Gene Details:
- Gene ID: BnaA08G0151900ZS
- Suggest Gene Name: SHK1 BINDING PROTEIN 1, PROTEIN ARGININE METHYLTRANSFERASE 5
- Description: putative flowering gene
- Species: Brassica napus
- Source: Putative flowering gene from PlantCFG
Protein Features:
Functional Descriptions:
- Involved in vernalization. Required for epigenetic silencing of FLC, and for vernalization-mediated histone modification.
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT4G31120
Sequences:
gDNA Sequence
- >BnaA08G0151900ZS
TGCCGCTCGGAGAGAGAGGAGGATGGGAGAGCAGCGAGTCCATGTACTGCGGCGTCGAGACTGATTTCTCCGACAATGTTCCTTCTCTTCTCTCCTTCCACATCTCCACCGGCGGATTCGACTATGTCCTTGCTCCTCTGGTTTGTTTCTTTCATTACTATTACTTCCCTCTGGATTCATCTCTCTCCCTGACTTCCCTTTTTGCTTTACGACTACAGATGAACCCTTCGTATAGGCCGAGCTTGGTGGAAGCAAACGGTTCTTCGGATACTCAGGCTCTTCCAGTCTCTGGCTCTGACTTAGTTTTGGCACCTTCTCAGTGGAGCAGCCATGTCGTTGGTACGATCCTCTTTGCTTTTCCCTATGTTATCAATGATGGGTTTTGATTAGTGGTCTTCTTTTTTTTTCATTTTTCTAGGAAAGGTTAGTTCGTGGATTGACTTGGATTCTGAAGATAAAGTCTTGCGTATGGACTCAGAAACCACACTGAAGCAAGAGATAGCCTGGGCTACACATCTCTCCTTGCAGGTGATTTGTGAATCCGTGGGTTTGATTGTTGATGAATGAGGAGGAATTGCGCATTGCTAATGTTTGTTGTTTGTTGCAGGCGTGCCTTCTTCCTACTCCTAAAGGGACCTCGTGTGCCAATTATGCTAGATGTGTGAACCAGATCCTACAAGGGCTGGGTAACTTGCAGGTGGTTTATGATCTCTTGCTTTCTTTAAAGATAATTTTTCATTCCAGCTTTAATAGTTTGTTTCTTATTCTTTTGTTTTGTTTGAATGTGTTTCTGCTATGAAGTTATGGCTGAGGGTTCCACTGGTGAAGTCTGATGGAGATTCAATGGATGCCACCTCAGAGGGTCTGGTAAGACGTTGTATCACAGTTGATGCAAACTTTAGATTGTTCTTACTTTTTGAGTCTGCTTGTGTTCCAAATGAATGTCTTATAAACCTATAAAAATACAAATGAATATCTTGTGCCTTCGTGTTTTTTTATCCTTTTTGTTATGTCATGTTGGCTGGCTCTAATAAATACTCGCGTTTATGCAGAATGATTCCTGGGAACTATGGAATTCGTTTCGTCTTCTTTGTGAGCATGACAGTAAGCTGTCTGTTGCTCTTGATGTTATGTGAGTTGAGAGAAACTCCTGATTGTTTTTTGTTAATCTGGACTCTAAATGTTTTTTTTTCCCCCTCTGCAAACATAACACCATTTCCTTTATGCAGGAGTAACCTACCCTCTGAAACTTCACTAGGACGCTGGATGGGAGAGTCTGTGAGAGCAGCCATAATAAGCACTGATGTAAGTCCCTCACCTTCTTACCACATTTTAAAAAATGGGTTTTGAAGTTCTGTGAATCACAAAATGCTTCTAATTTGGGTGTGCAGTCTTTCTTAACAAATGCTCGTGGTTATCCTTGCTTGTCAAAACGCCATCAAAAGCTAATAGCAGGATTTTTTGATCATGCTGTCCAGGTAATATATATTCCAGTCTTTGAAACGTAGAACACTAAATATAAATGCCAAGAATTTTAACTCTTTATGTGATCAGCTTTTTTTACTGAGTATGTCATTCTGTGATAAGATTCCTCTTTTCATTCATAAATATATGTTGTCTCGTCCTAAGCCTCATTGTCATCAATCTTGTAATTTCAGGTTGTAGTTTCTGGAAAGCTTGTTCATAATCTTCAAAAGGGTTCTGATTCTAACACTGAAGGTAAATTTTCCCATTTTTTCGTTCTCCGCTAACACTTAGCTGTTATCCTCAGGGCTTGTTTTATAGTGGTTTAGTTTATAATTGGCATCGTTTATAAGAACATCCGTTCCATGTTTCGAGCTAATTAGTTTGTATATAGTGTTGTCTTTTGACAAGTTCCCAAATTTTTTGTTTCTCAGGTACGCAGAGGCATCCCCTGCGGTCATATTTGGATTATGTTGCTTATCTGTTCCAGAAAATGGAACCACTTCCTGAACAGGAACGCATAGAGGTCATTTGTTGGATCCTTTACCTCACCCCTCTATTTCTTTTTCTTTTTATCACCAGAGATGCAGTCAGGCAGAACAAAACTCAATTCTTATCTTATTTTTTTTACAGCTTGGCTACAGGGATTTTTTGCAGGCACCCCTGCAGGTTATTCTCTCTTAATAAGTATAGTGATTTCTGTTTGTTTACACTAATACCTTACAGTCACTGTCATGAAACTGCTCCATTCTTACTGTAAAGAGCTTCTACTGTGTTTTAAGTACAGCCTCTGATGGATAACCTTGAAGCCCAAACCTATGAGACATTTGAGAGAGACTCTATTAAATACATCCAAGTATGTTGCGTATGCTTGTTTTATTTCCTTCACATCTTAAATTTTAACACTCTATTTTCTGGACGACCCTTCTTCTGTTTTCCCTTCGGTTAGCAGAAGGGAGTAGACCAATGGATGATTTTGTTATACAACTCAATATTATATGAATATCTTGCGTGGTTGCTTCTTGTGTCACGCCTAACTTTTGTCTCTTTTTGTTGCCAGTATCAAAGAGCAGTTGCCAAAGCCTTGGTGGACAGGGTCCCTGATGAAAAAGCGTCTGAGTTAACTACTGTACGTTACATGTCAATGTTTTGCTTTCATCATAGCTTACATGTGGCATTTTCATTTATAAGTGTTTGTTTTTGATACCTTATAAAGTACTTCAATAGCACTAAAGTCATAGTTTGTAGGTCTTGATGGTTGTGGGAGCTGGAAGAGGACCCCTTGTTAGGGCATCGTTGCAGGTAAAAACTTATGATGCAACTCCACGCTGATCACAATGAAACACTGTTTATTAATCAATTGTCTTCATTTTTTCATCGGTTTCACAGGCAGCTGAAGAAACTGATCGCAAGTTGAAAGTTTATGCGGTCGAAAAGAATCCTAATGCAGTTGTAACTCTCCATGTGAGTTGTCAGCAACCGAGTCAGTTGTAACACTGCTAAGTTTTATGTTTGTTTCTTTCGGACGTGCGCAGCGGTTTTATTAACTCAGAGAGCATCTTTATCCTTTCTGACAGAATTTGGTTAAGATGGAAGGGTGGGAAGACATGGTTACGATAATATCATGCGACATGCGTTTTTGGACTGCTCCTGAAAAAGCTGATATATTGGTCAGTATGTACAGGTTTTGGCAGCTATTAGGCATACCGACATTATACAGTTCATCTAATTCTCGTTTGCCTCTGTTCTTCAGGTTAGTGAACTGTTGGGTTCTTTTGGGGACAATGAGCTCTCTCCAGAGTGTCTTGATGGAGCCCAAAGGTTTCTGAAGCCAGATGGAATTTCGATACCATCCTCGTATGTGTACTCCTTCGCGAAGTTGAATTTCCATTAAAAAACTATGCTCTTATAGCTGCTAGTACAGTTTTAAAGCTTGAAGTATATTACATCTGTTCTTCTGTTTCTCTAACTCGAGTATCATTATTGTTACTTTTGCAGGTATACAAGTTTCATACAACCTGTAACAGCTTCGAAGCTTTACAATGACGTAGGTCCATCTTCTGTGTACTCTTTCTCACAAGAATTTTCAGTTCAACTTAGTATTTTACACTATAATTGTGGCAGGTTAAGGCCCATAAAGATCTTGCGCACTTTGAAACTCCTTATGTCGTCAAGCTGCACAGTGTAGCTAGACTTGCTCCTTCTCAACCTGTGAGTGTCTCTCTGTCTTCAGGATTGGCTAGTAGTAGCTTAAGGCGTTCTCTTTGAGTACATATATGCATGTCTTGTAGATCTTTCGATCTCATGTATTTTGTTTTGATCTTAATTAGGTTTTCACCTTCGCTCATCCAAACTTCTCAACAAAAGCCAACAACCAACGCTACAAAAAGCTTCGTTTCAATCTACCAAGCGACGCTGGCTCAGCCTTGGTTCATGGTACAAGGCTACAAGCTTTTCTAGTCTTTTGTCAGCTAAAGTGGGAATTATTATCTCCGTTTTTCCTATTCTGATGTGATCATACATAACTCAACAAAACAGGATTCGCTGGCTATTTTGATTCCGTCCTGTATAAAGATGTCCATCTTGGGATCGAGCCTACAACAGAAACACCAAACATGTTCAGCTGGTAATGGCTTAATGTTTTGAGTATGACATTTAGGCAGTTCAACCTACCTCTTGCTTTAAAGAAGAAAAAGAAAACCTATTTAATATGGTTTTCTTACTGGCAGGTTCCCGATCTTTTTCCCATTGAGGAAGCCTGTGGAGGTTCACCCAAATTTTCCATTAGAAGTACACTTTTGGAGGTGTTGTGGTTCGACGAAGGTACACAAATTGTTAAAACCACAATTGTTGCATAACTATACTTCCATTGTCCTGGGAACCATTAATTGATCCTCTGATATTCGGATTCAGGTTTGGTATGAATGGTCGGTGTCTTCACCAGCTCCATCTCCGATGCACAACACCAATGGCCGTTCCTACTGGGTCGGCCTTTAG
