Information report for BnaA04G0045000ZS
Gene Details
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Functional Annotation
- Member of the class III HD-ZIP protein family. Contains homeodomain and leucine zipper domain. Critical for vascular development and negatively regulates vascular cell differentiation.
Homologous
- Arabidopsis thaliana: AT1G52150.1, AT1G52150.2
- Brassica oleracea: XP_013592012.1, Bo6g027650, XP_013621760.1, Bo3g181130
- Brassica rapa: XP_009147709.1, Bra018948
- Raphanus raphanistrum: RrC974_p5
Gene Resources
- Pfam: PF00046 PF08670 PF01852
- UniProt: A0A078J5G9
- EMBL: HG994358 , LK034022
- AlphaFoldDB: A0A078J5G9
- OMA: NVARGHY
- InterPro: IPR001890 , IPR011009 , IPR013978 , IPR035920 , IPR044830
- PANTHER: PTHR45950 , PTHR45950:SF19
- SUPFAM: SSF56112 , SSF75471
- PROSITE: PS51295
- Gene3D: 1.10.510.10 , 3.30.110.60 , 3.30.200.20
- STRING: 3708.A0A078J5G9
Sequences
gDNA Sequence
- >BnaA04G0045000ZS
TGTATCTGAGGGTGAGGATTAATATACCTAAAGCTGGCCTCACGCAGGCGGTGATGGAGAAGATTCATGATACTTGGAGGAAAGAGGAGCTTGTGAGGCTTAAGTTCCATGAGGTGCTTGCTCGTGATATGAAGACCGGCTCATGAGATTGTTGAGGTATGTTTCAATTGATTACTGGTTGAAAAAAGATCTCTTTATTGCGTGCAGGACGTTAGTTGAATTTGAGGTGTGAAATTTGAAATTAGATAGCTAATATATAGGGACAATAACCACTTAATCTCAAGTTAGTTCTGCAATAGAATGGTCTTAGTAATGATCATTCAAGTTAGTTCTCTCTTAGTCTTGAATGATCTTGAACAATAATTACCTAATCTCATTACCTAATCTCAACTTAGTTCTGAAACTTAGTAGTTCTCTTTCTTAGTAACAGTAATGCAGTTTTGTATAGGAGATGGAGCTGAGCATGGCTGTTAAATAGTAACAAGTTGATGCAAAAAAAAATTGTTTTGTTGGGAACTGATTGGATTTACTCTTGATGGGCAGCGTCGAACTGGTGGAATGGTGATATGGAGAGCAGGAAGTGTAATGGTGGTTTACCGTGGACGTGACTATCAAGGACCTTCTGCAGTCTTTAATCAAATGGCCAGACCTGAAGAACACTATCAAGGACCTTCAGCAGGAAGTGTGCTGGTGTATTCTTATGTAACAGTAGATGATTTGATGCGTTTCTTTAGTGTCATTTCATGATATCTTTAGATATGAAGATAGGTTGGTTGATGTTCTTGAAAACATGGCGTTTTAAGGTGTATTGGTTTGAGTTTTTGCAGCTGATGAGAGAAGATGAGGCAACCCTTGGTAAAATAACTAAGCCTAGGCGTCCCAAGACTGTTGTTCTGTGTCCCACCAGAGAACTCTCTGAGCAGGTTCTTCTACTTCTACTGCTTTTATTTTCTCTCTTTACCAAGATTAGTTGCTGCTCTAGGACATCGTAAATTTGGATTCCATGTTTGAGTTGAAACAAATTTGAACTTGTGAAAAAAAAAATAAAAAAAATATGAACTTGTGGTTGCTGGGTAAAATGTAAAAGTTGGAATATTTATTTTCTAGAAAGTTTTGGTTGCCTTCTTATAGGATGACCATAACACTGGAGATCATGAGGCATATGCCTGAGCATCCCAACGTTGTTACCTTGAGGGAGACTTATGAGGATGAGCATGCTGTGCATTTGGGTATGGAGCTTTGTGAAGGTGTTGAGTTGTTTGATAGGAATGTGGCGAGAGGGCATTACACTGAGAGAGCTGCTGCTGTTGTCACTAAGACCATCATGGCAGTTGTTCAGGTTCGTCACGGTTTTGCTCTTTGTTTATCTCCAGATTGGTCTATAGATGTTCTATGTCTTAGTTTAAGCTCGTGTGCTGCTCCTTCTTCCTCTTCCCTTGCCGTAAAACCCTTCAAAGGTTTCCATTTGGACCTGTTTTTGATTGTCCTTAATGCTATGCTACACTAGGATTAGGCCACTTAATCTCTTTGCTGCAGTCAGAAAATGGAAATTGTGGGTTCATGCCATGTATATACAGAGTTTGGGTGATGTTCGCATTTGATGATTCTGATTCTGATTTGATTTGTGTTTTAATTGATAAAGACAGTTGCTTGCTCTTTTATGAATCTGTCCGTAATTGTTTTATTTACTATGCTACACTAGGGCTAGGCTACTAAATCTCTATGCTGCACTCACAAAATGGAAACCGTGGGTTCTTGCCATGAATATTGAGATTTTGGTGGTGTTTGCTCTAATTTCATTTGTATTAAGCAGTCATTTTGCATGTGATGCATAATAGACTTGCTTCTTAGAGGATTTTTTTGTTTTGATTTATTTATAATATAGCTGTTTGCTCTTCTCTGGATATGTTTTTAATTTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGTGTATAGGGATGAGCTGGGTCGCTTTGTTTCTAATAAAGGCAATGAATCGGTTCTCAAGAACTTTTGGCATCATACAGATGCTATCATCTGCTGCTCAATGAAGGTACTAACTTAAACATCAAACACTCAATGAATGTTTTATTATTCACTGATCCTCTTTTAACCTTTTTTTGTTTAGGCCATGCCAGTCTTCATATTTGCAAACCAGGCGGGGCTAGACATGCTTGAGACAACATTGGTTTCTCTTCAAGATATCTCTTTAGAGAAGATATTTGATGACAATGGAAGGAAGACTCTCTGCTCTGAGTTCCCACAGATCATGCAACAGGTTTTTTAACAACGTTCTGGTCTGATTCGTGTATGTAGTTTGATATCTGACTTTAACATGATTTTTTTGGTTTAGGGCTTTGCGAGTCTTCAAGGTGGGATATGTCTATCAAGCATGGGGAGACCAGTTTCATACGAGAGAGCAGTTGCTTGGAAAGTACTCAATGAAGAAGAGAATGCTCATTGTATCTGCTTTGTGTTCATCAACTGGTCCTTTGTTTGA
CDS Sequence
- >BnaA04G0045000ZS
ATGTATCTGAGGGTGAGGATTAATATACCTAAAGCTGGCCTCACGCAGGCGGTGATGGAGAAGATTCATGATACTTGGAGGAAAGAGGAGCTTGTGAGGCTTAAGTTCCATGAGCGTCGAACTGGTGGAATGGTGATATGGAGAGCAGGAAGTGTAATGGTGGTTTACCGTGGACGTGACTATCAAGGACCTTCTGCAGTCTTTAATCAAATGGCCAGACCTGAAGAACACTATCAAGGACCTTCAGCAGGAAGTGTGCTGGTGTATTCTTATTTTTGGTTGCCTTCTTATAGGATGACCATAACACTGGAGATCATGAGGCATATGCCTGAGCATCCCAACGTTGTTACCTTGAGGGAGACTTATGAGGATGAGCATGCTGTGCATTTGGGTATGGAGCTTTGTGAAGGTGTTGAGTTGTTTGATAGGAATGTGGCGAGAGGGCATTACACTGAGAGAGCTGCTGCTGTTGTCACTAAGACCATCATGGCAGTTGTTCAGTTTAAGCTCGTGTGCTGCTCCTTCTTCCTCTTCCCTTGCCGTAAAACCCTTCAAAGGGATGAGCTGGGTCGCTTTGTTTCTAATAAAGGCAATGAATCGGTTCTCAAGAACTTTTGGCATCATACAGATGCTATCATCTGCTGCTCAATGAAGGCCATGCCAGTCTTCATATTTGCAAACCAGGCGGGGCTAGACATGCTTGAGACAACATTGGTTTCTCTTCAAGATATCTCTTTAGAGAAGATATTTGATGACAATGGAAGGAAGACTCTCTGCTCTGAGTTCCCACAGATCATGCAACAGGGCTTTGCGAGTCTTCAAGGTGGGATATGTCTATCAAGCATGGGGAGACCAGTTTCATACGAGAGAGCAGTTGCTTGGAAAGTACTCAATGAAGAAGAGAATGCTCATTGTATCTGCTTTGTGTTCATCAACTGGTCCTTTGTTTGA
Protein Sequence
- >BnaA04G0045000ZS
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