Information report for BnaC06G0192800ZS
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- Encodes a AP2 domain transcription factor that can repress flowering. SMZ and its paralogous gene, SNARCHZAPFEN (SNZ), share a signature with partial complementarity to the miR172 microRNA, whose precursor is induced upon flowering.
Homologous
- Brassica oleracea: XP_013590878.1, Bo6g068410, XP_013601987.1, Bo8g087280
- Brassica rapa: XP_009116196.1, Bra007123
- Raphanus raphanistrum: RrC4601_p1
Gene Resources
- Pfam: PF00847
Sequences
gDNA Sequence
- >BnaC06G0192800ZS
CACTTGCATGTTGTCAACTTTGTATTTCCCGATGACGATGAAATACCAAGACTTAGTTCAAGGTCGCTGTGAGCATTTCCTGGAAGATAAAAATGTTAATGAATCATATATGAATGGAGATCTATTATTCTGTACTAATTAAATTGCTTAAAGACAAAGGCAAAAGGTTTAGCTAGCTAGGGTTTGCTTGATTTAATCAAAAGTAAATGTTAATTTTGTGGTTAGTGTTGTAACTTTCACTTAAATTGATCAATCAACGTCAGTAGATGTAAACGTTGTGATCCATATATATGAATTACCTTTAATATGGGAACCAAACTTCATGACTCCCTTTCCCAGCTCATTGTATTTGATTGCTGCTGCATCCCATCCCCTGTGAATATTCACACATGTATAATATCTCAAAACCATTTACAACATAGTATTAACTCTTTGGTTTCTTTGTGTGCCTATAATGGTGTTCATCTAATCATCTGTAAAGCTTATACGATGAAACATAAAATCTACAGAAATGTGATTTGATCAGCTGATTCAGTCAAACTGAAAAAAGTAACTGTGAAATATTAATTAAATATTTTTCTCATAAAAAGTGAGAGATAGGCTTTGAATGGTAAACAATAGATTAAAACAAATGGAGTATGGGTGGACAGAACATTAATGATTGACGAATACTTGTATATGTAAGCAGACAACTATTGCACTTTTTAAACCTGTTAACGAAGAATTTACAAAAGTATGATAATATTACACACGTGTAACAAAATATGATAGTGTTCAGTGAAGTGTTTTTAACATGAGATTAGATAAGAGTTGCGGTAAACCTGTTTTGGAATAGATGAATCTGATCATGATGGTTTTTGAATTGTGTGCATTTCTGAAGAGTTAAGCCTTTGTATTTGGAACTCCCTCTTCCGAAACTCGCACTCTCTCGCCTAAGTGTTTGCACGAACTCCACTTTATCTAAATTCTTCATCTATATGCAATTGATCATTTAGAATCCATAATTAATTCGACAAACGACAAACAAATATATACAATAGATAATTCAGCTTCATATATTTCAAGGGACGTATCTCTTGCACGTTTATATATGATATAGACTATTATATGTTTAACCTTGTCCATGTCTTGTCTGTAATCATCCACGACGAAGTTGATATCTGCATCGAGACCACGGAATTTGATAGCAGCTCGGTCGTACGCCCTGGTATATATATTCATATTCATTTATTAATAATCAACTAATATTTTTTAATATACTGTAATGTGTATACGTTGACAAAACCAAATCATACTAAAAATAGGAATGTTGTCACAAATAATATTTTTATATATTGTGTCTATTGTGTATATCAAAATTTCTCGTACCTTGCTGCTGCGTAGGCAGTATCAAACCCGCCTGTTGCGACAAACCATTATATAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAGGCTAGGTTAATAAATAAATAATCAACAGAATGTTTAGTTAGAAATTCATCGTTTATGTCTAATAGACATACACACGCGATTAATACGACCCGGTCGATAAAAAGATTGATCATACTTACCCAAGTAAACTTGCTTTCCACAATCCCTATAAATCATCAAGTCCCAGAACAAAAGTTAGGTTTCGATTGATAATTATTAAAATAAATAATAAAACTAATTAATAAAAAGCAATGAAATGAATAAAATAGAAAATAAGTTAAAAATTGAGGAAAGAATATGATTTTTTGTGAATAAATTCTTAAATTTAGTGATGATTATATGTATTTTTTTAAAATTAATAAATTTAAAATGTGTTTTTAAAGGTAATTTTATAAAATAAGTAATATATTTGTAAGAGAAGTAAATCGTTCAATAATAATAATAATAATAATAAAGTTTTTTTATATTTTCCTCATTGAAAAGTACTGTATTGATTATCAAAAGAAACAAAAATATATATATTTTTATTTGTAACTTAAAATAATTTTATTTTGGTTAGTACCAAATATGAGATTCCCAACGACCGGTGCGACGGTAAAAAGTGACGCCACGATAGTGAGAACTTCGTGACCTTGGTCCTCTTCTGCCCTTCTTCACCATTTGCTGATTACTCCTATGTAACGACGACAGATTCAACCAGTGTCTGTCGTCTCCGGAGAATTCAATATTCCGGCGAGCATCAGCCACAGGGAAAAGACCTTCTGCTTCCTTGAGAGGAACAACATCTCCGTCACGTTTGAGAATCCCGAAGGTGATGAAAGGTTTGTCGGTGGCAGAATCTGTGGATGATAATGAATATAAGGAGAGGTTAGATTCTTCTTCACCGGCAGTTGAGATTAGTGGTACTCTACGATCATGATCTTCTTGATAGTAAGAGAAGGTTCCAAGGTTGAGATCCAACAT
CDS Sequence
- >BnaC06G0192800ZS
ATGTTGGATCTCAACCTTGGAACCTTCTCTTACTATCAAGAAGATCATGATCGTAGAGTACCACTAATCTCAACTGCCGGTGAAGAAGAATCTAACCTCTCCTTATATTCATTATCATCCACAGATTCTGCCACCGACAAACCTTTCATCACCTTCGGGATTCTCAAACGTGACGGAGATGTTGTTCCTCTCAAGGAAGCAGAAGGTCTTTTCCCTGTGGCTGATGCTCGCCGGAATATTGAATTCTCCGGAGACGACAGACACTGGTTGAATCTGTCGTCGTTACATAGGAGTAATCAGCAAATGGTGAAGAAGGGCAGAAGAGGACCAAGGTCACGAAGTTCTCACTATCGTGGCGTCACTTTTTACCGTCGCACCGGTCGTTGGGAATCTCATATTTGGGATTGTGGAAAGCAAGTTTACTTGGGTAAGTATGATCAATCTTTTTATCGACCGGGTCGTATTAATCGCGTGGCGTACGACCGAGCTGCTATCAAATTCCGTGGTCTCGATGCAGATATCAACTTCGTCGTGGATGATTACAGACAAGACATGGACAAGATGAAGAATTTAGATAAAGTGGAGTTCGTGCAAACACTTAGGCGAGAGAGTGCGAGTTTCGGAAGAGGGAGTTCCAAATACAAAGGCTTAACTCTTCAGAAATGCACACAATTCAAAAACCATCATGATCAGATTCATCTATTCCAAAACAGGGGATGGGATGCAGCAGCAATCAAATACAATGAGCTGGGAAAGGGAGTCATGAAGTTTGGTTCCCATATTAAAGGAAATGCTCACAGCGACCTTGAACTAAGTCTTGGTATTTCATCGTCATCGGGAAATACAAAGTTGACAACATGCAAGTGA
Protein Sequence
- >BnaC06G0192800ZS
MLDLNLGTFSYYQEDHDRRVPLISTAGEEESNLSLYSLSSTDSATDKPFITFGILKRDGDVVPLKEAEGLFPVADARRNIEFSGDDRHWLNLSSLHRSNQQMVKKGRRGPRSRSSHYRGVTFYRRTGRWESHIWDCGKQVYLGKYDQSFYRPGRINRVAYDRAAIKFRGLDADINFVVDDYRQDMDKMKNLDKVEFVQTLRRESASFGRGSSKYKGLTLQKCTQFKNHHDQIHLFQNRGWDAAAIKYNELGKGVMKFGSHIKGNAHSDLELSLGISSSSGNTKLTTCK