediated histone modification.
Homologous
- Brassica napus: BnaC01G0076600ZS, BnaC03G0768600ZS, BnaA03G0524300ZS, BnaC07G0502300ZS, BnaA08G0151900ZS
- Brassica rapa: Bra024023, Bra010256
- Gossypium hirsutum: Gohir.A07G001000, Gohir.D07G001400
- Lactuca sativa: gene-LSAT_5X59301
- Manihot esculenta: MANES_12G085100
- Prunus persica: PRUPE_1G463300
- Vitis vinifera: VIT_04s0008g03120
Gene Resources
- Pfam: PF05185 PF17286 PF17285
- UniProt: A0A0D3A2Y3
- AlphaFoldDB: A0A0D3A2Y3
- OMA: VFIFTHP
- InterPro: IPR025799 , IPR029063 , IPR035075 , IPR035248
- PANTHER: PTHR10738 , PTHR10738:SF0
- SUPFAM: SSF53335
- PROSITE: PS51678
- Gene3D: 2.70.160.11 , 3.40.50.150
- eggNOG: KOG0822
- STRING: 109376.A0A0D3A2Y3
- HOGENOM: CLU_010247_1_0_1
Sequences
gDNA Sequence
- >Bo1g011580
TGGGAGAGTCTGCCAGGGCAGCCATATTAAGCACTGATGTAAGTGCCTCACCTATTTACCACATCGTTATAAACTCGATTTGAAGTCCTGTGAGTCACGAAATGTATTTCTATTTTTTTAATCACCAGAGGTGCAAGCAGGCAGAACCAAACTCAGTTCTAACAGTTCTCTTATTCCTTTTACAGCTTGGCTACAGGGATTTTTTGCAGGCACCCCTGCAGGTTAGTCTGTGTTCATAAGTAATATTGATTTCTATCTGTTCATCAGAATATATTTCATGAAAATGCTTTATTCTTACTGTAAAGAGTTCCTACTGTTATTTAAATACAGCCTCTGATGGATAACCTTGAAGCCCAAACCTATGAGACGTTTGAGAGAGACTCTATTAAATACATCCAAGTATGTTGCCTATGCTAGTTTTATTTCTTCCACATCTTAAATTTTAACACCTCTGTTTTCTGGAGTACCCTTCTATTTCTGCTTCGGTTTGCGGAAGAAGGATACTGATGGATGATTTTTATATACAACTCAATATCATTAACACTATTTTGCGTGATTGGACTTTTTGTCGTGCCTAACTTTTTCCATCTTCGTGTTGCTAGTATCAAAGGGCAGTTGCTAAAGCCTTGGTGGACAGGGTCCCTGATGAAAAAGCGTCCGAGTTAACTACTGTATGTCACCTGCCAATGTTTTTATTTCATAGGTTACATGTGGCATTTTCATTTATAAGTTTTTGTTTTTTGGTAACCTTATAAATTACTTCAATAGTACTAAAGTTTTTAGTTTGTAGGTCTCGATGGTTGTGGGAGCAGGAAGAGGACCCCTTGTGAGGGCATCGTTGCAGGTAAAGTTCCGATGCAGTGATCACAACTGAGACTTCAAAATTCATTTTTTTTGGGATCAATTGTGTTAATTGGTTTCTTATCCCAGTCAGCTGAAGAAACTGGCCGCAAGATGAAAGTTTATGCTGTCGAAAAGAACCCTAATGCAGTTGTAACGCTCGATGTGAGTTGTCAGCAACTGAGTCAATTAAAACATTGTTAAGTTTTATGTTGTTTCTTTCCGGCATGCAGAGCAGTTTTATTAACTCATAGAGCATTGTTATCCTATCTGACAGAATTTGGTTAAGATGGAAGGGTCATGCGACATGCGTTTTTGGAGTGCTCCTGAGAAAGCTGATATATTGGTTAGTATGAACAGATTTTGGTAGATATTACTCATGCCGGCATTATACAGTTCATCTAACTCTCGTTTGCATATGTTCTTCAGGTTAGCGAACTGCTGGGTTCTTTTGGAGACAATGAACTCTCTCCTGAGTGTCTTGATGGAGCCCAAAGGTTTCTGAAACCAGATGGAATTTCAATACCATCCTCGTATGTATACTCCTTCGCTAATGTCTAATTCCCACAAGAAAACTATGTCTAACAGCTGCTAGTTCAGCTTGAAGCTTGAAGAACATTGCATCTGTTTTTCTGTTTCAGTGATCATTGTTACTTTTGTAGGTATACAAGTTTCATACAACCTGTAACAGCTTCAAACCTTTACAATGACGTATTTTCATACAACCTGTAACAGCTTCAAACCTTTACAATGACGTATGTCCTTCTGACTTCTGCTGTGTGCTCTTTATCTCAAGTACTTTCAGTTCAGCTTAGTTTTTATTTTTACTGATTGGCAGGTTAAGGCTCATAAAGATCTTGCGCACTTTGAAACTGCTTATGTCGTCAAACTGCACAGTGTAGCTAAACTTGCTCCTTCCCAATCTGTGAGTCTCTCTCTCCCTTCAGGTTTGCTTAATAGGTTATAGCGCTCTCTTTGAATACATTTATGCAAGTTTTGTCGATCTCTTGATCTAAGGGAGGTTTGTTATGGTATCAATTAGGTTTTCATATTTACTCATCCAAACTTCTCAGCAAAAGCCAACAACCAACGCTACAAAAAGCTTCATTTCAACCTACCAAGCGACGCTGGCTCAGCCTTGGTGCATGGTACAAGCTTTTCTAGTTTTTGTCATTTAAAATGGGAATTATTATCTCCATTTTTCCTAACCTGAAACTAATCTGCTGTGATCACAAATAACAAAAACAGGGATTCGCTGGCTATTTTGATTCCGTCCTGTATAAAGACGTCCATCTTGGTACCGAGCCTACAACAGCAACACCAAACATGTTCAGCTGGTCATGGCTTAGTGTTTAAATATGCCATTTAACAGATGGACAGCTCTCTCCTATGTCAGAAAAAGAAAACTGATGTAATATAATGTTCCTTTTGATAGGTTCCCAATCTTTTTCCCATTGAAGAAGCCTGTGGAGGTCCACCCTGATTCTCCATTAGAAGTACACTTTTGGAGGTGTTGTGGTTCCTCAAAGGTAAAACTAAATGTCATAACCATAATGATTGTAGTATTGTACACTGTTGAGTGTTGACTCTCTTAGTCTTTGAGAACTATTATTGATTCTCTGATGTTCGGGTTCAGGTTTGGTATGAATGGTCGGTGTCATCTCCTACTCCATCTCCGATGCACAACACCAATGGCCGTTCGTACTGGGTCGGCCTTTAG
CDS Sequence
- >Bo1g011580
ATGGGAGAGTCTGCCAGGGCAGCCATATTAAGCACTGATAGGTGCAAGCAGGCAGAACCAAACTCAGTTCTAACAGTTCTCTTATTCCTTTTACAGCTTGGCTACAGGGATTTTTTGCAGGCACCCCTGCAGCCTCTGATGGATAACCTTGAAGCCCAAACCTATGAGACGTTTGAGAGAGACTCTATTAAATACATCCAATATCAAAGGGCAGTTGCTAAAGCCTTGGTGGACAGGGTCCCTGATGAAAAAGCGTCCGAGTTAACTACTGTCTCGATGGTTGTGGGAGCAGGAAGAGGACCCCTTGTGAGGGCATCGTTGCAGTCAGCTGAAGAAACTGGCCGCAAGATGAAAGTTTATGCTGTCGAAAAGAACCCTAATGCAGTTGTAACGCTCGATAATTTGGTTAAGATGGAAGGGTCATGCGACATGCGTTTTTGGAGTGCTCCTGAGAAAGCTGATATATTGGTTAGCGAACTGCTGGGTTCTTTTGGAGACAATGAACTCTCTCCTGAGTGTCTTGATGGAGCCCAAAGGTTTCTGAAACCAGATGGAATTTCAATACCATCCTCGTATACAAGTTTCATACAACCTGTAACAGCTTCAAACCTTTACAATGACGTTAAGGCTCATAAAGATCTTGCGCACTTTGAAACTGCTTATGTCGTCAAACTGCACAGTGTAGCTAAACTTGCTCCTTCCCAATCTGTGAGTCTCTCTCTCCCTTCAGGTTTGCTTAATAGGTTTTCATATTTACTCATCCAAACTTCTCAGCAAAAGCCAACAACCAACGCTACAAAAAGCTTCATTTCAACCTACCAAGCGACGCTGGCTCAGCCTTGGTGCATGGGATTCGCTGGCTATTTTGATTCCGTCCTGTATAAAGACGTCCATCTTGGTACCGAGCCTACAACAGCAACACCAAACATGTTCAGCTGGTTCCCAATCTTTTTCCCATTGAAGAAGCCTGTGGAGGTCCACCCTGATTCTCCATTAGAAGTACACTTTTGGAGGTGTTGTGGTTCCTCAAAGGTTTGGTATGAATGGTCGGTGTCATCTCCTACTCCATCTCCGATGCACAACACCAATGGCCGTTCGTACTGGGTCGGCCTTTAG
Protein Sequence
- >Bo1g011580
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