Information report for BnaC03G0085900ZS
Gene Details
|
|
Functional Annotation
- Member of the R2R3 factor gene family.
Homologous
- Brassica oleracea: XP_013627188.1, Bo3g012780
- Brassica rapa: XP_009131611.1, Bra006422, XP_009121051.1, Bra002107
Gene Resources
- Pfam: PF00249
- UniProt: A0A3P6ARD1
- EMBL: LR031872
- AlphaFoldDB: A0A3P6ARD1
- InterPro: IPR001005 , IPR009057 , IPR017930 , IPR050560
- PANTHER: PTHR45614 , PTHR45614:SF169
- SUPFAM: SSF46689
- PROSITE: PS50090 , PS51294
- Gene3D: 1.10.10.60
- SMR: A0A3P6ARD1
- CDD: cd00167
Sequences
gDNA Sequence
- >BnaC03G0085900ZS
TGGAACCAAAACTCATTGAGAAAGTTCTAACAGGTAACAAAACCATCAAGCTCTCAAGAAGATTTGAAGAAGCAAACAACTTCGGATCTCCACCAAACTCGCACACTAACCTCTCTCTCGCTAGAAACCATCTCCACAACAAATCCTACTCAGTCTTGGAGAGGGGTGAAAACGAAAATAGTTTTAAAAGGAGGGGCAATAATGGAATGAACAAAAAATTATGCTCAAGAGGACACTGGAGACCAACAGAAGATGCTAAACTCAAGGAGCTTGTTGCTCAGTTTGGTCCACAAAACTGGAATTTGATTGCTCACCACCTTCTTGGTAGATCAGGTACATTTATTTACTTTTATTTATCTGCTTATTACTACCTCACTTTCTCTCAAAATTCCGTGAATATAAGTATTTATATACTCCCTCCGTTTCATATTGTAAGTAGTTTTAAGAAAATGTTTTTGTTTCAAAATGTAAGTAGTTTTCGTATTTCTAGGTAATTTTTACATTTATTGAATACAGTGTGACCAATCAAATTAAATAGACTTATTTTTTATTGGTTAAAATATATCTAATCTATTTATTATAAAATACTTTTTAAAAACATAATAATTTTTTTAATCTTCGTCATTTTAGCCAAAACTATTTATATTATGAAACGGATGAAGTATATTTTTAGAATTGGTTAAAATTAATTTTGTATCAAAAAGTCCTGTTTTTTGTTTTACAAATGAGTATTTTTTTCCATTTGACAAAAAGAGATTTTCTCCAAAATTAATGATATTGACATTTTTAATGACTAGGAGCTAACGTCAGTGACATATTTGAAATTAACTAATTAAGTTTTTAAAGGGTAATTAATGTCGCGTATTTGATTTCAGGCAAGAGTTGTAGACTGAGATGGTGTAACCAATTAGACCCAAGGATTAACAAGAAAGCCTTCACCGAGGAAGAAGAGACGAGGCTTTTAACTGCTCATCGAGCCTATGGCAACAAGTGGTCTTTGATCTCACGTTTCTTCCCGGGTCGGACCGATAACGCCGTCAAGAACCATTGGCATGTCGTCATGGCTCGACGGACTAGAGCAAGTGAACGACAACAGGCTCTTCATGCACCGTCAGGAAACGCAGAAATGACGGTCTCGTCTGTGTACCGCTATAATCGTGGTGGGTTCTTCGGTAGGGTTGCGGAGGGTACTTTGGTCAACGAAGCAGATGACGACGATGGTTCAGCTGTCTCTACTTGTACGACGGAGCTCTCTCTCACTCCGCCTTCTTCAACTCATCAGCCACGCTTCTTGCACGACGATAATACCCTTGCATCAGGTAACACTTTTATGTATATGTTTGCTTGCTTTTTATTACGTTAGTACTTTGTCTCTTTTTAGAAAGAAATTATCTCATGACATTCTTGAGATATTAAAAGTATAGAAACTTGGAATGTTTTGTCGTGTTTTCTTGAGAAGCGTTTCGTGAATCTAATTATCATCGATTATGATCGACTTATACTTTAATCGATATTCACTAAATGATAATTTTGCATACATGCTATACAACCGACAACGAGTGACCACTTCGATAATTTTCATGTATATGGCAATAATGACAAATTTGAATGACAATAAAGAAAGAAGCAGTGTTTTACATTGTAATAGTACCTATATGTATATTAATATAAGAAACTATAGTACAATGTCACCCTGCGCTATTTCAATACAACAAATTCACGTGGGAATTAATAAGAAAATTATTTTGATAATCTTACAGGTAAAGATGGTCAGTGTGTGCAGATAGCAGAAGTAAATGGCGTATGTAGTAATAAGATGGACCATCAAAATCACTACACAACCACAGTCAGTGAAAGGGAGGTGGAGATGAAGACGAAGAGTGGCTTTTACATCTTTGATTTTCTTGGAGTTGGAGCTTCTTAA
CDS Sequence
- >BnaC03G0085900ZS
ATGGAACCAAAACTCATTGAGAAAGTTCTAACAGGTAACAAAACCATCAAGCTCTCAAGAAGATTTGAAGAAGCAAACAACTTCGGATCTCCACCAAACTCGCACACTAACCTCTCTCTCGCTAGAAACCATCTCCACAACAAATCCTACTCAGTCTTGGAGAGGGGTGAAAACGAAAATAGTTTTAAAAGGAGGGGCAATAATGGAATGAACAAAAAATTATGCTCAAGAGGACACTGGAGACCAACAGAAGATGCTAAACTCAAGGAGCTTGTTGCTCAGTTTGGTCCACAAAACTGGAATTTGATTGCTCACCACCTTCTTGGTAGATCAGGCAAGAGTTGTAGACTGAGATGGTGTAACCAATTAGACCCAAGGATTAACAAGAAAGCCTTCACCGAGGAAGAAGAGACGAGGCTTTTAACTGCTCATCGAGCCTATGGCAACAAGTGGTCTTTGATCTCACGTTTCTTCCCGGGTCGGACCGATAACGCCGTCAAGAACCATTGGCATGTCGTCATGGCTCGACGGACTAGAGCAAGTGAACGACAACAGGCTCTTCATGCACCGTCAGGAAACGCAGAAATGACGGTCTCGTCTGTGTACCGCTATAATCGTGGTGGGTTCTTCGGTAGGGTTGCGGAGGGTACTTTGGTCAACGAAGCAGATGACGACGATGGTTCAGCTGTCTCTACTTGTACGACGGAGCTCTCTCTCACTCCGCCTTCTTCAACTCATCAGCCACGCTTCTTGCACGACGATAATACCCTTGCATCAGGTAAAGATGGTCAGTGTGTGCAGATAGCAGAAGTAAATGGCGTATGTAGTAATAAGATGGACCATCAAAATCACTACACAACCACAGTCAGTGAAAGGGAGGTGGAGATGAAGACGAAGAGTGGCTTTTACATCTTTGATTTTCTTGGAGTTGGAGCTTCTTAA
Protein Sequence
- >BnaC03G0085900ZS
MEPKLIEKVLTGNKTIKLSRRFEEANNFGSPPNSHTNLSLARNHLHNKSYSVLERGENENSFKRRGNNGMNKKLCSRGHWRPTEDAKLKELVAQFGPQNWNLIAHHLLGRSGKSCRLRWCNQLDPRINKKAFTEEEETRLLTAHRAYGNKWSLISRFFPGRTDNAVKNHWHVVMARRTRASERQQALHAPSGNAEMTVSSVYRYNRGGFFGRVAEGTLVNEADDDDGSAVSTCTTELSLTPPSSTHQPRFLHDDNTLASGKDGQCVQIAEVNGVCSNKMDHQNHYTTTVSEREVEMKTKSGFYIFDFLGVGAS