Information report for BnaC05G0008000ZS
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes REDUCED CHLOROPLAST COVERAGE 1 (REC1) a protein with similarity to the FLOURY locus in maize. Located in the nucleus and cytosol. Contributes to establishing the size of the chloroplast compartment.
Homologous
- Actinidia chinensis: CEY00_Acc19775
- Arabidopsis thaliana: AT1G01320
- Brassica oleracea: Bo5g002550
- Brassica rapa: Bra033269
- Capsicum annuum: T459_21991
- Citrullus lanatus: Cla97C06G110500
- Glycine max: Glyma.07G055900
- Juglans regia: Jr07_08680
- Manihot esculenta: MANES_05G023000
- Populus trichocarpa: POPTR_002G170900v3
- Prunus persica: PRUPE_2G188000
- Rosa chinensis: RchiOBHm_Chr1g0359431
- Vitis vinifera: VIT_15s0046g00740
Gene Resources
- Pfam: PF15044 PF12807
- UniProt: A0A078FL63
- EMBL: HG994369 , LK032052
- OMA: VPTIAPW
- InterPro: IPR011990 , IPR019734 , IPR023231 , IPR025697 , IPR027523 , IPR028275 , IPR033646
- PANTHER: PTHR12601 , PTHR12601:SF17
- SUPFAM: SSF103107 , SSF48452
- PROSITE: PS50005 , PS51823
- Gene3D: 1.25.40.10
- OrthoDB: A0A078FL63
- SMR: A0A078FL63
- CDD: cd15466
- STRING: 3708.A0A078FL63
Sequences
gDNA Sequence
- >BnaC05G0008000ZS
TTGCTTCCTTATCACTCGCAAAACTTTTACTATCTCTATCTTTTTCTCTCACACCCTTCCTCCATGAAAGCTTACAGCTTCAGTTTTTCTTCGCACTGCTAAACTCTCACATAACTCTTTCTTATCATATTTTTTTACCATTCACTTTTTAGATTTCATATTTCGCTGGTGGAAAAGCTCACTAAACTAAGCTACTGCTCTACCTATCACTCGGTAACTACCGAACTTTGATTATTATTTTTCATGTTTAAGTTTGTGTTATATCAGCAGATAACATAGCTAACTGTATTATATTCAGTTTAAATGATTTGGATAAAATTATGGACATATAATTTGCTCATTTGTTTGTATGTCAGACAATGGTATTGTTTTAAGTTTTAACTAAGCAATTCGATTTATTTTCAGTTTATTTGGTTCTCTTTCAATAAAAGTAAAAAACAAAAAAATCTCGAGAAATGGCTCCCAAGAACAACCGTGGAAAGACAAAAGGAGACAAAAAGAAGAAGGAAGAGAAAGGTATCACCAATAGTGAAACCTTATCTATATGAATTTCAATTAAAAAAATAAGCTGTTGATTAATTTCCTTTAATTAATAGTTAAATTATAGTTTACATATGAACCATGGTTTACGGTTTATATGCAGTTCTTCCGGTTATGGTGGATGTCATTGTGAACCTTCCGGACGAGACGGAGGCTATTTTGAAGGTTCGTGTGATTATTTTCCTCCCATCATTTTCGAATTGTGTTGTTATTTCTCATATTTCTTGCGTGTTAACAACTGTTTTTTTTGGTAGCGATTTCTTTGTGAAATTCGTTATAACTTTTAACTTACAACCCGTTTTCTATTTTTTTTGTTTTAACACTTTCATGCACCCGGCTGATTTCTGTTACATTAGTTTCTTGACTGTATAATTGTATAATTCTGAAACTTTATCTTAATATGTTTCATGTTTTGCTTTTGATATAAACTCCCAATGTGCATGGCCGATTTTCTTTTCTTTGATTTTATTGTTGTTGTTGGGATAAGGTACGAAAGAATACACGTTACCATAAAAATTGATAGTTATACATGCTGTATTATTATTGTTTTTTCTAAATAAATCATTTTCAATTGACTTAGAATTATCTTTTAATTTTTTTTATCATTATTTGAACGTGTATATAAATACAAAACTGTGTGTAACACACAAATTAGATTATCAACTAATTCATTTATTTCATATTTTGGTAAATAAATTACGTAGACGTTATACAGACAGTGAAATATGTATAACGATAACATGTGTATATATACAAAATTATCGTCAATAAACACGTATAACTAATATTCATATTTTCTCGAAAATTTGTTAGACAGTTTTCTTCTATGATGCAATATCAGTGGTATATATAAGCCGTATTCCAGGCATAGGTTACGCATGTTTATTATCCTAGAAGAAAATATGATCAAATGTAGATTTAATAGAGAAACACGTATGTCTGAAAACAGGGCATATCAACGGACAGGATCATAGATGTTCGTCGGCTTTTATCCGTTAACTTCGACACCTGCCATGTCACCAACTATTCTCTCTCCCATGAGGTAAAAAAAACTATGAATGATATTTTGAGTGGAAGTTTCTAAATCACTTTCTCGTTTATGGTTGGTTACTTGTTAATGTTGGATGGTCCAGAGATATTCATATTTATTGGGGAATCTCATAGGATCTGAATACCAAAGTAAGGAAAAAGCAAATGAAAAAGACTTTTGTCTAACGTCTGAGAAAAAAAAATGTTTTTAAGTGTGATTGTGCCTAAAAATTGCTAGTTTTTGTCTTTTCTTTCCCTTTTCTGGAACTAGAAATGTAACCAGAATAAGTTATTTTTTCACTGCTTAAATCATAGGAATAGTATAAAGAAAATTAAAAGTTAGAATCATAGTAATAGTATAAAAGGAGTAAAAATTGTACTGTAATACTAAATCCATGTCTGTCGTTACAGGTAAGAGGATCGCAGTTAAAAGACACAGTGGATGTTTCGGCGCTTAAGCCGTGTGTTCTCACGTTAACAGAAGGTAAAGTTCCATCGTGCATCACAATTTGACGTGACGGTCGTTTTTAGTTCGACGCCGTTAACGCGCCGTAACGGATATAAAAAACGTGAAATCACATAAACGATGTCGTATTAATTATATGCCAAAACGGCGTCACATAAGCTTTTTTCGCGCTTCTTCTAATCAGGTGACGTTTGCAATTCTTTTTTTTTTTTCGTTCAGAGGATTACAATGAGGGAACAGCGATGGCGCACGTTAGACGGCTGCTTGACGTCGTCGCCTGTACTACTTGCTTCGGTCCGTCGCCGGAGAAATCCGATTCGGTGAAAAATGCGCAGGCTAAGGGAGGTGGAAAGAATCCCAAACAGACCGAAACGTCGCCTCCGCCGTCTCCTGCGCCGAAGGATGCGGTGGTTGATGAAGCCGGAGAGACTAGTCACTCTTTCCCTAAGCTCGGAAGCTTCTACGAGTTTTTCTCTCTCGCTCACATCACTCCTCCTCTTCAATGTAAGATTCTATCTCCCTCTCTAACCTTAAATTCGATGTCCATTTTCTCAATCGATTTGTATATGTTTATAGATGTACGGCTCGTGGCGAAGCGGGAAACCGAAGATATCGCGGCGGATGATCATCTTCTCTCCATCGATGTAAGCGCAAAGATCATTCTCCTTTCTATCTCAATTGGTTGGTTTCTCCATGTAGCAGTCGGCGTTTTGGTGATAACGTTTGCGTTTTGGTGAACTTTGGTCTCAGGTGAAGCTTTGTAACGGGAAGCTCGTTCATGTCGAAGGCTGCAGAAAAGGATTCTACAGCGTCGGGAAACAAAGAATCATATGTCACAATCTTGTTGATTTGCTTAGACAAATTAGTAGAGCCTTCGATAATGTAACTTCTTTATTTCGCCTCTCTTACCGTTGAAAATCCATTTGCTTATTCCTTTTTTTTTTTTTTTAATCATGTTTAGGCTTACAGTGATCTTCTGAAAGCATTTTCGGAGCGCAACAAGGTATGTTTATTTTTCTCTGAAATGAAGATTTAGCCGATGTTGAATTGGGTTTTGTTAAGTTTAAGAGCGTTTAATCTCTATATGTGCAGTTTGGGAATCTTCCTTATGGGTTTAGAGCAAACACATGGCTCATCCCGCCTTCTGCAGCGCAGTCACCAGCAGCGTTTCCGCCTCTCCCTGTCGAGGATGAGAGATGGGGAGGGGATGGTGGTGGTCAAGGAAGAGACGGCAGCTACGATTTGGTTCCGTGGGCCAACGAATTCGCCTTTATCGCATCGATGCCTTGCAAAACAGCAGAGGAGAGGCAACTTAGAGACAGAAAAGTGTTTCTCCTTCACAACCTCTTCGTTGATGTCGCCACTTTCAGAGCCATCAAGGCTGTTCAGAAAGTAATGGCTGACCCAGTTCTGGCTGAAGACTCTCAAGTGCTGTATTCCGAGACAGTTGGAGACTTGAGTGTTACGGTTACGAGGGATACTTCCAATGCAAGTAGCAAAGTGGATACAAAAATCGACGGAATTCAAGCCACTGGTTTGGATAAAACGAAGCTGATGGAACGGAACCTTCTCAAGGGACTTACAGCTGATGAGAACACTGCTGCTCATGTTAGTCTTTTTTTTTATATAACTTTCCATGTTTAATATTTGTTACTCATTGTTTAACAATTGTTCATGGACGCAGGATGTTGCTACTTTAGGAACTATAAGCCTTAAGTATTGTGGTTACATTTCTGTTGTCAAAATAGAGAAGGAGAATGAGAAGTTAAGCCCACCTTCTCAAATTGTTGACCTCCTTGAACAGCCTGAAGGTGGTGCTAATGCTCTAAACATCAACAGGTGATCATTTTTTACTTAGTGGGAAAAAACATTCATCCTTTTGTCTCTTTAGCTTGTGTAGTTACTTACCTGACTAATTATTCTCATGGTGCTTTACAGTTTGAGATTCCTTCTCCATAAATCCTCTCCTGAGCAGAACAAGAAAACACATCAGCAACAGGATGATGAGCTTACATCTTCCCGAGAATTTGTAAGTAAAATGCTGGGGGAAAGTCTTGTTAAGCTTGAGGAAGAAGAGATAGACAGGGATAATATCATGAGGTGGGAACTTGGAGCCTGTTGGATACAGCATTTACAAGATCAAAAGAATACGGAAAAGGACAAAAAACAAACCAACGAAAAGTCTAAAAATGAACTCAAGGTTGAAGGGCTTGGGAAGCCGCTTAAGTCTCTCAACAGCAACAAGAAAAAAACAGACGCAAGCAGCCCTAAGGCGCAGCAGACTGCAGTATCATCTCAGGTTGATACGGCTTCTTCAGAGGCTGATAATGCTGCAATAACTGCAACTTTGCAATCTGACGCCGAGAAGAATGCTCAAGAAAATGTGCTTGTCCTGAAGAATTTGTTGTCTGAAGCAGCCTTCACTCGCCTACAAGAGTCAGATACTGGACTTCACGACAAGGTTTTTACACTAAACCTCCAGTCCTTTCTCTATGTTCATTTACTTATTTTGTGGTAACTAAGAATATTTGTTTCAGTCTTTGCAAGAACTTGTCGACTTGGCACAAAAGTATTATACTGAAGTCGCTATTCCGAAGCTGGTAAATGAGTCTAAAAGTTTATTGTAGTCTTGTCTATTGCTAATATGAAGATAATAACACATCATGTGTTTGGTATTAATTGCTCAATACAGGTTGCAGATTTTGGTTCGTTGGAACTCTCCCCAGTCGATGGCCGGACTCTAACTGATTTTATGCACACAAGAGGTCTTCGGATGCGCTCTTTAGGATATGTCGTAAGTAGCCTTGTTTTAACTTCTTTTTATTAGAATCTACTGAAGATGAATGATCATATATAACCATCCACGTGTTATCTATGGTAACAACAGGTTAAGCTCTCAGATAAGTTGTCACATGTACAGTCTCTGTGTGTTCATGAGATGATAGTTAGAGCCCTTAAGCATATC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CDS Sequence
- >BnaC05G0008000ZS
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Protein Sequence
- >BnaC05G0008000ZS
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