Information report for BnaC03G0162800ZS
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- Polycomb group protein with zinc finger domain involved in negative regulation of reproductive development. Forms a complex with FIE, CLF, and MSI1. This complex modulates the expression of target genes including AG, PI and AP3.
Homologous
- Actinidia chinensis: CEY00_Acc27906
- Brassica oleracea: Bo2g050550, Bo00798s010
- Brassica rapa: Bra029179, Bra022541, Bra015200
- Citrullus lanatus: Cla97C07G144090
- Cucumis sativus: CsGy4G004110
- Gossypium hirsutum: Gohir.D03G105800
- Manihot esculenta: MANES_06G130800
- Nicotiana attenuata: A4A49_60215
- Prunus persica: PRUPE_4G152500
- Rosa chinensis: RchiOBHm_Chr5g0028591
Gene Resources
- Pfam: PF09733
Sequences
gDNA Sequence
- >BnaC03G0162800ZS
TACGAGGAAGAAAAGGACTCCGGAATCCTTGCAGGGTAGTCGCCGTCAGAGAAGATGTCAGGTCTAAAAGGAGCCATTTTGGTGTCGCCTAAAACAGGTGTTACATTACATGGCTTAACACATTAACTTACTATATTAAAAACTATATAAATTAATAATGTTGGGACTATGATATTTTATTAATTTATAAAGTTATTAATTTACAATTTTTTTATTTATAGATTTTCTATTTTTGAATATTTTTTATTTATAAAATAAAAAATATTTGATTTTAGCGTATATACATCAATTAAATTTTAGAAATTCGACTTTCATCGTGTTAATTTTATTATATTATTTGGTGTATATTTTAATGCTTCATATAATTTAAATGTGGTTTTTGTTATAATTTTACTAAATATTATCAAAACATATTAAAATGTTAAAAGAGAAATAGATGTATTTTCATTGTGAATATAAAACCAACGATATAATATTTAGTTTATAATTATATAAAATGTATATATAGGCATATTATTAATTTATGATTTTAATGGAGATTTGTAGAGATACTCTCCATTGCGGATGCCCTAATACCGGGAATCCAAATAAGAGAAAAGACCTCAAACTATCTGAAACAATACCATATAATTCAACAAAGCTTCCCCAGACTGCTTGATAGACTGAATAAGTTGGGATGAATCAGACTGAAACTGCACTCGATGGAATCCCATCTCTATGCACTTCACGACCGCGCTTCTTAGGGCCAGTCCCTCTGCTATCAAGGGTGATCTTATAGACCGTGAGCTTTCCTTATACGAGACTACAAACGTCTCCATTTGTAAGAAACATAATCTAAGGAACGACTTTATGACCAATGGAAAATAAGTAAAAAAGAATGGATGGGGTAAAAGTAAAACCTCAAACTAAGCCAAAGAAGAAGGAAAAAAGTAGTAATTAAATAAAATCCTACAATCAATTCAAGCATGAACCCTAGAATGAATTCTTCAGAATGCTGATGGACAATTATTTAGTCCCGTTTCATTAATTACCTACCATTTATCGGGTAAAATATATTTCAGACAAATGTAATATACAAACTTTTCTGTAAAGCAAATTAATAACTCCAAAATAAAAATAAGTAATTTAATAACACTCAAACGGGAAATTAAGGGATAATGTAAAATAATAACATCCAAAACGAAAAAGGATAAAAGGGGTCCAAAAGTAGTTAAAACCTACTCTCATTTCCTTTTTCTATTATTTAGAGTTTTTTTTAAAACTTAAATAAAGGCTTCTGGGTCTTCAATTTGCAAGCTGTTCGAAAAGCACCATACAGTTGTTCAAGGTTTGGGCGTCAAGGCGGCCATAAATCTTCAGTGTCCAGATATACTTTTTCCAGCACCTACACAAGTACTCACATTTATCAATAAAACCCACTTTCTTCTCTGAAACACCTTAAGAGTTAAATTACCAGAGCAAGTCCAGATTTCGGACCAAGAAGGGTCCGTGTAGTTTTGAGAACGCCTCACATCCACATGCGATGCAACCACCTGTGATAACTCTGCAAAGGGTCAACAACCAGTGTCAAGCTAATGCTTTATCCTATCATTATCTTTTTTAATGTAAAAAGTTGTGCAGGAATATCCACAAACTATATATAAACACATGTGACGCCAAATTTGTTTGCATTAAGACTCGAAATCACATGTACTGAAAACAGAGAAGGCATATACATACCGGTGCTTCTTCATAAAAGAGTTCCACATGTTCATCATTTGCAAGTCTGCAGGACCCATTCCTGGAGGAACTGTTTGACTAGACGACTCAGCACCCCCAGGTGGTATTTGGCTCTTCTCACTTTTAACAGAGTCAGCAGCATCTGAAGATTAAAAAAAGTTAAGAATTTGTCAAATGATCCAACGTTGTCCAATGCACATAAGAAAGTAAATTAGTCATAAATATTAAACTAAACAGGTTCCCAAAACTATAAATCCAGATAAGATTCATTACAATCAAGCACATACCGTCAGTCTTAATTGGCCTCGGCCTTGGGTTCCTTGCCGGAGTCTTCTGCTTCCTACGGCTGGATTTCATTGAACTGTTATTGTAATTTTTTTTCATGGTTTAAGTAAGATTATCACCTAAATGGGAGTAAGATAAGTAAAGTAAACATAATAGGCCAAGACAACTTACGAGAAAGGGTATGGTTCCAGCCTTGCGTTAGGGTCGCCCTTATTAGTCTGAATTTTGAAAAAATACAAAAGACAGATAATATATTATAGCACAATTTCTACTACTAGAAGGTTTGACACTGTTGTGCCATCGAAGACAATAGAAGATATCATAGTGTTGCAAATAAGGAAATATTCCAGTTCTCCTATTTAAACACTCAAAAGTCAACAGCGCATTGGGAATATTATTTTGGAAATAAGATGTACTAACCTCGGTGAACGTTACCTCACTCTTGAGAGACACATTTACAGCCGGATATTTTTCATTTACCTAAAACACAAGTGGAGCCGATTAGTGGGAACAATTAAAAATACTGAGCAATAGCTAAATGAGCTTTGAAGTTACAAACCCAAAATTCGAAATTGAAGAGATCATGGGTTGATGGCATGTGACACTCCAGGCCCTAAAACATGATTGAGAACAAAAAAAAAGATTACATCACTACATAGAATATATATAGTCCACTAGTATATTTTACTCAGAGGTATGAATGAGAGTAGAAATGAAAGTTCACCTTAAAACTGGCACATTTTACTAAGCAGAATGGACAAGTAAAGTCTCCAGTTACTGGAAGAAAATAAAATCCAAAATGTAATTTATGATACACATTATATTTTACACACATGGGTATGAAACAGGTTAATGATTACACAAATATACCTTCAGTTTTCTGTAATTTGTTGTTATAGTAACTGTAATTGAAAGCTACTTGTCCTTTTCTCAACCTATGCAATGGATATAGAAGAGTGATTTAGAGTCGACATGAAGAGGTAGACATTATAACTCATCAAGTTGTAGGTAACACTTCCCATTAGTAGAGAGGGGAATAAGCCAAAATTCAAGATTTTTTTTTTTTTGAAACTGAAATTCAAGAAAAATTGATAACTATAAAATTAAGGGAAAGGAAATGTAGATTGAACTGAAGTTACCTGTGAATTGGCAACACTACTGAAGAGGCAGGGAAGTCATTAAATGAAAATGAAGAACGATAAGGAGGATTTTCCGTTGCTCCAACCTCTTGTGCAGATATGGTGACTTGGACTTGCTGCGGTGAGCTCTTCAAACAAACAAACAAAAGTAAAAGAATTATGAGATACTTTAACACAATTAATATTAGAGTAAATGATGGAAGTGTTCCAAAAAGTGAAAAGTTACCGAGGTGAGGGGATTGCTGGGAACCTGAATCTCGACAAACTTCTCACTCATAGACATTAGCTGCAGAAATAGACAAGTTATACCAGTAATGTTTCCATAATAATGGTGAATATAGTAAACTAACAAAATTCACATTAGCAAGTGTTTCCAATTTACATTTTCAAGTTACATATGAAAGAAGTTAAATCCAGAGAGTCCACATTTCATTATAGGGAACAAATATGAAAAAGGAAACAGTAAAACCTAAGTTTAAGAAAACGATTAAGGCAAGATTACCTGTAAAAAGCAAGGCTGCATTTCAACAAGAGAGACTGAAGTTGCTTTCTCTCCCAAGTCCATATTTGGATATTCCTTCCACGAAGAATAGAGAGATTCCAAGGGTATTTTGCTCCATAGGCAATGTCCACCTATGTTTCCTGCCAGAACAAAGTAAATATAAACTCTCATGATGATTTATTTACAGAAGAAAGACACATTCAAAAACTTTTATAAATTAAAATACCTGAATGGATCTTGCTTGAATCAATGCCAGATTGAGAATTTTGCGCACCAGCTACAAGAAAGAAAATAAAATTGATCAGTTTATCTTGTATACTGTACATATACATAAATCATCAGTACACAACAATCACTCTATTACTCACCAAAGCTGATAAATAAGATAACGAGTGATCCTGATTTTGCATCCAACGCGAGTCTATCCATTCGAGGGAGAAGAAAATTGGCTTGAGGTTGACTAACTCCATCATCCCCAGTTAGGATACATGTTCGACTGAACTTATATATTGCAGAAGACTATAATTTGAGAGTTCCAAAAAAAACGAAAAAAATGTTAAGCGATGAAATGACATTAGGCAAAGATTAATCCAATTATGTCTGGGTTGAAACGCCTACCTTGGCGGTAGTCTTAGAAGAAACGAGTCTTGCCAGCATAATAAAAAGAGGAAAGAGTTCTTGAGTTTCTACACCAGCAGCATCTTTACTGCCCGGAAGGAACAAAGTCATTTGTATTCTGCACATCAGTAAAATATTGATTACTATTCACCAGGGGTAAAGTCTTTGAAACTTCTTCCCAAACAAACACTTAGCATTAAGGTTCCAGATTAATGATTGAGTTATATTCTAATCATAATTACACAAAACTAATGGAGATTCTGAACAGAATTTGTTTTTTCTTTTTACCTCCTTTGATGTTTGGCTTCAATCTTATAATTCAAACTTCGCTGAAGAAACAAGGGCTACACGGAAAAGATAAGAGAAAACTGTTAAGAGTCAACTACATAGCAAGATCACAAACGCTTACTTATAACCAAATGAAGTCAGCACAAACTACACAGCTATGGGAATTTTCTATGTCAAAAGCAAACCCAATGTTTGTGTCGCTCATTATTACACACATTCCTCTCTGTGAAAAGGTAACAGCTAGAGAAACACATACATTCTTAATAGCACGACGCTGGAAAAAGATGTAGAACTCTACAGGCGGGCAATACGTTGCTTTGAGGCTCTCTTCAGCAGCAATCTTCTCCTCGTCAGACATATGCGCACGGAAGTGTTCCATGTCCATCTGATCTATCAT
CDS Sequence
- >BnaC03G0162800ZS
ATGATAGATCAGATGGACATGGAACACTTCCGTGCGCATATGTCTGACGAGGAGAAGATTGCTGCTGAAGAGAGCCTCAAAGCAACGTATTGCCCGCCTGTAGAGTTCTACATCTTTTTCCAGCGTCGTGCTATTAAGAATCCCTTGTTTCTTCAGCGAAGTTTGAATTATAAGATTGAAGCCAAACATCAAAGGAGTAAAGATGCTGCTGGTGTAGAAACTCAAGAACTCTTTCCTCTTTTTATTATGCTGGCAAGACTCGTTTCTTCTAAGACTACCGCCAAGGTAGGCTCTTCTGCAATATATAAGTTCAGTCGAACATGTATCCTAACTGGGGATGATGGAGTTAGTCAACCTCAAGCCAATTTTCTTCTCCCTCGAATGGATAGACTCGCGTTGGATGCAAAATCAGGATCACTCGTTATCTTATTTATCAGCTTTGCTGGTGCGCAAAATTCTCAATCTGGCATTGATTCAAGCAAGATCCATTCAGGCGACACCAAAATGGCTCCTTTTAGACCTGACATCTTCTCTGACGGCGACTACCCTGCAAGGATTCCGGAGTCCTTTTCTTCCTCGTAG
Protein Sequence
- >BnaC03G0162800ZS
MIDQMDMEHFRAHMSDEEKIAAEESLKATYCPPVEFYIFFQRRAIKNPLFLQRSLNYKIEAKHQRSKDAAGVETQELFPLFIMLARLVSSKTTAKVGSSAIYKFSRTCILTGDDGVSQPQANFLLPRMDRLALDAKSGSLVILFISFAGAQNSQSGIDSSKIHSGDTKMAPFRPDIFSDGDYPARIPESFSSS