Gene Details:
- Gene ID: BnaA06G0363300ZS
- Suggest Gene Name: CRYPTOCHROME-INTERACTING BASIC-HELIX-LOOP-HELIX 2
- Description: putative flowering gene
- Species: Brassica napus
- Source: Putative flowering gene from PlantCFG
Protein Features:
- Pfam: PF00010
Functional Descriptions:
- basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein;(source:Araport11)
Homologous
- Arabidopsis thaliana — AT5G48560
Sequences:
gDNA Sequence
- >BnaA06G0363300ZS
GTTTAGATTAATTATCTTGGATTGTGGTGGAAGATTATGAACTTACAATGATATCACATCAGAAAAGCAAAAAGAATCCAAAGATAAACAATACAATTGAACCCTAATGATGAACAGAAAATTACATAATTTGATTAAAAAGGGGTAAAGTAAGAAAATAAAAGTAAAAATATGTTATTTTCATAAATGTGTATATATATGATGATGATGAGTATATGAATAAATCACAGAGATTGGAATGGTTATGTACACCCATCAATCTTTTTTCTTCTTATTATCTTCCTTGAGACCTTGAAAATAAACTGGTTGATCAAAGCTCAATTTTCATGTTTTGAGATTGAGATTCATGGTTGGGGTTATGTGCCACTCCCATCCCTACAATGCTTTGTAAATCTTCTTCGCTAAACATTTGGTACTGAAAACAAACACACGACAAAAAGATACGTGAGAACCATCTTACTATATTAAAATTGAACAAAAGAAGAAAAGTTAAAGCTTTGATCAGAAAAAAAAGTTAAAAGAATAATTTAGAAACCTGAGAAATTGTGTCAGTGAATTGGGTAAGTGTTGGTAAGTGGGTGAAGCCTCTGGCTAAGGCAGAGGGTTCCAGTGATTTCATAGGAGAATGGAGCATCATGTTATTGGAAGAAACATTGGTATGTAACTGTGAATTATTATTATAATTATGATGACTTAGAGACTCTAATTGGAGTCCTGATTCATGCACCCGGCTGCCGCTTGATGAAATCATCTGAAGAAATTCAAAATTTATAAAAATATGAGATTGTACTTTTAGTGGAAAAAAAATAGAAAAAGGTCCTTTCTAAAAGAAATTATAAAAAGTTTAACGAAAAGTAATTAGGATTAATGCTAATAGGCCGAATGAAAAAGGTATTGTTAACACAACGACAAAAAAGTACTACTAAAAATGATAACTATCAATTTCAAACGATAATTATTAACGAGAAAAAGACTACAATAGCACCAAACCAAGTTTTTGTTCCCAAAATAGCATTCAAGGATCAAAGTCACAAAAATAAGTTTCATTAAAGAGGTAAATATACACTTATACCCTTTGGGTTAATTAATCCAAACCTTAAGGTTTAGAGTTAAGGGAGTGGGGTTTTGGCATTAGAGTTTAAAATTTTATAAAAAATAAATACTAAAATTAAAAATAAAAATTTTTAAAACAGTTTCAAAAATTATTTTTAAACTATAAAAAGAATATTTGAAAAAAAATAAAAAAAATTTCAAAAAAAATTTAAAATAAAAATATATAAAAATTTCGAGTCTGAAAATATATAATCTGAAACTATAAAAAAATTTCTTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTATTATTTTTTATTTTTATTTTATTTTTATTATTTTTATTTTATTTGTTTTTATTTATTTTTATTTGTTTATTTAATTTTAAATCAAATGTATTAGAGATATTTTACCCTTTAATGAATGTCATTTTTGTGACTTTCTCCTTCTAGTGCTATTTTTGAGAGATAAACTTCAAAAGGTGCTATTATTGACAATTGCCCATTATTAATGGTTGTTAATTGATGTTAATGTTTAAGGTGACTTACAGCATCCTTTGACACAAGAGCGTCCACGTTAAATTCCAGCCTGGTGTCGTTCACTGATGATAACTTCATTGACAAGAACTGCCAATTATTAAAACAAAAAATATTAGAGAGATTAATTACAAAATAGTTAATATTCGGTGATTAATGAAACAATTAATTAGATTTAGATGAAGCAAACAAAATAATAATACCTCAACTTGTCTTTGCAATGATTGTACATAGTTTATAATTTCATCCAGCATCAGTGCCTTTCCAGTAACCTTTCATCGTATAAACAAAAGAAGAAGAAAATACATTAATCACCCTAATTATGCTAATCAATAATTATATCCAGAATCAAAATTTATTTTACCTTATTGCACCCAGGCACAAGATCTTGAAGCAGCTTCATCCTTTCACCAATTTTCTCCCTCCGAACCTAAACCAACATTAAAACACTAATCAAACCAAGTTCTAATCTCATACTAAACCAGTTAATTTTAATCTTAATTACTGAAAAAGGCAAGCAAATGCTGAGAATTAATTACTCTTTCGGCGAGACTGTGACTGTCGGTGGCTTGGCCTCGCCGAGCACGAACATGGATGTAATCTTTAGGAGGCTCAGGTGGCTTTGTGTCATTACCACCTTTGTTCCCTTCTTCTTCCTCTCCTTCGTCCTCTCTTCTCCTTTTCCCTCCCTTTTCTTCTGAAACTTCTTTCCTTTCCGCCGTCTGAGAAATTTGAAATTATTCAAAAAGTTAATTACTTTCTGTAAAAGCATGACTTTTCAGAGAACTGGGTTATTCGAAAAAACGTTGAAAGTACAAAACTTTGCTGGAAAATCTAAAGAAAAATAGAAACTTTGCGTGGGAAAATTTAAGAATTTCTTTCCGGGAAAATAATTTACCTTAGAGAAACTGGGCGACGGCGAAGCGGCGGGAAGAGGATTATCCTTAGATTTCCCTTTAGAAACAGATTTTCTCTTCCGGGAAAATTCTCCGGGGAGTTTCGGAGGTGAATCGCCGGCGGGGATCATCGGTCTGGAGGCGGAAGCGAACTCCGGAGAAGCAAGGGCCTTGAGAGCCGGCGTGCTGGAGACACGTGTCAGTTTCCCGGAGTTCACGATCTTGCCGTTGTTAACGGGGATGCCGGAGTTAGTTCTTCCGTTAAAACTCCGGCTACCGAAGCACGAGAACTTCGCCGCCCTCTCCGCAAACCCCGGGTCCCCCGAGAATTCCGTCAACGGCGCCGTTCTGTTCATCATCGGCGGCGGCGAGCTCATCGGAGTCGCGTAGCACGAGGCGGAGCGAGAAACGTTCCCGTTCATCGGAGCTCCGTAGATGTCGCCGGAGGTGTTCCCGATGTTACCAAGCTTTCCGATGAGTTCTCTGATGATAAACCCGTCGCCGCCTCCGCCGGAGAAGTTTGAGTTCGACGGCGTCGGCGAGGAGACGAGTGAGCTCAGAGCAGAGTCGAAGATGCTCTGTTGCTGTTCCGTTGACTTTTCCCACATGAAGCAATCCTGCGGCGGCGAGTTCCGAGCGAGATTCGGATCCATCAACCCCCAGTTAAGCATCGCCGATGAAGAGGACGGTTGTTCAAAATGCATCGCCATCTCAGACGGTGGAGGAAGCTCTGTGTTCATAAACAGCTCGTTGTCCATCCTTATTACACTTTCTTAAGACTGACTCAAGAAACTAAATATAGTATAAAGATTCTGAAAGTTACGCAGAAAACAATAACAGATACTAATTCACGCAATAATAGTCAAGACGTTCACATCAAGATGAGGTTTGGAGTGTGCCGGAGGAGAAAGAAAGAGCGTAAATGGT
CDS Sequence
- >BnaA06G0363300ZS
