Information report for BnaA09G0615700ZS
Gene Details
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Functional Annotation
- Encodes a poly(A) polymerase. Located in the nucleus.
Homologous
- Brassica oleracea: Bo8g104580, Bo8g067610, Bo7g078150
- Brassica rapa: Bra031010, Bra016573, Bra024894
- Gossypium hirsutum: Gohir.A09G176100, Gohir.D09G171800
- Juglans regia: Jr06_15070, Jr15_10090
- Manihot esculenta: MANES_01G015800, MANES_05G137200
Gene Resources
- Pfam: PF01909 PF04928 PF04926
- UniProt: A0A078G5I6
- RefSeq: XP_013664593.1
- EMBL: HG994363 , LK032123
- AlphaFoldDB: A0A078G5I6
- KEGG: bna:106369039
- OMA: VAFVCQM
- InterPro: IPR007010 , IPR007012 , IPR011068 , IPR014492 , IPR043519 , IPR048840
- PANTHER: PTHR10682 , PTHR10682:SF10
- SUPFAM: SSF55003 , SSF81301 , SSF81631
- Gene3D: 1.10.1410.10 , 3.30.460.10 , 3.30.70.590
- OrthoDB: A0A078G5I6
- SMR: A0A078G5I6
- CDD: cd05402
- STRING: 3708.A0A078G5I6
Sequences
gDNA Sequence
- >BnaA09G0615700ZS
TATAGAACTCGCTCTTCGTCTCTAATCCCAACGCGAGAGAAGGGGGTGAAACTCGTTGTTCTTCTTCTTCTCACCGGAGAATCATCTCGGATTGGTGGATTCAGTCTGCATCTATCGCCGTGGGTGTTCAAAAGGACGAGACTTTATGCGAGATTCTATTCGTTGTAATACCAGTTTCTCGGATTAGGGTTTTAAGGGTTGTTCCCGACAAGAGCTTGGCTACTGTTTTGTATGATTCCATAGTGTTTCGCTTTGGCTTTTTCTTTGATTCAGCAAAGCCTTTTGATTTTTGTATTTCTGTATGATCAACACTTTTCTCCATAGTAATCTTCTCAGAGTCTTTGTTTTTTTTTTAGCTTAACATTATTCGAATTATCCCCGTTGAGAAAAAAAAAGATGAATTTTTATGCTTGTAGAAGAATCTAATTGAAACATTGAGAGCAAAAAAAAGAAAAGTTAGGAAAAAAAGAGAGAGAGGAAAAGAAGTAGGTAAAGATCGATGGCTAGTGTCCAGCAGAATGGGCAGAGGTATGGTATCACAGAACCTATCTCTTTGGGAGGACCAACGGAGCTTGATGTGGTCAAGACACGAGAGCTCGAGAAGGTTTTGCTCATATCTTTAAGCTTGTGTTTATTGTATCTTAGCTTCGTGTTGATTTCTAATATGTTTTGGTTGTTCAGTATTTGCAAGATGTTGGATTGTACGAGAGTAAGGAGGAAGCTGTTAGAAGGGAGGAGGTTCTCGGGAGACTTGATCAGGTTCTTACTATTTTTTTTTTTTTGAAGTTTTATGGATTTTTCATTGATGTTTGTAAAAGATCCATGGTAAGGTCTTCGTTGTTTATTTGTGTACAGATTGTAAAAACATGGATAAAAACAATAAGCCGCGGCAAAGGGTTGAATGATCAGCTGCTTCATGAGGCCAATGCGGAGATATTTACTTTCGGTTCTTATCGGCTAGGGGTAACCATCAAGATCTTTAGAAGACTAACTTTGTTTTACTCTTTCCTTTTGTACTGTCAACTCTTTGGTGTAGAGGGAAAGGACATATCATGAATTGGTGAAAGCTGTGTGTTTGTTTGCTGTTGTCTTTTAGATGTACCTGTGTGGGAAGTGGCATCACATGTCTCAAATGCCTTTTTGTGTCATTCAAAAATATTGAGATCAATATTATATCCCTTGTATCGTTTCGGTATGAGCTTTTCAGGCATTTCAATTGTTGATAAATCTCGGGCACACTAGATTTTTGTTCTTAAACAGTCAGTGTCCTAGTGAAATCCTCTGCAGCTGATGATTGTTCTTTGTAACATGACTAACATCCACTATTCTAGCATATCTAGTGTTCCTATAACAGTTTGTTTTACTTCCTCATATAGGTACATGGACCTGGTGCTGATATTGACACTTTATGTGTGGGGCCTAGACATGCAACTAGAGAAGTACTTTTAACCTCTTGCATCTATACGTTGGCCTGAACATGTATCAAGTTTAATCTTCTTCTTTTTTTTTTAAATTGCCAATAGGGTGATTTCTTTGGTGAACTACAAAGGATGCTGTCCGAAATGCCTGAAGTAACTGAGCTTCACCCTGTGCCTGATGCTCATGTTCCCTTGATGGGATTCAAACTTAATGGAGTTTCTATAGATCTCCTTTATGCACAACTTCCACTATGGGTTATACCTAAGGTAATATCGGAATTTACAGAGAGGTGATTGTTTAGGATTATATTCCTCAGTTTAAACTCGTTCCTACTAGTTAAGGTTAAATAGTTTCACTTTATTTTATGCATTATTTATGGATTGGAAGAATCTTGATTGTCTTCCCTGCCTGATGTTTATGGTGCAGGACTTAGATATATCGCAGGATTCCATTCTACAGAATGCTGATGAGCAAACTGTTCGGAGTCTCAACGGTTGTAGAGTTACTGACCAGATCTTGCGTCTGGTTCCTAACATTGAGGTTTTGTTCTTACTGATGACATCTCTTAAGAACTTTATAATTAATTCATCCATATGATTTGCTTAGTCTGAATCTATGTTTTATTTATGAGCAGAATTTCAGAACAACATTAAGATGCATGCGGTTTTGGGCCAAGCGACGTGGAGTATACTCTAATGTATTAAGAATTCTTTCACTCGATTTCATTTATGTGACTCTCATGTTACTTATGTCAAAGTCTTTTTCCGACAATTGCTAGGTCTCTGGATTTCTTGGTGGTATAAACTGGGCATTGCTTGTAGCTCGGATATGTCAACTGTATCCTAACGCTCTCCCAAATATGTTAGCGTCTCGGTTCTTTAGAGTCTACACCCAATGGCGCTGGCCGAATCCAGTCCTTCTTTGTTCTATGGATGAAGGATCCCTCGGTCTTCAAGTTTGGGATCCTAGAAGAAACCCAAAGGACAGGTTGCACATGATGCCCATCATTACTCCTGCTTATCCTTGTATGAACTCCAGTTACAATGTCTCTGCAAGTACATTGCGGATTATGACTGGAGAGTTTCAGAGAGGCAAAGATATATGTGAGGTAAGGTTTTAGATAGTCTGAATAGTTTTGGCTTCTATGCAGATTGTGGGGGCTTATGACAGTCGTTTGATGTCTTGCAGGCTATGGAAGCAAACAAAGCTGACTGGGATACCCTCTTTGAGCCATTTGCATTCTTTGAAGCGTATAAAAACTATCTTCAGATCGACATCTCTGCGGCAAATGTCGATGATTTAAGAAAATGGAAAGGATGGGTTGAGTCACGTCTCAGACAGCTCACACTGAAGGTGAAACTCTTTGTCTATTATCTGTTGAATGTTGATAAAAAACAATCTCTGATTGTTTGACTTAGATATTTACATTGTATTCTTAGATTGAGAGACATACTTATGACATGCTTCAATGCCACCCTCATCCACATGACTTTCAAGATGCATCCCGACCGCTTCACTGCTCTTACTTCATGGGTCTGCAGCGTAAACAAGGAGTTCCAGCAGCCGAAGGCGAGCCGTTTGATATCAGAAGAACAGTTGAGGAGTTTAAACACACTGTTAACGGTTACATGTTGTGGATTCCGGGGATGGAGATTAGTGTCAGCCACATAAAGCGAAGAAGTCTACCGAGCTTTGTGTTTCCTGGTGGTGTTAGACCTTCGCATGCCTCTAAAGGAACATGGGACAGCAAACGCCGCGCAGAGCATAGAGTTTCTTCTACAGCAAGTGCAGCTACTACTACTACTGCAACAACAACAACAAATGAAGCGAGTTCTGAAAGTAAAGCTGGGTCTAACAGTCCAGGAGATGAGAAGAAGAGAAAACGGGGAGATGATGAGACACTCGCGGATCAGTTAAGGAACTCTAAACACGTTGCTGTTCCAGTGCCTGCTGAGAACGGTGAAGGCGGGAGCCCGGATCCATCTGTTGGATCCATTTGCTCTAGTCCTATGAAAGATAGCTATACAAACGGTAAATCCGATCCCATTAATACGGATCCACAAGAGAATGTTGTTGTTTTCAATAAGGAGGATGCACCAGAGAGTCATCCAATAGAGAAGATAGCCACTCCTCAAGCTCCTACTAGTGAAGAAACAGAGGAGCTTGAAGGCAGCTTTGACTTCGGAAACCAAGTCACTGCTACTGCAACTATACCTCCGTTCGAGGCCACTACTTCAAATGGCTCACCATTCTCTAATGAAGCACTGGAAGAACTCGAGGTTCTTTATTTGTCTTTCGATACTTAAACTAGTCTCATGATCTTGTTCTTGTCTGATTTTTTTTTTCTTGTTTCGTAAAGGTTCTTCCAATGCGACAGCCTGAGGTGACGCATAGAGCTCCAGTGCAACAGCGAAAACCCATAATCAAGTAAGTGGTTTGTATACTTGTACTCCATTTGCATCTGCATATAGGATTTGACAACGTTTGCTTGCTTTTTGTTGTCTGGTTATTCGCAGATTGAACTTCACGTCTCTAGGCAAAACCAACGGCAAGTGATAATGGTTCGTCCCTACATGGCCAAGAGTCTCAGAGCTTATCCAAATTCGAGTGGTTAAACTGAAGGCTGCTTCTTACTTTATGTAAAAGAAGGATTTAATATTATTATGCTTTGTCTCTTAGATGCTAAAGCAAGTTCTGAATACTTGAGTTCGATGTAAAACTCGTTTGGATAAGAACATAAAATACAAGTTCTAAATACTTGAGTTCCGG
CDS Sequence
- >BnaA09G0615700ZS
ATGGCTAGTGTCCAGCAGAATGGGCAGAGGTATGGTATCACAGAACCTATCTCTTTGGGAGGACCAACGGAGCTTGATGTGGTCAAGACACGAGAGCTCGAGAAGTATTTGCAAGATGTTGGATTGTACGAGAGTAAGGAGGAAGCTGTTAGAAGGGAGGAGGTTCTCGGGAGACTTGATCAGATTGTAAAAACATGGATAAAAACAATAAGCCGCGGCAAAGGGTTGAATGATCAGCTGCTTCATGAGGCCAATGCGGAGATATTTACTTTCGGTTCTTATCGGCTAGGGGTACATGGACCTGGTGCTGATATTGACACTTTATGTGTGGGGCCTAGACATGCAACTAGAGAAGGTGATTTCTTTGGTGAACTACAAAGGATGCTGTCCGAAATGCCTGAAGTAACTGAGCTTCACCCTGTGCCTGATGCTCATGTTCCCTTGATGGGATTCAAACTTAATGGAGTTTCTATAGATCTCCTTTATGCACAACTTCCACTATGGGTTATACCTAAGGACTTAGATATATCGCAGGATTCCATTCTACAGAATGCTGATGAGCAAACTGTTCGGAGTCTCAACGGTTGTAGAGTTACTGACCAGATCTTGCGTCTGGTTCCTAACATTGAGAATTTCAGAACAACATTAAGATGCATGCGGTTTTGGGCCAAGCGACGTGGAGTATACTCTAATGTCTCTGGATTTCTTGGTGGTATAAACTGGGCATTGCTTGTAGCTCGGATATGTCAACTGTATCCTAACGCTCTCCCAAATATGTTAGCGTCTCGGTTCTTTAGAGTCTACACCCAATGGCGCTGGCCGAATCCAGTCCTTCTTTGTTCTATGGATGAAGGATCCCTCGGTCTTCAAGTTTGGGATCCTAGAAGAAACCCAAAGGACAGGTTGCACATGATGCCCATCATTACTCCTGCTTATCCTTGTATGAACTCCAGTTACAATGTCTCTGCAAGTACATTGCGGATTATGACTGGAGAGTTTCAGAGAGGCAAAGATATATGTGAGGCTATGGAAGCAAACAAAGCTGACTGGGATACCCTCTTTGAGCCATTTGCATTCTTTGAAGCGTATAAAAACTATCTTCAGATCGACATCTCTGCGGCAAATGTCGATGATTTAAGAAAATGGAAAGGATGGGTTGAGTCACGTCTCAGACAGCTCACACTGAAGATTGAGAGACATACTTATGACATGCTTCAATGCCACCCTCATCCACATGACTTTCAAGATGCATCCCGACCGCTTCACTGCTCTTACTTCATGGGTCTGCAGCGTAAACAAGGAGTTCCAGCAGCCGAAGGCGAGCCGTTTGATATCAGAAGAACAGTTGAGGAGTTTAAACACACTGTTAACGGTTACATGTTGTGGATTCCGGGGATGGAGATTAGTGTCAGCCACATAAAGCGAAGAAGTCTACCGAGCTTTGTGTTTCCTGGTGGTGTTAGACCTTCGCATGCCTCTAAAGGAACATGGGACAGCAAACGCCGCGCAGAGCATAGAGTTTCTTCTACAGCAAGTGCAGCTACTACTACTACTGCAACAACAACAACAAATGAAGCGAGTTCTGAAAGTAAAGCTGGGTCTAACAGTCCAGGAGATGAGAAGAAGAGAAAACGGGGAGATGATGAGACACTCGCGGATCAGTTAAGGAACTCTAAACACGTTGCTGTTCCAGTGCCTGCTGAGAACGGTGAAGGCGGGAGCCCGGATCCATCTGTTGGATCCATTTGCTCTAGTCCTATGAAAGATAGCTATACAAACGGTAAATCCGATCCCATTAATACGGATCCACAAGAGAATGTTGTTGTTTTCAATAAGGAGGATGCACCAGAGAGTCATCCAATAGAGAAGATAGCCACTCCTCAAGCTCCTACTAGTGAAGAAACAGAGGAGCTTGAAGGCAGCTTTGACTTCGGAAACCAAGTCACTGCTACTGCAACTATACCTCCGTTCGAGGCCACTACTTCAAATGGCTCACCATTCTCTAATGAAGCACTGGAAGAACTCGAGGTTCTTCCAATGCGACAGCCTGAGGTGACGCATAGAGCTCCAGTGCAACAGCGAAAACCCATAATCAAATTGAACTTCACGTCTCTAGGCAAAACCAACGGCAAGTGA
Protein Sequence
- >BnaA09G0615700ZS
MASVQQNGQRYGITEPISLGGPTELDVVKTRELEKYLQDVGLYESKEEAVRREEVLGRLDQIVKTWIKTISRGKGLNDQLLHEANAEIFTFGSYRLGVHGPGADIDTLCVGPRHATREGDFFGELQRMLSEMPEVTELHPVPDAHVPLMGFKLNGVSIDLLYAQLPLWVIPKDLDISQDSILQNADEQTVRSLNGCRVTDQILRLVPNIENFRTTLRCMRFWAKRRGVYSNVSGFLGGINWALLVARICQLYPNALPNMLASRFFRVYTQWRWPNPVLLCSMDEGSLGLQVWDPRRNPKDRLHMMPIITPAYPCMNSSYNVSASTLRIMTGEFQRGKDICEAMEANKADWDTLFEPFAFFEAYKNYLQIDISAANVDDLRKWKGWVESRLRQLTLKIERHTYDMLQCHPHPHDFQDASRPLHCSYFMGLQRKQGVPAAEGEPFDIRRTVEEFKHTVNGYMLWIPGMEISVSHIKRRSLPSFVFPGGVRPSHASKGTWDSKRRAEHRVSSTASAATTTTATTTTNEASSESKAGSNSPGDEKKRKRGDDETLADQLRNSKHVAVPVPAENGEGGSPDPSVGSICSSPMKDSYTNGKSDPINTDPQENVVVFNKEDAPESHPIEKIATPQAPTSEETEELEGSFDFGNQVTATATIPPFEATTSNGSPFSNEALEELEVLPMRQPEVTHRAPVQQRKPIIKLNFTSLGKTNGK