Information report for BnaC05G0298000ZS
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a U1 small nuclear ribonucleoprotein (snRNP) factor involved in alternative splicing.
Homologous
- Actinidia chinensis: CEY00_Acc25644, CEY00_Acc14670
- Arabidopsis thaliana: AT1G04080
- Brassica oleracea: Bo5g004290, Bo8g002740, Bo5g079900
- Brassica rapa: Bra015287, Bra030554
- Gossypium hirsutum: Gohir.A07G204300, Gohir.D07G158300
- Manihot esculenta: MANES_13G040100
- Vitis vinifera: VIT_07s0005g04290
Gene Resources
- Pfam: PF05843
- UniProt: A0A816L1B7
- EMBL: HG994369
- AlphaFoldDB: A0A816L1B7
Sequences
gDNA Sequence
- >BnaC05G0298000ZS
TAAGAACTATAGTACACAACCTTGGAGGCTTTAAAGATGGCATGATGGATTTCACCAGAAGCAGAAGAACCAAGAGCAACCTGCATCACTTTGTTTTTGCAATTGAAGAACCTGTACCAATAAGAATACAAATCAAAGACTTAATGTAACATATATTAATCTCAATTACATTCAAGCAACATCCATCTATTCATAGTTTTAAAAAACACAGCAACGTACCTTCCATTGTGTCTAAACCATTGTCTGAACTCCTTCGATTTGATATTTCTCATGTTTCCGAAAGAGAAAACATAGTCAGAATTATATTCTCGACAGCCTCTCTGATTCCATTAAAAATACTTGCCTTGACTCAAAACCATGAAGTATTGTAGGGTTACTGAATAATACGTACGATGGCCTGATTTTCTTCGTTGTAGGCGTTCTTGATGCCACAAACAACACGAACAATGTCTGCAGAAAACTTTGGTAACAAAGGTTGAATACAGATGGACAATTATTAAACCAATAAAATGTTAGCTAATTGAAAAACCAAGATTAGATACAAATATCCAGCAAATCCACGTTTGTATTAACTAAAGACATGAGCTGCTCATATTTCTGAAACATGAACTGTTCTGTAGAATAAAGGCAGTTGTCTACATAAGCTCCACAAAGTTGGTCAGGTCGTTGAAGCGAATGGAAACTGGTGAGTCAGTGAGTTTGAAGTGGATGTTACTTCTTGTGACATTGAATACGCTTAGCACATAGATGGCATCTTCCTTCAACAGGTGCTTCAAAGTTTTGAGTCTATGAGCCCCGGTAGAACCTTGAACCAAGGTGGACTGTAAAACATAGGGATACTGGTGATAACTTTCAAAATTTCATAAACGTGCCAAAAAATGTTGTGATTTGTTACCCTTTTGAAGATTGGAAAATTCTTTGAAGAACTTACTTTAGTGCTCTCGCAGCTTCGGCTGCAACACATAATGATCCAACTCTAATATGTTCAAATCCTCTGTCTCTAATCCACCTATTTATGCCAAATACGAATTCCTGTAACTCTTGAGAAACATAGAAGAAATCAGTATTAGAAAACAATATTCTCTTTAGGTGTGATTGTATGGTCATACCAAGGATTTTAAAGGCAATCAACGATTTGAGTTTTTCCACCGTAGGCGGAAGAAGACGACGCTGGTGATGCTCGTCGACTCCTCTGACTCTAATCCCCTTGAGACGAATTTCTTCGTTGGAAGAAGCTTTGTGATTTCTCTTGGGCACCTTGCGCCACATATATACAGAGCTTCGGTGATGGGGGAGGTGAGAAATCTTGATTGATGAGGAGAAAGTGGATGAATTGATTGCATACTATAATCACTGTTAATAACTCTGTCAATTGAATTGAGGGAGAGATGAACAGACGGGGTTACGTTTCATACCCCAGCGAGAAAGAACCTGTATCAACGTGGATTAGGGTTCGTCTTCTTCTCAGGTTAAAACATGATTTCATATTGTCTTATAAAACCAAATCTCGTTTGTATCGTCTGTTTTCTTCTCTCTACAGAAGAATTTCTCTTCTTTTTCTTTGAGAATTTTGTCAGTCTCGCTTCAACCAAAGCTTGGATGATCACACCGAGGCCCGTATCAAGAGAATCATTAAAAGCCAAGAAGAAACGTAAAGATGAAATAATTCGGAGATGACACGTGTCGAGCTTTCCTTACCTCATTTGATGACGTGGCAACACCAGAGAAGAGAAAAACTCTACTTTATAGTAATAGATGTGTGATAGTATAATATTTAGATTAAAAATTTAATCACAATAAATATTTTGATGAACTTTAATTAATATTAAATAGCCTTTGTAAGATAATGTAAAAATTAAATTAAATATAATGAATTTAACTAATTTTATGTAACATTTTATTTATTTAATTAATAATATTGATAATCTAAAGTATTAGAGTTGTCTACTACTTGATCTTATCAATTATTTGTATTGTAGTTAAGCTTGTATGATCGTATAATATATTACAATATATTATAATTTATTTTTTGGTATAATAGTTAATATTTGTTTGTTTTGGAGTTTACATGAAGATTTTTAAGATTCTTTGAAAACTATTTCCTAATTTTGATAATTGTTTTCTAGTTGTTAAATGCTGACGATAAGATAAACAAAGTCTAGATAGCGTTTTCATTGTAATCTTGAGATTTTTTTTCTAATTTTTCAAAATTTGTAAATTTTTGTGTTTTTAGTTTGTTGATTATAATACTTAGACTATATATATATATATATATATTGATAAAGTCATATTGATTGTTCATTCTATCAGTTTTTATATTATTTTTCATGCTAATTTATTGTTGATTACCAGTTGTTGTTTTATTGAATTTGTCTCATTAATAGGCTTCCGATTTGACTTTGATCGTTATGGGCTAGTACCAAGATCAAGTCCTAGACAGGCAGACCTCTTCGTTATAAATTTCATTTAGAAGCTTAATTAACTTATTTGACATGCTTTTTTTAGGCTCTTTATTTTAAACATTGTTTTCTAAATATTTTCTCGGACATAAATCAGCAGAGAGCAACTTGATTTATATGAGGTGAATCAAACTAATGATTATAAGAATTCATCATTTAGTTTGCTTTAAGAACAATAATTTTTAAAAATCTTGCAAATCACTAGCATATTAAATTTATTTTAGTATAACTTATTTGGTTAGTTTCTATGAAGATCTTGACTGTAACTGACTATAATAATATTTGTCAAAACATAAAATCATAGTGTTGATTTATATTAAAAATATTAATGGATAAATATATTTGTTTATTTCTTTTGATTGATTAAAACTAATTTGAAACTCATAAATAAATTATGGCTTGGGGATCTCACTTTGTTCTCATAGTTAACATATTTCAGAGAGAGCTGTGTAAATTTCCAATCATGTTTTCATATTGGAATTATTTTCTAGTATATCCGATATTTTCTGGTGTGATACATTTTTTGTCTATTCGGATTTTGTCTTCGGCTTGTATGATTTACTTTTCATCGCGTATGTTTTTCGTTTTCCTTCAGTGTTATTTTTCATTAATTTCAAATCCTATATTTCTTGTTTTGCTCCTTGTTCATGCGGATTATGCGATTTTTTGATTTGAATATTATAAAAGAAAATACATTTGACATTGATTTCTAATTTATTTTGAAAATACGCTTTTGATGTTTTATTTTGAAGAGTATATTTAATTTTTGTGTTCTTGCAAGTTAAAATCGTGTATTCTTTATTTTATATTTTATTTTAGTTAATTCGCTTTATTAAATTTAAGCAACAGGAAGTGCGTAACTCTGTGCTGGATATGCCTGTTTTCACAAAAAAAAAAACTGATTCCATTAGAACCTCGTGGTTAGGCTAGGAGTTCTAAACATTTACTATGAACATTGGTTACCTGAGCAGGATATACGCCATAAGCAGCAGCTTGTGGGACGGGTGCTGGTGCTTGTGGAGCAGTATAACCAGCGGGATATGCACCATACGCAGCCTAAAACGTGCATAATGTGAACCATTAGAAGAGTAAAAACATATACACTAAGGAAGTAGATGATTTGGTTTTTTTTTTTAATAAAATACCTGCTGGCCATAGGCGGGGTTCCATTGCTGTGGTTATGCAGGAGCGGCTTGTGCTTGTGGACAAGCCTGAGGCTGTGCAGCGTATCCACCAGACCACTGAGCTTGTGCAGACACTGGCTGAGCAGGAAGAGTTCCGTTGTAAGTTTTCGCCATTTTAGTCCTATCAGAAGATAGAAAGTCATCTGCGCTACGCTTTCTCAGCTCTGACGTGCTCCGACGAAAGAGTTTAGCGTGTTGATCTTCTGCCTTTTTGATGGTCTTGACATCTCCAAAAAGGCCCAAGAACTGCAAAGCCAT
CDS Sequence
- >BnaC05G0298000ZS
ATGGCTTTGCAGTTCTTGGGCCTTTTTGGAGATGTCAAGACCATCAAAAAGGCAGAAGATCAACACGCTAAACTCTTTCGTCGGAGCACGTCAGAGCTGAGAAAGCGTAGCGCAGATGACTTTCTATCTTCTGATAGGACTAAAATGGCGAAAACTTACAACGGAACTCTTCCTGCTCAGCCACAATGGAACCCCGCCTATGGCCAGCAGGCTGCGTATGGTGCATATCCCGCTGGTTATACTGCTCCACAAGCACCAGCACCCGTCCCACAAGCTGCTGCTTATGGCGTATATCCTGCTCAGGTAACCAATGAATTCGTATTTGGCATAAATAGGTGGATTAGAGACAGAGGATTTGAACATATTAGAGTTGGATCATTATGTGTTGCAGCCGAAGCTGCGAGAGCACTAAAGTTCTTCAATTGCAAAAACAAAGTGATGCAGGTTGCTCTTGGTTCTTCTGCTTCTGGTGAAATCCATCATGCCATCTTTAAAGCCTCCAAGGTTGTGTACTATAGTTCTTAA
Protein Sequence
- >BnaC05G0298000ZS
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