ATGGACAACGAGCTGTTTATGAACACAGAGCTTCCTCCACCGTCTGAGATGGCGATGCATTTTGAACAACCGTCCTCTTCATCGGCGATGCTTAACTGGGGGTTGATGGATCCGAATCTCGCTCGGAACTCGCCGCCGCAGGATTGCTTCATGTGGGAAAAGTCAACGGAACAGCAACAGAGCATCTTCGACTCTGCTCTGAGCTCACTCGTCTCCTCGCCGACGCCGTCGAACTCAAACTTCTCCGGCGGAGGCGGCGACGGGTTTATCATCAGAGAACTCATCGGAAAGCTTGGTAACATCGGGAACACCTCCGGCGACATCTACGGAGCTCCGATGAACGGGAACGTTTCTCGCTCCGCCTCGTGCTACGCGACTCCGATGAGCTCGCCGCCGCCGATGATGAACAGAACGGCGCCGTTGACGGAATTCTCGGGGGACCCGGGGTTTGCGGAGAGGGCGGCGAAGTTCTCGTGCTTCGGTAGCCGGAGTTTTAACGGAAGAACTAACTCCGGCATCCCCGTTAACAACGGCAAGATCGTGAACTCCGGGAAACTGACACGTGTCTCCAGCACGCCGGCTCTCAAGGCCCTTGCTTCTCCGGAGTTCGCTTCCGCCTCCAGACCGATGATCCCCGCCGGCGATTCACCTCCGAAACTCCCCGGAGAATTTTCCCGGAAGAGAAAATCTGTTTCTAAAGGGAAATCTAAGGATAATCCTCTTCCCGCCGCTTCGCCGTCGCCCAGTTTCTCTAAGACGGCGGAAAGGAAAGAAGTTTCAGAAGAAAAGGGAGGGAAAAGGAGAAGAGAGGACGAAGGAGAGGAAGAAGAAGGGAACAAAGGTGGTAATGACACAAAGCCACCTGAGCCTCCTAAAGATTACATCCATGTTCGTGCTCGGCGAGGCCAAGCCACCGACAGTCACAGTCTCGCCGAAAGAGTTCGGAGGGAGAAAATTGGTGAAAGGATGAAGCTGCTTCAAGATCTTGTGCCTGGGTGCAATAAGGTTACTGGAAAGGCACTGATGCTGGATGAAATTATAAACTATGTACAATCATTGCAAAGACAAGTTGAGTTCTTGTCAATGAAGTTATCATCAGTGAACGACACCAGGCTGGAATTTAACGTGGACGCTCTTGTGTCAAAGGATGCTATGATTTCATCAAGCGGCAGCCGGGTGCATGAATCAGGACTCCAATTAGAGTCTCTAAGTCATCATAATTATAATAATAATTCACAGTTACATACCAATGTTTCTTCCAATAACATGATGCTCCATTCTCCTATGAAATCACTGGAACCCTCTGCCTTAGCCAGAGGCTTCACCCACTTACCAACACTTACCCAATTCACTGACACAATTTCTCAGTACCAAATGTTTAGCGAAGAAGATTTACAAAGCATTGTAGGGATGGGAGTGGCACATAACCCCAACCATGAATCTCAATCTCAAAACATGAAAATTGAGCTTTGA
Protein Sequence
- >BnaA06G0363300ZS
MDNELFMNTELPPPSEMAMHFEQPSSSSAMLNWGLMDPNLARNSPPQDCFMWEKSTEQQQSIFDSALSSLVSSPTPSNSNFSGGGGDGFIIRELIGKLGNIGNTSGDIYGAPMNGNVSRSASCYATPMSSPPPMMNRTAPLTEFSGDPGFAERAAKFSCFGSRSFNGRTNSGIPVNNGKIVNSGKLTRVSSTPALKALASPEFASASRPMIPAGDSPPKLPGEFSRKRKSVSKGKSKDNPLPAASPSPSFSKTAERKEVSEEKGGKRRREDEGEEEEGNKGGNDTKPPEPPKDYIHVRARRGQATDSHSLAERVRREKIGERMKLLQDLVPGCNKVTGKALMLDEIINYVQSLQRQVEFLSMKLSSVNDTRLEFNVDALVSKDAMISSSGSRVHESGLQLESLSHHNYNNNSQLHTNVSSNNMMLHSPMKSLEPSALARGFTHLPTLTQFTDTISQYQMFSEEDLQSIVGMGVAHNPNHESQSQNMKIEL