Information report for BnaC01G0239900ZS
Gene Details
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Functional Annotation
- Involved in the promotion of the transition of the vegetative meristem to reproductive development. Four forms of the protein (alpha, beta, delta and gamma) are produced by alternative splicing. Involved in RNA-mediated chromatin silencing. At one point it was believed to act as an abscisic acid receptor but the paper describing that function was retracted.
Homologous
- Actinidia chinensis: CEY00_Acc33056, CEY00_Acc22900
- Brassica oleracea: Bo1g054910
- Brassica rapa: Bra038446
- Citrullus lanatus: Cla97C06G113890
- Cucumis melo: MELO3C021258
- Juglans regia: Jr12_10090, Jr12_10140, Jr12_10120, Jr12_10130
- Manihot esculenta: MANES_03G206500, MANES_15G001500
- Populus trichocarpa: POPTR_010G147900v3
- Prunus persica: PRUPE_1G114600
- Rosa chinensis: RchiOBHm_Chr4g0425821
- Vitis vinifera: VIT_05s0077g00710
Gene Resources
- Pfam: PF00076 PF00397
- UniProt: A0A816RIN1
- EMBL: HG994365
- AlphaFoldDB: A0A816RIN1
- InterPro: IPR000504 , IPR001202 , IPR012677 , IPR035979 , IPR036020
- PANTHER: PTHR24012
- SUPFAM: SSF51045 , SSF54928
- PROSITE: PS50020 , PS50102
- Gene3D: 2.20.70.10 , 3.30.70.330
- CDD: cd00201 , cd12637
Sequences
gDNA Sequence
- >BnaC01G0239900ZS
ATTGATCTCTCCTCCAATTCACAAATCCAATTTCTCTAGGGTTTGATTTCTTCGACTTGAATTGCATTTCCATCCGAATTTCCCCAAATTCGTCAAGCTGGATAGGCACCGAGGGGATCGCCACGAGAGTGGCGCTTACGACGATTCCTACCGTAACCACCGAGCTCACCCTAGAGGTCCCCCTCGACTCTCAGATTCACCCTCCATGTCACGTTTCGGCGAGGATGACGAAGGTTTCAGCCGCCGTCGTCGCCGTGGAAACAGCCCTAGCAATTATCAAGTTGGAATTGGGGACAGAGGAGGTGGCGATCGACGCTGGGAAGATGACGGCCCCACGGATCGTAATTTTCACAGAGAAGGCGTTGGAGGAGGTTTCCGGCCGATGAACGCTCCTCCAGGGAGAGTAGATTTTCAGCCTATGGGTTATGGCTTCGACGGAGGTTTTCCGCCGATGAGTCGCGACGGAGGATTTCGGCCTAACGTGCCAGTGAATTTTCCGCCATCGGAAAGTCCAGATGCAGGGGGATATTCCGGCGGCAGGGGATTTCAATCAACGGGGCCTGATTACTCTGTGAGATTGACTTCACCGCCGATCCAGCAGCCTCTTTCTGGTCAGAAAAGAGGTCGTCCTCTCTCGGAGCAGAGTAGCTTTACTGGAACTGGTAAGCTTGGGCTCACTCTACTGTAATCGAGTTGTTTAGAGTTAACAGTGGTTCATTTATACTTGTATGTGATAATCAGAGCTATTTCCAAACTAAATTACCTTTACTGGATCATTCGTTTTGCAGATTTTACTGATCGTAGCAGTATGGTGAAGCTTTTTGTTGGCTCTGTACCAAGGACAGCTACAGAAGAAGAAGTGAGTTCATCTTTTTGATTATTTTCCTAATTTCTTCTCAATATATATGCACTTTGTTGAGGCAATCTAAACCACGAAGCTCGTAGACTCTGTTCATAAGCCGTTCTTGTTTATCATTTTGGTTTTCATAGGTCCGTCCCTTTTTCGAACAACACGGAAATGTTCTTGAGGTTGCTTTTATCAAGGACAAGAGAACAGGACAGCAGCAAGGTATGTTTATCTCCATTTTACTAGGAATCAGTCGTGATTTATGCTTCTAAATTTTTCAGGTCTCCTGAAAAGGCTGATGGGAAGCAACCCCAGTCTCATCATTGGCCTCCATTAGTTTTCAACAATTTTCGGGCTTTTGCTTATGCTAGCGAGCGTCTTATCTGTGTTCGTTTGGCACAGAAGAAGGCTGCCTGTTTAGTTTACTAAGAAAGGGTTTTTGTATTGACCTTGGTAAAATAGTTTTTGCGACTTGTGTCCATCCTAGAACCTTAGTTGTGTTTGAACAGTGTAGCAGACTTTATCATGTTTTAGAGTTGGAGTTAATGTACATAAAATTGAACAGATGTTTTACTGTTGCCTTTTAGTTGGCACTGGTTTAAAGAACGTTGTTTTCTCCTTTCCTATTGAATTCAGTATCTCTTTACTCTTCCTTTCGATGAATGAAAATGGTGTATATGGTCTTGACTGGATGAATGTATTTTTACTTGGTAGTCTTACAACGTTCATAAAATGGTTTGATTGATAAACCACCCCTGCTAGTCAATATTTGGCAGTTTCTTAGTGATTATATCATGTTGGATGTTTTGTTTCTTTAGTTTCTTTAATATCAACTTTGGATGTACCGTCTCTATTGGTTGATGATGAAATTATTTTTTACCATTTTGGATGCTTGATGCCTTAATGAATGATCTTTCCTTTTTTTCTTATTGTGGATGGCCGAGGAACTATAATGAATGTTCTCTTCGCTTTTTTTGAATGGCCTGGGATGTGGACTTCTTGTATGTTCTCACTTTCATTGATGAATGACTGTTTCGTTGAGTAGCTCTATTGTTCTGTATGGTAACGCTAACACTGCTGATCTACATTATGTGGAAGAGATCATATGTCTAATGATATTTTTTTTCTATGTACCTTTCACCAACCAAGCTCAAAAGCTTGGTTTCAGTTTTTAGTGGTCTTATTCTATATAGAGCTTGGTTTCAGTTTTTAGTGGTCTTATTCTATATATTGAGATTGCTCTTGAAAAATTCCATCAAAGTTCTGTCTTTATGATGCAAGTGTGAAGAATTACTAGATGATGAGTGATGTATTATTTAATAATTCGGGACTTTCCAAGAAGTTATTGTACGGTGACATAAAAGCTTTTACTCATCCCGTTATCACGGTTTGACTGTAGTAGATTTGACACATTCCTTGGTTTGAAATGTTAGATGGTGCTAAGATATGGAAGGCAACGATTATTATAATTTCTTAGAAATACGTCTTAGCTTTCACTCGCTCTCATTGCTTCGATCAGCATCAGGCATGAGCCGCCTTAGTATGTATTTAATGAAGCAAGTGTCATTCTTCTCTATATGCAACTATTACCAATGAATTGACGTTGGGTTGTGGTTATGTCTCTCAGAACTGTAATTCTTTTTGTGAATGTCGTCAAATGTGTGGTGTATGTTGTATGGTGTATGGTGACGAAAATGTGATGTATGGCTCTAGTTTTAATTATATCATTTGTTACTTAGCAGTGATTGAGAACTCTTAACTTGTAATTTTATCTAATTTTTTTTTGCAGTGATTGGATCTTTTTGCGTAATATATATTTTATTTGCAAATACCGACTGTGTTCTTTTTAAATAGTTTAAAGGCATATGCTTTATTTGAAGACATTAGTTTATTATTCTCTCCATCAAATCTACTACAGTAATCTAAGTCGAGGCTGTCAGGACATGTCTTATGATTTTCGTACTGAAACTTATGTGCTTTCAATGTGGTCGTGGCTTGTACATTTGTAAAGAAACTATTTACTAGTATCTCTTGATGTTTGATGGAGGGACAAGTGGAACCTTGAACAGAAGCTTATGTAGCAGTCTTTAATGCAGGCTGTTGTTTTGTAAAATATGCAACTTCTGAAGATGCGGATAGGGCCATTAGAGCATTGCACAATCAGATCACTCTTCCTGGGGTAACTACCATTGATGCCTTCTCTTATCAAGGACAGGAAAATACAGGTTAACTCATCTTTTACAATTTGCTGATTCCCAGGGAACTGGCCTTGTTCAAGTTCGATATGCTGATGGGGAGAGAGAACGCATAGGTAATCAACTTTCGCGCCATATTATCTGAATCTGGCCTTCATTGTCTGGTATACATAGGGTGACCATACGCTGTACAAATTCAAATTACGAGAATTGAGATAATGTGGGAAACTATATGAATCTTAAGGAAGTGGATCCTTTTTTCTGTGGTCCTTGCCTCACTCTCAAGTATTAACTGATTGAATTTACTTCTTCTGAAGGTGCGGTAGAGTTTAAGCTTTTTGTTGGTTCCTTAAACAAGCAAGCCACTGAAAACGAGGTTGAGGAGGTATGTCTCATATCCTACTTTTTGATGGAAAGTAATTACTTATGTCTGATTTACAAAGAGGGAAGCGTTCTAAATTTAGATATTACAGTATCCCCTGTCGCCTTAGCTGGTAATTTTAGTGATTATATGACAATTTAGTAGTCCTCTTGGAAGGGTCAGCGGCTTGAAATTTTGTGTCAACTATTCGAGCGCTTACACATTTTACTAACTGAGTGATCTCTTCTTTCAAATGGACTGACTGAGTGATCTCTTCTTCCAAATGGATGTAACTTTTTGGCTGTCAGCTTTCTTTTCTCAGTAAATATGATGAAGATGTGAACGGCTACTTTGTCCTGTTGTTGCTTTAACAGCTCTTTTTGCAATTTGGTCGCGTGGAGGATGTCTATCTCATGCGTGATGAATATAGACAGAGTCGTGGTATGTCTGGTAACTGCTACTAGATTCTATAAATTGTTTGATGGTGTTGATATGGTCAAACTGTTTTTGACACTCATTTAGGATGCGGGTTTGTTAAATATTCAAGCAAAGAGACGGCCATGGCAGCTATCGATGGTCTCAATGGAACTTATACCATGAGAGTAAGCTGTGAATCACATGAGTATCTCACTTTCTCTCATTATCCCCTCTAGACCTGTTTTGTTTACTGGCCTCTTTCCCTTCTCCAGGGTTGCAATCAGCCGTTGATTGTTCGGTTTGCTGATCCAAAGAGGCCTAAACCGGGCGAGTCAAGGTATTGCCTTGGAGACTATATTTTGAATTCATTATAATGCTAATATCAAAAAAATTGTGTCTACTGTCATTGTTTGTTCTATTGAGTTACATTTATGAGAATCTTTTGGGGCATGGGTGGAGGAGAGCTGCGAACCTTATTCCTTCTCCAGTTATTACTTGAATGCGATGAATTTCTTTCTATATATCCATAACTAGTTTCTGTTTCCAGGGAAGTGGCACATCCTGTTGGACTTTGTTCAGGGCCTCGTTTTCAAGCTTCAGGACCAAGGTGACTGGGGTGAAAGGAGATCGTTGTTTTTGTCATCAATTAATTATATATTTTGACTAAACCTGGTCTCCTTATCTTCATTTGTTAGGCCTACATCTAACCTTGGTGACCTTAGTGTGGATGTGAGCCACACAAATCCTTGGCGTCCTATGAATTCACCAAACATGGGGCCACCTGGTAACACTGGGATCCGTGGTACCGGAAGTGACTTGGCTCCTAGGCCAGGTCAAGCCACATTACCTTCAAATCAGGTAAGAACAGCTTGATGATCATGTATATTATCTTATATGTACACACCCAATCACACATAAAGTAATCGGGCATAAGGTTTTACATGTATTGTGTGAGTAGGACGAACATAATTTATATGCTGCACATATATGAGCGTATGGACTCTTGAAAAGAAGCATGAAGTTCCGACCTTCCAGCTTTTCATATGATGCAGCAAACTTGATGTGTTTTGCATTGAAATGATATGGCTTTGATTTGCATTTTGTCAGTTTCTAAGGAGTTTTTTTCTTCAATAATTTCTACTTCTGATGTTAGCTTTATTTGTGGCATTCTATAATGTTA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CDS Sequence
- >BnaC01G0239900ZS
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Protein Sequence
- >BnaC01G0239900ZS
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