Information report for BnaC04G0443400ZS
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a cytosine methyltransferase MET1. Required for silencing of FWA paternal allele in endosperm. Two lines with RNAi constructs directed against DMT1 have reduced agrobacterium-mediated tumor formation.
Homologous
- Brassica oleracea: Bo4g151200, Bo8g100720
- Brassica rapa: Bra030191, Bra039939
- Daucus carota: DCAR_009626
- Glycine max: Glyma.06G178200, Glyma.04G187600
- Nicotiana attenuata: A4A49_19701
- Populus trichocarpa: POPTR_004G134000v3
- Prunus avium: Pav_sc0000113.1_g130.1.mk
Gene Resources
- Pfam: PF01426 PF00145 PF12047
- UniProt: A0A816K2W1
- EMBL: HG994368
- InterPro: IPR001025 , IPR001525 , IPR017198 , IPR018117 , IPR022702 , IPR029063 , IPR031303 , IPR043151 , IPR050390
- PANTHER: PTHR10629 , PTHR10629:SF51
- SUPFAM: SSF53335
- PROSITE: PS00094 , PS00095 , PS51038 , PS51679
- Gene3D: 2.30.30.490 , 3.40.50.150 , 3.90.120.10
- SMR: A0A816K2W1
- CDD: cd04708
Sequences
gDNA Sequence
- >BnaC04G0443400ZS
AAAAAACACACACACACACAAGAGCAACGATAACAACAATGTTTCGTCGAACACAACTTCGAATCAAGAAACTATATAATATAAGTATGACAATCGAGTTTCAAGAGTTTTACCAAAAAAAAATTGAGTTTCAAGAGATGAGGTTTATTACAATGAAATAAATTATAAAGAAAAAAAATGCAAAACTAATTACTTTTGGCGAAGTTGTTGAGCTGTACTGCTTCTTTGAGCTTGCGACCAAGAGCAAAGGCCAAAGGGGGAGGCACTGCGTTCCCAATCTGCCTATGCTTGTGTGCTATGTCCCCTTCGAACTCATAGCTATCCGGAAACCCCTGCCACATAACAACCAAATCAATATCATTACTTGACTTGGAACATAATACTTACTCCCTTTCTTAATATTTGACATTTTTGCAGATTTTTTATATGCTAATTTTAATATTCAATATCAAATTTATTAACTTTTGTGTTATGTAGCTTTTGTTGTATTGTAGTTAAACAGATTTTTATTTTTACTTTAAAGTAAAAATAATAAATATTTTATTAATTTGCCCCACGCTCCTAAAACATCAACTAATAAAGAAAAAAGGAGGTTCATATATTACCTGAGATCGGGCGCATTCACGGACAGTGACGATCCTGTCTTGGTCAGGATGGAAGCACTTACCAACCATACCCATGGGACCAGGTTTAGTGACGCAAGTTGGAAAGTTGCCGTCCCAATCTAACCTCCCAAACAGTCCTTTCCACTGCTTTTTTTTACCAGGTTTCGCTGCTAGACACCCTGGAATCAAATCCACCACCAGTCCAGTAGATAACGTCACCTGTAATTAGAGTGTTAAAAATAATTGAATTTAGTAAGTTTGTCTAGTCGGATATGCATAAGAGTCTTATTATAGGACTCTGACCTTTTCCTCTGGGAGGTCACGCCAATCAGCACCTGGCCTCTTCGGGATTCTTTTACATCGGATGAGGTTGTGTTCGTTCATCGTTTGGCTAAGGTGATCAGTGGGAACATTCCTGTTTCCTCTTATCTCCTTTTGGAACCACGAGATTGGATCAGTTTCATACTGCAACAACACACAAGACATATTTTGATGTGTCATATCATAAAAACACTTTTTTTCTCCTGATGTGTGTGTTATATCATACCTCTTTGTCTATATTGGATTCTCCATTCTTTACTGATGGAAGATCGCCGATTGTGTCTCTCACGGTGATTGGACGGAAAGGTGCTCCCTGTTGAGTACTACGAACAGCAGCGTAGCGTAAACCTTTGGATAGTGAGATATTCAGCTGTGAAACATTAAAGACATGCATCGGCTCAGGCCATTCGGGAAGAACGTCTTCCGGTGCAGCTGCCCATATAAAAGCTCTTTTGCGAGATTGAGAAACCCCATATGCACCTGCCTCCAAGACCCCAAATCTCACCTGACAAAACATCATATTAGCAGAGACTTTGAGAATTCTATTTCCACATTGCAATGCTTACAGAGAGCATGAGTCTTTGTTACCTGGTAACCCATTTCGAGAAGAGAAGCCAGAGTGAGTTTAAACATCTGCCCTTTACTATATGAGACAAAGTTCCTCACGTTCTCCAGGAGAAAGTATCTTGGCCGGAAATAATCAACAAAAGACAAGAATGCTAATACCATTTGACACTGAATTTTACTCCATGGGCTTTGGCTGAACCGGTTCATACCAGAGAATCCCTGCCAAATTGCATTTGATTAAGGTCTCTTCTTCACTTATGCAAAAATATATGTATATATACCTGACATGGAGGGCCTCCGTTGATGAAATCCACTTGGCCAGGCAGTGGCAGAGTACGCTTCTGGTCCTCATCAAGTTTAGCAGCGAGTTCATTAGCTTCTGTAGTAGAGATACACTCATCTTGATCTCCACATTTCTCCATTATAGCCCTGCAACAGATAATCTCAAACAACTGATCACAACGCAAGAAACATGCACATTGAGAGAGAGATAGAGAGTAAAGCGCTGTATCTTGTCTACTAATTACCTAAGAGTCACATTGCAGTTATCAACAATAACTGTTGTTTCGGGATGGTTTTTTCTAAAAGCCTCCCCAGCTGGCCCTTCATACTCGATCGCCCACTTTGTTGCAGATACACCTTGTACAGCATGCACATGAATACCATCTTATTCAAGGGCTTTTGGTTGATAAAAGTGTTGGCTGGATATATAATACATACCTGCTTGTTCCAGTCCCTGAGACAGGCCACCACAACCAGCAAAAATATCTAGGGTCGCCAGACGCATCTCTTTAGGTAACTCATCAGGCTTGACAATACCAGAACCAGTTTCACTCTCTACTCCCTTCCCCTTTTTCTTTCTTAGAAGTGCGTCGTCCTTAACTGTAGAGAACTTCGGCTTGATATTCAGGGGCAACTGTTCCAAGATAATTAAGAGAAACATTTTAATTTTCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAAAAATTTTAATTTTAATTTTGTATTGGAACAGCAACAATTATAACAAATGAGTTATATAAACAATATTATATACCTGCTTGACGGAGCCTTTGGATGGGTCGTATATTTGTTCACAAAAGAAAATGTTCTCCGATATTGGAAATTCACTACAAGAGGGCATATCATTCTTCTTCCTTACTTCACATTTTCCCTTTAGAGCCTCTGGTTGGACAACAAATGTGTCCTCGCTGTAATACACCTAAAACAAATTGCAACAAAAGGAAGAAAAAAAAAACAGTTAAAAAGATTGTAAGATAAACTTATGAAGCATATATATTACAGAACAAATAATTGCTACCTCTCGGATATCTGAAGCATAGGCCTTTCCTTCAGATACATCTTCAGGCCTATAAAACCTTCGGACATTAACCTCAAAGGAACTCTTTCTAGATTTCTTTGGGACAATGATCTCAACAAGTTGGCACACAACAAAGGCTCTTAACCCGACGTTCCGCCCTGGCTTAAACTTCCCATTACCCTTCTTCGATCCATCTATACAGTCGGGGTATACGTAGACAAAATCGTCAGCACAGTAGTCAACCCCATAGGAGGAAAAACCAGTCTTCGAAGCGTTGAGTTTGATCTTTTTCCTCTCCTCTTCATCCTCTCTTACTCTGCATGAAGTGCACGATCCAGAAGCACAGCCCATATCACTCAGTGGAAGACGAAAGAAACCTCCTCTCTCAGGTGAATACAAACTCTTGCAGAAGTATTCCGTAGGCAAGTCTTTCGCCTTTCGTTCTTCAGCTCTTGCCCGGTCCAGCTTATCCGCAACGGCGTTCTCTTTCCTAAACTGATGCCCCCATGGCCTCGTTCGAATCTCGAAAGAGACTGTCCCTTTTACGTCCTTGAACTGTACAGCCATACATTTGTTCGTCAAAAACAGTTCCCTCTCGTTAGCAGCATTCTCCAGAACAGTCTCGGACCCTCTTTGTAAAAGTCTTCCATGCAGCATTTTGCTTTGATCTGAACTTTCAAACATGTACTCCACAAAGTAGATGGCCTGAGTTCCGCCGACTTCCGCGATGACAGCCCCACCTACAGCCACTGTTTCCCCTTCGAGGAGGGCTTGTCGATAGAGAGGCTCACCAGCCGAAGTTCTTCCTAGACTCTCACCATCCCATCTCGTTTCCATTTTTCCACAACTGTCTACAATTTTCTTTGGAAGCGTATGAGACTCTTCGACCTCAGCAGCTTCAGGTTCAGTTTCCTCCGCGTCATCTTCATCATTTTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCAGCCTCTTCCTCCACGTTTTCTGCACCAACCGCCTGCAAAGGCTCCTCTGGAGAGTAAATGGAGTAAAACTCGCCCCAGATTCTGTTGATCAGGCGCGTTGTCGTTGCTTGCATAGCTTTCCTCTTGGATACAGGTGCCACACCCGCCCTTGGGTTCAAATTCACTTTCAGCAAAATCTTCTTCTTCTTGATGGTCCATCTCGTGTTGTGCTTTTCCGCCCTTTTATTCGCGAGACCAGTAATAAACGCACACCTTCTGATCTCCTTGTTAGGAAACTCCGAAAACATCTGCAAGATTATCTGCCCGTGGCCAACCACGTATCTGTCAACAGCCGAGCGATCAGAAGAAATGTAAGCCTTATGGTTACTCTCGAGCTCAGACACTCTTCTTACGACATCTTCAAACGAAAGCCTCGCCATTCTAGTTTGCACCTCCAGCAGAGCAAAAACGCCGACTGCAACCCTCGCTGTTTTCAGAATAGGTTCGAACCAAGGGGAGTACTGCTTTGACGGTTTCCCAAGTCGATACCAGGCCGCATCTGTTCGTATCGAAACCGAGACCGTTGACACCCCATACTCAATCATCCATTCCTTTATTTGACTGAGGAATATAGGTATCCCAGCATGTTCCTCTGACGGCATAGAGGTAGCAGGATCATCTAGATCAATCCATATCCCTTGATCATCTGCCATCACACCGGATCCAAAGATAGTCACATCGATATCGGCACAAGGCTTCATCGGGAGAAGCTCCAGGGATATCAACCGTGAATCCATGTCGTAAAGCGCCCAGTTTTGAAGCATCTTACGAGGCAGGTCGTCGATGTCAACCTCGTAGTCGTCGTCATGGTATAATAAAAGCTCGTCAGTTTCTACTTGGGAGTTCTTGTAATGAGCTGGGAGAGGATAATCATTAGCGATCTCATCTTCAGTGGTCATTATGTATCCGTTCTTTGAAACGGAAGCTGAGCTGCTGCTTTTTCTGGGCCTTTGCATAGATTTCATATACTCTTCATCTTGTACAAGTCTAGCAAATTTTTCATCCTCGTCAACCATCTGCTGATCAGATGACACGGCCTTCCTCTCAGAAACTCCATCAATCCTCAGAACCCCATTAGAAGGTTGCCCTGCATCATATTCAAGTATGCTACTACTCGCATCCCTGAGAGCAACGAGTACAGGAATCTCAACGAATCTTGCATCATCTTTCTTAGCCGTATCATCCAAACCGGCAAGCT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CDS Sequence
- >BnaC04G0443400ZS
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