CDS Sequence
- >BnaA08G0151900ZS
ATGCCGCTCGGAGAGAGAGGAGGATGGGAGAGCAGCGAGTCCATGTACTGCGGCGTCGAGACTGATTTCTCCGACAATGTTCCTTCTCTTCTCTCCTTCCACATCTCCACCGGCGGATTCGACTATGTCCTTGCTCCTCTGGTTTGTTTCTTTCATTACTATTACTTCCCTCTGGATTCATCTCTCTCCCTGACTTCCCTTTTTGCTTTACGACTACAGATGAACCCTTCGTATAGGCCGAGCTTGGTGGAAGCAAACGGTTCTTCGGATACTCAGGCTCTTCCAGTCTCTGGCTCTGACTTAGTTTTGGCACCTTCTCAGTGGAGCAGCCATGTCGTTGGAAAGGTTAGTTCGTGGATTGACTTGGATTCTGAAGATAAAGTCTTGCGTATGGACTCAGAAACCACACTGAAGCAAGAGATAGCCTGGGCTACACATCTCTCCTTGCAGGCGTGCCTTCTTCCTACTCCTAAAGGGACCTCGTGTGCCAATTATGCTAGATGTGTGAACCAGATCCTACAAGGGCTGGGTAACTTGCAGTTATGGCTGAGGGTTCCACTGGTGAAGTCTGATGGAGATTCAATGGATGCCACCTCAGAGGGTCTGAATGATTCCTGGGAACTATGGAATTCGTTTCGTCTTCTTTGTGAGCATGACAGTAAGCTGTCTGTTGCTCTTGATGTTATGAGTAACCTACCCTCTGAAACTTCACTAGGACGCTGGATGGGAGAGTCTGTGAGAGCAGCCATAATAAGCACTGATTCTTTCTTAACAAATGCTCGTGGTTATCCTTGCTTGTCAAAACGCCATCAAAAGCTAATAGCAGGATTTTTTGATCATGCTGTCCAGGTTGTAGTTTCTGGAAAGCTTGTTCATAATCTTCAAAAGGGTTCTGATTCTAACACTGAAGGTACGCAGAGGCATCCCCTGCGGTCATATTTGGATTATGTTGCTTATCTGTTCCAGAAAATGGAACCACTTCCTGAACAGGAACGCATAGAGCTTGGCTACAGGGATTTTTTGCAGGCACCCCTGCAGCCTCTGATGGATAACCTTGAAGCCCAAACCTATGAGACATTTGAGAGAGACTCTATTAAATACATCCAATATCAAAGAGCAGTTGCCAAAGCCTTGGTGGACAGGGTCCCTGATGAAAAAGCGTCTGAGTTAACTACTGTCTTGATGGTTGTGGGAGCTGGAAGAGGACCCCTTGTTAGGGCATCGTTGCAGGCAGCTGAAGAAACTGATCGCAAGTTGAAAGTTTATGCGGTCGAAAAGAATCCTAATGCAGTTGTAACTCTCCATAATTTGGTTAAGATGGAAGGGTGGGAAGACATGGTTACGATAATATCATGCGACATGCGTTTTTGGACTGCTCCTGAAAAAGCTGATATATTGGTTAGTGAACTGTTGGGTTCTTTTGGGGACAATGAGCTCTCTCCAGAGTGTCTTGATGGAGCCCAAAGGTTTCTGAAGCCAGATGGAATTTCGATACCATCCTCGTATACAAGTTTCATACAACCTGTAACAGCTTCGAAGCTTTACAATGACGTTAAGGCCCATAAAGATCTTGCGCACTTTGAAACTCCTTATGTCGTCAAGCTGCACAGTGTAGCTAGACTTGCTCCTTCTCAACCTGTTTTCACCTTCGCTCATCCAAACTTCTCAACAAAAGCCAACAACCAACGCTACAAAAAGCTTCGTTTCAATCTACCAAGCGACGCTGGCTCAGCCTTGGTTCATGGATTCGCTGGCTATTTTGATTCCGTCCTGTATAAAGATGTCCATCTTGGGATCGAGCCTACAACAGAAACACCAAACATGTTCAGCTGGTTCCCGATCTTTTTCCCATTGAGGAAGCCTGTGGAGGTTCACCCAAATTTTCCATTAGAAGTACACTTTTGGAGGTGTTGTGGTTCGACGAAGGTTTGGTATGAATGGTCGGTGTCTTCACCAGCTCCATCTCCGATGCACAACACCAATGGCCGTTCCTACTGGGTCGGCCTTTAG
Protein Sequence
- >BnaA08G0151900ZS
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